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Artigo de método

O Método CrioAPEX para Análise de Microscopia Eletrônica da Localização da Proteína da Membrana dentro de células ultraestruturalmente preservadas

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DOI:

10.3791/60677

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27 de fevereiro de 2020

Neste artigo

Resumo

Este protocolo descreve o método crioAPEX, no qual uma proteína de membrana com etiqueta APEX2 pode ser localizada por microscopia eletrônica de transmissão dentro da ultraestrutura celular idealmente preservada.

Resumo

Eventos celulares-chave como transdução de sinal e tráfico de membrana dependem da localização adequada da proteína dentro dos compartimentos celulares. Compreender a localização subcelular precisa das proteínas é, portanto, importante para responder a muitas questões biológicas. A busca por um rótulo robusto para identificar a localização de proteínas combinada com a preservação e a coloração adequadas do celular tem sido historicamente desafiadora. Os recentes avanços nas imagens de microscopia eletrônica (EM) levaram ao desenvolvimento de muitos métodos e estratégias para aumentar a preservação celular e rotular proteínas alvo. Uma tag genética relativamente nova baseada em peroxidase, APEX2, é um líder promissor em etiquetas em ativas em clones. A preparação amostral para microscopia eletrônica de transmissão (TEM) também avançou nos últimos anos com o advento da criofixação por congelamento de alta pressão (FpE) e desidratação e coloração de baixa temperatura via substituição de congelamento (FS). O HPF e o FS proporcionam excelente preservação da ultraestrutura celular para imagens TEM, perdendo apenas para direcionar a crio-imagem de amostras vívidas. Aqui apresentamos um protocolo para o método crioAPEX, que combina o uso da tag APEX2 com HPF e FS. Neste protocolo, uma proteína de interesse é marcada com APEX2, seguida de fixação química e reação peroxidase. No lugar da tradicional coloração e desidratação alcoólica à temperatura ambiente, a amostra é criofixada e sofre desidratação e coloração em baixa temperatura via FS. Usando crioAPEX, não só uma proteína de interesse pode ser identificada dentro de compartimentos subcelulares, mas também informações adicionais podem ser resolvidas em relação à sua topologia dentro de uma membrana estruturalmente preservada. Mostramos que este método pode fornecer alta resolução suficiente para decifrar padrões de distribuição de proteínas dentro de um lumen organela, e distinguir a compartimentação de uma proteína dentro de uma organela próxima a outras organelas não rotuladas. Além disso, o crioAPEX é processualmente simples e incapacitado para células cultivadas na cultura tecidual. Não é mais tecnicamente desafiador do que métodos típicos de criofixação e congelamento de substituição. O CrioAPEX é amplamente aplicável para análise de TEM de qualquer proteína de membrana que possa ser geneticamente etiquetada.

Introdução

Estudos biológicos muitas vezes incluem questões de resolução de localização de proteínasubcelular dentro de células e organelas. A microscopia de imunofluorescência fornece uma visão útil de baixa resolução da localização de proteínas, e os recentes avanços na imagem de superresolução estão empurrando os limites de resolução para proteínas fluorescentesmarcadas 1,2,3. No entanto, a microscopia eletrônica (EM) continua sendo o padrão-ouro para a ultraestrutura celular de alta resolução por imagem, embora a rotulagem de proteínas seja um desafio.

Hi....

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Protocolo

1. Cultura Celular e Transfecção

  1. As células HEK-293T de sementes em um prato de 60 mm de diâmetro ou cultura tecidual maior e crescem para 60% a 90% de confluência em uma incubadora de cultura celular a 37 °C e 5% de CO2.
  2. Células transfect com plasmídeos de expressão mamífero com apex2 com marca ção de forma ativa da transfecção usando reagente transfection (ver Tabela de Materiais) de acordo com as instruções do fabricante.
  3. Às 12 h e 15 h após a transfecção, lave células uma vez com soro lona tampão de fosfato (PBS). Remova as células do prato lavando suavemente com PBS. Um reagente dissociante, como a trippsi....

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Resultados

Para comparar a preservação ultraestrutural utilizando o método crioAPEX com fixação e desidratação tradicionais, preparamos amostras em que uma membrana retícula endoplasmática (ERM; O peptídeo da membrana ER foi marcado com APEX2 e transfecdo em células HEK-293T. ERM-APEX2 localiza a face citoplasmática do PS e remodela a estrutura ER em estruturas morfologicamente distintas conhecidas como ER (OSER)34,42,43. A morfologia oSER.......

