Um protocolo para a quantificação de proteínas em fluidos biológicos complexos usando tecnologia automatizada imuno-MALDI (iMALDI) é apresentado.
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Artigo de método
Um protocolo para a quantificação de proteínas em fluidos biológicos complexos usando tecnologia automatizada imuno-MALDI (iMALDI) é apresentado.
Espectrometria de massa (MS) é uma das tecnologias mais utilizadas para quantificar proteínas em amostras complexas, com especificidade de excelente ensaio em resultado da detecção direta de relação massa-de-carga de cada molécula do alvo. No entanto, proteômica baseada em MS, como a maioria das outras técnicas analíticas, tem um viés para medição alta abundância analitos, então é um desafio para atingir limites de deteção de baixo ng/mL ou pg/mL em amostras complexas e isto é o intervalo de concentração para muitos doença-relevantes proteínas em biofluids tais como plasma humano. Para auxiliar na detecção de baixa abundância analitos, imuno-enriquecimento foi integrado no ensaio para concentrar-se e purificar o analito antes da medição do MS, melhorando significativamente a sensibilidade do ensaio. Neste trabalho, a imuno - Matrix-Assisted Laser dessorção/ionização (iMALDI) tecnologia é apresentada para a quantificação de proteínas e peptídeos em biofluids, com base em imuno-enriquecimento em grânulos, seguida por MALDI-MS medição sem prévia eluição. Os anticorpos antipeptídeos são acrescidos em grânulos magnéticos e incubados com amostras. Após a lavagem, os grânulos são transferidos diretamente em uma placa de destino MALDI, e os sinais são medidos por um MALDI-tempo de instrumento de voo (MALDI-TOF) após a solução de matriz foi aplicada aos talões. O procedimento de preparação de amostra é simplificado em comparação com outros ensaios imuno-MS, e a medição de MALDI é rápida. A preparação de toda a amostra é automatizada com um manuseio sistema, com reprodutibilidade do ensaio melhorada e uma taxa de transferência de líquidos. Neste artigo, o ensaio de iMALDI é usado para determinar a angiotensina peptídeo eu (Ang eu) concentração no plasma, que é usado clinicamente como leitura da atividade de renina do plasma para o rastreio de aldosteronismo primário (PA).
Espectrometria de massa tornou-se uma ferramenta indispensável em proteômica quantitativa. Espectrometria de massa pode determinar as massas de alvo proteínas ou peptídeos, portanto, os sinais obtidos do analito podem ser altamente específicos em comparação com os imunoensaios. Dois métodos de ionização, electrospray e MALDI, são mais comumente utilizados para a detecção de proteínas e peptídeos1,2,3,4. Um grande desafio na quantificação da proteína baseada em MS situa-se na detecção de proteínas de baixo-abundância em amostras complexas, em....
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as quantidades dos reagentes descritos abaixo são baseadas na medição de 20 amostras de plasma do paciente. O protocolo apresentado abaixo segue as orientações do Universidade de Victoria ' Comissão de ética de pesquisa humana s.
1. geração de Ang I em Plasma humano
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Um procedimento iMALDI automatizado para medição de Ang é mostrado na Figura 1. Peptídeos de alvo (endógenos ou peptídeos de proteínas digeridas) são enriquecidos em grânulos magnéticos antipeptídeos, e em seguida as contas são transferidas para uma placa-alvo para a medição de MALDI. Todo o processo é simplificado em comparação com outras tecnologias de imuno-MS que exigem etapas de eluição de peptídeo adicionais. Automação do ensaio iMALDI permite a análise.......
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Comparado a quantificação de proteína convencional baseada em MS, iMALDI utiliza anticorpos para enriquecer os analitos e purificá-los de amostras complexas, portanto, tornando possível quantificar proteínas ou peptídeos em baixas concentrações. Um passo crítico no protocolo iMALDI é o imuno-enriquecimento dos peptides alvo. Para este efeito, devem ser selecionados anticorpos com alta especificidade e afinidade. Em SISCAPA, relatou-se que seriam necessários para atingir alta sensibilidade em baixa ng/mL.......
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C.H.B detém a patente sobre a tecnologia iMALDI.
Agradecemos o apoio financeiro de Canadá do genoma e genoma da Colúmbia Britânica para operações (204PRO) e desenvolvimento de tecnologia (214PRO) através de rede de inovações o genoma (gim). Agradecemos a plataforma de descoberta de drogas do Instituto de pesquisa do centro de saúde de Universidade McGill para a utilização do instrumento MALDI-TOF para as filmagens. H.L. é grato pelo apoio de uma bolsa de pós-doutorado do nacional de ciência e engenharia pesquisa Conselho de Canadá (NSERC). C.H.B é grato pelo apoio de fundo de dotação a Leading Edge (Lopes). C.H.B. é grato pelo apoio da cadeira McGill Segal em Oncologia Molecular da McGill University (Montreal, Quebe....
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| Nome | Empresa | Número de catálogo | Comentários |
|---|---|---|---|
| Biorrecuperação de | plasma humano de controle saudável | HMPLEDTA2 | |
| bicarbonato de amônio | Sigma Aldrich | 09830 | |
| Citrato de amônio dibásico | Sigma Aldrich | 09833 | |
| CHAPS (> = 98%) | Sigma Aldrich | C9426 | |
| Albumina de clara de ovo de galinha (>98%) | Sigma Aldrich | A5503 | |
| Ácido etilenodiaminotetracético | Sigma Aldrich | EDS | |
| Ácido alfa-ciano-4-hidroxicinâmico | Sigma Aldrich | 70990 | |
| Solução salina tamponada com fosfato | Sigma Aldrich | P4417 | |
| Fluoreto de fenilmetanossulfonil | Sigma Aldrich | 78830 | |
| Ácido trifluoroacético | Thermo Fisher Scientific | 85172 | Grau LC-MS |
| acetonitrila | Fluka | 34967 | de grau LC-MS |
| Fluka | 39253 | de grau LC-MS | |
| Fluka | 320099 | de grau LC-MS | |
| Roche Diagnostics | 3118169001 | ||
| Dynabeads Esferas magnéticas de proteína G | Thermo Fisher Scientific | 10003D | 2.8 μ m, 30 mg/mL |
| spananti-Ang I anticorpo policlonal de cabra | Santa Cruz Biotechnology | sc-7419 | |
| Nat e SIS Ang I | sintetizados na Universidade de Victoria-Genome BC Proteomics Center | ||
| Sistema automatizado de manuseio de líquidos | Agilent | 16050-102 Estação de | trabalho robótica Agilent Bravo |
| Magnet | Thermo Fisher Scientific | 12321D | Ímã Invitrogen DynaMag-2 |
| Rotador de tubo | Theromo Scientific | 400110Q | Rotor de tubo Labquake |
| Ímã | Thermo Fisher Scientific | 12027 | Ímã de saia lateral DynaMag-96 |
| Ímã | VP Scientific | 771RM-1 | usado para puxar as contas para o fundo do poço |
| MALDI-TOF | Bruker | Bruker Microflex LRF instrumento |
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