JoVE Encyclopedia of Experiments
Neuronauka
0 wyświetleń • 3:38 min • May 29th, 2025
Zacznij od mózgowego przepływu krwi lub mapy CBF wygenerowanej przez obrazowanie metodą rezonansu magnetycznego i znakowanie wirowania tętnic, nieinwazyjną metodę pomiaru przepływu krwi w tkance mózgowej.
Uzyskaj strukturalny obraz mózgu i, korzystając z narzędzi obliczeniowych, podziel obszary mózgu na obszary funkcjonalne.
Generuj widoki trójpłaszczyznowe, pokazujące przekrojowe obrazy mózgu w trzech płaszczyznach, przy czym każdy podzielony na segmenty region jest wyświetlany w odrębnych kolorach reprezentujących obszary funkcjonalne.
Zintegruj dane CBF z podzielonymi na segmenty regionami, aby zmapować wartości przepływu krwi do określonych obszarów mózgu.
Jasne kolory wskazują na wysoki przepływ krwi, podczas gdy ciepłe odcienie reprezentują niski poziom.
Użyj algorytmów do przetworzenia danych CBF i stwórz atlas do porównywania poziomów przepływu krwi w różnych regionach mózgu.
Zmienna czerwona linia podkreśla średni CBF we wszystkich regionach, określając ilościowo przepływ krwi.
Kolory atlasu odpowiadają kolorowemu paskowi i reprezentują prawdopodobieństwo poziomu przepływu krwi w określonych obszarach mózgu - czerwony oznacza wysokie prawdopodobieństwo, a niebieski oznacza niskie prawdopodobieństwo.
Aby rozpocząć, uzyskaj dane pacjenta w formacie Neuroimaging Informatics Technology Initiative lub NIFTI. W dostosowanym katalogu roboczym przejdź do katalogu, w którym znajdują się dane w bieżącym katalogu roboczym MATLAB, a następnie za pomocą funkcji odczytu NIFTI załaduj do obszaru roboczego odzyskiwanie inwersji tłumionej płynem lub FLAIR. Za pomocą tej funkcji rozmiaru sprawdź wymiary sekwencji FLAIR. Następnie wywołaj polecenie FLAIR slice, aby wyświetlić sekwencję FLAIR mózgu.
Korzystając z dolnego paska przewijania, przeglądaj różne sekwencje. Następnie podobnie załaduj i oceń mózgowy przepływ krwi lub sekwencje CBF. W obszarze roboczym wywołaj funkcję segmentu FLAIR i uruchom wstępnie wytrenowany program do segmentacji obrazów oparty na sieci 3D U-Net, aby automatycznie wygenerować trójpłaszczyznowe widoki segmentacji obszarów funkcjonalnych mózgu.
Każdy kolor reprezentuje odrębny region funkcjonalny. Aby przeprowadzić inspekcję w czasie rzeczywistym różnych obszarów funkcjonalnych mózgu, kliknij i przeciągnij środek celownika, aby przeprowadzić dowolne badanie 3D zrekonstruowanej anatomii mózgu. Naciśnij i przeciągnij lewym przyciskiem myszy nad dowolnym obszarem obrazów, aby modyfikować poziomy jasności i kontrastu w czasie rzeczywistym. Zwolnij przycisk myszy, aby potwierdzić i sfinalizować regulacje.
Wywołaj funkcję trójpłaszczyznową CBF, aby wygenerować trójpłaszczyznowy graficzny widok interfejsu użytkownika, wyświetlający rozkład przestrzenny CBF w regionach funkcjonalnych. Przesuń celownik, aby umożliwić zbadanie rozkładów CBF w obszarach zainteresowania. Następnie kliknij przycisk Wskazówki dotyczące danych w prawym górnym rogu interfejsu, aby wyświetlić wartości CBF w dowolnej pozycji.
Naciśnij i przeciągnij lewym przyciskiem myszy nad dowolnym obszarem obrazów, aby modyfikować poziomy jasności i kontrastu w czasie rzeczywistym. Zwolnij przycisk myszy, aby potwierdzić i sfinalizować regulacje. Uruchom funkcję CBF Atlas, aby przekonwertować rozkład przestrzenny CBF na atlas CBF. Kliknij przycisk Powiększ/pomniejszaj w prawym górnym rogu interfejsu.
W niniejszym artykule opisano metodę wizualizacji mózgowego przepływu krwi (CBF) z wykorzystaniem obrazowania rezonansem magnetycznym z etykietowaniem spinowym krwi tętniczej. Podejście to integruje strukturalne obrazowanie mózgu z segmentacją obliczeniową w celu zmapowania przepływu krwi w obrębie funkcjonalnych obszarów mózgu.
Metoda ta umożliwia ilościowe mapowanie przepływu krwi w mózgu w obrębie funkcjonalnie zdefiniowanych regionów, wspierając walidację celów w procesie odkrywania leków ukierunkowanych na OUN poprzez powiązanie odpowiedzi hemodynamicznych z wzorcami aktywności neuronalnej. Podejście oparte na atlasie zwiększa pewność prognostyczną w modelach przedklinicznych, dostarczając powtarzalnych, specyficznych dla regionu odczytów hemodynamicznych, które mogą posłużyć do ograniczania ryzyka w hipotezach mechanistycznych. Ułatwia ono ciągłość translacyjną od etapu odkrywania do badań przedklinicznych poprzez standaryzację pomiarów przepływu krwi w różnych warunkach eksperymentalnych.
Metoda ta wpisuje się w kontinuum procesu odkrywania – od wczesnego testowania hipotez dotyczących celu po walidację przedkliniczną, w której ilościowe dane hemodynamiczne stanowią podstawę do podejmowania decyzji o kontynuowaniu lub przerwaniu badań.
Powiązane filmy
0 Wyświetlenia
Powiązane filmy
0 Wyświetlenia
Powiązane filmy
0 Wyświetlenia
Powiązane filmy
0 Wyświetlenia
Powiązane filmy
0 Wyświetlenia
Powiązane filmy
0 Wyświetlenia
Powiązane filmy
0 Wyświetlenia
Powiązane filmy
0 Wyświetlenia
Powiązane filmy
0 Wyświetlenia
Powiązane filmy
0 Wyświetlenia
Ostatnia aktualizacja: 22 sierpnia 2026