Kwantyfikacja polarności i dynamiki składnika układu wydzielania u Legionella pneumophila

0 views • 3:37 min • October 30th, 2025

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Zacznij od Legionella pneumophila, patogenu układu oddechowego wykazującego ekspresję fluorescencyjnie znakowanego składnika systemu wydzielania wymaganego do zakażenia gospodarza.

Aby określić ilościowo polaryzację tych składników, uzyskaj obrazy fluorescencyjne i dostosuj kontrast, aby odróżnić poszczególne komórki.

Umieść prostokątne obszary od bieguna komórki w kierunku cytoplazmy, aby zmierzyć gradienty fluorescencji.

Zamaskuj te obszary, aby wyodrębnić średnią intensywność i wariancję, a następnie oblicz wyniki polaryzacji jako stosunek wariancji do średniej intensywności.

Wysokie wyniki polaryzacji wskazują na ukierunkowaną rekrutację składników na biegunach bakteryjnych.

Aby uzyskać dynamiczne pomiary, zrób dwa zdjęcia poklatkowe i dostosuj kontrast, aby wyraźnie zwizualizować komórki.

Umieść kwadratowe obszary w środku komórki, aby zmierzyć fluorescencję cytozolową.

Maskuj całe komórki, aby skorygować fotowybielanie i zdefiniuj obszary tła między komórkami w celu odjęcia szumu.

Eksportuj wszystkie intensywności i oblicz zmianę fluorescencji w czasie.

Zwiększona intensywność wskazuje na grupowanie, podczas gdy zmniejszona intensywność odzwierciedla dynamiczną redystrybucję składników wydzielania w obrębie bakterii.

Aby określić ilościowo polaryzację, dostosuj kontrast obrazu, aby bakterie były wyraźnie widoczne.

Następnie powiększ obszar zainteresowania i użyj narzędzia Region, aby umieścić prostokąt o wymiarach 0,25 na 1,3 mikrometra, zaczynając od bieguna i rozciągając się do cytoplazmy, upewniając się, że prostokąt pozostaje w granicach bakterii.

Zaznacz co najmniej 200 bakterii i utwórz maski, używając przycisku regionu do maskowania w menu analizy. Kliknij na statystyki maski i wybierz obiekt w zakresie maski. Następnie zaznacz średnią intensywność i wariancję w obszarze cechy i intensywność.

Wyeksportuj dane jako plik tekstowy i użyj aplikacji arkusza kalkulacyjnego, aby obliczyć wyniki polaryzacji każdej bakterii jako stosunek wariancji do średniej intensywności.

Aby określić ilościowo dynamikę białek fuzyjnych, otwórz okno przechwytywania obrazu i zaznacz upływ czasu.

Wprowadź dwa w polu Liczba punktów czasowych. Uzyskaj dwa kolejne obrazy Legionella Pneumophila wyrażające interesujące nas białko fluorescencyjne.

Dostosuj kontrast obrazu, aż komórki będą wyraźnie widoczne. Następnie użyj narzędzia regionu, aby umieścić kwadrat o wymiarach 0,25 na 0,25 mikrometra pośrodku co najmniej 400 komórek.

Następnie użyj przycisku regionu do maski w menu analizy, aby utworzyć maskę interesujących kwadratów. Utwórz nową pustą maskę i użyj narzędzia Piksel, aby zaznaczyć cały obszar komórki z co najmniej 25 losowych komórek. Utwórz kolejną maskę i użyj dużego pędzla, aby zaznaczyć obszary między komórkami.

Na koniec wybierz statystyki maski i upewnij się, że obiekt jest wybrany w obszarze maski dla maski pierwszej. W obszarze Cechy i intensywność wybierz średnią intensywność. Wyeksportuj dane i powtórz proces dla maski 2. Dla maski 3 wybierz całą maskę i wyeksportuj średnią intensywność.

07:28

Mikroskopia fluorescencyjna żywych komórek w celu obserwacji podstawowych procesów podczas wzrostu komórek drobnoustrojów

Related Videos

0 Views

09:47

Wizualizacja zagęszczenia DNA u sinic za pomocą wysokonapięciowej krioelektronowej tomografii

Related Videos

0 Views

05:57

Mikroskopia fluorescencyjna żywych komórek w celu zbadania lokalizacji białek subkomórkowych i zmian morfologii komórek u bakterii

Related Videos

0 Views

09:25

Oczyszczanie wakuoli patogenów z fagocytów zakażonych bakterią Legionella

Related Videos

0 Views

02:30

Oznaczanie replikacji Legionella pneumophila w makrofagach poddanych działaniu pęcherzyków błony zewnętrznej

Related Videos

0 Views

03:04

Izolacja zewnętrznych pęcherzyków błonowych Legionella pneumophila oparta na ultrawirowaniu

Related Videos

0 Views

13:54

Możliwe do leczenia infekcje komórek ssaków bakteriami zaszczepionymi przez pierwotniaki

Related Videos

0 Views

12:30

Wykorzystanie Galleria mellonella jako organizmu modelowego do badania zakażenia Legionella pneumophila

Related Videos

0 Views

11:17

Monitorowanie zmian polarności błony, integralności błony i stężeń jonów wewnątrzkomórkowych w Streptococcus pneumoniae przy użyciu barwników fluorescencyjnych

Related Videos

0 Views

08:34

Legionella pneumophila (Legionella pneumophila) Pęcherzyki błony zewnętrznej: izolacja i analiza ich potencjału prozapalnego na makrofagach

Related Videos

0 Views

Last updated: 18 July 2026