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Artigo de método

A indução de transições mesenquimais-epiteliais em células de sarcoma

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DOI:

10.3791/55520

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7 de abril de 2017

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1Department of Medicine, Duke University, 2Department of Bioengineering, Rice University, 3Department of Molecular Genetics and Microbiology, Duke University, 4Solid Tumor Program and the Duke Prostate Center, Duke University Medical Center, 5Duke University Medical Center

Neste artigo

Aviso de errata

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Resumo

Apresentamos aqui um método de cultura de células para a indução de transições mesenquimais-epiteliais (MET) em células de sarcoma com base na expressão ectópica combinado de microARN-200 e os membros da família grainyhead-like 2 (GRHL2). Este método é adequado para a melhor compreensão do impacto biológico de plasticidade fenotípica sobre a agressividade e tratamentos do cancro.

Resumo

plasticidade fenotípica refere-se a um fenómeno no qual as células transitoriamente ganhar traços de outra linhagem. Durante a progressão do carcinoma, plasticidade fenotípica impulsiona invasão, disseminação e metástase. Com efeito, enquanto que a maioria dos estudos de plasticidade fenotípica têm sido no contexto de carcinomas epiteliais derivadas de, verifica-se os sarcomas, os quais são mesenquimal de origem, também exibem plasticidade fenotípica, com um subconjunto de sarcomas submetidos a um fenómeno que se assemelha a um mesenchymal- transição epitelial (MET). Aqui, nós desenvolvemos um método compreendendo a família de miR-200 e grainyhead-like 2 (GRHL2) para imitar este fenómeno MET-como observado no sarcoma paciente samples.We sequencialmente expressar GRHL2 e a família de miR-200 utilizando a transdução de células e transfecção, respectivamente , para compreender melhor as bases moleculares destas transições fenotípica em células de sarcoma. células de sarcoma que expressam miR-200s e GRHL2 demonstrado characterist epitelial aumentadaics na morfologia celular e alteração de biomarcadores epiteliais e mesenquimais. Estudos futuros utilizando estes métodos podem ser utilizados para compreender melhor as consequências fenotipicas de processos MET-como sobre células de sarcoma, tais como migração, invasão, propensão metastática, e resistência à terapia.

Introdução

plasticidade fenotípica refere-se a uma transição reversível entre os fenótipos celulares, e é geralmente divididos em dois tipos, epitelial-a-mesenquimal (EMT) transições e transições mesenquimais-a-epitelial (MET). Esta plasticidade fenotípica desempenha um papel importante em processos normais de organismos multicelulares, tais como desenvolvimento e cicatrização de feridas 1; no entanto, estas mesmas vias e programas de expressão génica também pode levar a doenças, tais como fibrose (revisto em 2, 3, 4) e a metástase de carcinoma (revisto em referências 5, 6, 7, 8). Durante a metástase, por exemplo, EMT perturba polaridade celular, as interacções célula-célula, e promove a invasão 9, 10. Juntos, EMT contribuirs para um estado fenotípico que facilita a disseminação de células de cancro. Além disso, EMT também conduz a uma série de outras alterações fenotípicas que dirigem um fenipo agressivo, incluindo a desregulação do metabolismo celular de cancro 6, o desenvolvimento de resistência ao fármaco 11, 12, o aumento da capacidade do tumor-iniciação 13, 14 e 15 acolher evasão imune.

plasticidade fenotípica tem sido bem estudada na progressão do carcinoma; no entanto, os sarcomas também exibem plasticidade fenotípica. Curiosamente, parece que alguns dos mesmos drivers de plasticidade fenotípica em carcinomas também contribuem para a plasticidade sarcoma e agressividade. Por exemplo, células tumorais circulantes (CTCs) a partir de pacientes de sarcoma foram mostrados para expressar o EpCAM, uma proteína da superfície celular que é tipicamente encontrado em culas epiteliais 16. Addicionalmente, 250 amostras de sarcoma dos tecidos moles foram categorizados como epitelial-mesenquimal como ou semelhantes com base na expressão do gene. Pacientes na assinatura biomarcador epitelial-like tiveram melhor prognóstico do que pacientes com a assinatura biomarcador mesenquimais-like 17. Isto é consistente com muitos carcinomas, em que os doentes com mais de carcinomas epiteliais semelhantes têm melhores resultados em comparação com os pacientes com mais do mesquima semelhante a tumores 18.

