$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
А. Подготовка материалов и стерилизации
- До подготовки материалов инкапсуляции, подготовить 0,5% решение фотоинициатора Irgacure 2959 (I2959) в фосфатном буферном растворе (PBS), путем смешивания и инкубации в течение нескольких дней при температуре 37 ° C. Решение может быть шприц фильтруется для стерилизации и хранить при комнатной температуре в течение длительного использования.
- На основе нужной композиции гелей, которые будут обобщены, вычислить (с помощью электронных таблиц, таких как Microsoft Excel) веса полимера и сшивающего необходимости. Из данного веса полимера должны быть растворены в общем объеме определены для достижения желаемой концентрации в гидрогели, сшивающий агент и раствора полимера часть от общего объема геля должны быть определены с помощью электронных таблиц. Подобные расчеты должны быть сделаны, если какой-либо кулон фрагментов (например, клей или РГД YGSR содержащие олигопептид) должны быть включены до сшивания.
- Взвесьте необходимое количество полимера и сшивающего агента и поместить в пробирки Эппендорф. Отрегулируйте расчета таблицы соответственно для фактического веса полимера. (Примечание: объемы могут быть изменены, чтобы компенсировать фактической массы полимера и сшивающего получается).
- Подготовка гель формы с помощью лезвия бритвы, чтобы сократить вершины прочь индивидуальной упаковке 1 мл стерильного одноразового шприца. Обеспечить плоский отруб делается для пресс-форм, которые будут использоваться для гелей photopatterned.
- Место шприца пресс-форм, Эппендорф труб (с крышками открытых) и любые другие необходимые материалы под бактерицидной источник света (как правило, встроенные в шкафы биологической безопасности) и стерилизовать в течение 30 минут.
Б. Подготовка сотовый
- После стерилизации, добавить соответствующие стерильные объемом буфера (на таблицу расчетов, в то время выбор буфера может варьироваться, PBS и слабые буфера основания, такого как триэтаноламин, как правило, используются для свободных радикалов и Майкл типа сшивания, соответственно) с полимером и Эппендорф (опционально) кулон часть должны быть включены (например, клей пептид) и вихревые распустить (если вортексе вне стерильных обернуть капот Эппендорф с парафильмом).
- Добавьте соответствующий объем раствора фрагмент кулон в раствор полимера и обернуть печать с парафильмом. Кратко вихря и инкубировать при температуре 37 ° С до реагирует (если это возможно, на вершине поворотные пластины размешать) во время клеточного препарата. Это включает в себя реакцию на тиоловые пептид (через цистеин группы) акрилат или метакрилат, так что пептид включены в качестве кулона группы в конечном гидрогеля.
- Trypsinize и посчитать клетки и отдельных на порции содержащие необходимое количество для каждого набора гелей. Например, для набора из трех 50 мкл гели при плотности 10 млн. кл / мл, отдельные 1500000 клеток в отдельных конической трубе. Рекомендуется не более 4-гели быть подготовлены в индивидуальный набор из-за времени гелеобразования (обратите внимание: если синтеза нескольких наборов гелей, содержащих одну Эппендорф адекватного объема раствора полимера для всех множеств может быть подготовлен).
- Центрифуга клеток.
- Хотя клетки вращаются вниз
- Свет инициировал свободных радикалов сшивания: добавить 0,5% I2959 решение полимерного раствора равна 10% от общего объема набор геля (для конечной концентрации инициатора 0,05%).
- Майкл-типа (дополнение) сшивания: добавить буфер для сшивателя для достижения соответствующей концентрации раствора.
- Для последовательного сшивания: эти гели включают оба типа сшивания и требуют оба предыдущих шагах.
С. Формирование Гидрогель
- Аспирируйте супернатант из центрифугировали части клетки. Подождите, пока жидкость урегулировать после первоначального стремления и повторно аспирата удалить как можно больше средств массовой информации насколько возможно, не нарушая клеточный осадок.
- Ресуспендируют осадок клеток с полимерным раствором, пока клетки равномерно распределены. Свернуть образования пузырьков медленным пипетки раствор вверх и вниз (примерно 10 циклов должно быть достаточным для распространения клеток).
- Сшивание Гидрогели
- Свет инициировал свободных радикалов сшивания: Алиготе соответствующий объем в формы наконечника шприца. Expose шприцы к ультрафиолетовому излучению для радикального сшивания (например, 10 минут воздействия до 365 нм, 4 мВт/см2 ультрафиолетового излучения является общим для акрилатных функционализированных полимеров). Этот шаг должен выполняться быстро, чтобы минимизировать ячейки урегулирования до ультрафиолетового облучения светом.
