Сочетание различных методов, чтобы максимизировать сбор данных от мыши ткань представлена.
Методическая статья
Сочетание различных методов, чтобы максимизировать сбор данных от мыши ткань представлена.
Выходя за рамки одной функции гена, чтобы сократить глубже в гене регуляторных сетей требуется несколько мутаций объединены в одно животное. Такой анализ двух или более генов должна быть дополнена в гибридизация других генов, или иммуногистохимии их белков, как в целом установлены развивающихся органов или разделы для подробного разрешение клеточные и тканевые изменения выражения. Объединение нескольких изменений гена требует использования CRE или flipase условно удаления генов и избежать эмбриональной летальности. Обязательные схемы размножения резко повысить усилий и затрат пропорционально числу генов, мутации в результате очень немногие животные с полным репертуаром генетических модификаций лучшего. Амортизировать огромное количество усилий и времени, чтобы получить эти несколько драгоценных образцов, которые реализуют множественные мутации требует ткани оптимизации. Более того, расследование одного животного с несколькими методами облегчает коррелируют дефекты гена удаления с выражением профилей. Нами разработана методика получения более тщательный анализ данного животного, с способность анализировать несколько различных гистологически узнаваемых структур, а также экспрессии генов и белков все из того же образца в целом как монтируется органов и секций. Хотя мышей были использованы, чтобы продемонстрировать эффективность этой техники он может быть применен к широкому кругу животных. Для этого мы объединяем липофильный краситель трассировки, целые горы на месте гибридизация, иммуногистохимии, и гистологии, чтобы извлечь максимально возможное количество данных.
1. Липофильные Dye инъекций
Ткань приготовления:
Все ткани вскрытия и манипуляции проводятся на животных фиксировали в 4% параформальдегида (PFA) в 0,1 М фосфатного буфера (рН 7,4), по transcardial перфузии использованием перистальтического насоса с соответствующего размера иглы. Ткань может быть сохранен в 4% PFA в холодильнике до 6 месяцев. Все препараты и манипуляции проводятся на 0,4% или выше PFA до монтажа с глицерином для работы с изображениями. Это количество PFA эффективно устраняет РНКазы и сохраняет РНК на месте гибридизации.
Dye хранения:
Все красители должны храниться в темном закрытом отсеке, чтобы минимизировать циркуляцию воздуха и воздействия ярком дневном свете, так как они светочувствительных. Чтобы избежать перекрестного загрязнения, отдельный набор инструментов следует использовать для обработки каждого красителя.

Рисунок 1. Схема обзор эксперимента. Ухо подвергается позволяет визуализировать все структуры. Липофильные красителя затем вводится и позволили диффузным. После диффузии различных нейронных популяций можно увидеть помечены различными красителями. Далее, в гибридизация (Sox2) осуществляется на ухо и этикетки экспрессии мРНК. Immunohistochemistry Затем проводится(Myo7, тубулина) для визуализации экспрессии белка. Вслед за гистологических срезов, в котором как в точке, гибридизации и иммуногистохимии могут быть визуализированы.
2. В гибридизация
В случае, если вы хотите начать с в гибридизация (после чего трассировки с липофильных красителей будет невозможно), обратитесь к ткани подготовки в части 1. Каждый мыть, если не указано, осуществляется с 2 мл раствора при комнатной температуре на инвертор / смесителя. Будьте уверены, чтобы работать в чистой, свободной РНКазы окружающей среды.
| Таблица 1. Протеиназы К пищеварения время на мышь ткани. | |
| AGE (эмбриональных день) | Время (мин) |
| E8.5 | 6 |
| E9.5 | 10 |
| E10.5 | 13 |
| E11.5 | 15 |
| E12.5 | 17 |
| E14.5 | 18 |
| E16.5 + | 20 + |
* Образцы могут быть отображены на данном этапе и / или после иммуногистохимии этапе работы мастера (часть 3).
Решения:
3. Иммуногистохимия
Шаги 1 и 2 можно опустить, если часть 2 был завершен. В этом случае, убедитесь, что все глицерин или другие монтажные среды смывается. Заметим, что не все антитела все еще будет в состоянии обнаружить их эпитопа после переваривания протеиназы К. У нас есть шорт-лист антитела, которые могут быть использованы в сочетании с в гибридизация в тканях млекопитающих, поскольку они сохраняют свою специфику (см. таблицу 2).
