За весь дизайн протокол, содержащий четыре основных этапа изображен на рисунке 1. Все шаги описаны во всех подробностях. Сотовые изоляции, трансдукции и культуры, а затем конфокальной микроскопии около 24 часов представляет собой последовательное и обязательное сроки. Вирус строительство должно быть сделано заранее изолятор, а затем используется для генетической трансдукция.
1. Выделение взрослых кардиомиоцитов из сердца крысы
- Взрослых самцов крыс линии Вистар примерно 250 г в весе (6-12 недель) являются anesthetised на введении препарата в 170 мкл раствора анестезии на 100 г веса
- Кроме того, цитрата (2 мкл / г веса тела) вводится, чтобы избежать свертывания крови во время операции.
- Langendorff перфузии Set-Up должны быть подготовлены. Все решения должны быть насыщена кислородом.
- Когда крыса anesthetised, животного фиксируется на доске и хирургии верхней части тела дезинфицируют 70% этанола.
- Животное убили, проходящем через сонной артерии.
- Грудная клетка открывается с помощью ножниц. Сердце и аорте должно быть доступным. Pericard удаляется.
- Ice-холодный раствор + (5 мл) вводят в обоих желудочках использованием 26-иглы для ареста сердца и промыть крови.
- Аорта схватил с зажимом и оборвать на дуги аорты просто были первыми ветвление.
- Сердце удаляется из груди и аорты прилагается к канюли из перфузии настройки по щипцов и зажим, чтобы ретроградный Langendorff-перфузии. Имейте в виду, чтобы не foraminate аортального клапанов.
- Сердце должно быть исправлено лигатуры вокруг аорты / канюли. Открытые суда также должны быть перевязаны.
- Сердце ретроградно озарен кислородом насыщенный раствор + при комнатной температуре (23 ° C) в течение 10 мин при давлении примерно 70 мбар. Убедитесь, что нет воздушных пузырей ввести аорты.
- Перфузии решение переключается на Liberase раствора при температуре 37 ° C в течение примерно 25 мин со скоростью 4 мл / мин с помощью перистальтического насоса. В конце перфузии сердце должно выглядеть мраморными белыми. Пищеварения время, возможно, придется адаптироваться к ситуации / ткани состоянии.
- Сердце взят из перфузии настройки и помещен в чашку Петри с раствором при температуре 37 ° C. Остальные суда и предсердия обрезаются. Судов отбрасываются и предсердия - при необходимости - трактуются по-разному (не входит в этот протокол). Желудочки разделены на примерно 6 штук.
- Части переданы в 100 мл колбу Эрленмейера, содержащую 20 мл раствора при температуре 37 ° С и слегка взволнован в 37 ° С на водяной бане 5 мин. Наконец супернатант отбрасывается.
- Описанная выше процедура повторяется несколько раз. Супернатант должен появиться чуть непрозрачным.
- Приращение концентрация ионов кальция инициируют добавлением 20 мл раствора B 1 / 2 на 37 ° C в клетки и ткани Остальные остаточного раствора в колбу. Это немного потрясен в 37 ° С водяной бане в течение еще 5 мин. Впоследствии супернатант отбрасывается.
- Добавить еще 20 мл раствора B 1 / 2. (Решение / супернатант должен содержать жизнеспособных клеток.) Капля клетки передается в чашку Петри на инвертированный микроскоп культуры клеток. Если клетки показывают высокую спонтанную активность (сокращений) нужно ждать, пока клетки приходят, чтобы отдохнуть.
- Еще раз супернатант отбрасывается и 20 мл раствора В 1 / 2, добавил.
- Кончик пластиковой пипетки Пастера отрезана таким образом, что ткань произведения могут пройти легко, когда взволнованный через отверстие. С пламенем лечения острые края размягчаются (топленое).
- Теперь ткани куски слегка и осторожно растирают. Ткань части должны "развалиться" в клетки.
- Ячейку, содержащую надосадочную сливают и разбавляют раствор B для достижения желаемой плотности клеток, которая зависит от типа экспериментов и должна быть определена опытным путем.
2. Строительство аденовирус для синтеза белков трансдукции
Для получения аденовирусы Transpose-Ad Аденовирусные векторной системы от Biomedicals MP используется 1. Этот протокол начинается с доступных и проверенных вступления вектор (pCR259) для флуоресцентного белка слияния или GEB с 2.
- Размере 10 нг выше начальной pCR259 вектора, содержащего ген интереса трансформируется со 100 мкл-1 HighQ Transpose-AD ™ 294 компетентных клеток.
