Monitorowanie kolonizacji bakteryjnej korzeni Arabidopsis thaliana w bezglebowym systemie

0 wyświetleń2:32 min • March 31st, 2026

Zacznij od sadzonek Arabidopsis thaliana hodowanych na niskiej gęstości siatkowych podporach, które unoszą się na powierzchni płynnego podłoża w bezglebowym systemie.

Te siewki zostały wcześniej zaszczepione bakteriami, które kolonizują korzenie i tworzą biofilm.

Trzymaj sadzonkę i delikatnie ściśnij łodygę poniżej liści kleszczemi.

Następnie podnieś sadzonkę z siatki, nie uszkadzając korzenia, zachowując skolonizowaną strukturę korzeniową.

Przenieś sadzonkę na wielodołową płytę zawierającą wodę podwójnie destylowaną.

Przykryj płytkę folią i sonikuj próbki za pomocą wielozębnego sonikatora, aby rozbić biofilm i usunąć bakterie z powierzchni korzenia.

Po sonikacji użyj sonikowanej zawiesiny bakteryjnej do przygotowania serii rozcieńczeń.

Rozcieńczone próbki nakładaj na płytki agarowe i dodaj szklane kulki, aby równomiernie rozprowadzić bakterie.

Usuń kulki i inkubuj płytki, aby umożliwić powstawanie kolonii żywotnym bakteriom.

Tworzenie kolonii potwierdza udane kolonizowanie korzeni przez bakterie w systemie bezglebowym.

Po płukaniu usuń siewki z siatki, delikatnie umieszczając pod liściami po stronie liścia pod ostrzałem sterylizowane kleszcze. Delikatnie ściśnij łodygę i przesuń sadzonki w górę i z dala od siatki, aby usunąć korzeń bez jego łamania. Aby usunąć bakterie z korzeni roślin, przenieś siewki z każdej siatki do indywidualnych dołków 24-dołkowej płyty sonikacyjnej zawierającej jeden mililitr podwójnie destylowanej wody.

Sonikuj wszystkie próbki na płycie jednocześnie, używając wielozaczewowego sonikatora, jak opisano w rękopisie. Aby ilościowo określić bakterie, wykonaj seriowe 10-krotne rozcieńczenia sonikowanych próbek w ośrodku wzrostu bakterii. Rozprzestrzeniaj się za pomocą sterylnych szklanych koralików i inkubuj w optymalnej temperaturze dla bakterii, aż poszczególne kolonie będą liczalne.