- Майкл-типа (дополнение) сшивания: Использование широкого отверстия пипетки, добавьте соответствующий объем сшивателя решение полимер / элемент решения, установить пипеткой желаемого индивидуального объема геля, пипетка раствор вверх и внизгомогенизации и аликвоту в формы наконечника шприца. Этот шаг должен выполняться быстро, чтобы обеспечить равномерное распределение клеток. Разрешить 10-30 минут (в зависимости от индивидуальной системы) инкубации в культуре капот для сшивания.
- Последовательное сшивание: Это включает в себя Майкл типа реакции присоединения, а затем воздействие света на второй сшивания. Лишь небольшая часть теоретических сшивки должна быть реакция в течение первых сшивания, а затем стерильной маски следует наносить непосредственно на поверхность геля до освещенности использованием стерилизованных пинцетом. Функционализированных красителя (например, methacrylated родамин (MeRho) в конечной концентрации в геле 20 нМ), также могут быть добавлены в исходном растворе для визуализации рисунка, так как она будет включать преимущественно в радикально сшитый регионов гель (рис. 2 ).
Д. культуры клеток и анализа
- После сшивания, окунуться гели в лунки пластины тканевой культуры средах для инкубации и анализа (см. следующие шаги).
- Клетки могут быть визуализированы для морфологии с использованием световой микроскопии (рис. 3, как правило, синтезированные гидрогели прозрачный) и жизнеспособность использованием флуоресцентных живых / мертвых окрашивания комплект (рис. 3 и 4). Окрашивание для сотовых актина (например, родамин или флуоресцеин помечены фаллоидином) и ядер (например, 4'-6-Diamidino-2-фенилиндола (DAPI)) может быть выполнено с использованием стандартных фиксации и пермеабилизации процедур (рис. 4) со следующей процедурой.
- Промыть конструкций 3X в течение 5 мин с PBS.
- Fix гели путем инкубации в 1 мл 4% формальдегида в течение 30 мин при комнатной температуре.
- Промыть конструкций 3X с блокировкой раствор, содержащий 3% (м / о) BSA и 0,5% (м / о) Твин в PBS.
- Permeabilize мембраны с 0,25% (м / о) Тритон Х в блокировании решения в течение 20 мин.
- Промыть конструкций 3X с блокирующим раствором.
- Пятно для F-актина с 0,66 мкг / мл FITC или родамин фаллоидином в блокировании решения в течение двух часов при комнатной температуре.
- Промыть 3x с блокирующим раствором.
- Пятно сотовой ядер с использованием 0,4 мкл / мл DAPI в PBS в течение 20 мин.
- Промыть 3X с PBS.
- Визуализация клеток с использованием epifluorescent или конфокальной микроскопии.
- Пролиферации клеток в гели обычно оценивается с помощью коммерчески доступных тестов (например, общая ДНК или биохимического состава). PicoGreen является широко используемым и чувствительным флуоресцентные нуклеиновой кислоты пятно для количественного двухцепочечной ДНК (Певец и соавт.). Клетки могут также учитываться и нормированы на начальное число управление с помощью визуализации методы, описанные в шаге 2.
- Гистологическое секционирования и окрашивание также может быть использован для визуализации клеток и формируется матрица. Следующие протокол для обезвоживания и секционирования 3D гидрогели могут быть использованы для получения поперечного сечения ломтиками на стеклах:
- Фиксация и обезвоживание
- Промыть образец 3X в PBS.
- Исправлена ошибка, при 5 - 30 минут в 4% параформальдегида.
- Промыть образец 3X в PBS.
- Инкубируйте образца в этаноле при 25 ° С в течение 1 часа при каждом из следующих этанола (об. / об) концентрации в воде (по порядку): 50%, 70%, 95%, 95%, 100% (В этот момент, образцы может храниться в течение ночи при 25 ° С).
- Расчистка и инфильтрация
- Трансфер до 100% Citrisolv в течение 1 часа при 25 ° С, а затем на один час при температуре 65 ° C.
- Вырезать образцы пополам с лезвием в чашке Петри, что сечение образец подвергается воздействию.
- Трансфер в смеси 1:1 Citrisolv / Micro-среза Парафин в течение 1 часа при температуре 65 ° C.
