Reação em cadeia da polimerase gradiente para determinar a temperatura ideal de recozimento

0 vistas2:30 min • July 8th, 2025

A reação em cadeia da polimerase gradiente é uma técnica para otimizar a temperatura de recozimento na qual os primers - DNA de fita simples específica da sequência - se ligam aos locais complementares no DNA molde.

Pegue uma mistura contendo primers diretos e reversos, dNTPs e DNA polimerase termoestável em um tampão apropriado. Adicione o DNA molde e transfira os constituintes para uma placa de PCR.

Coloque a placa em um termociclador gradiente com um bloco de aquecimento especializado. Isso estabelece um gradiente linear de temperatura de recozimento entre a faixa de 55 °C a 65 °C, com um incremento consistente na temperatura em toda a placa.

A reação aquece a placa a uma alta temperatura, desnaturando o DNA de fita dupla em fitas simples e ativando a DNA polimerase. Posteriormente, a temperatura é reduzida de acordo com os valores programados em cada poço, facilitando o recozimento do primer.

Na temperatura de recozimento abaixo do ideal, os primers se ligam não especificamente ao DNA desnaturado, levando a uma amplificação não específica durante a reação de PCR. Em temperatura acima do ideal, quantidades insuficientes dos primers se ligam ao DNA.

Na temperatura ideal, os primers se ligam especificamente ao DNA alvo. Em seguida, a temperatura aumenta ligeiramente, permitindo que a polimerase estenda os primers usando dNTPs. Esses ciclos repetitivos de desnaturação, recozimento e extensão levam à amplificação do DNA.

Analise o produto em cada poço. Os poços com temperaturas de recozimento não ótimas apresentam amplificação menor ou não específica.

Uma temperatura de recozimento ideal produz a amplificação específica máxima do DNA.

Para realizar um PCR de gradiente, comece preparando uma mistura principal. Em seguida, remova 19 microlitros da mistura master para o controle sem modelo, ou NTC, em uma placa de 96 poços. Em seguida, adicione o modelo à mistura principal restante. Alíquota de 20 microlitros da mistura de amostra na placa de 96 poços. Realize a PCR seguindo os parâmetros de ciclagem e, em seguida, gere os perfis de fusão térmica, usando os parâmetros mencionados no manuscrito.

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Última atualização: 29 agosto 2026