JoVE Encyclopedia of Experiments
Neuronauka
0 wyświetleń • 5:16 min • April 28th, 2025
Zacznij od zawiesiny białek z nadekspresją komórek drożdży związanych z chorobami neurodegeneracyjnymi.
To nadekspresja białka jest odpowiedzialne za modyfikacje w białkach upakowujących DNA lub histonach z chemicznymi ugrupowaniami.
Dodaj wodorotlenek sodu i beta-merkaptoetanol, a następnie inkubuj na lodzie.
Wodorotlenek sodu i beta-merkaptoetanol powodują lizę komórek, uwalniając białka wewnątrzkomórkowe, w tym histony.
Odwiruj lizat, aby zebrać białka. Odrzucić supernatant.
Dodaj barwnik ładujący do granulek białka i podgrzej go, aby je zdenaturować.
Załaduj te zdenaturowane białka i marker białkowy na żel i elektroforę, aby oddzielić je według rozmiaru.
Elektrotransferuj białka na membranę, umyj i dodaj bufor blokujący, aby zapobiec niespecyficznemu wiązaniu.
Dodaj przeciwciała pierwszorzędowe, które specyficznie wiążą się ze zmodyfikowanymi histonami.
Umyj w celu usunięcia niezwiązanych przeciwciał i inkubuj z fluorescencyjnymi przeciwciałami drugorzędowymi, które wiążą się z przeciwciałami pierwszorzędowymi.
Wyraźny fluorescencyjny pas potwierdza modyfikacje histonów, wskazując na nadekspresję białek neurodegeneracyjnych.
Aby zlizować komórki do analizy western blot, rozmrozić granulki komórek drożdży na lodzie przed ponownym zawieszeniem w 100 mikrolitrach wody destylowanej. Dodaj 300 mikrolitrów 0,2-molowego wodorotlenku sodu i 20 mikrolitrów 2-merkaptoetanolu do każdej próbki komórki. I ponownie zawiesić granulki przez pipetowanie.
Po 10-minutowej inkubacji na lodzie otocz komórki przez odwirowanie i ponownie zawieś próbki w 100 mikrolitrach barwnika ładującego. Następnie gotuj próbki przez 10 minut na bloku grzewczym. Podczas lizy próbek umieść dwa żele w uchwycie na żel i napełnij wewnętrzną komorę do góry buforem do pracy, a komorę zewnętrzną do znaku linii dwóch żeli.
Gdy próbki są gotowe, załaduj 15 mikrolitrów każdego roztworu do lizy komórek do każdej studzienki 10-dołkowego 12% żelu poliakryloamidowego i dodaj 5 mikrolitrów drabinki białkowej do dołka drabinki białkowej. Uruchom żel na około 45 minut przy napięciu 150 V lub do momentu, gdy przód barwnika dotknie dna żelu.
Podczas pracy żelu namocz dwie wkładki włókniste na żel w buforze transferowym i jedną membranę z polifluorku winylidenu lub PVDF na żel w metanolu. Gdy żel będzie gotowy, przepłukać membranę i przenieść bufor. I umieść jedną wstępnie nasączoną podkładkę z włókna na dnie półsuchej komórki aparatu transferowego, a następnie membranę PVDF, żel i drugą wstępnie nasączoną podkładkę z włókna.
Następnie ustaw moc na 150 miliamperów na 1 godzinę. Pod koniec transferu białka zdjąć membranę z aparatu transferowego w celu krótkiego spłukania wodą destylowaną. Umieść przepłukaną stronę z białka błonowego do góry w małym pudełku do barwienia i przykryj membranę solą fizjologiczną buforowaną Tris lub buforem blokującym TBS na 1 godzinę inkubacji w temperaturze pokojowej z delikatnym kołysaniem.
Pod koniec inkubacji blokującej inkubować błonę przez noc z histonem przeciwdrożdżowym i specyficznym przeciwciałem modyfikującym w TBS w temperaturze 4 stopni Celsjusza oraz odpowiednim przeciwciałem kontrolującym obciążenie jądrowe.
Następnego ranka umyj membranę cztery razy w TBS, uzupełnionym 0,1% polisorbatem 20 przez pięć minut z kołysaniem w temperaturze pokojowej na pranie. Po ostatnim płukaniu inkubować blot z odpowiednimi przeciwciałami drugorzędowymi przez 1 godzinę w temperaturze pokojowej, a następnie cztery 5-minutowe płukanie w TBST i jedno pięciominutowe płukanie w TBS samo z kołysaniem.
Następnie zobrazuj plamę za pomocą fluorescencyjnego systemu obrazowania Western Blot przez 2 minuty.
Niniejsze badanie przedstawia protokół analizy modyfikacji histonów w komórkach drożdży wykazujących nadekspresję białek związanych z chorobami neurodegeneracyjnymi. Metoda obejmuje lizę komórek, rozdział białek za pomocą elektroforezy oraz detekcję z wykorzystaniem specyficznych przeciwciał.
Ilościowe wykrywanie modyfikacji histonów w modelach drożdżowych z nadekspresją białek neurodegeneracyjnych umożliwia mechanistyczną redukcję ryzyka na styku epigenetyki i proteinopatii. Niniejszy schemat doświadczalny wspiera wczesny etap walidacji celów terapeutycznych poprzez powiązanie nadekspresji białek ze zmianami stanu chromatyny, co pozwala na określenie wiarygodności predykcyjnej dla szlaków istotnych w procesach neurodegeneracji. Podejście to stanowi powtarzalną platformę do badania mechanizmów chorobowych i priorytetyzacji celów w portfelach badawczych skoncentrowanych na neurobiologii.
Metoda ta wpisuje się w ciąg procesu badawczego, od wczesnych studiów mechanistycznych po przedkliniczną priorytetyzację celów w badaniach nad neurodegeneracją.
Powiązane filmy
0 Wyświetlenia
Powiązane filmy
0 Wyświetlenia
Powiązane filmy
0 Wyświetlenia
Powiązane filmy
0 Wyświetlenia
Powiązane filmy
0 Wyświetlenia
Powiązane filmy
0 Wyświetlenia
Powiązane filmy
0 Wyświetlenia
Powiązane filmy
0 Wyświetlenia
Powiązane filmy
0 Wyświetlenia
Powiązane filmy
0 Wyświetlenia
Ostatnia aktualizacja: 22 sierpnia 2026