Gradientowa reakcja łańcuchowa polimerazy w celu określenia optymalnej temperatury wyżarzania

0 wyświetleń2:30 min • July 8th, 2025

Gradientowa reakcja łańcuchowa polimerazy to technika optymalizacji temperatury wyżarzania, w której startery - specyficzne dla sekwencji, jednoniciowe DNA - wiążą się z komplementarnymi miejscami na matrycowym DNA.

Weź mieszaninę zawierającą startery do przodu i do tyłu, dNTP i termostabilną polimerazę DNA w odpowiednim buforze. Dodać matrycę DNA i przenieść składniki na płytkę PCR.

Umieść płytkę w gradientowym termocyklerze ze specjalistycznym blokiem grzewczym. W ten sposób powstaje liniowy gradient temperatury wyżarzania w zakresie od 55 °C do 65 °C, ze stałym wzrostem temperatury na całej płycie.

Reakcja podgrzewa płytkę w wysokiej temperaturze, denaturując dwuniciowe DNA na pojedyncze nici i aktywując polimerazę DNA. Później temperatura jest obniżana zgodnie z zaprogramowanymi wartościami w każdym dołku, co ułatwia wyżarzanie gruntu.

W temperaturze wyżarzania poniżej optymalnej startery wiążą się niespecyficznie ze zdenaturowanym DNA, co prowadzi do niespecyficznej amplifikacji podczas reakcji PCR. W temperaturze powyżej optymalnej niewystarczająca ilość starterów wiąże się z DNA.

W optymalnej temperaturze startery wiążą się specyficznie z docelowym DNA. Następnie temperatura nieznacznie wzrasta, co pozwala polimerazie na wydłużenie starterów za pomocą dNTP. Te powtarzające się cykle denaturacji, wyżarzania i wydłużania prowadzą do amplifikacji DNA.

Przeanalizuj produkt w każdym dołku. Studnie o nieoptymalnych temperaturach wyżarzania wykazują mniejsze lub niespecyficzne wzmocnienie.

Optymalna temperatura wyżarzania zapewnia maksymalną specyficzną amplifikację DNA.

Aby wykonać gradientowy PCR, zacznij od przygotowania mieszanki wzorcowej. Następnie usuń 19 mikrolitrów mieszanki wzorcowej do kontroli bez matrycy lub NTC na 96-dołkowej płytce. Następnie dodaj szablon do pozostałego miksu głównego. Podwielokrotność 20 mikrolitrów próbki wymieszać z płytką 96-dołkową. Wykonaj PCR zgodnie z parametrami cyklicznymi, a następnie wygeneruj termiczne profile topnienia, używając parametrów wymienionych w manuskrypcie.

08:38

Ukierunkowana analiza metylacji DNA za pomocą sekwencjonowania nowej generacji

Powiązane filmy

0 Wyświetlenia

10:27

Metody zwiększania czułości genotypowania polimorfizmu pojedynczego nukleotydu topniejącego w wysokiej rozdzielczości w malarii

Powiązane filmy

0 Wyświetlenia

08:54

Opracowywanie i testowanie specyficznych dla gatunku ilościowych testów PCR do zastosowań środowiskowych DNA

Powiązane filmy

0 Wyświetlenia

09:02

Szybkie termocyklowanie PCR z wykorzystaniem mikroskalowej konwekcji termicznej

Powiązane filmy

0 Wyświetlenia

09:00

Reakcja łańcuchowa polimerazy: podstawowy protokół oraz strategie rozwiązywania problemów i optymalizacji

Powiązane filmy

0 Wyświetlenia

04:09

PCR z topnieniem w wysokiej rozdzielczości w celu określenia zmian sekwencji w zmutowanych sekwencjach DNA

Powiązane filmy

0 Wyświetlenia

11:27

Badanie pętli DNA za pomocą pojedynczej cząsteczki FRET

Powiązane filmy

0 Wyświetlenia

08:00

Nanorurki DNA jako wszechstronne narzędzie do badania polimerów półelastycznych

Powiązane filmy

0 Wyświetlenia

13:10

Wykorzystanie pierwiastka aluminiowego zawierającego minigeny do analizy kolistych RNA

Powiązane filmy

0 Wyświetlenia

09:51

Oczyszczanie białka o wysokiej masie cząsteczkowej w Streptococcus mutans

Powiązane filmy

0 Wyświetlenia

Ostatnia aktualizacja: 29 sierpnia 2026