- Эту смесь выдерживают в течение 20 мин на льду следует теплового шока в течение 45 с при 42 ° С и хранят на льду в течение еще 2 мин.
- Добавить 900-му; Л неизбирательного LB-средой и расти при температуре 37 ° С при легком помешивании в течение 4 часов.
- Пластина 50 мкл, 100 мкл и 200 мкл на пластинах содержащих LB-среде с хлорамфениколом (См, 20 мкг / мл), ампициллин (100 мкг / мл), тетрациклину (15 мкг / мл), X-Gal (280 мкг / мл ) и IPTG (40 мкг / мл). (Более интенсивным и быстрее синего окрашивания можно, используя более дорогие красителя Bluo-Гал с 300μg/ml. Это должно быть использовано, в частности, когда вы не так хорошо знакомы в признании и отличительный синий / белый колоний)
- Вырасти в течение 24 часов при температуре 37 ° C. Оставить при 4 ° С до хорошей идентификации голубые колонии возможно. Когда Есть проблемы решить, какой колонии действительно белый забрать некоторые из колоний и репликации на другую пластину, содержащую трех антибиотиков, X-Gal и IPTG, и пусть они растут в течение ночи при температуре 37 ° C.
Замечание) HighQ-1 Transpose-AD ™ 294 клетки содержат два важных плазмид: аденовирус позвоночника (Transpose-Ad ™ 294) и помощник плазмиды выражения транспозазы, которая выступает посредником вставка гена в свои сайты цели, находящейся в гене LacZ из Transpose-AD 294 плазмиды. - Чтобы определить положительные колонии, содержащие ген интереса к вирусу позвоночник выполняют колонии-PCR, как описано в 2.7-2.9. Использование вектора грунтовки фланговые сайт множественного клонирования (вперед 5 'CCCAGTCACGACGTTGTAAAACG 3', обратный 5 'GCGGATAACAATTTCACACAGG 3') и сделать ПЦР колонии со 100%-белые колонии и использовать одну синий колонии в качестве контроля за Transpose-AD 294 плазмид без встроенного гена интересов. Синие колонии даст вам краткий фрагмент ПЦР (~ 200bp), колонии содержащий ген проявляют интерес большого продукта ПЦР (в зависимости от длины вашего интересующего гена) и колонии с двумя фрагментами несколько колоний клеток и должны быть отделены если в дальнейшем использоваться.
- Согласно таблице ниже мастера смесь должна быть подготовлена.
- Выберите один 100% белый колонии автоклавного зубочистку и сначала повторить этой колонии на LB-пластина с Ст.
- Передача колонию в ПЦР-смеси. Twirl его в ПЦР-смеси 3-4 раза, чем удалить зубочисткой прежде чем она сможет впитать много ПЦР-смеси. ПЦР-протокола зависит от кб вставлять и использовать полимеразы. Температуры отжига праймеров составляет 57 ° С, а использование 35 циклов рекомендуется.
- Вырасти за ночь культур (LB-среде с см) положительных клонов и изолировать плазмиды с коммерческой доступны комплект без спина колонны, потому что центробежная сила срывает огромный вектор вируса.
- Преобразование 0,5 мкг изолированных плазмид в 100 мкл DH5α компетентных клеток. Инкубируйте ДНК с клетками на льду в течение 30 мин. Теплового шока 45 с при 42 ° С и установить на льду в течение 2 мин.
- Добавить 900 мкл неизбирательного LB-средой и расти при температуре 37 ° С при легком помешивании в течение 1 часа.
- Пластина 50 мкл на пластину, содержащую LB-среде с Cm, X-Gal и IPTG. Инкубировать при 37 ° С в течение 24 часов.
- Пика и повторить до 20 100% белые колонии на отдельных ампициллин, тетрациклин и хлорамфеникол чашки, содержащие IPTG и Х-Гал. Пусть они растут в течение ночи при температуре 37 ° C. Выберите колонии, которые на 100% белый, устойчивы хлорамфеникол, ампициллин и тетрациклином чувствительны.
- Колония-PCR (необязательно): положительные клоны могут быть проверены снова колонии-ПЦР и проверить, что они содержат вставки.
- Выберите одну колонию положительные рекомбинантных и расти в 600 мл LB-среде с Ст.
- Изолировать плазмиды использованием плазмиды комплект макси.
- Дайджест 5 мкг плазмиды с Pac я в течение двух часов при температуре 37 ° С и остановить реакцию при 65 ° С в течение 20 мин.
