Este protocolo descreve o método crioAPEX, no qual uma proteína de membrana com etiqueta APEX2 pode ser localizada por microscopia eletrônica de transmissão dentro da ultraestrutura celular idealmente preservada.
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Artigo de método
Este protocolo descreve o método crioAPEX, no qual uma proteína de membrana com etiqueta APEX2 pode ser localizada por microscopia eletrônica de transmissão dentro da ultraestrutura celular idealmente preservada.
Eventos celulares-chave como transdução de sinal e tráfico de membrana dependem da localização adequada da proteína dentro dos compartimentos celulares. Compreender a localização subcelular precisa das proteínas é, portanto, importante para responder a muitas questões biológicas. A busca por um rótulo robusto para identificar a localização de proteínas combinada com a preservação e a coloração adequadas do celular tem sido historicamente desafiadora. Os recentes avanços nas imagens de microscopia eletrônica (EM) levaram ao desenvolvimento de muitos métodos e estratégias para aumentar a preservação celular e rotular proteínas alvo. Uma tag genética relativamente nova baseada em peroxidase, APEX2, é um líder promissor em etiquetas em ativas em clones. A preparação amostral para microscopia eletrônica de transmissão (TEM) também avançou nos últimos anos com o advento da criofixação por congelamento de alta pressão (FpE) e desidratação e coloração de baixa temperatura via substituição de congelamento (FS). O HPF e o FS proporcionam excelente preservação da ultraestrutura celular para imagens TEM, perdendo apenas para direcionar a crio-imagem de amostras vívidas. Aqui apresentamos um protocolo para o método crioAPEX, que combina o uso da tag APEX2 com HPF e FS. Neste protocolo, uma proteína de interesse é marcada com APEX2, seguida de fixação química e reação peroxidase. No lugar da tradicional coloração e desidratação alcoólica à temperatura ambiente, a amostra é criofixada e sofre desidratação e coloração em baixa temperatura via FS. Usando crioAPEX, não só uma proteína de interesse pode ser identificada dentro de compartimentos subcelulares, mas também informações adicionais podem ser resolvidas em relação à sua topologia dentro de uma membrana estruturalmente preservada. Mostramos que este método pode fornecer alta resolução suficiente para decifrar padrões de distribuição de proteínas dentro de um lumen organela, e distinguir a compartimentação de uma proteína dentro de uma organela próxima a outras organelas não rotuladas. Além disso, o crioAPEX é processualmente simples e incapacitado para células cultivadas na cultura tecidual. Não é mais tecnicamente desafiador do que métodos típicos de criofixação e congelamento de substituição. O CrioAPEX é amplamente aplicável para análise de TEM de qualquer proteína de membrana que possa ser geneticamente etiquetada.
Estudos biológicos muitas vezes incluem questões de resolução de localização de proteínasubcelular dentro de células e organelas. A microscopia de imunofluorescência fornece uma visão útil de baixa resolução da localização de proteínas, e os recentes avanços na imagem de superresolução estão empurrando os limites de resolução para proteínas fluorescentesmarcadas 1,2,3. No entanto, a microscopia eletrônica (EM) continua sendo o padrão-ouro para a ultraestrutura celular de alta resolução por imagem, embora a rotulagem de proteínas seja um desafio.
Hi....
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1. Cultura Celular e Transfecção
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Para comparar a preservação ultraestrutural utilizando o método crioAPEX com fixação e desidratação tradicionais, preparamos amostras em que uma membrana retícula endoplasmática (ERM; O peptídeo da membrana ER foi marcado com APEX2 e transfecdo em células HEK-293T. ERM-APEX2 localiza a face citoplasmática do PS e remodela a estrutura ER em estruturas morfologicamente distintas conhecidas como ER (OSER)34,42,43. A morfologia oSER.......
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O protocolo crioAPEX aqui apresentado fornece um método robusto para caracterizar a localização das proteínas da membrana dentro do ambiente celular. Não só o uso de uma tag APEX2 geneticamente codificada fornece localização precisa de uma proteína de interesse, mas o uso de criofixação e desidratação de baixa temperatura proporciona excelente preservação e coloração da ultraestrutura celular circundante. Combinados, essas abordagens são uma poderosa ferramenta para localizar uma proteína com alta precisão dentro de seu .......
