Este protocolo descreve um processo experimental para produzir partículas pseudodigitadas virais infecciosas de alto titer (pp) com glicoproteínas envelope de duas cepas de gripe A e como determinar sua infectividade. Este protocolo é altamente adaptável para desenvolver pps de qualquer outro tipo de vírus envolvidos com glicoproteínas envelope diferentes.
A transmissão direta ocasional do vírus altamente patogênico da gripe aviária A H5N1 (HPAI H5N1) e H7N9 aos seres humanos e sua letalidade são graves problemas de saúde pública e sugerem a possibilidade de uma epidemia. No entanto, nossa compreensão molecular do vírus é rudimentar, e é necessário estudar as propriedades biológicas de suas proteínas envelope como alvos terapêuticos e desenvolver estratégias para controlar a infecção. Desenvolvemos uma plataforma de partículas pseudodigitadas virais sólidas (pp) para estudar o vírus da gripe aviária, incluindo a análise funcional de sua hemaglutinina (HA) e glicoproteínas envelope de neuraminidase (NA), as características de ressortamento dos HAs e NAs, receptores, troposmas, anticorpos neutralizantes, diagnóstico, infectividade, para fins de desenvolvimento de medicamentos e projeto de vacinas. Aqui, descrevemos um procedimento experimental para estabelecer pps com o envelope glicoproteínas (HA, NA) a partir de duas cepas de gripe A (HAPI H5N1 e 2013 aviário H7N9). Sua geração é baseada na capacidade de alguns vírus, como o vírus da leucemia murina (MLV), para incorporar glicoproteínas envelope em um pp. Além disso, também detalhamos como esses pps são quantificados com RT-qPCR, e a detecção de infectividade de pps vírus nativos e incompatíveis, dependendo da origem dos HAs e NAs. Este sistema é altamente flexível e adaptável e pode ser usado para estabelecer pps virais com glicoproteínas envelope que podem ser incorporados em qualquer outro tipo de vírus envolto. Assim, esta plataforma de partículas virais pode ser usada para estudar vírus selvagens em muitas investigações de pesquisa.
A missão de uma partícula viral é transportar seu genoma de uma célula hospedeira infectada para uma célula hospedeira não infectada e entregá-la ao citoplasma ou ao núcleo em umaforma1 competente para replicação. Este processo é inicialmente desencadeado pela ligação aos receptores celulares hospedeiros, seguido pela fusão de virion e membranas celulares. Para vírus envolvidos, como os vírus da gripe, as glicoproteínas de pico são responsáveis pela ligação do receptor e fusão1,2. Glicoproteínas envelope viral (por exemplo, pirogênios, antígenos), estão envolvidos em muitas propriedades e eventos importantes, tais como iniciação do ciclo de vida do vírus (ligação e fusão), patogênese viral, imunogenicidade, apoptose celular hospedeira e tropismo celular, a via endocítica celular, bem como a transmissão e reassortmentinterespécies 1,3,4,5,6,7. Pesquisa sobre glicoproteínas envelope viral nos ajudará a entender muitos aspectos do processo de infecção viral. Partículas virais pseudodigitadas (pp), também denominadas pseudovirions ou pseudopartículas, podem ser geradas através de uma técnica de pseudotipagem8,9,10. Esta tecnologia tem sido utilizada para desenvolver partículas pseudodigitadas de muitos vírus, incluindo hepatite C11,12,hepatite B13,vírus da estomatite vesicular (VSV)14,15,e vírus da gripe16,17,18,19. Esta tecnologia é baseada na proteína Gag-Pol de lentivírus ou outros retrovírus.