Enquanto alguns sarcomas exibir biomarcadores e vias de expressão génica consistentes com MET, as bases moleculares da plasticidade fenotípica permanecem pouco compreendidos. Para estudar os mecanismos e os condutores de MET em sarcoma foi desenvolvido um modelo de indução MET utilizando dois factores específicos do epitélio, o microARN (MIR) -200 família e grainyhead-like 2 (GRHL2). Os miR-200 são uma família de pequenos RNAs não-codificantes que regulam a expressão de genes por ligao ao dos UTRs 3 de messenger ARN e evitando a tradução na proteína. A família de miR-200 consiste em dois sub-grupos - um contendo miR-141 e miR-200a, e o outro incluindo o miR-200b, miR-200c, e miR-429. Os membros da família de miR-200 são enriquecidos em tecidos epiteliais, e a perda de miR-200 está associado com a metástase em carcinomas 19. A família de miR-200 também é regulada negativamente nos sarcomas de tecidos moles em comparação com o tecido normal 20. Similar aos miR-200s, GRHL2 é um regulador chave que é importante para o desenvolvimento epitelial 21. O factor de transcrição GRHL2 actua em dois modos para regular positivamente genes epiteliais, tais como a E-caderina: 1) Em células epiteliais, GRHL2 reprime directamente o principal regulador EMT, ZEB1 22; e 2) GRHL2 activa directamente a transcrição de genes epiteliais 23. As nossas investigações anteriores mostraram que a expressão combinada de miR-200s e GRHL2 em células de sarcomainduz um fenótipo MET-24 como. Aqui, nós apresentamos um protocolo detalhado para criar um modelo in vitro de indução MET em células de sarcoma usando a expressão ectópica de miR-200s e GRHL2.

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Protocolo

1. Preparação dos Reagentes

  1. Prepare DMEM para cultura de células por adição de 50 ml de soro fetal de bovino (FBS) e 5 mL de penicilina-estreptomicina (5000 U / mL) a 500 mL de meio DMEM. Este meio pode ser armazenado a 4 ° C durante até seis meses.
  2. Ressuspender iniciadores liofilizados em água isenta de nuclease, a uma concentração final de 10 uM. iniciadores loja re-suspenso a -20 ° C.
  3. Prepare ensaio de radioimunoprecipitação tampão (RIPA) (NaCl 150 mM, 0,5% de desoxicolato de sódio, 0,1% de SDS, Tris a 50 mM, pH 8,0). Suplemento com o cocktail inibidor de protease antes da utilização e manter tampão em gelo quando em utilização. Armazenar a 4 ° C.
  4. Prepare a 10 mg / mL de polibreno (brometo de hexadimetrina) no filtro de água e de uma seringa para esterilizar utilizando um filtro de 0,45? M de polietersulfona. Solução pode ser armazenada a 4 ° C durante até seis meses.
  5. Prepara-se uma solução de 1 mg / mL de trabalho de cloreto de tetrazólio azul nitro por dissolução de 10 mg em 10 mL de PBS. Armazenar a 4 ° C.

2. Transdução Lentivirus de GRHL2

Dia 1

  1. A placa 3 x 10 5 culas HEK293T por poço de uma placa de 6 cavidades em 2 ml de DMEM suplementado. Quantificar culas utilizando um contador de células automatizado. As células devem ser 40 - 60% confluentes, após cultura durante a noite a 37 ° C com 5% de CO 2.

Dia 2

  1. Dilui-se 2 ug de vector vazio (pCMV-EGFP-UBC) ou 2? G de pCMV-GRHL2-UBC-EGFP 24, 25 em 200 uL de meio sem soro, juntamente com 1,8 ug de pΔ8.9 e 0,2 ug de pCMV-VSV plasmídeos auxiliares -G. Num tubo separado, dilui-se 4 ul de um reagente de transfecção à base de lípidos em 200 uL de meio isento de soro por transfecção (8 uL em 400 uL de duas amostras). Adicionar 200? L de mistura de reagente de transfecção para cada solução de plasmídeo e incubar durante 20 min à temperatura ambiente.
  2. Durante o incubação, lavar as células HEK293T por remoção do meio por aspiração e lavagem as células com 1 ml de PBS. Substituir o PBS com 800 uL de meio isento de soro. Após 20 min, adiciona-se 200 uL de reagente de transfecção: mistura de plasmídeo a partir do passo 2.2 gota a gota, a cada poço e incubar as células durante 2 h a 37 ° C em 5% de CO 2.
  3. Cuidadosamente remover meio de transfecção por aspiração e substituir com 2 ml de DMEM suplementado. As células voltem para a incubadora para a cultura durante a noite.
    NOTA: As células HEK293T são vagamente aderente. Meios de substituição deve ser realizado com cuidado para limitar a remoção das células a partir do fundo do prato ou frasco.

