June 17th, 2009
Ten film dokumentuje metody zbierania próbek wody morskiej z wybrzeży i przetwarzania ich do różnych dalszych zastosowań, w tym koncentracji biomasy, oczyszczania kwasów nukleinowych, obfitości komórek, analiz składników odżywczych i śladowych gazów.
Cześć, nazywam się Elena Kova i pracuję w laboratorium Stephena Hallama na Wydziale Mikrobiologii i Immunologii Uniwersytetu Kolumbii Brytyjskiej. Dzisiaj pokażemy Ci procedurę pobierania wody morskiej do analizy fizycznej, chemicznej i biologicznej. Stosujemy tę procedurę w naszym laboratorium do badania oceanicznych parametrów graficznych wód morskich.
Więc zacznijmy. Najpierw przypisywana jest liczba odlewów i głębokości w każdym odlewie, następnie określane są głębokości do pobrania próbki oraz całkowita objętość, która ma zostać zebrana dla bieżącego odlewu. Upewnij się, że urządzenia do pobierania próbek wody z przepływem go i kin są w pozycji otwartej, a wszystkie zawory i kurki są zamknięte.
Przymocuj CTD do podstawy żyłki i opuść ją do wody, aby uzyskać najgłębszą głębokość w profilu. Wprowadzić urządzenie do pobierania próbek na linię bezpośrednio po CTD. Upewnij się, że przewód jest prawidłowo zamontowany we wsporniku urządzenia, a są dokręcone.
Do każdego urządzenia należy przymocować obciążony komunikator z wyjątkiem najgłębszej głębokości pobierania próbek przed opuszczeniem go do wody. Obniż linię i odległość między pierwszą określoną głębokością a następną, a następnie ustaw inne urządzenie do pobierania próbek. Należy pamiętać, że w przypadku przedziałów głębokości, w których pobierane są próbki wody o dużej objętości, łącznie dwie butelki o pojemności 12 litrów są ładowane kolejno w odległości około 0,75 metra od siebie.
Gdy wszystkie urządzenia znajdą się na linii, opuść linkę na najgłębszą głębokość i poczekaj, aż miną dwie minuty. Wyślij komunikator w dół, wyzwalając każde urządzenie w pozycji zamkniętej. Odczekaj kilka minut, zanim odzyskasz linię.
Aby upewnić się, że wszystkie urządzenia są zamknięte, zwiń linkę i rozładuj każde urządzenie na pokład, gdy wynurzy się z wody. W przypadku głębokości, które wymagają dużych objętości próbek do oczyszczania białka DNA lub RNA, należy zastosować dwa urządzenia do pobierania próbek w tandemie. Natychmiast zbierz RNA z jednej butelki i przefiltruj je na statku.
Po pobraniu próbek chemikaliów i składników odżywczych w drugiej butelce, spuść pozostałą wodę do samochodu, aby uzyskać końcową objętość 20 litrów. W przypadku próbek o małej objętości należy odłożyć jeden litr wody do filtracji w sterylnych butelkach Nalgene. Zazwyczaj próbki o małej objętości z 16 przedziałów głębokości są pobierane jako próbki 16 x jeden litr, a sześć próbek o pojemności 20 litrów jest pobieranych jako próbki o dużej objętości.
Podczas pobierania próbek gazu należy zawsze pobierać próbki tlenu i gazów śladowych. Najpierw przymocuj cienki kawałek rurki do króćca urządzenia do pobierania próbek wody. Umieść drugi koniec rurki w butelkach z serum glos.
Wypłucz butelkę serum trzy razy, ale pobierz próbkę wody i napełnij ją do przepełnienia, tak aby nie było pęcherzyków powietrza. Dodaj 50 mikrolitrów chlorku rtęci do butelki z serum. Należy uważać, aby nie wprowadzić pęcherzyków powietrza do próbki.
