Denaturacja elektroforezy w żelu poliakryloamidowym mocznika do analizy RNA: technika oddzielania fluorescencyjnie znakowanych fosforylowanych oligonukleotydów RNA od ich niefosforylowanych odpowiedników

0 wyświetleń • 5:34 min. • July 8th, 2025

Na początek weź próbkę zawierającą fluorescencyjnie znakowane fosforylowane i niefosforylowane oligonukleotydy RNA zmieszane z barwnikiem ładującym zawierającym mocznik. Podgrzać próbkę.

Mocznik - silny denaturant - w połączeniu z ciepłem denaturuje drugorzędową strukturę RNA, w wyniku czego powstaje jego zlinearyzowana i nieustrukturyzowana konformacja. Teraz odlej żel, mieszając roztwór akrylamidu-bisakryloamidu z mocznikiem.

Dodaj tetrametylenodiaminę, katalizator i nadsiarczan amonu, środek utleniający, aby ułatwić późniejszą polimeryzację żelu.

Wlej roztwór do wstępnie zmontowanego aparatu kasetowego. Włóż grzebień, tworząc dołki do ładowania próbki. Pozwól żelowi spolimeryzować. Umieść kasetę w aparacie żelowym. Dodaj bufor do pracy do górnego i dolnego zbiornika, utrzymując przepływ prądu przez cały żel. Wyjmij grzebień.

Załaduj próbkę zmieszaną z barwnikiem wizualizacyjnym do studzienki i podłącz żel do źródła zasilania o żądanym napięciu. Mocznik zawarty w żelu umożliwia cząsteczkom RNA migrację jako gatunki liniowe.

Żel działa jak sito, umożliwiając ujemnie naładowanym cząsteczkom RNA przemieszczanie się przez pory w kierunku elektrody dodatniej. Podczas biegu ufosforylow

Wyświetl pełny transkrypt i uzyskaj dostęp do tysięcy filmów naukowych

Zaloguj się

Przeglądaj więcej filmów

Denaturująca elektroforeza PAGE z użyciem mocznika