August 7th, 2010
Análise microscópica de γH2AX focos, que formam após a fosforilação de H2AX em Ser-139 em resposta ao DNA dupla fita-breaks, tornou-se uma ferramenta valiosa na biologia da radiação. Aqui usamos um anticorpo mono-metilado histona H3 em lisina 4 como um marcador epigenético ativamente de eucromatina transcrever, para avaliar a distribuição espacial da radiação induzida por formação γH2AX dentro do núcleo.
Olá, sou Raja Ti fazendo meu doutorado no Baker IDI Heart and Diabetes Institute. Vou guiá-lo pelas etapas envolvidas na ilustração 3D da modificação oriental que marcou danos ao DNA e condensação cromática em uma nova célula cardíaca. O DNA é enrolado em zonas nucleares.
Cada nucleossomo é composto de quatro tipos diferentes de histonas, H dois A, H dois b, H três e H quatro radios. A formação de quebras de DNA e isso é marcado por PHO de H dois X.Este pho de H dois X ocorre principalmente na creatina que é marcada pela metilação de H três K quatro. Agora veremos a ilustração 3D das modificações no imunomarcador celular com a camada pho H dois X e a metilada H Three K quatro.
Vamos começar. Começamos colocando o curso E da suspensão celular em 15 mil. Os tubos Falcon S são lavados duas vezes com aromatização PB em um 50 G e Resus.
Suspenda em novas mídias para ver o efeito imediato da radiação nos eventos celulares. Mantenha as células nos olhos por cinco a 10 minutos antes e durante a radiação. Exponha as células à radiação gama ou raios-x Após a radiação, dispense três mililitros da suspensão celular em cada GU de seis.
Placa de poço para pico gama H dois X incubar células entre 30 minutos a uma hora a 37 graus centígrados. Usamos a missão Cytosine para colocar as células não aderentes em lâminas de vidro. Ao montar o clipe de citosina, certifique-se de que todo o cabo do filtro coincida com o funil.
Dispense um 50 microlitros, limpe esta suspensão celular em cada citosina final, coloque os clipes de citosina na missão de citosina e gire-o 500 RPM por cinco minutos. Remova os clipes de citosina e separe as lâminas do cartão do filtro. Não deixe as células secarem ao ar por muito tempo, pois isso pode influenciar o fundo na coloração com fluoresceína.
Usando o pino de bloqueio de líquido, desenha círculos Ao redor de cada esfregaço, fixamos as células com cabeça de 4% de paraforma em temperatura ambiente por cinco minutos. Em comparação com etanol ou ol, uma melhor fixação foi observada com cabeça paraforme a 4%. Deslizamentos de vento com células permanentes PPS com Triton X 100 em temperatura ambiente por cinco minutos.
Em comparação com o gêmeo 80, observamos um sinal melhor nas células com Triton X 100. Observe as células com PP S3 vezes cada por cinco minutos. Bloqueie as células em uma pessoa BSA por 10 minutos em temperatura ambiente e repita isso três vezes quando comparado a outros agentes bloqueadores e vezes.
A BSA foi mais eficiente Na minimização da ligação não específica de anticorpos primários, usamos dois anticorpos primários diluídos um em 500 com 1% de BSA em aproximadamente 50 microlitros de anticorpo primário para cada lâmina. A incubação do anticorpo primário à temperatura ambiente por 60 minutos reduz a coloração de fundo em comparação com a incubação noturna a quatro graus centígrados. Lave as células três vezes com PBS por cinco minutos.
Alexa andar 4 88, bom anti-mouse e Alexa andar 5 46 palavras anti coelho. Anticorpos secundários foram usados para manter diferentes marcadores simultaneamente. Use anticorpos criados em diferentes espécies.
Adicione aproximadamente 50 microlitros de anticorpo secundário diluído a cada lâmina. Incube as células em temperatura ambiente por 90 minutos. Recomenda-se incubar células em sua câmara úmida, pois isso impedirá que as células e os anticorpos sequem as lâminas de lavagem com PB S3 vezes cada por cinco minutos.
50 microlitros de uma diluição em 500 do topo três em PBS foram adicionados a cada lâmina. Lave as lâminas com PBS três vezes cada por cinco minutos. Remova o excesso de umidade das lâminas e adicione a solução Antifa.
Recomenda-se não secar completamente as células antes de adicionar a solução Antifa. Coloque uma lamínula na lâmina. K deve ser tomado para evitar a formação de bolhas de ar.
Deixe as lâminas durante a noite em uma câmara escura e úmida. Sele a lâmina com esmalte para evitar o ressecamento das células. As imagens adquiridas por um microscópio confocal revelam.