Partículas virais pseudodigitadas podem ser obtidas usando um sistema de três plasmídeos cotransfecting um plasmid de expressão de glicoproteína envelope viral, uma embalagem retroviral plasmid faltando o gene env envelope, e um plasmid repórter separado em células produtores pp. O retrovírus é montado por sua proteína Gag, e buds de uma membrana celular infectada que expressa o vírus envelope proteína1. Portanto, é possível obter pps de gripe de alto titer usando a proteína gag retrovírus para produzir botões em uma membrana celular expressando influenza HA e NA. Em nossos estudos anteriores, has/nas em todas as combinações foram funcionais e capazes de executar suas funções correspondentes no ciclo de vida viral16,17,18,20,21. Estes pps são usados para investigar características biológicas da gripe, incluindo a hemaglutinação, a atividade da neuraminidase, o tropismo obrigatório do HA-receptor, e a infectividade. Como ha e NA são proteínas funcionais de superfície importantes no ciclo de vida viral, HAs e NAs incompatíveis derivados de diferentes cepas de gripe podem demonstrar parcialmente a ressortição entre eles. Aqui, geramos oito tipos de influenza pps, combinando dois HAs e dois NAs (derivados da cepa HPAI H5N1 e da mancha H7N9), usando um sistema de pseudotipagem de três plasmídeos. Estes oito tipos de pps incluem dois pps nativos, H5N1pp, H7N9pp; dois pps incompatíveis, (H5+N9)pp, (H7+N1)pp; e quatro pps que abrigam apenas uma única glicoproteína (HA ou NA), H5pp, N1pp, H7pp, N9pp. Estudos sobre o vírus influenza, como H5N1 e H7N9, são limitados por requisitos de biossegurança. Todos os estudos das cepas do vírus da gripe selvagem devem ser realizados em um laboratório de nível 3 de biossegurança (BSL-3). A tecnologia de partículas virais pseudodigitadas pode ser usada para empacotar um virion artificial em um ambiente de nível 2 de biossegurança (BSL-2). Portanto, pps representam uma ferramenta mais segura e útil para estudar os processos do vírus da gripe, dependendo de suas duas principais glicoproteínas: hemaglutinina (HA) e neuraminidase (NA).
Este protocolo descreve a geração desses pps com uma estratégia de cotransfecção de três plasmid (vista geral na Figura 1),como quantificar pps e detecção de infectividade. A produção pp envolve três tipos de plasmídeos (Figura 1). O gene gag-pol, que codifica a proteína Gag-Pol retrovírus, foi clonado de um kit de embalagem retrovírus e inserido no plasmídeo pcDNA 3.1 e chamado pcDNA-Gag-Pol. O gene de proteína fluorescente verde melhorada (eGFP), que codifica a Proteína Fluorescente Verde, foi clonado do vetor pTRE-EGFP, inserido no plasmídeo pcDNA 3.1 e chamado pcDNA-GFP. Durante a clonagem, uma seqüência de sinal de embalagem () foi adicionada através de uma cartilha. Os genes HA e NA foram clonados em um plasmid pVRC, chamado pVRC-HA e pVRC-NA, respectivamente. O último plasmídeo codifica a proteína de fusão e pode ser substituído por qualquer outra proteína de fusão de interesse. Nossa plataforma de pseudotipagem inclui dois plasmídeos de expressão glicoproteína: pVRC-HA e pVRC-NA. Isso pode simplificar a pesquisa sobre a revariedadeção entre diferentes cepas de vírus em uma configuração BSL-2.
1. Dia 1: Cultura celular e semeadura
2. Dia 2: Cotransfecção de quatro plasmídeos mediada por Lipofection
3. Dia 3: Semeadura de células suscetíveis
4. Dia 4: Pseudodigitado Coleção de Partículas Virais, Quantificação e Ensaio de Infectividade
5. Dia 5 ou 6: Detecção de infectividade
Neste protocolo, descrevemos um método para produzir partículas pseudodigitadas pelo vírus influenza (pp) em uma configuração BSL-2. O repórter plasmid pcDNA-GFP é incorporado aos pps e pode ser usado para quantificar pps pela FACS em um ensaio de infectividade. Escolhemos dois tipos de linhas celulares suscetíveis porque elas são amplamente utilizadas na pesquisa da gripe. As células MDCK forneceriam um bom controle para as células humanas imortalizadas variáveis usadas nesses estudos.
