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Faça uma cultura de Lactococcus lactis expressando a peptidase ligada à membrana NisP.
Misture a cultura com um meio rico em nutrientes.
Adicione o ágar derretido, misture e despeje em um prato para distribuir uniformemente L. lactis no ágar.
Depois de solidificado, perfure os poços no ágar.
Em seguida, pegue E. coli recombinante produzindo variantes precursoras de tipo selvagem ou modificadas do peptídeo antimicrobiano nisina.
Centrifugue para pellet as bactérias, descarte os sobrenadantes e ressuspenda os pellets em tampão.
Sonicar para lisar as bactérias, centrifugar e transferir os sobrenadantes para tubos novos.
Normalize os lisados para a mesma densidade óptica usando tampão para garantir níveis consistentes de peptídeos.
Pipetar cada amostra para alvéolos de ágar individuais e incubar as amostras.
Durante a incubação, os peptídeos precursores de nisina se difundem no ágar e são clivados por NisP, gerando nisina madura.
A nisina madura inibe o crescimento de L. lactis , formando halos claros ao redor do poço.
Compare os tamanhos do halo para avaliar a atividade antimicrobiana das variantes da nisina.
Adicione um mililitro da pré-cultura de Lactococcus lactis a 25 mililitros de caldo 2X M17 contendo 10 microgramas por mililitro de cloranfenicol e dois por cento de glicose. Em seguida, adicione 25 mililitros de ágar derretido morno, misture e despeje a solução em uma placa de Petri grande. Mantendo condições estéreis, seque a placa por 10 a 15 minutos.
Em seguida, esterilize as extremidades de uma pipeta Pasteur de vidro com chama. Depois que a pipeta esfriar, use sua extremidade larga para criar orifícios no ágar solidificado. Rotule o fundo da placa de Petri para cada amostra ao lado da posição do orifício correspondente.
Para o ensaio de atividade, pegue as amostras de um mililitro das culturas de produção de E.coli e centrifugue-as por três minutos a 7.000 vezes g. Aspirar o meio restante e ressuspender o sedimento celular em 500 microlitros de tampão fosfato de sódio por pipetagem.
Em seguida, sonice a amostra no gelo submergindo a ponta da sonda sonicadora na suspensão celular. Inicie a sonicação. Em seguida, centrifugue o lisado celular por 10 minutos a 13.000 vezes g para granular os detritos das células.
Transferir o sobrenadante para um novo tubo de reacção no gelo. Diluir e normalizar os sobrenadantes para um mililitro de um OD600 igual a 0,6, em relação à densidade celular colhida, com tampão fosfato de sódio e misturar. Para testar a atividade antimicrobiana, adicione 40 microlitros da amostra normalizada no orifício designado do ágar indicador.
Aguarde até que toda a amostra seja difundida para o ágar. Incube a placa durante a noite a 30 graus Celsius. No dia seguinte, tire fotos da placa de ágar usando um scanner de mesa ou câmera digital.
O tamanho do halo de inibição do crescimento pode ser medido manualmente ou usando software.