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Para estudar interações proteína-proteína específicas em bactérias vivas usando microscopia de imagem de fluorescência, FLIM, combinado com transferência de energia de ressonância de Förster, FRET, comece com uma suspensão bacteriana recombinante. As bactérias expressam proteínas citoplasmáticas específicas envolvidas em vias metabólicas, marcadas com proteínas fluorescentes doadoras e aceptoras, adequadas para FRET.
Localize a suspensão bacteriana em uma almofada de agarose, que imobiliza as bactérias em uma lâmina de microscópio. Coloque uma lamínula na lâmina e sele.
Posicione a lâmina no palco de um microscópio de varredura invertida de excitação de dois fótons para microscopia FLIM-FRET. Use uma lâmpada de fluorescência para selecionar e escanear uma região de interesse na monocamada bacteriana.
A interação entre as proteínas citoplasmáticas expressas aproxima as proteínas fluorescentes doadoras e aceptoras, na orientação apropriada. Após a iluminação do laser com um comprimento de onda adequado, a proteína fluorescente do doador fica excitada.
A proximidade das proteínas fluorescentes desencadeia o FRET, levando à transferência de energia não radiativa do doador para as proteínas fluorescentes aceitadoras, que ficam excitadas e, eventualmente, retornam ao estado fundamental, emitindo fluorescência.
A transferência de energia não radiativa reduz o tempo necessário para a proteína fluorescente do doador excitado retornar ao seu estado fundamental, a vida útil da fluorescência do doador - medida pelo FLIM. A diminuição do tempo médio de vida de fluorescência da proteína fluorescente do doador devido ao FRET confirma a interação proteína-proteína na bactéria.
Coloque uma lâmina de vidro de microscópio em uma superfície horizontal plana e arrume duas lâminas de vidro cobertas com duas camadas de fita adesiva ao redor dela. Pipete uma gota de 70 microlitros de agarose derretida a 1% na lâmina de vidro e coloque uma quarta lâmina por cima para achatar a gota de agarose. Pressione suavemente por cerca de um minuto.
Retire a lâmina superior e solte cerca de três microlitros de bactérias em três a quatro pontos em diferentes locais da almofada de agarose. Cubra a almofada de agarose com uma lamínula de vidro de microscopia e fixe-a com parafina derretida para selá-la na lâmina de vidro, começando pelos quatro cantos.
Coloque a lâmina de microscopia no palco, com a lamínula voltada para a objetiva. Gire a torre do cubo do filtro para selecionar o cubo eGFP e abra a fluorescência lamp obturador. Em seguida, envie a luz de fluorescência para a ocular do microscópio. Concentre a objetiva nas bactérias usando o botão do microscópio.
Selecione uma região de interesse na amostra usando o joystick que controla a platina motorizada. Envie o caminho de emissão de fluorescência de volta para o detector e, em seguida, gire a torre do cubo do filtro para selecionar o cubo dicróico para o laser de 930 nanômetros e defina a potência do laser para 20 miliwatts. Defina o tamanho da região de interesse para 30 micrômetros, o que ajusta a tensão que opera os espelhos galvo e define o alcance de seus movimentos.
Ligue o detector e comece a escanear a amostra. Escolha o campo de visão para a imagem, finalmente movendo o palco da interface do computador. Isso pode ser feito na configuração movendo a cruz na imagem no software de controle do microscópio que definirá o novo centro da imagem e pressionando "Mover estágio".
Um bom campo de visão para aquisição deve conter de 10 a 30 bactérias imóveis, todas em foco. Se estiver interessado em extrair dados FLIM-FRET de células individuais, certifique-se de que as bactérias estejam bem individualizadas.