Wykrywanie interakcji białko-białko u larw Drosophila za pomocą testu ligacji zbliżeniowej

0 wyświetleń3:08 min. • July 8th, 2025

Weźmy ścianę ciała larw Drosophila, składającą się z mięśni unerwionych przez neurony ruchowe w celu utworzenia połączeń nerwowo-mięśniowych lub NMJ.

Postsynaptyczna błona mięśniowa w NMJ zawiera oddziałujące białka związane z błoną, które są znakowane pierwszorzędowymi przeciwciałami.

Dodaj test ligacji zbliżeniowej lub PLA, sondy zawierające przeciwciała drugorzędowe sprzężone z jednoniciowymi oligonukleotydami. Inkubuj, aby sondy związały się z przeciwciałami pierwotnymi.

Zmyj wszelkie niezwiązane sondy.

Inkubować z buforem ligacyjnym zawierającym oligonukleotydy łącznikowe i enzymy ligazy.

Bliskość oddziałujących białek ułatwia wiązanie konektorów z sondami. Ligaza następnie uszczelnia luki, tworząc koliste DNA.

Zmyj wszystkie niezwiązane złącza.

Inkubować z roztworem amplifikacyjnym zawierającym polimerazę, która amplifikuje koliste DNA poprzez amplifikację toczącego się koła.

Detektor znakowany fluoroforem sonduje w roztworze wyżarzanie do amplifikowanego DNA, a po wzbudzeniu wytwarza sygnał fluorescencyjny.

Zamontuj ścianę ciała na szkiełku, aby uwidocznić fluorescencyjnie znakowane interakcje białko-białko w NMJ.

Aby rozpocząć test, dodaj do ścian ciała rozcieńczenie od 1 do 5 w co najmniej 200 mikrolitrach całkowitej objętości zarówno sondy PLA anty-mysiej minus, jak i sondy PLA anty-królika plus w 1% BSA. Inkubować przez dwie godziny w temperaturze 37 stopni Celsjusza.

Po użyciu buforu płuczącego A do dwukrotnego przemycia ścian ciała przez 5 minut każda, dodać rozcieńczenie ligazy od 1 do 40 w roztworze ligazy. Inkubować przez godzinę w temperaturze 37 stopni Celsjusza.

Po inkubacji użyć buforu A do przemywania ścian ciała dwa razy przez 2 minuty przed dodaniem rozcieńczenia polimerazy w ilości od 1 do 80 w roztworze amplifikacyjnym. Inkubować przez dwie godziny w temperaturze 37 stopni Celsjusza.

Aby przygotować próbki do obrazowania, należy użyć buforu B do przemywania ścian ciała dwukrotnie po 10 minut każde. Następnie użyj 100-krotnego rozcieńczenia buforu do mycia B, aby wykonać końcowe płukanie przez 1 minutę. Równoważ ściany ciała w kilku kroplach roztworu montażowego przez co najmniej 30 minut.

Za pomocą cienkich kleszczyków ostrożnie przenieś ściany ciała na zjeżdżalnię platformową ze skórkami skierowanymi w dół. Ustaw je w rzędach w tej samej orientacji w odległości jednej lub dwóch kropli od roztworu montażowego. Na preparacie należy nałożyć szkiełko nakrywkowe o wymiarach 22 milimetry na 40 milimetrów, uważając, aby nie wytworzyć pęcherzyków powietrza. Następnie użyj przezroczystego lakieru do paznokci, aby uszczelnić szkiełko.