- Концентрат целом дайджеста в SpeedVac при комнатной температуре в течение 30 мин до конечного объема 10 мкл или использовать фенол-хлороформ экстракции.
- Оттепель флакон замороженных QBi-HEK 293 клеток с нежным агитации в 37 ° С водяной бане. Промыть вне флакон с 70% этанола и приступить асептически в стерильные капотом.
- Передача клетки стерильные 15 мл трубки, добавляют по каплям 10 мл DMEM (+10% FCS), в то время как нежный агитацию и центрифуги 10 мин при 250xg для осаждения клеток.
- Удалите супернатант. Ресуспендируют гранул в 10 мл DMEM (+10% FCS), осторожно пипетирования вверх и вниз.
- Семенной в 75 см 2 колбу и добавляют 10 мл DMEM с 10% FCS к клеткам. Выдержите в течение ночи при температуре 37 ° С в 5% СО 2 инкубатора.
- На следующий день проверить плотность клеток. QBi-HEK 293 клетки должны быть разделены на 1:10 до 1:20 отношение.
- Удаление среды из клеток и trypsinize с 2 мл трипсина в течение 1-3 мин. Дайте 10 мл DMEM в клетки и центрифуге при 250xg течение 10 мин.
- Удалить тщательно средних и дают 10 мл свежей среды для клеток, ресуспендирования и считать клетки.
- Пластина в шесть и одна скважина с 2x10 5, 3х10 5 , 4x10 5, 5x10 6x10 5 и 5 клеток. Инкубируйте блюдо при температуре 37 ° С в СО 2-инкубаторе.
- На следующий день использовать также с 50% слияния для трансфекции с концентрированным Pac я переварить. У нас есть хороший опыт работы с Lipofectamine 2000 трансфекции, но и другими методами (такими как кальций фосфат трансфекции) должны быть подходящими.
- Изменение средней и 3-4 ч до трансфекции, чтобы получить клетки в экспоненциальный рост во время процедуры.
- Смешайте 5 мкл Lipofectamine с 250 мкл DMEM и инкубировать при комнатной температуре в течение 5 мин.
- Дайте Lipofectamine-Medium смеси ДНК (Pac я дайджест) и перемешать, нажав на реакционную трубку, не смешивания с помощью пипетки. Выдержите смесь 20 мин при комнатной температуре.
- Оставьте смесь для трансфекции клеток и рок пластинка перемешать. Инкубировать при 37 ° C с 5% CO 2. Изменение среде после 4-5 часов.
- Через два дня после трансфекции принять среды от клеток и отдать его в свежем колбу культуры (75 см 2).
- Trypsinize клеток с 500 мкл трипсина на срок до 5 мин. Дайте 1 мл DMEM в клетки, возьмите всю смесь и поместить его вместе с 17 мл свежей среды (DMEM с ФТС) в культуре колбу. Развивайте клетки при 37 ° C с 5% CO 2, пока цитопатический эффект (ЦПЭ) видны. На рисунке 2, чтобы узнать, как CPE должно выглядеть.
- Сбор клетки со средой, в 50 мл трубку и заморозить клетки при температуре -80 ° C. Перерыв клетки с тремя циклов замораживания / оттаивания (-80 ° С/37 ° С водяной бане).
- Центрифуга 20 мин при 8000xg и 4 ° C. Декантируйте супернатант в 100 мм диаметром блюдо и отбросить гранул. Используйте стерильный фильтр с размером пор 0.45μm для фильтрата супернатант. Это первая акция вируса (проход 1).
- Используйте 1 / 3 от этой акции для трансдукции 75см 2 колбу с QBi-HEK 293 ячеек с 70% слияния. Инкубировать при 37 ° С и 5% CO 2 до CPE с видны.
- Если клетки показывают, CPE с собирать их и извлекать вирусов как делал раньше. Это отрывок 2 вируса.
- Повторите шаги 2,37 и 2,38 с вирусом прохождения 2 и так далее, пока усиление вирусов достигает достаточный запас вируса. Вирус может быть сконцентрированы с конкретными труб центрифугирования (Amicon Ультра-15 центробежный фильтр с ultracel-100 мембрану из Millipore) и сохраняется в течение нескольких месяцев при температуре -80 ° C. Для подсчета инфекционных частиц использовать доску анализа.
- Используйте вирус проход 2 или выше для трансдукции клеток и для дальнейшего усиления вируса.
3. Первичные культуры клеток и аденовирусной трансдукции
- Стерильные круглый скользит крышка диаметром 20 мм размещаются в стандартных 12-луночных планшетах.
