$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
CD95 ― receptor śmierci ― wiąże się ze swoimi agonistycznymi przeciwciałami, wywołując tworzenie wywołującego śmierć kompleksu sygnalizacyjnego lub DISC ― wielobiałkowego kompleksu, który rekrutuje prokaspazę 8. W DISC prokaspaza 8 dimeryzuje i przetwarza się, tworząc różne pośrednie produkty rozszczepienia, a na końcu aktywną formę, która inicjuje apoptozę.
Aby przeanalizować przetwarzanie kaspazy-ósemki za pomocą chemiluminescencyjnego western blot, należy pobrać lizat zawierający pośrednie produkty rozszczepienia kaspazy 8 związane z DISC w probówce. Uzupełnij to białkiem A-agarozy o przeciwciała anty-CD95 wychwycone przez kulki A. Przeciwciała anty-CD95 wiążą się ze składnikiem DISC ― CD95, tworząc kompleksy białkowe.
Załaduj próbkę na żel poliakryloamidowy SDS, aby oddzielić różnej wielkości immunoprecypitowane produkty pośrednie kaspazy 8 jako odrębne prążki. Umieść żel na membranie bibułkowej i przyłóż prąd elektryczny. Półprodukty kaspazy 8 wydostają się z żelu na błonę bibułową.
Potraktuj błonę roztworem zawierającym białko blokujące, aby nasycić miejsca wiązania białek ― zapobiegając niespecyficznym wiązaniom.
Dodaj roztwór przeciwciał pierwszorzędowych, które wiążą się z produktami kaspazy-ośmiu w określonym miejscu.
Dodaj znakowane enzymatycznie przeciwciała drugorzędowe, które specyficznie wiążą się z komplementarnym regionem Fc przeciwciała pierwszorzędowego, tworząc kompleks kaspazy-ósemki-produktu rozszczepienia ósemkowego-pierwotnego przeciwciała-przeciwciała drugorzędowego.
Dodaj substrat chemiluminescencyjny, który reaguje z drugorzędowym enzymem sprzężonym z przeciwciałami i emituje światło. Natężenie emitowanego światła koreluje z ilością produktu rozszczepienia kaspazy-ósemki.
Aby wykonać western blot, dodaj 20 mikrolitrów bufora ładującego 4X do kulek i podgrzewaj w temperaturze 95 stopni Celsjusza przez 10 minut. Jednocześnie podgrzewaj kontrole lizatu w temperaturze 95 stopni Celsjusza przez 5 minut. Załaduj lizaty, immunoprecypitanty i wzorzec białkowy do 12,5% żelu SDS i pracuj ze stałym napięciem 80 woltów.
Po zakończeniu przebiegu żelu przenieś białka z żelu SDS do membrany nitrocelulozowej. Po zakończeniu transferu umieścić osuszoną błonę w pudełku i inkubować ją przez godzinę w roztworze blokującym, pod delikatnym mieszaniem. Następnie umyj membranę trzy razy przez 5 minut PBST.
Aby wykryć białka, dodaj pierwsze przeciwciało pierwszorzędowe we wskazanym rozcieńczeniu do błony i inkubuj je przez noc w temperaturze 4 stopni Celsjusza z delikatnym mieszaniem. Następnego dnia przemyj membranę trzema 5-minutowymi płukaniami PBST, a następnie inkubuj membranę z 20 mililitrami przeciwciała wtórnego, delikatnie wstrząsając przez 1 godzinę w temperaturze pokojowej.
Ponownie umyj membranę trzykrotnie PBST. Po odrzuceniu ostatniego płukania PBST dodaj około 1 mililitra substratu z nadtlenku chrzanu do membrany i wykryj sygnał chemoluminescencyjny.