Zamknij butelkę z surowicą gumowym korkiem C zaciśniętą aluminiową nakrętką, a następnie przechowuj ją na lodzie w celu pobrania próbek do pomiarów składników odżywczych, w tym azotanów, fosforanów i krzemianów. Najpierw przepłucz strzykawkę o pojemności 60 ml próbką wody. Następnie podłącz filtr dyskowy acro o średnicy 0,2 mikrometra w linii.
Przepchnąć przez strzykawkę około dwóch ml wody. Aby oczyścić filtr. Wypłucz butelkę polietylenową około 10 ml przefiltrowanej wody trzy razy.
Podczas płukania wstrząśnij butelką, a następnie dodaj przefiltrowaną próbkę wody do butelek wypełnionych w około trzech czwartych. Przechowywać próbkę na lodzie. Opróżnij probówki z dystalną wodą, aby pobrać próbki do pomiarów amoniaku.
Najpierw wypłucz probówki zbiorcze, ale dokładnie pobierz próbkę wody. Napełnić cylinder z podziałką o pojemności 10 ml rurką z próbką wody w ilości pięciu ml próbki wody z cylindra z miarką, a pozostałą część opróżnić z butli. Następnie dodaj pięć ml z powrotem do pustego cylindra.
Po pobraniu próbek ze wszystkich głębokości do każdej probówki należy dodać 7,5 ml odczynnika roboczego amonu. Aby pobrać próbki do zliczania komórek, napełnij wstępnie oznakowaną probówkę Falcon o pojemności 50 ml zawierającą 5,4 ml, 37% wysokości formalnej do znaku 50 ml, aby uzyskać końcowe stężenie 4%Uważaj, aby nie przelać probówki. Przechowywać próbkę na lodzie w celu pobrania próbek.
Do pomiarów siarkowodoru. Napełnij do góry wstępnie oznakowaną probówkę Falcon o pojemności 50 ml zawierającą trzy ml 20% octanu. Uważaj, aby nie przelać rurki.
Przechowywać próbkę na lodzie w celu zebrania małych objętości. Do zagęszczania biomasy. Napełnij litrowe butelki Nalgene do góry, aby zebrać duże objętości do koncentracji biomasy.
Napełnij 20-litrowe balony do góry. Ostateczny wynik pobierania próbek wody morskiej wynosi około 32 do 48. Próbki gazów, 32 próbki amonu.
16 próbek siarkowodoru. 16 próbek do zliczania komórek. Sześć 20-litrowych samochodów, 16 jednolitrowych butelek i cztery sterexy.
Punkt drugi: dwa filtry mikrometryczne zawierające biomasę mikrobiologiczną są zachowywane na później. Izolacja RNA. Właśnie pokazaliśmy, jak pobierać różnego rodzaju próbki wody do analizy biochemicznej.
Wymaga to wielu przygotowań i planowania. Dlatego zaplanuj dwa dni przed podróżą na uporządkowanie rzeczy i jeden dzień po niej na posprzątanie, nie pozwól, aby słona woda miała kontakt z pompą peralt lub do aluminiowej skrzyni zago używanej do transportu sprzętu terenowego. Traktuj sprzęt z szacunkiem, a będzie dobrze służył przez długi czas.
Więc to wszystko. Dziękujemy za oglądanie i życzymy powodzenia w eksperymentach.
View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos
To wideo dokumentuje metody pobierania próbek morskiej wody przybrzeżnej i przetwarzania ich na różne zastosowania w dalszym ciągu, w tym koncentracji biomasy, oczyszczania kwasów nukleinowych, obfitości komórek, analizy składników odżywczych i gazów śladowych.
Robust seawater sampling and collection protocols are foundational for generating high-quality datasets in marine biopharma discovery, enabling accurate assessment of environmental variables and biological materials. These methods underpin downstream analyses such as nucleic acid purification, cell abundance quantification, and nutrient profiling, which are critical for target validation and mechanistic de-risking in marine-derived drug discovery. Standardized collection ensures reproducibility and comparability across discovery programs, supporting portfolio-wide decision-making.
Seawater sampling and collection methods are positioned at the front end of the marine biopharma discovery continuum, providing foundational material for workflows spanning target validation, screening, and translational research.