Dia 3

  1. Actualizar meios em células HEK293T transfectadas e a placa 3 x 10 5 culas RD por poço de uma placa de 6 cavidades em 2 ml de DMEM suplementado. Células de cultura durante a noite. culas RD são uma linha de células de rabdomiossarcoma humano comercialmente disponível.

dia 4

  1. Recolhe meios viral a partir de células HEK293T. Pipetar o meio DMEM a partir das células HEK293T e em lugar de um novo 15 mL cónico. Cuidadosamente substituir com novos media DMEM e células lugar HEK293T de volta na incubadora para o dia seguinte.
  2. Adicionar 2 mL de 10 mg / ml de polibreno por mL de meio virais em dois novos tubos de 50 mL cónicos (uma para a transfecção o vector vazio e outro para a transfecção GRHL2). filtro de seringa de meios viral, removendo o êmbolo de uma seringa de 3 mL e anexar um filtro de 0,45? m de polietersulfona para a ponta.
    1. Adicionar os meios virais recolhidas no passo 2.6 para dentro do tambor da seringa, e mergulhar meios para os novos tubos de 50 mL cónicos contendo polibrene. Remover o meio a partir de culas RD por aspiração a vácuo e adicionar meios viral filtrada para células RD.

dia 5

  1. Dia 4. células HEK293T de repetição podem ser descartados após a mídia viral foi recolhido.

dia 7

  1. Lavar as células RD com 1 mL de PBS e adicionar 200 ul de tripsina a 0,05% por poço. Incubar a 37 ° C durante 5 min, adicionar 2 ml de meio suplementado, e mover-se suspensão de células para um novo 15 mL cónico. células centrifugar a 250 xg durante 5 min à temperatura ambiente e meios aspirado. Ressuspender em 1 mL de meio DMEM (suplementado com 5% de FBS e 1% de penicilina-estreptomicina).
    NOTA: Usando uma percentagem mais elevada de SBF podem provocar entupimento, durante o fluxo de citometria
    1. células de filtro para citometria de fluxo. Usar uma pipeta para aplicar a suspensão de células 1 mL DR através de um filtro de 30 um em tubos de citometria de fluxo e os tubos de colocar em gelo.
    2. Ordenação de eGFP + 26 em tubos de microcentrífuga de 1,5 mL contendo 0,5 mL de DMEM suplementado com 10% FBS e 1% de penicilina-estreptomicina e colocar em gelo. Placa eGFP + no total de 1 mL de DMEM suplementado classificados em um único poço de uma placa de 12 poços e lugar na incubadora para cultura.
      ; NOTA: O rendimento de células a partir de EGFP + citometria de fluxo após esta transdução é geralmente baixa (50.000-100.000 células). As células podem precisar de ser cultivadas durante 10 - 14 dias antes de prosseguir para o passo 3.