- 20 мкл раствора ECM равномерно распределяется по каждой покровным стеклом. Останки, отбрасываются. Для сушки следует выдержать минимум 1 час при температуре 37 ° C. Кроме покрытия может по сухой в течение ночи (12 ч) при комнатной температуре.
- Каждая скважина заполняется 1 мл Средний M199 с приложениями включает антибиотики и ITS.
- Клеточной суспензии (с шагом 1,21) от 200 до 400 мкл в каждую лунку добавляют. Культивирование клеток происходит при температуре 37 ° С в 5% СО 2 инкубатора.
- Клетки имеют право осадка и через 1 ч среда изменилась.
- Сразу же после изменения среды достаточное количество раствора, содержащего вирус (от прохождения 2 или выше) смешивают осторожно покачайте его тарелку.
- В случае долгого культуральной среде термин меняется каждые 2 дня.
- 24 часа после трансфекции выражение GEB может быть обнаружено.
4. Конфокальной микроскопии для 3D субклеточных структур и Са 2 + сигнализации
Конфокальной микроскопии может быть выполнена на любом конфокальной микроскопии. Тем не менее, кальций-изображений эксперименты требуют приобретения скорости не менее видео, частоту (25-30 Гц). Это ограничивает используемым технологиям либо нескольких сканеров пучка (например, диск Нипкова, прокатилась поле или килограмм-лучевой массив сканера) или очень быстро один луч сканера (например, резонансный сканер или акусто оптический дефлектор (AOD)-сканер). Для обзора см.. 3. 3D-визуализация субклеточных требует Z-Drive. Здесь килограмм-лучевой массив сканера (VTinfinity, VisiTech Int., Сандерленд, Великобритания) не используется.
- Микроскопа и периферийное оборудование должно быть установлено в рабочий режим. Специально для лазерных это может потребовать разогрева период до стабильного мощность будет достигнута.
- Клетки должны быть переданы в экспериментальной камере (покровное стекло передачи). Покровные стекла с клетками передаются экспериментальной камере. 1 мл Tyrode раствора (содержащего 1,8 мМ внеклеточного кальция) будет добавлена.
- Экспериментальной камере должен быть помещен на столик микроскопа. Стимуляция электродов, перфузии настройку и дальнейшее peripheRAL устройств, например, контроль температуры, должны быть организованы соответственно.
- Клетки будут сосредоточены на и выбрать с помощью белого света и / или epifluorescent освещения.
- Приобретение таким параметрам, как мощность лазера, и т.д. время экспозиции или весь протокол эксперимента должна быть настройки.
- Временных рядов и / или Z-раздел изображения могут быть приобретены.
- На настройку дальнейшее развитие многомодовых измерений можно сделать с помощью электрофизиологии (патч-зажим) и / или оптическое манипулирование как флуоресценции после перераспределения photobleach (FRAP) или uncaging веществ, в том числе два фотолиза фотона.
- Анализ изображений, особенно в 3D-реконструкция осуществляется на специализированное программное обеспечение анализа, таких как Imaris (Bitplane AG, Цюрих, Швейцария), скорость (импровизация, Ковентри, Великобритания) или Arivis браузер (arivis GmbH, Росток, Германия).
5. Представитель Результаты:
Окончательные итоги протокола последовательности изображений, которые могут быть использованы для извлечения дополнительных данных.
Примером может служить исследование субклеточных структур и органелл. На рисунке 3 изображен пример 3-мерного расположение аппарата Гольджи. В отличие от электронной микроскопии все расследования может быть выполнено на живых клетках.

Рисунок 1: Общий поток основных экспериментальных шагов.

Рисунок 2: левое изображение изображает Q-HEK клеток в культуре с 90-95% слияния, которые не трансдуцированных. Cytopatic эффектов после вирусной трансдукции показаны в правой части. Клетки круглые и оторваться от нижней части пластины. В этих клетках ядра занимает большую часть клетки, в результате активного производства вируса.

Рисунок 3: взрослых крыс сердечных миоцитов трансфицированных YFP-синтез белка ориентации аппарата Гольджи. Кардиомиоцитов после аденовирусных переноса генов (один день в культуре) выражают флуоресцентного белка слияния. Группа изображает одну конфокальной ломтик взят из Z-Stack. В панели В той же ячейке изображен после деконволюции использованием теоретической функции рассеяния точки (PSF). Это де-размытое изображение стек впоследствии используется для визуализации клеток и получить 3D-реконструкции объем, как показано на панели C или 3D реконструкции поверхности (D). Бар составляет 10 мкм.