Ocena filamentacji indukowanej antybiotykiem w E. coli za pomocą testu posiewu i cytometrii przepływowej

0 wyświetleń3:27 min • September 26th, 2025

Zacznij od hodowli E. coli wstępnie potraktowanej antybiotykiem.

Antybiotyk ten blokuje podziały komórkowe, w wyniku czego powstają wydłużone komórki nitkowate o zwiększonej zawartości DNA.

Umieść porcję kultury na bogatej w składniki odżywcze płytce agarowej i inkubuj.

Komórki nitkowate nie dzielą się pomimo ciągłego wzrostu; Tylko komórki nienitkowate tworzą kolonie, co skutkuje niską liczbą kolonii.

Rozcieńczyć pozostałą kulturę bakteryjną i dodać fluorescencyjny barwnik wiążący DNA. Następnie wysiaduj w ciemności.

Barwnik dostaje się do komórek i wiąże się z DNA.

Odwirować próbkę, a następnie przepuścić ją przez cytometr przepływowy.

Ilość rozproszonego światła z każdej komórki odpowiada jej rozmiarowi.

Podobnie fluorescencja emitowana przez kwasy nukleinowe związane z barwnikiem wskazuje na zawartość bakteryjnego DNA.

Komórki poddane działaniu antybiotyków wykazują zwiększone rozproszenie i fluorescencję, co odzwierciedla nitkowaty wzrost i ciągłą replikację DNA bez podziału.

Świadczy to o modyfikacjach w fizjologii bakterii spowodowanych przez antybiotyki hamujące podziały komórkowe.

Przygotować dziesięciokrotne seryjne rozcieńczenia, do 10 do minus siódmej, z 200 mikrolitrów próbki hodowli w świeżej pożywce.

Mieszać między każdym rozcieńczeniem, bardzo delikatnie wirując lub odwracając probówkę. Na niewybranych płytkach z agarozy LB rozmieścić 100 mikrolitrów odpowiedniego rozcieńczenia i inkubować przez noc w temperaturze 37 stopni Celsjusza. Następnego dnia policz liczbę kolonii, aby określić stężenie żywotnych komórek w każdej próbce hodowli.

Wykreślić jtk na mililitr w funkcji czasu dla kultur komórkowych niepoddanych działaniu substancji i poddanych działaniu środka. Zmierz OD 600 kultury na spektrofotometrze. Rozcieńczyć próbkę hodowli świeżą pożywką w temperaturze czterech stopni Celsjusza, aby otrzymać próbkę o OD 600 w 0,06, co odpowiada około 15 000 komórek na mikrolitr.

W przypadku barwienia DNA należy zmieszać rozcieńczoną próbkę bakteryjną z roztworem fluorescencyjnym DNA o stężeniu 10 mikrogramów na mililitr w stosunku objętościowym jeden do jednego i inkubować w ciemności przez 15 minut. Przed wstrzyknięciem próbki należy wymieszać próbkę przez bardzo delikatne wirowanie lub odwrócenie probówki. Przepuścić próbkę do cytometru przepływowego z natężeniem przepływu około 120 000 komórek na minutę.

Pozyskiwanie światła rozproszonego do przodu i bocznego, a także barwnika fluorescencyjnego DNA/sygnału fluorescencyjnego z odpowiednimi ustawieniami.