Reação em cadeia da polimerase quantitativa para enumerar bacteriófagos

0 vistas3:25 min • July 8th, 2025

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Para enumerar bacteriófagos por meio de reação em cadeia da polimerase quantitativa, qPCR, obtenha um coquetel de reação qPCR contendo Taq DNA polimerase, primers, trifosfatos de desoxinucleotídeos - dNTPs - e moléculas de corante repórter fluorescente em um tampão otimizado. Transfira para os poços de uma placa qPCR.

Adicione bacteriófagos tratados termicamente. O tratamento térmico libera DNA de bacteriófagos de partículas de bacteriófagos. Sele a placa, evitando a evaporação da mistura. Carregue a placa no sistema qPCR, definindo as condições de ciclo apropriadas.

O aquecimento a altas temperaturas desnatura o DNA de fita dupla em fitas simples. Também ativa a Taq DNA polimerase. O recozimento faz com que os primers específicos da sequência se liguem às fitas complementares de DNA do bacteriófago. A extensão permite que a Taq DNA polimerase ativada adicione dNTPs à extremidade 3' do primer, estendendo a fita de DNA em crescimento na direção 5' a 3'.

As moléculas de corante se intercalam no DNA de fita dupla recém-sintetizado, causando aumento da intensidade de fluorescência. Cada ciclo de PCR dobra a quantidade de DNA alvo, aumentando a intensidade da fluorescência.

Determine o valor do ciclo limiar, Ct, no qual a fluorescência medida excede o nível de fundo.

O valor de Ct está inversamente relacionado à quantidade inicial de DNA, com cada genoma de bacteriófago equivalente a uma partícula de bacteriófago, facilitando a quantificação do bacteriófago a partir da curva padrão do DNA do bacteriófago.

Pós-amplificação, realizar análise da curva de fusão, aumentando gradativamente a temperatura da reação. A uma temperatura de fusão específica, metade do DNA se separa em fitas simples, liberando moléculas de corante e causando diminuição repentina da fluorescência.

Uma temperatura de fusão distinta, exclusiva para o produto qPCR, valida a especificidade do produto.

Prepare a pré-mistura de qPCR para 10 amostras de fagos biopanned de concentração desconhecida e 7 amostras de concentrações padrão em triplicata, resultando em uma pré-mistura para 51 amostras contendo 255 microlitros de qPCR Master Mix, 51 microlitros de primers e 102 microlitros de água.

Alíquota de 8 microlitros da mistura de PCR preparada em 51 poços de uma placa qPCR de 96 poços. Em seguida, adicione dois microlitros de amostras de fagos T7 tratadas termicamente a cada um desses poços, dispensando-os abaixo da superfície da pré-mistura de qPCR. Usando filme adesivo, sele a placa.

Enrole a placa em papel alumínio para minimizar o fotobranqueamento de fluorescência e, em seguida, prossiga para executar a placa no equipamento qPCR. Defina as condições de ciclo e as configurações da curva de fusão conforme descrito no protocolo de texto.

14:15

Deteção Molecular no local de Phytopathogens solo-carregadas usando um sistema portátil de PCR em tempo real

Vídeos relacionados

0 Visualizações

06:25

Localização e Quantificação de Begomovírus em Tecidos Whitefly por Imunofluorescência e PCR Quantitativo

Vídeos relacionados

0 Visualizações

06:48

Avaliação quantitativa de reação em cadeia de polimerase em tempo real da expressão de microRNA em rim e soro de camundongos com comprometimento renal dependente da idade

Vídeos relacionados

0 Visualizações

02:36

Bacteriophage Synthesis Using a Cell-Free Transcription-Translation System

Vídeos relacionados

0 Visualizações

02:40

Amplification and Recovery of Infectious Bacteriophages

Vídeos relacionados

0 Visualizações

11:33

Síntese de bacteriófagos infecciosa em uma e. coli-com base em sistema de expressão livre de célula

Vídeos relacionados

0 Visualizações

05:42

PCR quantitativo do bacteriófago T7 de Biopanning

Vídeos relacionados

0 Visualizações

09:01

Manipulação Genética Mediada por Fagos da Espiroqueta da Doença de Lyme Borrelia burgdorferi

Vídeos relacionados

0 Visualizações

09:23

Entendendo o impacto de bacteriófagos de clima temperado sobre seus lisógenos através de transcriptômica

Vídeos relacionados

0 Visualizações

03:33

Um ensaio adaptado baseado em densidade óptica em microplacas para caracterizar a infecção por actinobacteriófagos

Vídeos relacionados

0 Visualizações

Última atualização: 22 agosto 2026