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Discussão

O protocolo crioAPEX aqui apresentado fornece um método robusto para caracterizar a localização das proteínas da membrana dentro do ambiente celular. Não só o uso de uma tag APEX2 geneticamente codificada fornece localização precisa de uma proteína de interesse, mas o uso de criofixação e desidratação de baixa temperatura proporciona excelente preservação e coloração da ultraestrutura celular circundante. Combinados, essas abordagens são uma poderosa ferramenta para localizar uma proteína com alta precisão dentro de seu .......

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Divulgações

Os autores não declaram conflito de interesses.

Agradecimentos

O protocolo aqui descrito decorre de uma publicação de Sengupta et al., Journal of Cell Science, 132 (6), jcs22315 (2019)48. Este trabalho é apoiado por subsídios R01GM10092 (para S.M.) e AI081077 (R.V.S.) dos Institutos Nacionais de Saúde, CTSI-106564 (para S.M.) do Indiana Clinical and Translational Sciences Institute, e PI4D-209263 (to S.M.) do Instituto purdue university de inflamação, imunologia, imunologia e doença infecciosa.

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Materiais

Lista de materiais utilizados neste artigo
NomeEmpresaNúmero de catálogoComentários
3,3'-Diaminobenzidina tetracloridrato hidratoSigma-AldrichD5637-1G
Acetona (Destilado em Vidro)Microscopia Eletrônica Sciences10016
Beakers; Plástico, descartável 120 ccMicroscopia Eletrônica Sciences60952
Albumina de soro bovinoFrascos de armazenamento criogênico Sigma-AldrichA7906-100G
, 2 mLVWR82050-168
Dulbecco's Modified Eagle's MediumCorning10-017-CV
Durcupan ACM Fluka, componente único A, resina epóxi MSigma-Aldrich44611-500ML
Durcupan ACM Fluka, monocomponente B, endurecedor 964Sigma-Aldrich44612-500ML
Durcupan ACM Fluka, monocomponente C, acelerador 960 (DY 060)Sigma-Aldrich44613-100ML
Durcupan ACM Fluka, monocomponente DSigma-Aldrich44614-100ML
Molde de incorporação, plano padrão, 14 mm x 5 mm x 6 mmMicroscopia eletrônica Sciences70901
Molde de embutimento, padrão plano, 14 mm x 5 mm x 4 mmMicroscopia Eletrônica Sciences70900
Soro Fetal Bovino; Nu-Serum IV Suplemento de Meio de CrescimentoCorning355104
Barcos de Faca de Vidro, 6,4 mmCiências de Microscopia Eletrônica71008
Fabricante de Facas de VidroLeica MicrosystemsEM KMR3
Glutaraldeído 10% SoluçãoAquosa Microscopia Eletrônica Ciências16120
HEK 293 CélulasATCCCRL-1573
Freezer de alta pressão com sistema de transferência rápidaLeica MicrosystemsEM PACT2Produto arquivado substituído por solução Leica EM ICE
Peróxido de hidrogênio 30% ReagenteFisher Scientific50-266-27
Lipofectamine 3000ThermoFisher ScientificL3000015
Transportador de membrana para EM PACT2, 1,5 mm x 0,1 mmMager Scientific16707898
Tetróxido de Ósmio, cristalinoMicroscopia Eletrônica Sciences19110
Fosfato Tampolado Salino (PBS) 20X, Grau Ultra PuroVWR97062-950
Cápsulas de Plástico para AFS/AFS2, 5 mm x 15 mmMager Scientific16702738
Slot, cobre 2 x 1 mm com filme de suporte FormvarMicroscopia Eletrônica SciencesFF2010-
Tampão de Cacodilato de Sódio, 0,2 M, pH 7,4Ciências de Microscopia Eletrônica102090-962
Hidróxido de Sódio, Pellet 500 G (ACS)Avantor Macron Fine Chemicals7708-10
Microscopia EletrônicaÁcido Tânico21710
Placas de Cultura de Tecidos, Poliestireno, Estéril, Corning, 100 mmVWR25382-166
Tiras deFaca Ultra VidroMicroscopia Eletrônica Ciências71012
UltramicrótomoLeica MicrosystemsEM UC7
Acetato de Uranilo Di-hidratadoMicroscopia Ciências22400
de transfecção de Ciências

Referências

  1. Huang, B., Bates, M., Zhuang, X. Super-Resolution Fluorescence Microscopy. Annual Review of Biochemistry. 78, 993-1016 (2009).
  2. Sydor, A. M., Czymmek, K. J., Puchner, E. M., Mennella, V. Super-Resolution Microscopy From Single Molecules to Supramolecular Assemblies.

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Reimpressões e permissões

Etiquetas

Congelamento sob Alta PressãoSubstituição por CongelamentoTag APEX2Microscopia Eletrônica de TransmissãoPreservação CelularTopologia ProteicaCompartimentos Subcelulares