Estudos para entender a transmissão interespécies de encefalopatias espongiformes transmissíveis (EETs, doenças priônicas) são desafiadores, pois normalmente dependem de estudos de desafio animal in vivo longos e caros. Vários ensaios in vitro foram desenvolvidos para ajudar a medir as barreiras das espécies de príons, reduzindo assim o uso de animais e fornecendo resultados mais rápidos do que os bioensaios em animais. Aqui, apresentamos o protocolo para um ensaio de conversão rápida de príons in vitro chamado ensaio de taxa de eficiência de conversão (CER). Neste ensaio, a proteína príon celular (PrPC) de um cérebro hospedeiro não infectado é desnaturada em pH 7,4 e 3,5 para produzir dois substratos. Quando o substrato de pH 7,4 é incubado com agente TSE, a quantidade de PrPC que se converte em um estado resistente à proteinase K (PK) é modulada pela barreira de espécies do hospedeiro original ao agente TSE. Em contraste, o PrPC no substrato de pH 3,5 é dobrado incorretamente por qualquer agente de EET. Ao comparar a quantidade de proteína príon resistente a PK nos dois substratos, uma avaliação da barreira de espécies do hospedeiro pode ser feita. Mostramos que o ensaio CER prevê corretamente as barreiras de espécies de príons conhecidas de camundongos de laboratório e, como exemplo, mostramos alguns resultados preliminares sugerindo que linces (Lynx rufus) podem ser suscetíveis ao agente de doença debilitante crônica de veado de cauda branca (Odocoileus virginianus).