Além disso, para a análise de rede membrana TATS uma série de técnicas de biologia de células comumente usados como intracelular de Ca2 + imagem, patch-clamp eletrofisiologia, ou estudos de dose-resposta farmacológica dependem criticamente de alta qualidade de isolamento de células primárias dos átrios ou ventrículos ou selecione Peças de tecido cardíaco para permitir a caracterização de miócitos cardíacos intactas diferenciadas, estruturalmente e fisiológicas maduros. Assim, a avaliação de isolamento e de qualidade para as células AM e VM descritos na seção 1 são, em última análise útil para muitas questões diferentes, incluindo a análise de rede TATS aqui descrito, que depende fundamentalmente da membrana intacta e integridade celular.
A Figura 1 apresenta um manual passo a passo de imagens como proceder com a dissecção do tecido cardíaco começando com as câmaras atriais em coração mouse. Subsequentemente, as câmaras ventriculares e o septo é preparado umd dissecado conforme necessário. Seleção precisa e preparação das peças de tecidos corretos é importante estabelecer de forma confiável AM e VM isolamentos com pureza de células suficientes. Após a digestão de colagenase pode ser relativamente difícil de identificar a linha de esvaziamento correcto entre a fibrilação ventricular e tecido, mas uma vez que as células de AM e VM são misturados em suspensão de células não controlado, é impossível reverter a população celular mista. Portanto, a orientação anatômica, a visualização do tecido 3D, experiência suficiente com a manipulação de tecido digerido, a correta identificação das peças de tecidos específicos e suas linhas de dissecação irá contribuir para o sucesso do isolamento de células.

Figura 1.Dissection de tecido atrial. (A) virado para a parte anterior do coração, dois s cirúrgicosutures fixar a aorta proximal até o fim toco de uma cânula 21 G aço. (B) Vista para a base do coração mostra restantes tecido pulmonar obstruindo a visão da câmara atrial durante a dissecção. LA, átrio esquerdo; RA, átrio direito. (C) Restante lungtissue e grandes vasos foram removidos para aceder às câmaras atriais. Cheio triângulo preto, artéria pulmonar; triângulo estriado, veias pulmonares; preenchido triângulo branco, veia cava superior; triângulo em caixa, veia cava inferior. (D) Em primeiro lugar, a parede do átrio direito é dissecado enquanto a pinça segure o apêndice atrial. (E) Ver na cavidade direita câmara atrial. O triângulo preto marca o septo interatrial íntegro. (F) A dissecção é continuou a entrar na cavidade da câmara atrial esquerda. (G) Após a dissecção completa dos átrios direito e esquerdo, as válvulas atrioventriculares se tornam visíveis. O aparelho valvar fibroso é dissecado e descartado para subsequently colher apenas o tecido do músculo ventricular. vista (H) Posterior dos átrios direito e esquerdo isoladas. LA, átrio esquerdo; RA, barras atrium.Scale direita: 700 uM.
Para determinar a qualidade de isolamento de células, a Figura 2 apresenta exemplos típicos de células durante a avaliação do rendimento e a viabilidade de haste ou em forma de tijolo miócitos intactas estriados típico, tanto para AMs e MV. Pouco danificado, visualmente imperceptíveis, bem como células gravemente danificadas com morfologias anormais excessivamente curvos, em forma esférica ou de células anormais, podem ser facilmente identificados, incluindo a exclusão de azul de tripano, tal como descrito na secção 1.11. Enquanto miócitos intactas permanecem brilhantes e homogeneamente estriado quando expostos a tripan extracelular azul, células danificadas normalmente apresentam múltiplas bolhas de membrana e / ou acumular rapidamente dano à membrana intracelular indicando azul tripano. Contudo, o azul de tripano por si só, pode danificar as células por meio de unnecessarily longa incubação e avaliação imediata da qualidade celular é, portanto, obrigatório. Exemplos de formas mais óbvias de danos celulares como contratura miofilamentos ou danos na superfície comprometer a integridade celular bruto são mostrados nas Figuras 4C e 4D. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2. Trypan coloração de células de exclusão de azul. Isolado (A) e células SOU (B) VM são misturados em suspensão com azul de tripano e visualizadas em microscópio de luz invertida mostrado na 40Xmagnification. Nota thatabnormal células esféricas em (A) e (B), tendo-se azul de tripan, que indicatesmembrane leakage e danos estruturais. Em contraste, as células centralAM e VM com membranas intactas excluir azul de tripano como mostrado. Além disso, note que AM intacto e células VM apresentam estrias sarcômero em todo o seu volume celular, bolhas nomembrane e bordas afiadas nas duas faces laterais e os dois discos intercalares. Barras de escala: 20 ^ m.
