Name: Pobieranie i pobieranie próbek wody morskiej (Wideo) | JoVE Journal
Uploaded: 2009-06-17T19:00:00.000+00:00
Duration: 8 min 23 s
Description: Poznaj metody pobierania próbek wody morskiej do analiz biologicznych i chemicznych. Film demonstruje techniki próbkowania przy użyciu urządzeń go flow i kin dla badań oceanograficznych.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

Pragniemy podziękować Canadian Foundation for Innovation, British Columbia Knowledge Development Fund oraz National Sciences and Engineering Research Council (NSERC) w Kanadzie za wsparcie prowadzonych badań nad regionami o niskiej zawartości tlenu w wodach przybrzeżnych i otwartych oceanach. Ponadto D.A.W. otrzymał stypendia od NSERC, Killam oraz fundowane przez fundację TULA Centre for Microbial Diversity and Evolution.

Część 1: Pobieranie wody
<ol>
<li>Każdemu rzutowi przypisuje się odpowiednie głębokości.</li>
<li>Określa się głębokości, z których pobierane będą próbki, oraz całkowitą objętość do zebrania podczas bieżącego rzutu.</li>
<li>Należy upewnić się, że butle Go-Flo i Niskin są otwarte, a ich zawory i kraniki zamknięte.</li>
<li>Sonda CTD jest montowana na dole liny i opuszczana do wody.</li>
<li>Butla przeznaczona do najgłębszego punktu poboru w pierwszym rzucie jest montowana na linie za sondą CTD; należy upewnić się, że lina jest prawidłowo osadzona w uchwycie, a śruby są dokręcone.</li>
<li>Przed opuszczeniem do każdej butli (z wyjątkiem najgłębszej) przytwierdza się posłańca.</li>
<li>Lina jest opuszczana na odległość między pierwszą a kolejną głębokością, po czym montuje się następną butlę. Należy pamiętać, że dla głębokości, z których pobierane jest 20L do filtracji, montuje się kolejno dwie butle o pojemności 12L w odstępie ok. 0,75m.</li>
<li>Gdy wszystkie butle znajdą się na linie, jest ona opuszczana na pożądaną głębokość i oczekuje się 2 minut.</li>
<li>Wysyłany jest posłaniec i oczekuje się kilka minut, aby upewnić się, że wszystkie butle zostały zamknięte.</li>
<li>Lina jest wciągana, a butle zdejmowane w miarę ich pojawiania się na stelażach.</li>
<li>W przypadku głębokości wymagających próbek 20L do analiz DNA i RNA, pobiera się dwie butle Niskin. Jedna butla służy do pomiaru parametrów chemicznych (patrz. poniżej), natomiast zawartość drugiej jest przelewana do kanistra. RNA jest izolowane natychmiast z drugiej butli Niskin. Pozostała część pierwszej butli jest również przelewana do kanistra, aby uzyskać końcową objętość ~20L. W przypadku próbek o niskiej rozdzielczości tylko 1L wody jest odstawiany do filtracji w sterylnych butelkach Nalgene.</li>
</ol>
Część 2: Pobieranie próbek gazu
<ol>