- Трансфер до 100% микро-вырезать Парафин в течение 1 часа при температуре 65 ° C.
- Трансфер до 100% микро-вырезать Парафин в течение ночи при температуре 65 ° C.
- Трансфер до 100% микро-вырезать Парафин в течение 1-2 часов при температуре 65 ° C.
- Вложения
- Позиция образца в кожуре наклона формы со 100% парафина.
- Нанесите небольшое количество воска в форме кровати, и вставить две половинки образца с сечением вниз.
- Применить фильтр верхней части
- Добавить дополнительные воска, чтобы погрузить верхнюю часть и дать затвердеть в течение ~ 10 минут.
- Передача вставки до 4 ° C холодильник, чтобы образец, чтобы укрепиться в одночасье.
- Образец может быть разделред следующий день, как правило, на 5-10 мкм в толщину среза с использованием коммерчески доступных микротомы. Как правило кожуры наклона формы устанавливается вертикально, прижимая микротома стадии, и ручного управления используются для установки раздел толщины среза и выравнивание образца с лезвием.
- Добыча РНК
Экспрессия генов также могут быть оценены количественно (например, с помощью реального времени полимеразной цепной реакции (ПЦР)). Протокол для выделения РНК из гидрогелей 3D, пример которой приводится ниже, довольно сильно отличается от более простой 2D случае. - Этикетка сертифицированных РНКазы свободной Эппендорф трубки для каждого 3D-гидрогеля и добавьте 500 мкл Trizol ® реагента в каждую пробирку.
- Используйте пестиком (ткани мясорубку), чтобы вручную молоть гидрогелей до получения прозрачного раствора. Обеспечить различные шлифовальные используются для каждого условия.
- Vortex каждого Эппендорф в течение 20 секунд с целью гомогенизации образцов.
- Инкубируйте образцы при комнатной температуре в течение пяти минут, чтобы позволить полной диссоциации нуклеопротеида комплексов.
- Прохладный образцы на льду в течение 20 мин
- Добавьте 200 мкл (в мл Trizol) хлороформа к каждому образцу и вихря.
- Инкубируйте образцы при комнатной температуре в течение пяти минут.
- Центрифуга образцов при 12 000 мкг при 4 ° С в течение 15 мин.
- Передача водной фазы (прозрачный верхний слой) к новым Эппендорф труб (избегая межфазной области и нижней красной, фенол-хлороформ фаза). РНК остается в открытом виде водной фазе.
- Общие методы для РНК изоляции и хранения теперь может быть использован.
- После экстракции РНК, имеющиеся в продаже наборы для обратной транскриптазы и ПЦР в реальном времени, часто используются с некоторыми изменениями (Elisseff и соавт., Strehin и соавт.).
Представитель Результаты:
См. рисунки 2-4 (как указано в перечисленных протоколов) для представителя результатов визуализации photopatterned гидрогелей и инкапсуляции клеток в гелях.

Рисунок 1. Обзор 3D процедуры инкапсуляции. Диаграмма шаги соответствуют названия разделов в ступенчатом протоколов.

Рисунок 2. Photopatterned гидрогеля использованием последовательной Майкл типа того, то радикальной полимеризации. () Схема photopatterning частично сшитый гидрогель с включением красителей реактивной фотографии. (B) Круг или (C) полосой прозрачная пленка маска узорной гиалуроновой кислоты гидрогелей. Methacrylated родамин (MeRho) зарегистрировано только в регионах геля, которые были под воздействием света. Шкала бар = 100 мкм.

Рисунок 3. Визуализация клеток в 3D гидрогелей. Стволовые клетки визуализируется с помощью () световой микроскопии или (б) живут (зеленый, кальцеин AM) и мертвых (красный, этидия гомодимера-1) окрашивания 24 часов после инкапсуляции на 1 млн. клеток / мл в гиалуроновой кислоты гидрогель сшитый через свет инициировал свободных радикалов механизма. Шкала бар = 100 мкм.

Рисунок 4. Визуализация клеток в 3D гидрогелей. hMSCs окрашивают в течение () живых клеток (кальцеин AM) или (б) сотовой актина (родамин фаллоидином) и ядер (DAPI) пять дней после инкапсуляции на 1 млн. клеток / мл в гиалуроновой кислоты гидрогель сшитый через Майкл типа механизма ( использование подвесных клей пептидов и бифункциональных протеолитически разложению сшивателей пептид). Шкала бар = 100 мкм.