Após rendimentos isolamento, celulares bem sucedidas de VMs a partir de 5 x 10 maio - 10 junho pode ser esperado de um único digestão coração mouse. O rendimento de MAs é significativamente inferior na ordem de 3 x 03-3 outubro 4 x 10 em forma de haste, com exclusão do azul de tripano de células. Em contraste com a VM, SOU isolamentos ocasionalmente falhar, mesmo em mãos experientes. Passo 1.11 resume os procedimentos como estimar o rendimento de células isoladas saudáveis em suspensão. Adicionalmente, determinar as dimensões médias de célula através passo 1.13, como mostrado na Figura 3 para AM individuais ou isolados de células VM ou para comparar AM contra populações de células VM side-by-side (quando necessário). Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3.Bright análise de campo de morfometria de miócitos cardíacos. Contorno A VM foi detectado pelas ferramentas de análise de imagem descritos no passo 1.13. Use a ferramenta de seleção polígono para marcar visualmente e definir a fronteira extracelular de células definido pela membrana superfície externa para análise. Anúncio da região selecionada de interesse (ROI) com o gerente de ROI seguido por medidas de distância 1D. Para os estudos comparativos de AM versus dimensões VM, é útil para documentar o comprimento da célula, a largura, e a área, e para calcular a relação comprimento: largura.
nt "> Para membranas fluorescente Tats mancha, quer em células de AM ou de VM, o corante de membrana integral di-8-ANEPPS é utilizado tal como descrito na secção
2, seguido por microscopia confocal, o que resultou nas imagens representativas de redes Tats mostrados nas
Figuras 4A e
4B. Além disso,
a Figura 4A mostra a correspondente imagem transmitida luz de um AM intacta lado-a-lado da imagem confocal com TATS (para aquisição de imagem ver secção
3). Conforme descrito por passo
1.12, a integridade da membrana e a superfície morfológica de vida miócitos é julgado por meio das imagens de luz transmitida. A região ampliada do sinal di-8-ANEPPS destaca a morfologia da rede subjacente TATS em AMs, caracterizado por axiais abundante (longitudinais) de membranas tubulares. Em contraste, a morfologia de TATS saudável VMs como mostrado na
Figura 4B é caracterizada por números semelhantes de aproximadamente um axiald componentes transversais. Em contraste,
as Figuras 4C e
4D mostram exemplos de miócitos cardíacos danificados que devem ser excluídos da análise posterior. Em particular, a célula de AM na
Figura 4C é contraída, como evidenciado por um comprimento sarcómero anormalmente curto de 1,2 um e uma rede TATS irregular, ao passo que a célula distorcida VM na
Figura 4D apresenta várias bolhas de membrana (cerca de destaque por triângulos vermelhos) indicando rupturas de membranas , que pode ocorrer na superfície externa da membrana, mas também nas membranas tatuagens.
Clique aqui para ver uma versão maior desta figura. 
Coloração da membrana Figura 4.Live de fibrilação ventricular e mio intactacitos. correspondentes transmitidos luz e imagens confocal de vida di-8-ANEPPS manchado intacto (A) AM e células (B) da VM. Em contraste, um PM parcialmente contraído e potencialmente danificados com um comprimento de 1,2 um sarcómero é mostrado em (C). Miócitos contratadas normalmente mostram anormalmente encurtados e estruturas Tats distorcidas, portanto, excluídos da análise posterior. Outro indicador importante para os defeitos da membrana celular são bolhas de membrana (triângulos vermelhos) como mostrado em uma máquina virtual em (D). Bolhas de membrana representam estruturas de membrana de superfície danificadas e células com bolhas devem ser excluídos da análise posterior TATS. Além disso, o VM mostra dano bruto aparentemente faltando uma parte inteira de sua porção inferior esquerda (marcado com asterisco). Em resumo, por meio da comparação da luz transmitida e imagens confocais, células de morfologia e intacto superfície é documentada e combinadas com a informação do sinal fluorescente. Marcas 'N' nuclei omitidos da análise da mancha da membrana TATS. Barras amarelas indicam ampliada ROIs da mesma imagem confocal apresentado acima. Barras de escala:. 10 m Por favor, clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Imagens confocais de membranas Tats com uma relação sinal-para-ruído suficiente, como mostrado nas Figuras 4A e 4B são aceites para análise quantitativa. A análise da membrana TATS baseia-se em dados obtidos a partir de skeletonized os componentes de sinal rectilíneos fluorescentes. Figura 5 mostra o diagrama de fluxo dos passos de processamento de imagem, que são descritos em detalhe por passos 4,3 a 4,5. Estes passos produzir imagens que representam skeletonized TATS rectilíneas redes de membrana, como mostrado para cada isolado VM (Figura 5A) e AM células (Fifigura 5B).

