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Tome placas de microtitulação contendo um antibiótico aminoglicosídeo diluído em série. Uma das placas contém NTBC, uma droga sintética.
Introduza Pseudomonas aeruginosa, uma bactéria gram-negativa, e incuba.
A bactéria produz piomelanina - um pigmento extracelular protetor - nos poços não tratados com NTBC, enquanto a droga impede a produção de piomelanina.
O antibiótico catiônico se liga a lipopolissacarídeos aniônicos, ou LPS, na membrana externa bacteriana, deslocando as pontes catiônicas e desestabilizando a membrana.
Ao entrar na bactéria, o antibiótico se liga ao sítio aminoacil, ou sítio A, na subunidade ribossômica 30S.
O antibiótico ligado impede a ligação do aminoacil-tRNA e o movimento ribossômico através do mRNA, interferindo na síntese de proteínas e inibindo o crescimento bacteriano.
Após a incubação, meça a densidade óptica da cultura para avaliar o crescimento bacteriano.
A menor concentração de antibiótico que impede o crescimento bacteriano é a concentração inibitória mínima ou CIM.
Valores semelhantes de CIM para poços tratados com NTBC e não tratados com NTBC não indicam nenhum impacto do NTBC na sensibilidade antibiótica das bactérias.
Um dia antes do ensaio de CIM, preparar culturas das estirpes a testar em LB com e sem 2-[2-nitro-4-trifluorometil)benzoil]-1-3 ciclohexanodiona ou NTBC. Esta demonstração usa o nível representativo de 300 micromolares de NTBC. O método de titulação para determinar a concentração apropriada de NTBC é descrito no texto do protocolo. Incubar as culturas durante a noite a 37 graus Celsius com aeração. No dia seguinte, faça as soluções mestre LB mais NTBC e LB mais DMSO para o ensaio MIC.
Para testar um antibiótico para uma cepa, adicione 600 micromolares de NTBC a 2 mililitros de LB e misture para fazer a solução mestre de NTBC. O NTBC é adicionado a uma concentração de 600 micromolares porque será diluído duas vezes quando o inóculo for adicionado, resultando em uma concentração final de 300 micromolares. Adicione um volume equivalente do DMSO do veículo a 2 mililitros de LB e misture para fazer a solução mestre sem NTBC. Essas duas soluções principais serão usadas para criar soluções de estoque de antibióticos, bem como para configurar a série de diluição em placas de 96 poços.
Em seguida, prepare as soluções antibióticas nas soluções mestre LB mais NTBC ou LB mais DMSO. Preparar a gentamicina mais ou menos a solução-mãe de NTBC a 64 microgramas por mililitro. Fazer a canamicina mais ou menos a solução-mãe NTBC a 256 microgramas por mililitro. Preparar a tobramicina associada ou negativa à solução-mãe NTBC a 8 microgramas por mililitro.
Depois que as soluções antibióticas 2X forem feitas, adicione 100 microlitros de cada solução antibiótica a quatro poços em uma placa de 96 poços na linha A. Por exemplo, a gentamicina deve ser colocada em A1 a A4. A canamicina deve ser colocada em A5 a A8 e a tobramicina deve ser colocada em A9 a A12.
Adicione 50 microlitros da solução mestre LB mais NTBC ou LB mais DMSO às linhas B a H da placa de 96 poços. Certifique-se de que uma placa seja LB mais NTBC e uma placa seja LB mais DMSO. Usando um cabeçalho de micropipeta, execute diluições seriadas duplas dos antibióticos transferindo 50 microlitros da solução da linha A para a linha B. Misture a solução, troque as pontas da pipeta e transfira 50 microlitros da solução da linha B para a linha C. Repita para as linhas restantes.
Depois de diluir a linha G, remova 50 microlitros da solução dessa linha e descarte. Use a linha H como um controle sem antibióticos para o crescimento bacteriano. Recupere as culturas da noite para o dia. Após lavar todas as culturas para eliminar a biomelanina presente no meio, meça o OD600 das culturas. Diluir as culturas durante a noite em LB.
Usando uma micropipeta multicanal, adicione 50 microlitros da cultura bacteriana diluída aos poços apropriados. Adicione bactérias a três poços para cada cepa e concentração de antibiótico. Adicione 50 microlitros de LB ao quarto poço para atuar como controle da contaminação bacteriana. Cubra as placas de 96 poços com parafilme e incube por aproximadamente 24 horas a 37 graus Celsius.
No dia seguinte, examine visualmente as placas quanto ao crescimento bacteriano nos poços. A CIM é a concentração mais baixa de antibiótico em que não se observa crescimento bacteriano para as três repetições de cada estirpe.