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Para purificar a proteína recombinante fundida à etiqueta de poli-histidina - uma sequência de resíduos de histidina em um terminal - de um lisado de células bacterianas, primeiro dilua o lisado celular para evitar o entupimento da coluna durante a execução cromatográfica.
Montar uma coluna de afinidade contendo catiões divalentes de níquel imobilizados sobre uma matriz de grânulos de agarose utilizando ácido nitrilotriacético, um agente quelante. O ácido nitrilotriacético se liga aos cátions de níquel por meio de quatro sítios covalentes coordenados, enquanto dois locais no íon metálico permanecem disponíveis para interações com marcadores de poli-histidina na proteína de interesse.
Equilibre a coluna com tampão adequado para otimizar as condições para interações metal-proteína eficazes. Carregue o lisado celular na coluna.
As proteínas recombinantes, transportando resíduos de histidina terminal acessíveis, formam ligações de coordenação com cátions de níquel devido à alta afinidade do íon metálico pelo imidazol, a cadeia lateral da histidina, e se ligam à matriz. O alto número de histidinas consecutivas na proteína recombinante fortalece sua ligação à matriz.
Em comparação, as proteínas sem resíduos de histidina não aderem à coluna e eluem em fluxo. Lave a coluna com tampão imidazol de baixa concentração.
O imidazol compete com contaminantes proteicos fracamente ligados que podem ter aderido inespecificamente à matriz por meio de resíduos de histidina em sua cadeia polipeptídica, deslocando-os e facilitando a eluição. Lave a coluna com tampão imidazol altamente concentrado para dissociar as proteínas recombinantes marcadas com histidina fortemente ligadas do quelato de íons de níquel, eluíndo-as em fluxo.
Recolha a fracção de proteínas recombinantes purificada para análise posterior.
Comece este protocolo com superexpressão induzível de uma proteína marcada com histidina, conforme descrito no protocolo de texto. Prepare 1 mililitro de resina de ácido nitriloacético em uma coluna de gravidade, para purificar a proteína. No dia anterior ao uso, equilibre a coluna durante a noite a 4 graus Celsius com 2 mililitros de tampão de equilíbrio.
No dia seguinte, leve a coluna de 4 graus Celsius à temperatura ambiente, antes de carregar o lisado clarificado, e deixe-a repousar por aproximadamente duas a três horas. Em seguida, suspenda novamente o pellet no tampão de lise.
Sonicar as células no gelo por intervalos de 10 vezes 10 segundos, pausando 30 segundos entre os pulsos. Clarificar o lisado por centrifugação a 3080 x g durante 30 minutos a 4 graus Celsius utilizando uma microcentrífuga.
Prepare o lisado clarificado com volumes iguais de tampão de lise e, em seguida, aplique o lisado clarificado preparado na coluna e colete o fluxo. Reaplique o fluxo de lisado clarificado na coluna e colete o fluxo secundário.
Em seguida, lave a coluna com 5 mililitros de tampão de lavagem #1 e colete o fluxo. Lave a coluna novamente com 5 mililitros de tampão de lavagem #2 e colete o fluxo. Agora, aplique 2 mililitros de tampão de eluição. Colete o fluxo em duas frações de 1 mililitro cada.