Figura 5.Workflow para esqueletizações de imagens fluorescentes Tats. Etapas de processamento de imagem, que levam a uma imagem esqueletonizada da rede estão representados por TATS exemplos individuais passo-a-passo da imagem, tanto a um di-8-ANEPPS coradas VM (A) e AM (B). Para a etapa de processamento de imagem individual, por favor, consulte a secção 4. Nota diferenças na barra de escala:. 20Hm (A) e 10 um (B) Por favor, clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Um passo crítico durante o processamento de imagem, determinar o limiar apropriado para binarização dados como descrito na seção 4.5.6. A imagem binária resultante deve incluir apenas sinais de membrana verdadeiros da rede TATS mas não falsas estruturas derivadas por thresholding errônea do barulho sinal de fundo. No entanto, é importante que o limite é baixo o suficiente para detectar todas as estruturas Tats verdadeiros componentes de tal modo que não são verdadeiros Tats erroneamente perdidos durante a análise de imagem. Figura 6 ilustra o processo como para seleccionar o limiar durante binarizao de dados. Enquanto um valor de 40, como mostrado nas Figuras 6B e 6C parece adequado para detectar todas as estruturas Tats verdadeiros individualmente, a escolha de um limite superior, por exemplo, de 60, como mostrado na Figura 6A não detecta mais fracas estruturas de membrana axial (ATS), tal como indicado por triângulos amarelos . Em contraste, a escolha de um limite inferior, por exemplo, de 20, como mostrado na Figura 6D conduz a detecção errónea de ruído de fundo estruturas tats como falsos-positivos, tal como indicado pelatriângulos amarelos.

Figura 6.How para determinar o limiar do sinal durante skeletonizing de dados de imagem Tats. Os exemplos mostram esqueletos Tats cada gerados para diferentes limites durante a binarizao de dados (descritos no passo 4.5). Imagens Superior: mostrar os ajustes de limite usando Fiji. Menores de imagens: sobreposição de imagens esqueletizadas a imagem de fluorescência de entrada correspondente com e regiões ampliadas, conforme indicado. Um exemplo de limiar elevado, 60 aplicado em (A) não é aparentemente adequado para detectar todas as estruturas Tats verdadeiros, tal como indicado por triângulos amarelas na secção ampliada. Um limiar de 40 aplicado em (B) e (C) detectar todas as estruturas e tats correctamente não detecta o ruído de fundo, enquanto que um baixo limiar eg., 20 em (D) erroneamente identifica o ruído de fundo como estruturas de tatuagens e, assim, produz sinais de falso-positivos de estruturas de membrana não-existentes. Sinais de falso-positivos são indicados por triângulos amarelos na inserção ampliada. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
O "Analisar Skeleton (2D / 3D)" plugin suporta a análise detalhada das estruturas Tats esqueletizadas. Uma vez executado, o plugin produz uma tabela de dados com os seguintes parâmetros: esqueleto #branches, #junctions, # ponto final de voxels, a duração média do ramo, pontos #triple, pontos #quadruple e comprimento máximo de ramo. Para uma descrição detalhada de todos os parâmetros de saída possíveis consulte tohttp: //fiji.sc/wiki/index.php/AnalyzeSkeleton e artigos relacionados 29-31. Uma tabela típica de saída de dados é mostrado na Figura 7A.