<li>W przypadku potrzeby pobrania próbek tlenu, wykonuje się to w pierwszej kolejności.</li>
<li>Kawałek cienkiej rurki przyczepia się do kranu butli Niskin/Go-Flo, a drugi koniec rurki umieszcza się w szklanych butelkach z surowicą.</li>
<li>Butelkę z surowicą płucze się 3 krotnie wodą z próbki, a następnie napełnia po brzegi w taki sposób, aby nie pojawiły się pęcherzyki powietrza.</li>
<li>Do butelki z surowicą dodaje się 50μl chlorku rtęci (HgCl2) w sposób, który nie wprowadzi pęcherzyków powietrza do próbki.</li>
<li>Butelkę uszczelnia się gumowym korkiem i zaciska aluminiową kapslowaniem, a następnie przechowuje w lodzie w lodówce przenośnej.</li>
</ol>
Część 3: Pobieranie próbek składników odżywczych
<ol>
<li>Strzykawkę o pojemności 60 cc płucze się wodą z próbki, w obwodzie montuje się filtr (0.2 μm) i przepuszcza niewielką ilość wody przez acrodisc.</li>
<li>Butelkę polietylenową płucze się ~10 ml filtrowanej wody 3 razy (wstrząsając butelką podczas płukania).</li>
<li>Do butelek dolewa się filtrowaną wodę z próbki, wypełniając je w około ¾ objętości.</li>
<li>Próbkę przechowuje się w lodzie w chłodziarce.</li>
</ol>
Część 4: Pobieranie próbek amoniaku
<ol>
<li>Probówki płucze się wodą z próbki.</li>
<li>Probówki napełnia się całkowicie wodą z próbki.</li>
<li>Za pomocą pipety 10ml pobiera się 5ml wody z próbki; resztę wody w probówce wylewa się, a 5ml znajdujące się w końcówce pipety przelewa z powrotem do probówki z próbką.</li>
<li>Po pobraniu próbek ze wszystkich głębokości do każdej probówki dodaje się 7,5ml roboczego odczynnika amonowego.</li>
</ol>
Część 5: Pobieranie próbek do liczenia komórek
<ol><li>Wcześniej oznakowaną probówkę Falcona o pojemności 50 ml zawierającą 5,4 ml 37% formaldehydu wypełnia się po brzegi, aby uzyskać końcowe stężenie 4%. Należy zachować ostrożność, aby nie rozlać zawartości.</li></ol>
Część 6: Pobieranie próbek do pomiarów siarkowodoru
<ol>
<li>Wcześniej opisaną probówkę Falcon o pojemności 50 ml zawierającą 20% octanu cynku (Zn(O2CCH3)2) napełnia się do pełna, uważając, aby nie rozlać zawartości.</li>
</ol>
Część 7: Pobieranie małych objętości w celu zagęszczenia biomasy
<ol>
<li>Butelki o pojemności 1 litra są napełniane po brzegi.</li>
</ol>
Część 8: Pobieranie dużych objętości w celu zagęszczenia biomasy
<ol>
<li>Napełnia się 20-litrowe kanistry.</li>
</ol>
Część 9: Reprezentatywne wyniki
Ostatecznym wynikiem pobierania próbek wody morskiej jest uzyskanie około 12 próbek tlenu rozpuszczonego, 32-48 próbek gazów, 16 próbek biogenów, 32 próbek amoniaku, 16 próbek siarkowodoru, 16 próbek do zliczeń komórkowych, 6 20-litrowych kanistrów, 16 1-litrowych butelek oraz 4 filtrów Sterivex 0.22μm zawierających biomasę mikrobową utrwaloną w RNA later.

