O ensaio consiste de monitorização de piranina fluorescência como uma função do tempo, enquanto um gradiente de protões é gerado. Para esse fim, as amostras são submetidas a iluminação alternativamente (daí bombear protões pela BR é desencadeada) e, em seguida, para medições de fluorescência utilizando excitação e emissão de comprimentos de onda de piranina (λ ex = 455 nm e λ em = 509 nm).
A Figura 1 mostra um controlo representativo obtidos com o ensaio, na ausência de mexa / MexB, verificando que o gradiente de protão gerado pela BR é reversível. Depois de um ciclo de acidificação, proteolipossomas são mantidos no escuro durante 45 minutos a fim de parar a BR para bombear protões (protões difundir lentamente e de forma passiva através de bicamadas lipídicas após o seu gradiente de concentração). Após este tempo de recuperação, a activação de BR é possível, simplesmente, iluminando a mesma suspensão novamente.
Figura 2corresponde a uma medição de transporte real. Um controle negativo com lipossomas livres de proteínas mostra que, como esperado, o pH é constante sobre iluminação (Figuras 2A e 2B, os círculos de laranja). No entanto, proteolipossomas contendo BR nas suas membranas não bomba de protões, assim, o pH dentro dos lipossomas diminui e um gradiente estável é construído (Figuras 2A e 2B, quadrados roxo). Triângulos cinza e diamantes vermelhos (Figura 2A) representam pH dentro de proteolipossomos contendo BR e MexB, na presença ou na ausência de Hoechst 33342, respectivamente. Observamos uma atividade independente do substrato onde o gradiente de prótons é apenas parcialmente dissipada por MexB contra-transporte. Atribuímos essa observação a uma atividade basal de MexB.
A fim de testar o efeito de mexa na actividade de MexB, mexa foi adicionado para a reconstituição, o primeiro na ausência de qualquer tipo de substrato ( Figura 2B, diamantes azuis). Mais uma vez, o gradiente de protão gerado pela BR é apenas parcialmente dissipada. A medição de transporte real é realizado no mesmo exemplo. Previamente, o gradiente de protões deve ser reinicializado e o substrato tem de ser adicionado à suspensão a fim de atingir o seu sítio de ligação na proteína. Para esse efeito, a suspensão foi incubada no escuro, na presença do substrato durante 45 minutos. Após a iluminação posterior, pode-se ver que o gradiente de prótons gerado pela BR está agora totalmente dissipada por MexAB (Figura 2B, triângulos verdes), como conseqüência do transporte de substrato pela bomba.

. Figura 1 Reversibilidade da gradiente de prótons construído pela iluminação BR: piranina fluorescência de proteolipossomos BR medidos em função do tempo. De 0-15 min, BR bombas de prótons como resultado da ativação de luz. De 15-60 min, proteolipossomas são incubados no escuro, durante este tempo, protões passivamente mova para fora dos lipossomas, até o pH intravesicular e pH extravesicular são iguais. De 60-75 min, BR ainda é funcional e bombas de prótons sobre iluminação.

. Figura 2 Transporte ensaio: piranina fluorescência, convertidos para os correspondentes variações de pH, em função do tempo A) pH dentro dos lipossomas de controlo (círculos laranja); pH dentro de proteolipossomas contendo BR na membrana (quadrados roxo), pH dentro. de proteolipossomas contendo BR, e MexB na membrana sem Hoechst 33342 (d vermelhoiamonds); pH dentro de proteolipossomos contendo BR e MexB na membrana com Hoechst 33342 (triângulos cinza) B) pH dentro de lipossomas de controle (círculos laranja);. pH dentro de proteolipossomos contendo BR na membrana (quadrados roxos); pH dentro de proteolipossomas contendo BR, MexB e mexa na membrana sem Hoechst 33342 (diamantes azuis); pH dentro de proteolipossomas contendo BR, MexB e mexa na membrana com Hoechst 33342 (triângulos verdes).