Oi-C: um método para estudar a arquitetura tridimensional de Genomas.

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6 de maio de 2010

10.3791/1869-v

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Nynke L. van Berkum^*¹ , Erez Lieberman-Aiden^*²^,³^,⁴^,⁵ , Louise Williams^*² , Maxim Imakaev⁶ , Andreas Gnirke² , Leonid A. Mirny³^,⁶ , Job Dekker¹ , Eric S. Lander²^,⁷^,⁸

¹Program in Gene Function and Expression, Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology, University of Massachusetts Medical School, ²Broad Institute of Harvard and Massachusetts Institute of Technology, ³Division of Health Sciences and Technology, Massachusetts Institute of Technology, ⁴Program for Evolutionary Dynamics, Department of Organismic and Evolutionary Biology, Department of Mathematics, Harvard University , ⁵Department of Applied Mathematics, Harvard University , ⁶Department of Physics, Massachusetts Institute of Technology, ⁷Department of Systems Biology, Harvard Medical School, ⁸Department of Biology, Massachusetts Institute of Technology

^* These authors contributed equally

O método de Hi-C permite a identificação imparciais, de todo o genoma de interações cromatina (1). Oi-C casais ligadura proximidade e seqüenciamento massivamente paralelo. Os dados resultantes podem ser usados para estudar a arquitetura genômica em múltiplas escalas: resultados iniciais identificadas características como territórios cromossomo, a segregação da cromatina abertas e fechadas, e estrutura da cromatina na escala megabase.