Wykrywanie modyfikacji histonów w komórkach drożdży z nadekspresją białek neurodegeneracyjnych

0 wyświetleń5:16 min • April 28th, 2025

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Zacznij od zawiesiny białek z nadekspresją komórek drożdży związanych z chorobami neurodegeneracyjnymi.

To nadekspresja białka jest odpowiedzialne za modyfikacje w białkach upakowujących DNA lub histonach z chemicznymi ugrupowaniami.

Dodaj wodorotlenek sodu i beta-merkaptoetanol, a następnie inkubuj na lodzie.

Wodorotlenek sodu i beta-merkaptoetanol powodują lizę komórek, uwalniając białka wewnątrzkomórkowe, w tym histony.

Odwiruj lizat, aby zebrać białka. Odrzucić supernatant.

Dodaj barwnik ładujący do granulek białka i podgrzej go, aby je zdenaturować.

Załaduj te zdenaturowane białka i marker białkowy na żel i elektroforę, aby oddzielić je według rozmiaru.

Elektrotransferuj białka na membranę, umyj i dodaj bufor blokujący, aby zapobiec niespecyficznemu wiązaniu.

Dodaj przeciwciała pierwszorzędowe, które specyficznie wiążą się ze zmodyfikowanymi histonami.

Umyj w celu usunięcia niezwiązanych przeciwciał i inkubuj z fluorescencyjnymi przeciwciałami drugorzędowymi, które wiążą się z przeciwciałami pierwszorzędowymi.

Wyraźny fluorescencyjny pas potwierdza modyfikacje histonów, wskazując na nadekspresję białek neurodegeneracyjnych.

Aby zlizować komórki do analizy western blot, rozmrozić granulki komórek drożdży na lodzie przed ponownym zawieszeniem w 100 mikrolitrach wody destylowanej. Dodaj 300 mikrolitrów 0,2-molowego wodorotlenku sodu i 20 mikrolitrów 2-merkaptoetanolu do każdej próbki komórki. I ponownie zawiesić granulki przez pipetowanie.

Po 10-minutowej inkubacji na lodzie otocz komórki przez odwirowanie i ponownie zawieś próbki w 100 mikrolitrach barwnika ładującego. Następnie gotuj próbki przez 10 minut na bloku grzewczym. Podczas lizy próbek umieść dwa żele w uchwycie na żel i napełnij wewnętrzną komorę do góry buforem do pracy, a komorę zewnętrzną do znaku linii dwóch żeli.

Gdy próbki są gotowe, załaduj 15 mikrolitrów każdego roztworu do lizy komórek do każdej studzienki 10-dołkowego 12% żelu poliakryloamidowego i dodaj 5 mikrolitrów drabinki białkowej do dołka drabinki białkowej. Uruchom żel na około 45 minut przy napięciu 150 V lub do momentu, gdy przód barwnika dotknie dna żelu.

Podczas pracy żelu namocz dwie wkładki włókniste na żel w buforze transferowym i jedną membranę z polifluorku winylidenu lub PVDF na żel w metanolu. Gdy żel będzie gotowy, przepłukać membranę i przenieść bufor. I umieść jedną wstępnie nasączoną podkładkę z włókna na dnie półsuchej komórki aparatu transferowego, a następnie membranę PVDF, żel i drugą wstępnie nasączoną podkładkę z włókna.

Następnie ustaw moc na 150 miliamperów na 1 godzinę. Pod koniec transferu białka zdjąć membranę z aparatu transferowego w celu krótkiego spłukania wodą destylowaną. Umieść przepłukaną stronę z białka błonowego do góry w małym pudełku do barwienia i przykryj membranę solą fizjologiczną buforowaną Tris lub buforem blokującym TBS na 1 godzinę inkubacji w temperaturze pokojowej z delikatnym kołysaniem.

Pod koniec inkubacji blokującej inkubować błonę przez noc z histonem przeciwdrożdżowym i specyficznym przeciwciałem modyfikującym w TBS w temperaturze 4 stopni Celsjusza oraz odpowiednim przeciwciałem kontrolującym obciążenie jądrowe.

Następnego ranka umyj membranę cztery razy w TBS, uzupełnionym 0,1% polisorbatem 20 przez pięć minut z kołysaniem w temperaturze pokojowej na pranie. Po ostatnim płukaniu inkubować blot z odpowiednimi przeciwciałami drugorzędowymi przez 1 godzinę w temperaturze pokojowej, a następnie cztery 5-minutowe płukanie w TBST i jedno pięciominutowe płukanie w TBS samo z kołysaniem.

Następnie zobrazuj plamę za pomocą fluorescencyjnego systemu obrazowania Western Blot przez 2 minuty.

09:43

Oczyszczanie białek histonów H3 i H4 oraz oznaczanie ilościowe acetylowanych śladów histonów w komórkach i tkance mózgowej

Powiązane filmy

0 Wyświetlenia

09:11

Testy do walidacji inhibitorów acetylotransferazy histonowej

Powiązane filmy

0 Wyświetlenia

05:52

Badania przesiewowe modyfikacji histonów przy użyciu chromatografii cieczowej, spektrometrii ruchliwości uwięzionych jonów i spektrometrii mas czasu przelotu

Powiązane filmy

0 Wyświetlenia

09:06

Testy wzrostu do oceny toksyczności poliglutaminy w drożdżach

Powiązane filmy

0 Wyświetlenia

08:44

Izolowanie wzmocnionych wariantów Hsp104 przy użyciu modeli proteinopatii drożdżowej

Powiązane filmy

0 Wyświetlenia

12:28

Technika oczyszczania białek pozwalająca na wykrycie sumoilacji i ubikwitynacji pączkujących białek kinetochoru drożdży Ndc10 i Ndc80

Powiązane filmy

0 Wyświetlenia

08:48

Ukierunkowana mutageneza in situ genów histonów u pączkujących drożdży

Powiązane filmy

0 Wyświetlenia

08:12

Wysokoprzepustowe badania przesiewowe w kierunku dziedziczenia na podstawie białek u S. cerevisiae

Powiązane filmy

0 Wyświetlenia

11:06

Immunoprecypitacja chromatyny (ChIP) modyfikacji histonów z Saccharomyces cerevisiae

Powiązane filmy

0 Wyświetlenia

11:04

Ocena wpływu agregacji białek na komórkowy stres oksydacyjny u drożdży

Powiązane filmy

0 Wyświetlenia

Ostatnia aktualizacja: 22 sierpnia 2026