3. Transfecção reversa de miR-200s

  1. Preparar 50 uM stocks de miR-200 imita usando livre de nuclease H 2 O. estoques alíquotas e armazenar a -20 ° C para evitar ciclos de congelamento / descongelamento.
  2. Adiciona-se 3 mL de cada um de 50? M de miR-200 mímico (miR-200a, miR-200b, e miR-200 c) a 300 uL de meio isento de soro ou 9 mL de 50 um miARN controlo negativo para meio isento de soro de 300 uL.
  3. Adicionar 6 mL de reagente de transfecção específico siRNA para 600 uL de meio isento de soro e 300 pL de dividir esta mistura em dois tubos, um para cada uma das duas misturas de miR passo 3.2. Combinam-se as 300 uL de cada mistura de miR do passo 3.2 com uma mistura de 300 uL de reagente de transfeco. Incubar durante 20 min a te quartomperatura.
  4. Durante a incubação, preparar uma suspensão de células de 600.000 células EGFP + RD expressam EV ou GRHL2 criado na secção 2 em 2,4 mL (250 células / ml) de meio isento de soro por tratamento.
  5. Numa placa de 24 poços, adicionar 100 ul por poço de miR-200 mistura ou mistura de controlo negativo a partir do passo 3.3 em seis poços, e, em seguida, adicionar 400 uL de cada suspensão de células em três poços de cada mistura de miR.
  6. Incubar as células a 37 ° C em 5% de CO 2 durante a noite e meios de comunicação para alterar totalmente suplementado DMEM no dia seguinte. Recolher as células 2 dias mais tarde para análise utilizando o tampão adequado (ver abaixo). imagiologia de lapso de tempo de células de sarcoma RD submetidos a MET é disponível como material suplementar. Imagem cada poço a cada 2 h com uma objetiva de 10X usando um gerador de imagens ao vivo de células automatizado 27.

4. extracção de ARN, transcrição reversa, e qPCR

  1. Extrair ARN de acordo com as instruções do fabricante, usando um padrão de RNAkit de extracção 24. ARN extraído pode ser armazenado a -80 ° C.
  2. Quantificar a concentração de ARN. Descongelar e trabalhar com ARN em gelo. Para quantificar as concentrações de ARN, medir a absorvância de UV a 260 nm com um espectrofotetro leitor de placas de acordo com o protocolo do fabricante. Dilui-se todas as amostras para a concentração mais baixa com água isenta de nuclease.
  3. Realizar a transcrição inversa de ARN total em ADN complementar (ADNc). Combinar não menos do que 100 ng de ARN total com tampão de PCR, de mistura de dNTP (100 mM), os iniciadores de hexâmeros aleatórios, transcriptase e água isenta de nuclease reversa num volume de reacção de 20 uL 24. Executar ciclos de RT de acordo com o protocolo do fabricante. ADNc pode ser armazenada a longo prazo a -20 ° C.
  4. Diluir 20 uL a reacções de 100 uL com 80 uL de livre de nuclease H 2 O.
  5. Dissolvem-se 5 mL de uma baseada em fluorescência corante intercalante 2x qPCR master mix, 0,06 L de cada iniciador a 10? M, umND 2? L de reaco de RT por amostra diluída.
  6. Run qPCR de acordo com o protocolo do fabricante para a mistura principal à base de fluorescência.
  7. Quantificar as quantidades relativas de ARNm pelo método CT delta e normalizar a GAPDH. Traça-se a expressão do mRNA média das réplicas biológicas ± desvio padrão para cada grupo de tratamento.
    NOTA: precauções especiais devem ser tomadas quando se trabalha com ARN a fim de evitar contacto com RNases, tais como a utilização de plásticos e reagentes isentos de RNase. equipamento não descartável deve ser tratada antes do uso para remover RNases.

5. Imunofluorescência Coloração

  1. Seguindo o passo 3.6, meios aspirado por aspiração a partir de células RD em formato de 24 poços.
  2. Fixar as células por adição de 500 uL de paraformaldeído a 4% (PFA) por poço e incubar durante 15 min à temperatura ambiente (RT). Após a fixação, as células lugar em solução salina tamponada com fosfato (PBS) e armazenar a 4 ° C durante a noite se necessário.
  3. permeabilizaras células por adição de 500 ul de PBS + 0,2% de Triton-X100 e incubar 30 min a RT. Por aspiração de vácuo, remover o tampão de permeabilização e lavar três vezes com PBS.
  4. Bloco em 500 mL de 5% de albumina de soro bovino (BSA) / PBS e incubar as células durante 30 minutos à temperatura ambiente. As células podem ser armazenadas a 4 ° C durante a noite se necessário.
  5. Prepare uma diluição de anticorpo primário. Pipetar 200 L de 5% de BSA / PBS por poço num cónico de 15 mL (12 poços = 2,4 mL) e adicionar 1 mL de anticorpo primário por mL de BSA a 5% / PBS necessário. Remover o tampão de bloqueio por aspiração a vácuo e dispensar 200 uL de anticorpo primário diluído a cada poço.
    1. Incubar as células em 1: 1.000 de anticorpos diluídos primários em BSA a 5% / PBS durante 1 h à temperatura ambiente ou durante a noite a 4 ° C. Após a incubação, lavar as células duas vezes com PBS.
  6. Preparar uma diluição de anticorpo secundário no mesmo volume de BSA a 5% / PBS como acima. Adicionar o anticorpo secundário conjugado com corante vermelho-extremo usando uma diluição de 1: 2000. Além disso adicionar1 ug / mL de corante Hoechst à mistura. Remover o PBS e adicionar 200 mL da mistura para cada poço.
    1. Incubar à temperatura ambiente durante 1 h no escuro. Lavar 3 vezes com PBS, deixa as células em PBS, e proteger as células da luz utilizando folha metálica. As células podem ser armazenadas a 4 ° C, se necessário.
  7. células de imagem em ampliação total 400X num microscópio de epifluorescência invertido com excitao de comprimento de onda 594-650 nm.

