10 października 2019
Ta metoda polega na wykorzystaniu klinicznych danych diagnostycznych dla pacjentów z rakiem prostaty w celu kierowania procedurami pobierania próbek podczas biobankowania tkanek po radykalnej prostatektomii. Pozwala to przezwyciężyć problemy z wcześniej opublikowanymi metodami dotyczącymi wydajności i dostępności świeżej tkanki dla szerszego zakresu dalszych zastosowań.
Znaczenie tego protokołu w porównaniu z poprzednimi metodami pobierania próbek prostaty polega na tym, że daje nam większą pewność celowania w świeżą tkankę nowotworową do badań. Dlatego możemy zabrać świeżą tkankę prosto z powrotem do laboratorium i użyć jej do hodowli lub obrazowania, ponieważ mamy dużą pewność, które próbki są nowotworem, a które są łagodne. Moją kluczową radą podczas nauki tej techniki jest współpraca z lokalnym patologiem, aby ostateczna diagnoza tkankowa i raport nie były zagrożone.
Aby celować w lokalizację guza, przejrzyj obrazy MRI, aby zmierzyć lokalizację nad guzem i znaleźć sekwencję, w której guz jest najbardziej widoczny w płaszczyźnie osiowej. Przewiń obrazy osiowe, aby zidentyfikować obraz, na którym guz jest największy i wydrukuj obraz w celach informacyjnych. Na odpowiednim obrazie koronalnym zmierz odległość od podstawy prostaty do wybranej pozycji osiowej i zmierz całą długość prostaty od wierzchołka do podstawy w milimetrach.
Następnie wydrukuj te pomiary i zaznacz lokalizacje guza w celach informacyjnych. Po pobraniu próbki wysterylizuj okap z przepływem laminarnym i aparat do krojenia prostaty 70% etanolem i zważyć prostatę na standardowej skali w gramach. Następnie pomaluj prawą stronę niebieskim tuszem, a lewą stronę próbki czarnym tuszem, pokrywając tuszem całą kapsułkę i pęcherzyki nasienne, aby umożliwić rozróżnienie marginesów chirurgicznych.
Aby przeciąć prostatę, umieść tkankę tak, aby podstawa i wierzchołek były skierowane w przeciwległe ściany aparatu, tylną stroną w dół i przednią stroną do góry. Umieść złote szpilki wokół próbki tkanki, lekko popychając prostatę do wewnątrz, jeśli to konieczne, aby uzyskać dokładne dopasowanie, i zmierz długość prostaty od podstawy do wierzchołka, aby porównać ten pomiar z długością prostaty mierzoną za pomocą MRI. Jeśli prostata się skurczyła, dostosuj przewidywaną pozycję krojenia o odpowiedni procent redukcji.
Następnie zmierz od podstawy do żądanego przekroju poprzecznego i wybierz szpilkę, która znajduje się najbliżej tego pomiaru, aby ją przeciąć. Zakładając rękawice z kolczugi, aby zapobiec obrażeniom, umieść ostrza urządzenia do krojenia po obu stronach zidentyfikowanej szpilki i użyj przekładki, aby utrzymać ostrza w odległości pięciu milimetrów od siebie. Aby uzyskać plasterek, użyj długich pociągnięć, aby powoli, ale stanowczo przesuwać ostrza w dół, do przodu i do tyłu, potwierdzając dotykiem, że cały plasterek został oddzielony przed demontażem urządzenia.
Następnie usuń ścianki i szpilki i użyj rękawiczek, aby ostrożnie przenieść plasterek na sterylny kawałek tablicy korkowej. Po pobraniu próbki należy przeprowadzić oględziny wycinka poprzecznego w celu porównania z osiowym obrazem MRI. W niektórych przypadkach obszar guza może wydawać się jaśniejszy niż otaczająca tkanka.
Delikatnie obmacuj poprzeczny plasterek. Guz może być twardszy niż otaczająca go tkanka. Korzystając z osiowego obrazu MRI jako przewodnika, wybierz jeden lub więcej obszarów do pobrania próbki i użyj sześciomilimetrowego stempla, aby docisnąć obszar tkanki będącej przedmiotem zainteresowania.
Przekręć stempel do tkanek w miejscu i w dół do korka, aby zapewnić pełne oddzielenie za pomocą ostrego skalpela, aby w razie potrzeby oddzielić próbkę z biopsji od próbki. Po pobraniu próbki należy wyjąć stempel i za pomocą tłoka wyrzucić próbkę do odpowiedniego pojemnika w celu przeprowadzenia dalszej analizy. Następnie namaluj na czerwono otwory, w których zostały wykonane stemple i zanotuj położenie każdego stempla wraz z wagą prostaty i wszelkimi uwagami dotyczącymi koloru i jędrności tkanki.
Przypnij kapsułkę prostaty do korka, aby zapobiec pękaniu podczas mocowania. Zanurz prostatę i korek w utrwalaczu, upewniając się, że próbka jest całkowicie zanurzona. W tej reprezentatywnej analizie, z pierwszych 92 przypadków, w których pobrano próbki, jak wykazano, 64% próbek zawierało co najmniej 40% guza i zostało zgłoszonych do Projektu 100 000 Genomów bez mikrodysekcji.
DNA zostało wyekstrahowane i we wszystkich przypadkach miało wystarczającą wydajność i jakość, a wstępny podzbiór 59 tych próbek został opublikowany w celu porównania z wcześniejszą metodą pobierania próbek. Po tej procedurze świeże próbki guza można wykorzystać do obrazowania na żywo lub hodowli, co pozwala nam przetestować nowe biomarkery, leki i dowiedzieć się więcej o biologii guza. Teraz, gdy rutynowo stosujemy tę metodę, udało mi się przedstawić projekt wykorzystujący tę tkankę do hodowli ex vivo, aby przyjrzeć się nowym kombinacjom przedklinicznych terapii raka prostaty.
Niniejszy protokół zwiększa efektywność pobierania próbek tkanek raka prostaty poprzez wykorzystanie danych diagnostyki klinicznej do naprowadzania procesu pobierania. Umożliwia on pozyskanie świeżej tkanki nowotworowej, która może być bezpośrednio wykorzystana w różnych dalszych zastosowaniach.
Celowane pobieranie próbek tkanki prostaty z wykorzystaniem danych z MRI i biopsji odpowiada na krytyczną potrzebę wysokiej pewności identyfikacji nowotworu w procesach biobankowania. Podejście to zwiększa pewność prognostyczną dla aplikacji w dalszych etapach, umożliwiając bardziej wiarygodne badania translacyjne oraz rozwój modeli przedklinicznych. Poprzez zwiększenie proporcji próbek bogatych w tkankę nowotworową, metoda ta wspiera solidne podejmowanie decyzji dotyczących portfela projektów oraz optymalizację ryzyka w rozwoju badań i rozwoju (R&D) w onkologii.
Ta metoda pobierania próbek pod kontrolą MRI i biopsji integruje etap pozyskiwania tkanek z późniejszą analizą molekularną, łącząc wczesną fazę odkryć z badaniami translacyjnymi i przedklinicznymi.