A melhor resolução espacial se foi e o laser de hélio foi usado para a aquisição da imagem. Um objeto de emissões de óleo 63 duas lentes preferidas a lentes de maior ou menor ampliação. Um fator de zoom de três ou quatro produzirá uma imagem de melhor resolução.
Para contabilidade de FO de muitas células, é preferível usar uma velocidade de varredura de oito, um tamanho de imagem de 1024 em células de 1024 pixels. Ao criar imagens para vários canais, recomenda-se uma aquisição de varredura de linha sequencial em comparação com a varredura de quadro. Para evitar o branqueamento da amostra, o ganho do detector e o deslocamento do amplificador são ajustados para reduzir os mouses e a saturação do sinal.
Como o tamanho do Kama HX X quatro pode ser inferior a 0,5 micrômetros, recomenda-se adquirir imagens com pelo menos 0,5 micrômetro. As imagens do tamanho do passo ao longo do eixo do jato são necessárias em um padrão de série de jato usando a marca primeiro e a marca perdida. Para ilustrar a relação espacial entre diferentes proteínas, recomenda-se usar uma velocidade de varredura de seis com tamanho de imagem de 2048 E 2 48 pixels usando metamor primeiro.
O segundo pode ser contado a partir de imagens adquiridas em vários microscópios confocais. Abra tags de imagem gamma hgx diretamente do menu de arquivo ou usando números de conta. Tags. Vá para o menu de processo e escolha Pilha aritmática.
Escolha a projeção máxima e selecione os planos a serem incluídos. E clique em OK. Agora escolha cartola e selecione Gamma H duas imagens X como imagem de origem aplicada.
O filtro de cartola e a imagem resultante serão uma imagem binária com menos ruído e variação reduzida na intensidade dos focos. Vá para regiões e selecione a ferramenta de desenho de região e desenhe regiões ao redor dos núcleos. Vá para processar, menu e imagem de limite de venda.
Escolha o limite de inclusão e defina os valores de limite inferior e superior. Geralmente, são os valores limite que afetam o número quatro. O valor limite ideal é aquele que minimiza a inclusão do plano de fundo e maximiza a inclusão da incursão.
Isso pode ser melhor alcançado contando o número de incursões usando diferentes valores limite. E então compare o número de incursão com a contagem a olho nu. Selecione a imagem DPI e vá para o menu de regiões e selecione a opção de transferência de regiões.
Agora temos incursões correspondentes e imagens nucleares prontas para contagem. A maioria das regiões nucleares é transferida para a cartola. Vá para o menu de medição e selecione análise integrada ou IMA, selecione Medir todas as regiões e clique em medir para obter o número FTE.
Agora, os números FTE de cada região podem ser exportados para a planilha usando a opção Dados de log. Abra as imagens do projetor a jato criadas anteriormente para cada canal. Vá para exibir e selecione alinhar cores.
Selecione as respectivas imagens de origem para cada canal para criar uma imagem de imagem para todos os três canais. A análise de varredura de linha é realizada para ilustrar o posicionamento espacial de diferentes marcadores no núcleo. Vá para o comando medir barras de ferramentas e selecione a linha seca da análise de varredura de linha na célula.
Isso criará um gráfico mostrando a intensidade fluorescente de cada canal ao longo da linha e representa a distância de diferentes marcadores em relação uns aos outros. Para criar uma imagem 3D a partir de uma pilha, vá para um menu de pilha e escolha Reconstrução 3D. Selecione o máximo do tipo de reconstrução 3D.
Escolha o plano de rotação, escolha a distância de calibração do jato. Normalmente, o usuário especifica clique em OK para criar uma reconstrução 3D. E isso conclui nosso protocolo para imunofluor e coloração e análise de imagem.
Em resumo, o microscópio confocal de imunofluorescência é duas técnicas para o visual tridimensional de diferentes marcadores C e gama H dois X foy no núcleo da célula. Obrigado por assistir.
View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos
Este estudo concentra-se na análise de focos γH2AX, que são indicadores críticos de quebras de fita dupla de DNA na biologia da radiação. Ao utilizar um anticorpo para a histona H3 mono-metilada na lisina 4, a pesquisa avalia a distribuição espacial da formação de γH2AX dentro do núcleo após a exposição à radiação.
Understanding the spatial distribution of DNA damage markers like γH2AX provides mechanistic insights into chromatin context and transcriptional activity following radiation exposure. This approach supports target validation by linking epigenetic states to DNA repair pathways, enabling predictive confidence in preclinical models of genotoxic stress. The method enhances assay development for screening radiation-modifying compounds by quantifying foci formation in defined nuclear compartments.
The method fits within the discovery continuum from target validation through lead identification to preclinical assessment, particularly for genotoxic compound screening and mechanistic follow-up.