6. Western Blotting

  1. Lavar as células duas vezes com 3,6 de PBS gelado. Em gelo, as células lisam com 50 ul de 1x tampão RIPA suplementado com um cocktail inibidor de protease 1x.
  2. Os lisados ​​de rocha, a 4 ° C durante 15 minutos, recolher os lisados ​​para tubos de 1,5 ml e centrifugar a alta velocidade (20000 xg) durante 5 min para clarificar as amostras. Os lisados ​​celulares podem ser armazenadas a longo prazo a -80 ° C, se necessário.
  3. Quantificar a proteína total utilizando um ensaio de Bradford e aliquotar uma quantidade igual de proteína em novos tubos de microcentrifuga de 1,5 mL. BrinAs amostras de g para volume igual usando tampão RIPA e tampão de carga Laemmli 3x suplementado com 2-mercaptoetanol.
  4. Incubar as amostras em tamp de carga de Laemmli 1x amostra durante 5 minutos a 95 ° C e executado de SDS-PAGE utilizando um gel de Tris-glicina 4-12% a 200 V durante 45 min. A quantidade de faixas carregadas de proteína, dependendo da linha celular. Em alguns casos, 50-100 ug de proteína total é necessária para a detecção de E-caderina em linhas celulares mesenquimais.
  5. Transferência de proteínas para uma membrana de nitrocelulose durante 2 horas a 50 V em tampão de transferência 1x Tris-glicina.
  6. membrana bloco durante 1 h a temperatura ambiente ou durante a noite a 4 ° C em um tampão de bloqueio à base de BSA.
  7. Dilui-se os anticorpos primários em 1: 1000 de concentração em 5 mL de tampão de bloqueio, adicionar diluição para a membrana, e incubar com agitação suave durante 1 h a temperatura ambiente ou durante a noite a 4 ° C. membrana de lavagem 3 vezes em PBS com 0,05% de Tween-20.
  8. Incubar as membranas durante 1 h à RT com Secundaria acoplado-fluorescente no infravermelhoy anticorpo a 1: 20000 em tampão de bloqueio de diluição como acima.
  9. Lavar membrana duas vezes em PBS com 0,05% de Tween-20 e depois uma vez em PBS.
  10. membrana imagem utilizando detecção de fluorescência no infravermelho padrão.

7. ensaios de crescimento independente da ancoragem

NOTA: Para um protocolo de ensaio em agar mole detalhada, ver 28.