Решения
| Таблица 2. Антитела, которые работают с протеиназы К переваривается ткани. | ||
| Cat # | Пункт | Продавец |
| 25-6790 | Анти-миозина-VIIA Поликлональные | Proteus Biosciences |
| 25-6791 | Анти-миозина-VI Поликлональные | Proteus Biosciences |
| 9661 | Расколотая каспазы-3 Поликлональные | Сотовые сигнализации |
| T7451 | Анти-ацетилированный тубулина Monoclonдр. | Сигма |
| PRB-238C | Prox1 поликлональных | Covance |
4. Гистология
Гистология может быть введена после того, часть 1 увеличить разрешение липофильный краситель трассировки в толстых тотальных таких как мозг несовершеннолетних или после завершения Части 2 или 3. Для серийных срезах мозга, мы рекомендуем Compresstome VF-700 микротома (Precisionary инструменты Inc, Гринвилл, Северная Каролина), чтобы получить равномерную толщину сечения. Замороженные срезы меньше оптимального из-за большей красителя утечки во время секционирования процессе 3. Подготовка серийных срезов и монтаж в глицерине 4 является предпочтительным методом подготовки ткани при тотальных или поверхности крепления не позволяют адекватной визуализации тканей регионах, представляющих интерес. Ткань также может впоследствии быть встроены в эпоксидной смоле и нарезать на 1-2 мкм толщиной с использованием стекла или алмазные ножи для ПЭМ. При использовании этой методики наиболее иммунофлюоресценции останется и даже более стабильным после пластических вложение, однако, все липофильные трассировка будет полностью потерял на этом этапе, как они растворяются в смоле алкоголя и эпоксидной смолы. Примите меры предосторожности, как образцы будут светочувствительных пока они не будут внедрены.
Для Compresstome VF-700 микротома секционирования, следуйте рекомендациям Precisionary инструменты Инк
Эпоксидные Встраивание / Секционирование:
Решения
5. Представитель Результаты

Рисунок 2. Липофильные красителя размещения и обработки изображений в эмбриона мыши. Три различных длин волн липофильных красителей вводили и инкубировали чтобы визуализации тройничного нерва (TN), языкоглоточного нерва (GN), и блуждающий нерв (VN) центральной проекции. ) Липофильные размещения красителя в периферической части три черепных нервов, чтобы диффузия в ствол головного мозга для визуализации своих центральных процессов. TN помечена NeuroVue красный, GN: NeurVue Maroon, В. Н.: NeuroVue Jade. Б) То же мыши, как в () после инкубации. Некоторые диффузии можно увидеть микроскопии светлого. С) То же мыши, как в (А и В). Задний мозг была расчленена и плоские смонтирован. Некоторые маркировка центральных процессов трех нервов помечены можно увидеть микроскопии светлого. D) конфокальной образ (С). С использованием конфокальной специфические нейроны можно увидеть, а также использование трех различных красителей позволяет для оценки распределения каждой группы населения по отношению к другим. Красители были обследованы последовательно. NeuroVue Джейд была отображаемого в возбуждении 488 нм и излучения 500-550 нм. NeuroVue Красной отображаемого в возбуждении 535 нм и излучения 550-600 нм. NeuroVue Maroon был отображаемого в возбуждении 643 нм и эмиссии на 650-700 нм.

Рисунок 3. Схема обзор эксперимента. Ухо подвергается позволяет визуализировать все структуры. Липофильные красительзатем вводят и позволили диффузным. После диффузии различных нейронных популяций можно увидеть помечены различными красителями. Далее, в гибридизация (Sox2) осуществляется на ухо и этикетки экспрессии мРНК. Immunohistochemistry Затем проводится (Myo7, тубулина) для визуализации экспрессии белка. Вслед за гистологических срезов, в котором как в точке, гибридизации и иммуногистохимии могут быть визуализированы.
