Multipleksowe obrazowanie immunofluorescencyjne oparte na kodach kreskowych DNA do analizy próbek FFPE z genetycznie przeprogramowanego mysiego czerniaka

Przedstawiamy protokół opracowania i walidacji multipleksowego panelu immunofluorescencyjnego do badania mysich tkanek FFPE i demonstrujemy jego użyteczność poprzez badanie próbek z modelu czerniaka traktowanego nanocząstkami dostarczającymi DNA osocza, kodujące sygnały immunologiczne do przeprogramowania mikrośrodowiska guza. W tej dziedzinie brakowało rygorystycznie opracowanych i zwalidowanych protokołów immunofluorescencji multipleksowych kompatybilnych z mysimi tkankami FFPE zatopionymi w parafinie utrwalonymi w formalinie.

Osadzanie parafiny utrwalonej formaliną zachowuje morfologię tkanek przez długi czas, jest łatwe w obsłudze i przechowywaniu oraz umożliwia tworzenie mikromacierzy tkankowych do oglądania wielu próbek na jednym szkiełku.