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Técnicas Biológicas
0 vistas • 3:25 min • July 8th, 2025
Para enumerar bacteriófagos por meio de reação em cadeia da polimerase quantitativa, qPCR, obtenha um coquetel de reação qPCR contendo Taq DNA polimerase, primers, trifosfatos de desoxinucleotídeos - dNTPs - e moléculas de corante repórter fluorescente em um tampão otimizado. Transfira para os poços de uma placa qPCR.
Adicione bacteriófagos tratados termicamente. O tratamento térmico libera DNA de bacteriófagos de partículas de bacteriófagos. Sele a placa, evitando a evaporação da mistura. Carregue a placa no sistema qPCR, definindo as condições de ciclo apropriadas.
O aquecimento a altas temperaturas desnatura o DNA de fita dupla em fitas simples. Também ativa a Taq DNA polimerase. O recozimento faz com que os primers específicos da sequência se liguem às fitas complementares de DNA do bacteriófago. A extensão permite que a Taq DNA polimerase ativada adicione dNTPs à extremidade 3' do primer, estendendo a fita de DNA em crescimento na direção 5' a 3'.
As moléculas de corante se intercalam no DNA de fita dupla recém-sintetizado, causando aumento da intensidade de fluorescência. Cada ciclo de PCR dobra a quantidade de DNA alvo, aumentando a intensidade da fluorescência.
Determine o valor do ciclo limiar, Ct, no qual a fluorescência medida excede o nível de fundo.
O valor de Ct está inversamente relacionado à quantidade inicial de DNA, com cada genoma de bacteriófago equivalente a uma partícula de bacteriófago, facilitando a quantificação do bacteriófago a partir da curva padrão do DNA do bacteriófago.
Pós-amplificação, realizar análise da curva de fusão, aumentando gradativamente a temperatura da reação. A uma temperatura de fusão específica, metade do DNA se separa em fitas simples, liberando moléculas de corante e causando diminuição repentina da fluorescência.
Uma temperatura de fusão distinta, exclusiva para o produto qPCR, valida a especificidade do produto.
Prepare a pré-mistura de qPCR para 10 amostras de fagos biopanned de concentração desconhecida e 7 amostras de concentrações padrão em triplicata, resultando em uma pré-mistura para 51 amostras contendo 255 microlitros de qPCR Master Mix, 51 microlitros de primers e 102 microlitros de água.
Alíquota de 8 microlitros da mistura de PCR preparada em 51 poços de uma placa qPCR de 96 poços. Em seguida, adicione dois microlitros de amostras de fagos T7 tratadas termicamente a cada um desses poços, dispensando-os abaixo da superfície da pré-mistura de qPCR. Usando filme adesivo, sele a placa.
Enrole a placa em papel alumínio para minimizar o fotobranqueamento de fluorescência e, em seguida, prossiga para executar a placa no equipamento qPCR. Defina as condições de ciclo e as configurações da curva de fusão conforme descrito no protocolo de texto.
Este artigo detalha um método para enumerar bacteriófagos utilizando reação em cadeia da polimerase quantitativa (qPCR). O processo envolve a preparação de um coquetel de reação de qPCR, a adição de bacteriófagos tratados termicamente e a análise da fluorescência resultante para quantificar partículas de bacteriófago.
A enumeração de bacteriófagos baseada em PCR quantitativa permite a quantificação precisa e de alto rendimento de partículas virais em fluxos de trabalho na fase de descoberta. Esta abordagem sustenta a validação robusta de alvos e o desenvolvimento de ensaios, fornecendo resultados quantitativos e reprodutíveis, essenciais para decisões precoces. A integração da enumeração por qPCR em fluxos de biotecnologia farmacêutica aumenta a confiança preditiva e a triagem de portfólios para terapêuticas baseadas em fagos ou moduladoras do microbioma.
A enumeração de fagos baseada em qPCR insere-se na continuidade entre a descoberta inicial e a identificação de candidatos promissores, fornecendo resultados quantitativos para testes de hipóteses e avaliação da prontidão do ensaio.
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Última atualização: 22 agosto 2026