  1. Quente meios 2x DMEM estéril a 42 ° C em banho de água quente. Durante este tempo, o calor de pré-autoclavadas a 1% de agarose em microondas durante 3 minutos. Micro-ondas durante um período adicional de 30 segundos de cada vez conforme necessário, ou até estarem completamente fundidos. Mover de agarose para um banho de água a 42 ° C.
  2. Colocar um tubo de 50 mL cónico numa proveta com 42 ° C em água estéril um capuz e misturar 1% de agarose e meios 2x DMEM numa mistura 1: 1 proporção de contabilidade para 1,5 mL de mistura por poço numa placa de 6 poços. Sempre preparar extra de DMEM / agarose para dar conta de erro pipetagem e para evitar bolhas.
  3. Adicionar a mistura aoos lados do poço, assegurando que não se formem bolhas e deixar repousar durante 30 minutos à temperatura ambiente.
  4. Enquanto a camada inferior é solidificando, preparar a cada grupo de células RD transf ectadas no passo 3 aspirao por meios e lavagem uma vez com 1 mL de PBS. Aspirar PBS e adicionar 0,2 ml de 0,05% de tripsina e incubar a 37 ° C durante 5 min.
  5. Neutraliza-se a tripsina em 0,8 mL de meio e células Triturar para formar uma suspensão de célula única. Transferir a suspensão de células para um tubo cónico de 15 mL.
  6. Contagem de células e calcular o volume de suspensão de células necessário para a 10.000 células por poço.
  7. Aquecer 0,6% de agarose em microondas durante 3 minutos, seguido por 30 segundos de cada vez até que esteja completamente derretida. Mover de agarose a 42 ° C Banho de água.
  8. Colocar um tubo de 50 mL cónico numa proveta com 42 ° C em água estéril um capuz. Misturar 0,6% de agarose e suspensão de células diluída numa proporção de 1: 1 para se preparar 1,5 mL de mistura por poço numa placa de 6 poços. Sempre preparar suspensão de células de cama / agarose misturar para dar conta de erro pipetagem epara evitar bolhas.
    NOTA: É importante trabalhar a 42 ° C aqui. Se a temperatura é muito baixa a mistura vai solidificar antes do plaqueamento, e temperaturas acima de 42 ° C irá afectar a viabilidade celular.
  9. Misture bem por trituração células várias vezes e adicionar mistura de células aos poços, assegurando que não forma bolhas, e deixar solidificar durante 20 minutos a RT.
  10. Adicionar 2 ml de meio suplementado a cada poço e mover as placas para incubadora.
    1. Mudança de mídia uma vez por semana, durante 3-4 semanas ou até colônias multicelulares formar. Tenha cuidado para evitar tocar o agar ao remover a mídia por aspiração a vácuo. Em alternativa, usar um P1000 para remover a camada de topo do meio líquido.
    2. Manchar placas de agar mole por adição de 200 uL de solução de cloreto de azul de tetrazólio Nitro (1 mg / mL em PBS) e incubar a placa durante a noite a 37 ° C. Substituir meios no dia seguinte com PBS para imagiologia.
    3. poços de imagem em 40X ampliação total em um microscópio invertido.
    4. Realizar a análise em ImageJ para a área colónia e número. Lote número médio de colónias de réplicas biológicas ± desvio padrão.

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Resultados

Esquema para a indução de MET em células de sarcoma

Uma linha do tempo geral para a indução de alterações MET-como em células de sarcoma é mostrado na Figura 1. O protocolo começa por transdução GRHL2 (Figura 1A), seguido por transfecção da família miR-200 (Figura 1B). membros da família GRHL2 ou miR-200 não foram capazes de afectar a aparência de células RD quando expressa sozin...

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Discussão

Sarcomas são cancros raros, mas altamente agressivas de uma linhagem mesenquimal. Apesar da sua linhagem mesenquimal, um subconjunto dos sarcomas parece sofrer uma transição fenotípica para um estado mais epitelial semelhante. Este interruptor MET-like tem relevância prognóstico, como pacientes com mais tumores epiteliais, como são menos agressivos 24. Apesar da sua relevância clínica, existem poucos estudos sobre os mecanismos moleculares de condução dessas transições fenotípicas em sarcomas.

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Divulgações

Os autores não têm nada a revelar.

Agradecimentos

JAS reconhece o apoio do Instituto Duke Cancer, The Duke University Genitourinary Oncologia Laboratory, e do Departamento de Ortopedia da Universidade de Duke. HL foi apoiado pela National Science Foundation (NSF) Centro de Física Biológica Teórica (NSF PHY-1427654) e NSF DMS-1361411, e como CPRIT (Prevenção do Câncer e Instituto de Pesquisa do Texas) Scholar na Cancer Research do Estado do Texas na Universidade Rice. KEW foi apoiado pelo NIH F32 CA192630 MKJ e HL beneficiado a partir de discussões úteis com Mary C. Farach-Carson, JN Onuchic, Samir M. Hanash, Kenneth J. Pienta, e Donald S. Coffey.