В этом видео мы продемонстрируем метод объединить четыре техники в целях максимизации сбора данных и сплоченность путем сопоставления данных в рамках данного животного (рис. 3). Такой подход позволит сократить количество разведения и при этом время, необходимое для получения публикуемые данных при одновременном повышении информацию о совместной локализации и корреляционного эффектов мутантов. Хотя эмбриональных мышах были использованы в этом видео, взрослой мыши, а также других животных, таких как курица, Xenopus, и данио рерио могут быть проанализированы с помощью этих методов, а также. При использовании других видов протеиназы К пищеварения, возможно, должны быть изменены. Здесь мы используем различные флуоресцирующие красители NeuroVue специально этикетки до трех нейронных популяций, представляющих интерес. Польза от этих красителей является то, что они могут быть использованы в мутантных мышей, которая может быть проблематичным, когда полагаться исключительно на иммуногистохимии, которые могут или не могут быть затронуты мутациями, которые будут проанализированы, и они называют нейроны ретроградно и anterogradely 5. Недавнее исследование, также увеличилось число нейронов населения, которые могут быть помечены одновременно до шести 2. После, липофильный краситель трассировки же тканью, затем могут быть проанализированы с использованием на месте гибридизации, для анализа транскрипции генов и может быть в дальнейшем проанализированы с помощью иммуногистохимии для белка распределения. Последний анализ может быть дополнен подробным гистологии, который может добавить к характеристике фенотипа 6. Это многофакторный анализ имеет потенциал, чтобы получить новые идеи через корреляционного анализа в пределах одного животного, которое в противном случае могут быть невероятным или по крайней мере, нуждающиеся в более обширные протоколы и мышь разведения.
Конфокальной изображения были получены в Университете штата Айова Карвер центр для работы с изображениями. Финансирование было предоставлено SBIR гранта (MH079805) для BF Дополнительная поддержка для разведения мышей для этого проекта была предоставлена NIDCD (5R01DC00559007) для BF
| Имя | Компания | Каталожный номер | Комментарии |
|---|---|---|---|
| in situ гибридизация: | |||
| Набор буферов для промывки и блокировки PC DIG | Roche Group | 1585762 | |
| Премикс 20x SSC буфера | Roche Group | 1666681 | |
| Протеиназа K 20mg/ml | Ambion | AM2546 | |
| Диэтилпирокарбонат (DEPC) | Research Products International Corp. | D43060 | |
| Формамид | Sigma-Aldrich | F9037 | |
| Декстрансульфат | Research Products International Corp. | D20020 | |
| BM Purple | Roche Group | 11442074001 | |
| Fab-фрагменты анти-Dig-AP | Roche Group | 11093274910 | |
| Фермент РНКаза А 10mg/ml | Fermentas | EN0531 | |
| RNase Away | Research Products International Corp. | 7003 | |
| ДНК спермы лосося 10mg/ml | Invitrogen | 15632-011 | |
| Фильтрующий блок Stericup 0.22μm; 500ml | EMD Millipore | SCGVU05RE | |
| Фильтрующие диски 0.2μm; 25mm | Whatman, GE Healthcare | 6780-2502 | |
| Фосфатно-солевой буфер с pH 7.4 в пакетах | Sigma-Aldrich | P-5368 | |
| Иммуногистохимия: | |||
| Сыворотка козы | Sigma-Aldrich | G9023 | |
| Triton X-100 | Sigma-Aldrich | T8532 | |
| Краситель H–chst | Polysciences, Inc. | 9460 | |
| Гистология: | |||
| Среда для заливки Poly/Bed 812 / комплект DMP-30 | Polysciences, Inc. | 08792-1 | |
| Пропиленоксид | Sigma-Aldrich | 110205 | |
| Раствор глутарового альдегида 50% | Fisher Scientific | G151 | |
| Среда для заключения срезов DPX | Fluka | 44581 | |
| Шейкер-рокер | MidSci | 55D1114 | |
| Нагревательный блок | Fisher Scientific | 11-715-125D | |
| Ротатор | Thermo Fisher Scientific, Inc. | 400110Q | |
| Инкубатор, установленный на 60° | Fisher Scientific | 11-690-625D | |
| Трассировка красителями: | |||
| Микроножницы | Geuder | G-19775 | |
| Прецизионный пинцет | E.M.S | 72680-F | |
| Краситель NeuroVue: Maroon, Red, Jade | MTTI | FS-100(1,2,6) | |
| 1X фосфатно-солевый буфер (PBS) | Sigma-Aldrich | P-5368 | |
| Диссекционный стереомикроскоп | Leica Microsystems | M205 FA | |
| Инкубатор, установленный на 36° | Fisher Scientific | 11-690-506DQ | |
| Конфокальный микроскоп | Leica Microsystems | LSM 510 | |
| Предметные стекла | Surgipath | 00240 | |
| Покровные стекла | Surgipath | 00106 | |
| RPI | Глицерин | G22025-0.5 | |
| Параформальдегид (4% и 0.4%) | Fisher Scientific | T353-500 |