Comprimento esqueleto total por ROI:
Σ (#branches x comprimento ramo média) = 5155 px = 515,5 uM
O comprimento total do esqueleto pode ser normalizada para a área da imagem. Para o exemplo mostrado na Figura 7, o comprimento normalizado de esqueleto 0.64μm / mM 2 e a soma de todas as junções são calculados como se mostra abaixo:
Normalizado comprimento esqueleto:
515,5 um / 803,6 mM 2 = 0,64 um / mM 2
Número normalizado de junções:
155 junções / 803,6 mM 2 2

Figura saída de dados a partir de imagens 7.Automated esqueletizadas. (A) uma folha de cálculo de dados típico gerado pela 'Analise esqueleto (2D / 3D)' de encaixe a partir da imagem esqueletonizada mostrado em (B). Para uma descrição detalhada de possíveis parâmetros de saída, consulte http://fiji.sc/wiki/index.php/AnalyzeSkeleton . Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
As etapas de processamento de imagem descritos em 4.5 e ilustrados na Figura 5 pode ser automatizada usando uma macro Fiji fornecida como ficheiro de código complementar 4.3 e 4.4. A macro pode ser vantajoso para a análise do conjunto de dados de grupos completos, por exemplo através da preparação de pilhas de imagens de entrada individuais para cada grupo de tratamento independente para análise automatizada usando os comandos de macro.
A estratégia delineada software permite ainda a análise de orientação rede TATS para todos os componentes. Para isso, use o "direcionalidade" plugin (http://fiji.sc/Directionality) 29,31 que produz dados de histograma mostrando a distribuição de orientação de todos os TATS orientações de componentes. Se o eixo x da imagem de entrada corresponde ao eixo principal de uma dada célula ou AM VM, axial (longitudinais) Tats componentes será representada por a 0 ° caixa, ao passo que os componentes transversais serão representados pela 90 &# 176; bin. figura 8 mostra direcionalidade exemplar histogramas de imagens Tats esqueletizadas para a VM (8A) contra um (8B) célula AM. Enquanto o histograma de uma direccionalidade VM típico mostra uma distribuição de pico duplo, a 0 ° e 90 °, o PM histograma mostra um único pico dominante a 0 °. Estes exemplos estão de acordo com observações anteriores de que os componentes individuais de tatuagens VMs são quase igualmente distribuídas pelos túbulos T e A-túbulos, enquanto que os componentes tatuagens em AMs podem ser predominantemente composto por uma túbulos.

Figura 8.Representative histograma direcionalidade das redes tatuagens de células individuais. Histogramas direcionalidade foram gerados a partir de imagens de VM esqueletizadas indivíduo (A) versus AM (B Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
| Tampão de perfusão | mM |
| NaCl | 120,4 |
| KCl | 14.7 |
| KH 2 PO 4 | 0,6 |
| Na 2 HPO 4 | 0,6 |
| MgSO4 | 1.2 |
| HEPES | 10 |
| NaHCO3 | 4.6 |
| Taurina | 30 |
| 2,3-butanodiona-monoxime | 10 |
| Glicose | 5.5 |
| pH 7,4 |
| Tampão de digestão | mM (se não especificado) |
| NaCl | 120,4 |
| KCl | 14.7 |
| KH 2 PO 4 | 0,6 |
| Na 2 HPO 4 | 0,6 |
| MgSO4 | 1.2 |
| HEPES | 10 |
| NaHCO3 | 4.6 |
| Taurina | 30 |
| 2,3-butanodiona-monoxime | 10 |
| Glicose | 5.5 |
| A colagenase do tipo II | 600 U / ml |
| pH 7,4 |
| Tampão de paragem | mM (se não especificado) |
| NaCl | 120,4 |
| KCl | 14.7 |
| KH 2 PO 4 | 0,6 |
| Na 2 HPO 4 | 0,6 |
| MgSO4 | 1.2 |
| HEPES | 10 |
| NaHCO3 | 4.6 |
| Taurina | 30 |
| 2,3-butanodiona-monoxime | 10 |
| Glicose | 5.5 |
| CaCl2 | 0,0125 |
| de soro de vitelo | 10% |
| pH 7,4 |
Tabela 1.Buffer solutiões. O conteúdo de três soluções tampão fisiológicas diferentes para o isolamento de células e de imagem encontram-se resumidos.