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Materiais

Lista de materiais utilizados neste artigo
NomeEmpresaNúmero de catálogoComentários
Contador automatizado CountessLife technologiesAMQAX1000
Countess cell counting chamber slidesInvitrogenC10283
SimpliAmp Thermal CyclerThermo FisherA24811
Odyssey FcLI-COR Inc
ViiA7 Sistema de PCR em Tempo RealThermo Fisher4453536
PCR microplacaCorning321-29-051
KAPA SYBR Kit de qPCR universal rápidoKAPA BiosystemsKK4602
Bloco de Partida (PBS) Buffer de bloqueioThermo Fisher37538BSA baseado em tampão de bloqueio
Agarose de Propósito Geral LEGenesee Scientific20-102
10x Tris/Glicina/SDS BufferBio-Rad Laboratories Inc161-0732Tampão de corrida
10x Tris/Glycine BufferBio-Rad Laboratories Inc161-0734Tampão de transferência
RIPA BufferSigma Life SciencesSLBG8489
Amersham Protran 0.45 μ m nitroceluloseGE Healthcare Lifesciences10600012
Quick-RNA MiniPrep KitGenesee Scientific11-358
Laemmli Sample Buffer (4X)Bio-Rad Laboratories Inc1610747
Mini Trans-Blot CellBio-Rad Laboratories Inc1703930
Mini-Protean Tetra CellBio-Rad Laboratories Inc1658005EDU
DPBSLife technologies14190-144
0,05% Tripsina-EDTALife technologies11995-065
DMEMLife technologies11995-065
Lipofectamina RNAi MaxThermoFisher 13778150
Lipofectamina 2000 RagentsThermo Fisher11668019
Penicilina EstreptomicinaLife technologies15140-122
miRVana miRNA miRNA miMImímica controle negativo #1Thermo Fisher4464058neg miRNA
tem-miR-200 mirVana miRNA miRNA miMímicaThermo Fisher4464066miR200A
tem-miR-200 mirVana miRNA miRNA imitaThermo Fisher4404066miR200B
tem-miR-200 mirVana miRNA imitaThermo Fisher4404066miR200C
Opti-MEMLife technologies11088-021meio sem soro
anticorpo anti-EcadherinBD Bioscience610182
anti-beta actinaSanta Cruz Biotechnologysc-69879
anti-EpCamAb SerotecMCA18706
anti-ZO1Invitrogen402200
IRDye 800WLI-COR Inc925-32210
IRDye 680LI-COR Inc926-32223
anti-mouse AlexaFluor 647Thermo FisherA211241
anti-coelho AlexaFluor 647Thermo Fisherab150075
Halt Protease e Inibidor de FosfatosThermo Fisher1861281
Precision Plus Protein Dual ColorBio-Rad Laboratories Inc161-0374
Partec CellTricsSysmex04-004-232630 μ m filtro para fluxo
GAPDH-FIDTAGCCACATCGCTCAGACAC
GAPDH-RIDTGCCCAATACGACCAAATCC
Ecadherin-FIDTTGGAGGAATTCTTGCTTTGC
Ecadherin-RIDTCGCTCTCCTCCGAAGAAAC
ZEB1-FIDTGCATACAGAACCCAACTTGAACGTC
ZEB1-RIDTCGATTACACCCAGACTGC
NOTCH-FIDTGGCAATCCGAGGACTATGAG
NOTCH-RIDTCTCAGAACGCACTCGTTGAT
nitro azul tetrazólio BrometoN5514
Seringa de 3 mLSigma
Filtro de seringa estérilVWR28145-505
Tubo de fundo redondo de polipropileno de 5 mL Tubos decitometria de fluxo352063
transcrição reversa de cDNA de alta capacidadeThermo FisherKit detranscrição reversa
4368814 4% paraformaldiídeoSanta Cruz Biotechnologysc-281612
Triton-X100Sigma93443
albumina de soro bovinoSigmaA7906
de hexadimetrina Sigma de polibreno H9268 BD Bioscience 309657 Kit de

Referências

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Errata


Formal Correction: Erratum: Induction of Mesenchymal-Epithelial Transitions in Sarcoma Cells
Posted by JoVE Editors on 7/03/2018. Citeable Link.

An erratum was issued for: Induction of Mesenchymal-Epithelial Transitions in Sarcoma Cells. An author name was updated.

One of the authors' names was corrected from:

Shenghan Xu

to:

Shengnan Xu

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