Este protocolo é baseado no vírus Retrovírus MLV, que pode incorporar um repórter GFP e produzir botões na membrana celular. Esta técnica tem sido amplamente desenvolvida para embalagem partículas do vírus influenza4,22,23,24. Alguns outros sistemas são baseados no sistema de pseudotipagem lentiviral HIV-119,25,26 ou no sistema de expressão de células baculovírus-insetos27,28,29. Muitos outros genes de repórter também têm sido utilizados para a produção de pseudopartículas, como luciferase (luminescência)30,31,32,33, β-gal/LacZ (por colorimetria)34,35,e secretado phosphatase alcalino36,37. Millet et al. usaram o ensaio luciferase para quantificar a infectividade de partículas pseudodigitadas coronavírus33. Em comparação com a luciferase, a fluorescência verde da GFP é facilmente observada com um microscópio biológico fluorescente invertido. Esta é uma maneira conveniente de verificar a eficiência da transfecção e da infecção. Para este estudo, a infectividade pode ser determinada diretamente atoling as células GFP-positivas com FACS.
Neste método, várias etapas afetam criticamente os resultados. A densidade celular otimizada é um fator crítico para a transfecção bem-sucedida. Neste protocolo, uma densidade celular na faixa de 80-90% de confluentes foi encontrado para ser ideal para a produção pp do vírus influenza. Maior ou menor densidade celular resultará em menor eficiência de transfecção. Bom estado fisiológico das células produtoras também é muito importante para a alta produção de partículas. É por isso que as células hek 293T/17 de passagem de células inferiores são recomendadas para produzir pps neste protocolo. Além disso, o volume de reagente de transfecção e a proporção das quatro quantidades de plasmídeos também podem afetar a eficiência da transfecção. Para obter a maior eficiência de transfecção, recomenda-se otimizar esses fatores variando e testando sua quantidade. Definimos a proporção de quatro quantidades de plasmídeos como 16:16:1:1 e o volume de reagente de transfecção como 8 μL para uma transfecção de poços em uma placa de 6 poços. Outra questão é o manuseio das células. As células produtoras HEK 293T/17 são de baixa adesão, então o manuseio manual das células deve ser muito gentil. A lipofecção pode levar a um aumento da permeabilidade celular, e soro e anticorpos no meio podem aumentar a citotoxicidade. É melhor usar dmem sem soro e livre de anticorpos para culturas pós-transfected HEK 293T/17 células. Além disso, o tempo de coleta é importante. Em 36-48 h pós-transfecção, a cor do supernatant celular deve ser verificado para se certificar de que é rosa ou laranja-rosa antes da coleção pp. Supernatant amarelo indica que o meio é muito ácido para apoiar o crescimento celular e geralmente leva a rendimentos pp pobres.
Realizamos o ensaio de transfecção em uma placa de 6 poços. Para obter mais volume pp o número de poços de transfecção pode ser aumentado e supernatants que contêm os mesmos pps podem ser agrupados. Alternativamente, algum outro tipo de embarcações pode ser usado para aumentar o rendimento pp. Por exemplo, 18 μL de reagente de transfecção e 5,5 μg de DNA plasmídeo podem ser usados para realizar transfecção com 2,2 x 106 células em um prato de 60 mm. Da mesma forma, um ensaio de infectividade pode ser realizado em uma placa de 24 poços.
O sucesso desta técnica pode ser influenciado por muitos fatores. Portanto, o procedimento deve ser otimizado para embalagens de partículas de diferentes tipos de vírus.
Neste protocolo, foram geradas partículas virais pseudodigitadas de HPAI H5N1 e H7N9, bem como seus reassortants. Neste método, usamos qRT-PCR do GFP-RNA no ensaio de infectividade no nível unicelular (como cópias do genoma por célula) em vez de Tissue Culture Infectious Dose 50 (TCID50) ou MOI tradicional23,38,39. Os métodos de titration da infectividade do vírus são baseados em ensaios da chapa ou nos ensaios de TCID50, que são demorados e labor-intensive. Ambos os ensaios dependem da medição de efeitos citopáticos visíveis (CPE) causada por infecção por vírus em linhas celulares, por isso pode ser difícil titrate vírus de baixa infectividade (ou seja, H7pp neste estudo). Achamos que é um método conveniente, eficaz e rápido para normalizar pps com qRT-PCR do RNA GFP contido em pps de gripe.