<ol><li>Cline, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Spectrophotometric+determination+of+hydrogen+sulfide+in+natural+waters%5BTitle%5D)+AND+%22Limnology+%26+Oceanography%22%5BJournal%5D)">Spectrophotometric determination of hydrogen sulfide in natural waters.</a> Limnology & Oceanography. 14, 454-458 (1969).</li>
<li>Holmes, R. M., Aminot, A., Kerouel, R., Hooker, B. A., Peterson, B. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+simple+and+precise+method+for+measuring+ammonium+in+marine+and+freshwater+ecosystems%5BTitle%5D)+AND+%22Canadian+Journal+of+fisheries+and+Aquatic+Science%22%5BJournal%5D)">A simple and precise method for measuring ammonium in marine and freshwater ecosystems.</a> Canadian Journal of fisheries and Aquatic Science. 56, 1801-1808 (1999).</li>
</ol>

Autorzy nie zgłaszają żadnych konfliktów interesów.

Ogólnie rzecz biorąc, tego rodzaju pobieranie próbek wymaga bardzo starannego przygotowania i planowania, dlatego należy zarezerwować 2 dni przed wyprawą na uporządkowanie spraw oraz jeden dzień po niej na wyczyszczenie całego sprzętu. Co do zasady, nie należy dopuścić do kontaktu wody słonej z pompą perystaltyczną ani do jej przedostania się do aluminiowej skrzyni Zarges używanej do transportu sprzętu terenowego. Właściwa dbałość o urządzenia zapewni ich bezawaryjne działanie przez długi czas.

<table><tbody><tr><td>Butle 20L</td><td></td><td>Fisher Scientific</td><td>02-960-15</td><td></td></tr><tr><td>Tygon 3/8&quot;</td><td></td><td>Cole-Parmer</td><td>06429-36</td><td></td></tr><tr><td>Filtry Sterivex</td><td></td><td>Fisher Scientific</td><td>SVG010RS</td><td></td></tr><tr><td>Obudowa przedfiltra</td><td></td><td>AMD</td><td>501200</td><td></td></tr><tr><td>Złączka Luer</td><td></td><td>Cole-Parmer</td><td>31507-27</td><td></td></tr><tr><td>Przewód Tygon 1/4&quot;</td><td></td><td>Cole-Parmer</td><td>06429-24</td><td></td></tr><tr><td>Przewód Tygon 1/4&quot;</td><td></td><td>Cole-Parmer</td><td>06429-24</td><td></td></tr><tr><td>Przewód Tygon 1/4&quot;</td><td></td><td>Cole-Parmer</td><td>06429-24</td><td></td></tr><tr><td>Plastikowe probówki 50ml</td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Szklane fiolki do serum</td><td></td><td></td><td></td><td>Pobieranie szklanych próbek</td></tr><tr><td>Septa i aluminiowe nakrętki do szklanych fiolek do serum</td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Zakuwarka ręczna</td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Pipeta 20-200ul i końcówki</td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Probówki szklane</td><td></td><td></td><td></td><td>Pobieranie próbek amonu</td></tr><tr><td>Plastikowe butelki 30ml</td><td></td><td></td><td></td><td>Pobieranie składników odżywczych</td></tr><tr><td>Filtry Acrodisc</td><td></td><td>EMD Millipore</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Probówki 5 ml</td><td></td><td></td><td></td><td>Pobieranie próbek azotynów</td></tr><tr><td>37% formaldehyd</td><td>Odczynnik</td><td></td><td></td><td>Do próbek z liczeniem komórek</td></tr><tr><td>20% octan cynku</td><td>Odczynnik</td><td></td><td></td><td>Do próbek siarczków</td></tr><tr><td>Chlorek rtęci(II)</td><td>Odczynnik</td><td></td><td></td><td>Do próbek gazów</td></tr><tr><td>Woda milliQ</td><td>Odczynnik</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Odczynnik roboczy do amonu</td><td>Odczynnik</td><td></td><td></td><td>Bufor borowy, siarczyn sodu, ortoftalodialdehyd</td></tr><tr><td>Sulfanilamid</td><td>Odczynnik</td><td></td><td></td><td>5g w 450ml wody i 50ml HCl</td></tr><tr><td>Roztwór dwuwodoroczlorku N-(1-naftylo)-etylenodiaminy</td><td>Odczynnik</td><td></td><td></td><td>0,5g w 500ml wody</td></tr></tbody></table>

