CRISPR-Mediated Reorganization of Chromatin Loop Structure

Stefanie L. Morgan; Erin Y. Chang; Natasha C. Mariano; Abel Bermudez; Nicole L. Arruda; Fanting Wu; Yunhai Luo; Gautam Shankar; Star K. Huynh; Chiao-Chain Huang; Sharon J. Pitteri; Kevin C. Wang

doi:10.3791/57457

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Genética

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Mediada por CRISPR reorganização da estrutura de Loop de cromatina

CRISPR-Mediated Reorganization of Chromatin Loop Structure

JoVE Journal
Genética

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JoVE Journal Genética

CRISPR-Mediated Reorganization of Chromatin Loop Structure

Mediada por CRISPR reorganização da estrutura de Loop de cromatina

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09:20 min

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September 14, 2018

DOI:

10.3791/57457-v

DOI:

10.3791/57457-v

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09:20 min

September 14, 2018

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Stefanie L. Morgan*^1,2, Erin Y. Chang*¹, Natasha C. Mariano¹, Abel Bermudez³, Nicole L. Arruda⁴, Fanting Wu⁵, Yunhai Luo¹, Gautam Shankar¹, Star K. Huynh¹, Chiao-Chain Huang⁵, Sharon J. Pitteri³, Kevin C. Wang^1,2,6

¹Department of Dermatology, Program in Epithelial Biology,Stanford University School of Medicine ²Program in Cancer Biology,Stanford University School of Medicine ³Canary Center for Cancer Early Detection, Department of Radiology,Stanford University School of Medicine ⁴Department of Biology,Bridgewater State University ⁵System Biosciences ⁶Veterans Affairs Healthcare System

Summary

Loop de cromatina desempenha um papel significativo na regulação gênica; no entanto, tem havido sem avanços tecnológicos que permitem a modificação seletiva e reversível de loops de cromatina. Aqui descrevemos um sistema poderoso para reorganização do laço da cromatina usar CRISPR-dCas9 (CLOuD9), demonstrado para seletivamente e reversivelmente modular a expressão gênica no alvo loci.