Em conjunto, nossa técnica é segura e adaptável, e pode ser usada para estudar vírus envolvidos, incluindo seus receptores, troposms, função glicoproteína envelope, neutralizando anticorpos, desenvolvimento de medicamentos antivírus, diagnóstico e projeto de vacinas e Avaliação.
The authors have nothing to disclose.
Benzonase Nuclease | Millipore | 70664 | Effective viscosity reduction and removal of nucleic acids from protein solutions |
Clear Flat Bottom Polystyrene TC-treated Microplates (96-well) | Corning | 3599 | Treated for optimal cell attachment<br/> Sterilized by gamma radiation and certified nonpyrogenic<br/> Individual alphanumeric codes for well identification |
Clear TC-treated Multiple Well Plates (6-wells) | Costar | 3516 | Individual alphanumerical codes for well identification<br/> Treated for optimal cell attachment<br/> Sterilized by gamma irradiation |
Dulbecco's modified essential medium (DMEM) | Gibco | 11965092 | A widely used basal medium for supporting the growth of many different mammalian cells |
Fetal bovine serum | Excell | FND500 | fetal bovine sera that can offer excellent value for basic cell culture, specialty research, and specific assays |
Fluorescence Activated Cell Sorting (FACS) | Beckman coulter | cytoflex | |
Human alveolar adenocarcinoma A549 cells | ATCC | CRM-CCL-185 | |
Human embryonic kidney (HEK) HEK-293T/17 cells | ATCC | CRL-11268 | A versatile transfection reagent that has been shown to effectively transfect the widest variety of adherent and suspension cell lines |
Inverted fluorescent biological microscope | Olympus | BX51-32P01-FLB3 | |
Inverted light microscope | Olympus | CKX31-12PHP | |
Lipofectamine 2000 Transfection Reagent | Invitrogen | 11668019 | Rapid, sensitive and precise probe-based qPCR detection and quantitation of target RNA targets. |
Luna Universal Probe One-Step RT-qPCR Kit | NEB | E3006L | Will withstand up to 14,000 RCF<br/> RNase-/DNase-free Nonpyrogenic |
Madin-Darby Canine Kidney (MDCK) cells | ATCC | CCL-34 | |
MaxyClear Snaplock Microcentrifuge Tube (1.5 mL) | Axygen | MCT-150-C | 33 mm, gamma sterilized |
Millex-HV Syringe Filter Unit, 0.45 µm, PVDF | Millipore | SLHV033RS | an improved Minimal Essential Medium (MEM) that allows for a reduction of Fetal Bovine Serum supplementation by at least 50% with no change in cell growth rate or morphology. Opti-MEM I medium is also recommended for use with cationic lipid transfection reagents, such as Lipofectamine reagent. |
Opti-MEM I Reduced Serum Medium | Gibco | 11058021 | The antibiotics penicillin and streptomycin are used to prevent bacterial contamination of cell cultures due to their effective combined action against gram-positive and gram-negative bacteria. |
penicillin-streptomycin | Gibco | 15140122 | Maximum RCF is 12,500 xg<br/> Temperature range from -80 °C to 120 °C<br/> RNase-/DNase-free<br/> Sterile |
PP Centrifuge Tubes (15 mL) | Corning | 430791 | a stable and highly reactive serine protease |
Proteinase K | Beyotime | ST532 | Treated for optimal cell attachment<br/> Sterilized by gamma radiation and certified nonpyrogenic |
TC-treated Culture Dish (60mm) | Corning | 430166 | Trypsin from bovine pancreas<br/> TPCK Treated, essentially salt-free, lyophilized powder, ≥10,000 BAEE units/mg protein |
TPCK-trypsin | Sigma | T1426 | This liquid formulation of trypsin contains EDTA and phenol red. Gibco Trypsin-EDTA is made from trypsin powder, an irradiated mixture of proteases derived from porcine pancreas. Due to its digestive strength, trypsin is widely used for cell dissociation, routine cell culture passaging, and primary tissue dissociation. The trypsin concentration required for dissociation varies with cell type and experimental requirements. |
Trypsin-EDTA (0.25%), phenol red | Gibco | 25200056 |