pobieranie i gromadzenie próbek wody morskiej

Seawater Sampling and Collection

W niniejszym filmie przedstawiono metody pobierania próbek wody morskiej z obszarów przybrzeżnych oraz ich przetwarzania na potrzeby różnych zastosowań analitycznych, w tym koncentracji biomasy, oczyszczania kwasów nukleinowych, oznaczania liczebności komórek oraz analiz składników odżywczych i gazów śladowych. W dzisiejszej demonstracji próbki pobrano z pokładu statku HMS John Strickland operującego w zatoce Saanich Inlet. Do poboru próbek wykorzystano żuraw A-frame z wielofunkcyjną wciągarką i systemem lin oraz butle do poboru wody Niskin lub Go-Flo. Do badania parametrów masy wody wykorzystano również czujniki przewodności, temperatury i głębokości (CTD). W celu zminimalizowania efektu odgazowania w pierwszej kolejności pobrano próbki gazów śladowych. Następnie oznaczono zawartość składników odżywczych, skład chemiczny wody oraz liczebność komórek. Na koniec pobrano próbki wody do filtracji biomasy. Czas przygotowania i poboru próbek podczas jednego rzutu wynosi ok. 1,5 godziny przy maksymalnej głębokości 215 metrów. W związku z tym do przeprowadzenia opisanej tutaj serii pobrań potrzeba zazwyczaj łącznie 6 godzin.

Niniejszy film dokumentuje metody pobierania próbek przybrzeżnych wód morskich oraz ich przetwarzania na potrzeby różnych zastosowań analitycznych, w tym zagęszczania biomasy, oczyszczania kwasów nukleinowych, oznaczania liczby komórek oraz analizy składników odżywczych i gazów śladowych.

Pobieranie i gromadzenie próbek wody morskiej

Niniejszy film dokumentuje metody pobierania próbek wody morskiej z obszarów przybrzeżnych oraz ich przetwarzania do różnych zastosowań analitycznych, w tym do analizy biomasy...

Witam, jestem Elena Kova z laboratorium Stephena Hallama w Katedrze Mikrobiologii i Immunologii na Uniwersytecie Kolumbii Brytyjskiej. Dzisiaj przedstawimy procedurę pobierania próbek wody morskiej do analizy fizycznej, chemicznej i biologicznej. Stosujemy tę procedurę w naszym laboratorium do badania parametrów oceanograficznych wód morskich.Zacznijmy zatem. Najpierw wyznacza się liczbę rzutów oraz głębokości dla każdego z nich, a następnie określa głębokości, z których pobierane będą próbki, oraz całkowitą objętość wody do zebrania podczas obecnego rzutu. Należy upewnić się, że urządzenia do pobierania próbek wody go-flow i kin znajdują się w pozycji otwartej, a wszystkie zawory i kraniki są zamknięte.Przymocuj CTD do podstawy linki i opuść go do wody na maksymalną głębokość przewidzianą w profilu. Bezpośrednio za CTD zamocuj na lince urządzenie do pobierania próbek. Upewnij się, że linka jest prawidłowo osadzona w uchwycie urządzenia, a śruby są dokręcone.Do każdego urządzenia, z wyjątkiem tego przeznaczonego do najgłębszego poboru próbek, przymocuj obciążony posłaniec przed opuszczeniem go do wody. Opuść linię na odległość odpowiadającą różnicy między pierwszą określoną głęboko

Research

JoVE Journal

Biology

Biologia

Pobieranie i zbieranie próbek wody morskiej

W niniejszym filmie przedstawiono proces filtracji dużych objętości (≥20 L) biomasy drobnoustrojowej o średnicy od 0.22μm do 2.7μm z kolumny wody.

Filtracja próbek wody morskiej z wybrzeża o dużej objętości (20L+)

Niniejszy film dokumentuje filtrację małych objętości (~1 L) biomasy mikrobowej z kolumny wody.

Filtracja małych objętości (1–3 l) próbek przybrzeżnej wody morskiej

Źródło: Villela, H. D. M. i in. Poszukiwanie szczepów mikroorganizmów do bioremediacji oraz rozwój probiotyków do badań i ochrony metaorganizmów. J. Vis. Exp. (2019)Ten film demonstruje selektywną izolację bakterii morskich degradujących ropę poprzez wzbogacanie próbek wody morskiej na nośnikach olejowych, co umożliwia odzyskiwanie czystych szczepów z potencjalnymi zastosowaniami w bioremediacji ropy naftowej i oczyszczaniu środowiska.

Selektywne wzbogacanie i izolacja bakterii morskich degradujących ropę z próbek wody morskiej

Tutaj prezentujemy kompleksowy protokół do oceny dostępności organicznych i nieorganicznych składników odżywczych oraz obfitości i struktury społeczności mikroorganizmów i wirusów w odległych środowiskach morskich.

