A haste neural e as células progenitoras (NSPCs) são a base celular para as complexas estruturas e funções do cérebro. Eles estão localizados em nichos especializados in vivo e podem ser isolados e expandidos in vitro, servindo como um importante recurso para o transplante de células para reparar danos cerebrais. No entanto, os NSPCs são heterogêneos e não claramente definidos no nível molecular ou purificados devido à falta de marcadores específicos de superfície celular. O protocolo apresentado, que foi relatado previamente, combina um sistema neural-endothelial da cocultura com um método metabólico da rotulagem do glicana para identificar o sialoglycoproteome de superfície de nspcs preliminares. O sistema de cocultura NSPC-endotelial permite a autorenovação e expansão de NSPCs primários in vitro, gerando um número suficiente de nspcs. os Sialoglicanos em nspcs cultivados são rotulados usando um repórter metabólico de ácido siálico não natural com grupos funcionais bioortogonais. Comparando o sialoglycoproteome dos NSPCs Self-renovando expandidos em uma cocultura endothelial com diferenciação da cultura neural, nós identificamos uma lista de proteínas da membrana que são enriquecidas em NSPCs. Em detalhe, o protocolo envolve: 1) set-up de uma cocultura NSPC-endotelial e de uma cultura de diferenciação de NSPC; 2) rotulagem com azidoaçúcar por-O-acetilado N-azidoacetilmannosamina (AC4Mannaz); e 3) conjugação de biotina ao sialoglicíno modificado para imagem após fixação da cultura neural ou extração protéica da cultura neural para análise de espectrometria de massas. Em seguida, os candidatos a marcadores de superfície enriquecidos com NSPC são selecionados por análise comparativa de dados de espectrometria de massas tanto do NSPC expandido quanto de culturas neurais diferenciadas. Este protocolo é altamente sensível para identificar proteínas da membrana da baixa abundância nos materiais de partida, e pode ser aplicado à descoberta do marcador em outros sistemas com modificações apropriadas