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Os autores não declaram conflito de interesses.
O protocolo aqui descrito decorre de uma publicação de Sengupta et al., Journal of Cell Science, 132 (6), jcs22315 (2019)48. Este trabalho é apoiado por subsídios R01GM10092 (para S.M.) e AI081077 (R.V.S.) dos Institutos Nacionais de Saúde, CTSI-106564 (para S.M.) do Indiana Clinical and Translational Sciences Institute, e PI4D-209263 (to S.M.) do Instituto purdue university de inflamação, imunologia, imunologia e doença infecciosa.
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| Nome | Empresa | Número de catálogo | Comentários |
|---|---|---|---|
| 3,3'-Diaminobenzidina tetracloridrato hidrato | Sigma-Aldrich | D5637-1G | |
| Acetona (Destilado em Vidro) | Microscopia Eletrônica Sciences | 10016 | |
| Beakers; Plástico, descartável 120 cc | Microscopia Eletrônica Sciences | 60952 | |
| Albumina de soro bovino | Frascos de armazenamento criogênico Sigma-Aldrich | A7906-100G | |
| , 2 mL | VWR | 82050-168 | |
| Dulbecco's Modified Eagle's Medium | Corning | 10-017-CV | |
| Durcupan ACM Fluka, componente único A, resina epóxi M | Sigma-Aldrich | 44611-500ML | |
| Durcupan ACM Fluka, monocomponente B, endurecedor 964 | Sigma-Aldrich | 44612-500ML | |
| Durcupan ACM Fluka, monocomponente C, acelerador 960 (DY 060) | Sigma-Aldrich | 44613-100ML | |
| Durcupan ACM Fluka, monocomponente D | Sigma-Aldrich | 44614-100ML | |
| Molde de incorporação, plano padrão, 14 mm x 5 mm x 6 mm | Microscopia eletrônica Sciences | 70901 | |
| Molde de embutimento, padrão plano, 14 mm x 5 mm x 4 mm | Microscopia Eletrônica Sciences | 70900 | |
| Soro Fetal Bovino; Nu-Serum IV Suplemento de Meio de Crescimento | Corning | 355104 | |
| Barcos de Faca de Vidro, 6,4 mm | Ciências de Microscopia Eletrônica | 71008 | |
| Fabricante de Facas de Vidro | Leica Microsystems | EM KMR3 | |
| Glutaraldeído 10% Solução | Aquosa Microscopia Eletrônica Ciências | 16120 | |
| HEK 293 Células | ATCC | CRL-1573 | |
| Freezer de alta pressão com sistema de transferência rápida | Leica Microsystems | EM PACT2 | Produto arquivado substituído por solução Leica EM ICE |
| Peróxido de hidrogênio 30% Reagente | Fisher Scientific | 50-266-27 | |
| Lipofectamine 3000 | ThermoFisher Scientific | L3000015 | |
| Transportador de membrana para EM PACT2, 1,5 mm x 0,1 mm | Mager Scientific | 16707898 | |
| Tetróxido de Ósmio, cristalino | Microscopia Eletrônica Sciences | 19110 | |
| Fosfato Tampolado Salino (PBS) 20X, Grau Ultra Puro | VWR | 97062-950 | |
| Cápsulas de Plástico para AFS/AFS2, 5 mm x 15 mm | Mager Scientific | 16702738 | |
| Slot, cobre 2 x 1 mm com filme de suporte Formvar | Microscopia Eletrônica Sciences | FF2010- | |
| Tampão de Cacodilato de Sódio, 0,2 M, pH 7,4 | Ciências de Microscopia Eletrônica | 102090-962 | |
| Hidróxido de Sódio, Pellet 500 G (ACS) | Avantor Macron Fine Chemicals | 7708-10 | |
| Microscopia Eletrônica | Ácido Tânico | 21710 | |
| Placas de Cultura de Tecidos, Poliestireno, Estéril, Corning, 100 mm | VWR | 25382-166 | |
| Tiras de | Faca Ultra VidroMicroscopia Eletrônica Ciências | 71012 | |
| Ultramicrótomo | Leica Microsystems | EM UC7 | |
| Acetato de Uranilo Di-hidratado | Microscopia Ciências | 22400 |
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