Odkrywanie niewidzialnych graczy w oceanie - przewodnik terenowy po chemii wody i mikrobiologii morskiej

Wymagana jest szczególna ostrożność przy użyciu "czystych technik" do prawidłowego pobierania i przetwarzania próbek wody do badań metali śladowych w środowisku wodnym. Przedstawiono protokół pobierania próbek, przetwarzania i procedur analitycznych w celu uzyskania wiarygodnych danych i wyników z monitoringu środowiskowego o wysokiej czułości dla szczegółowych badań metali śladowych.

Czyste pobieranie próbek i analiza wód rzecznych i ujść rzek do badań metali śladowych

Tutaj prezentujemy małe inkubacje rdzenia do pomiaru wymiany gazu osad-woda i substancji rozpuszczonej. Umożliwią one wiarygodne pomiary wymiany osad-woda, które ocenią rolę osadów we wpływie na procesy biologiczne i biogeochemiczne w ekosystemach wodnych.

Bentosowa wymianaO2, N2 i rozpuszczonych składników odżywczych przy użyciu inkubacji z małym rdzeniem

Plankton i zawieszone cząstki odgrywają główną rolę w cyklach biogeochemicznych w oceanie. W tym przypadku zapewniamy ultraczystą, bezstresową metodę zbierania różnych rozmiarów cząstek i planktonu na morzu, która jest w stanie poradzić sobie z dużymi ilościami wody morskiej.

Ultra-czyste, wielowarstwowe urządzenie do zbierania frakcjonowanego planktonu morskiego i zawieszonych cząstek

Większość dotychczasowych badań nad mikroplastikiem miała miejsce w systemach morskich, gdzie poziom zawieszonych ciał stałych jest stosunkowo niski. Uwaga skupia się obecnie na systemach słodkowodnych, które mogą charakteryzować się dużą ilością osadów i pływającymi szczątkami. Protokół ten dotyczy zbierania i analizowania próbek mikroplastiku ze środowisk wodnych, które zawierają wysokie zawieszone ładunki stałe.

Pobieranie próbek, sortowanie i charakteryzowanie mikrodrobin plastiku w środowisku wodnym z dużą ilością zawieszonych osadów i dużymi pływającymi odpadami

Tutaj prezentujemy nowatorski protokół odzyskiwania morskiego eDNA poprzez zbieranie i filtrację próbek wody morskiej z działających promów i innych statków handlowych.

Pływające laboratorium: Standardowa procedura operacyjna pobierania i filtrowania próbek wody morskiej z działających promów do analizy środowiskowej DNA

W tym miejscu opisano metody pobierania próbek ze stref eufotowych ekosystemów morskich i słodkowodnych w celu wyizolowania cyjanofagów (i ich gospodarzy) oraz procesy po pobraniu próbek, które wzbogacają pojedyncze genotypy i charakteryzują dynamikę interakcji wirus-gospodarz.

Pobieranie próbek środowiskowych mikroorganizmów fotosyntetycznych i ich wirusów: od terenu do laboratorium

Protokół ten opisuje ustandaryzowany sposób zbierania próbek DNA środowiskowego waleni (eDNA) z jednostek obserwatorów wielorybów. Priorytetem jest wykonalność dla badaczy i wykwalifikowanych naukowców-obywateli, natomiast warunki środowiskowe, czas filtracji, mętność oraz logistyka pokładowa wyznaczają praktyczne ograniczenia zastosowania.

Pobieranie próbek DNA środowiskowych z jednostek obserwatorskich wielorybów w celu monitorowania waleni

Poznaj metody pobierania próbek wody morskiej do analiz biologicznych i chemicznych. Film demonstruje techniki próbkowania przy użyciu urządzeń go flow i kin dla badań oceanograficznych.

Pobieranie i gromadzenie próbek wody morskiej

Przeglądaj więcej filmów