RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
ru_RU
Menu
Menu
Menu
Menu
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Точным методом оценки гибели клеток описывается. Протокол улучшает обычных Аннексин В / пропидий йодида (PI) протоколов, которые отображают до 40% ложно-положительных событий в клеточных линий и первичных клеток от широкого круга животных моделях.
Исследования клеточного апоптоза было существенное влияние с момента появления проточной цитометрии основе методов. Пропидий йодида (PI) широко используется в сочетании с Аннексин V, чтобы определить, клетки жизнеспособны, апоптоза, или некротических через различия в плазме целостность мембраны и проницаемость 1,2. Аннексин V / PI протокол широко используется подход к изучению апоптоза клеток 3. П. И. используется чаще, чем у других ядерных пятна, потому что это экономично, стабильный и хороший показатель жизнеспособности клеток, основанный на его способности, чтобы исключить красителя в живых клетках 4,5. Способность П. И. войти клеток зависит от проницаемости мембраны; PI не окрашивает жить или в начале апоптоза клеток из-за присутствия нетронутыми плазматической мембраны 1,2,6. В конце апоптоза и некроза клеток, целостность плазмы и ядерной мембраны уменьшается 7,8, что позволяет PI проходить через мембраны, интеркалировать в нуклеиновые кислоты, а также отображать красной флуоресценции 1,2,9. К сожалению, мы обнаружили, что обычные Аннексин V / PI протоколов привести к значительным числом ложных положительных событий (до 40%), которые связаны с П. И. окрашивания РНК в цитоплазматических отсека 10. Первичные элементы и клеточных линий в широком диапазоне моделей на животных затронуты, с крупными ячейками (ядерное топливо: цитоплазматические отношения <0,5), демонстрирующий высшую возникновения 10. При этом, мы демонстрируем изменение Аннексин V / PI метод, который обеспечивает значительное улучшение оценки гибели клеток по сравнению с обычными методами. Этот протокол использует изменения в клеточной проницаемости в процессе клеточного крепления к содействию вступления РНКазы в клетки следующие окрашивания. Оба времени и концентрации РНКазы были оптимизированы для удаления цитоплазматической РНК. Результатом является значительное улучшение по сравнению с обычными Аннексин V / PI протоколов (<5% событий с окрашиванием цитоплазмы PI).
Эта процедура может быть выполнена в 500 мкл силиконовая трубки или 6 мл полистирола с круглым дном FACS труб. Последний обычно используется при проведении анализа жизнеспособности в сочетании с другими процедурами. Все объемы указаны только для 6 мл полистирола с круглым дном FACS труб. Для 500 мкл силиконовая трубки, свести все объемы на 1 / 5.
Оптимальная концентрация для анализа потока цитометрии в 2-4 х 10 6 клеток на 200 мкл объема. Сотовые потери могут возникнуть в результате этой процедуры, и таким образом, мы рекомендуем, чтобы каждый образец состоит из 4 х 10 6 клеток в начале процедуры.
1. Сотовые подготовка
2. Применение Аннексин V / PI пятно
3. Представитель Результаты:
Примеры типов клеток и клеточных линий, которые имеют различные степени ложно-положительных П. И. окрашивания показаны на рисунке 1. Для учета ложно-положительных событий, клетки фиксируют, а затем обрабатывают РНКазы А. Это приводит к значительному уменьшению количества ложно-положительных событий, по сравнению с клетками, которые не прошли РНКазы лечения (рис. 2В). Рис 2С показывает, представитель изображений клеток, подвергшихся РНКазы лечения, по сравнению с клетками, которые не имеют лечения РНКазы. Рисунок 3 показывает, как изменение Аннексин V / PI протокол, с фиксацией и шаги РНКазы лечения, улучшает обычные протоколы, ограничивая число ложно-положительных событий окрашивания.

Рисунок 1. Обычные протоколы йодида пропидий окрашивания привести к значительным числом ложных положительных событий. Ранее мы оценивали степень ложноположительных окрашиванию через первичные элементы в широком диапазоне моделей на животных, а также в различных клеточных линиях 10. Представитель изображения показывают степень ложных срабатываний окрашивания в три уникальные клеточные популяции (обычно используются клеточные линии - RAW макрофагов и два первичных клеток - костного мозга мышиных макрофагов (БММ) и золотая рыбка первичной макрофагов почек (ПКМ)). Правда позитивных событий дисплей ожидается совместное локализации между ИП и DRAQ5 в ядерном отсеке (желтые области изображают колокализации между ИП и DRAQ5). DRAQ5 очень membraпе проницаемой краситель, который точно пятна ядерной отсеке и в живых и мертвых клеток 10,11,12. Для облегчения визуального определения колокализации DRAQ5 пятна был дан зеленый pseudocolour.

Рисунок 2. Более точное значение PI окрашивание ядер. () Мы оценили точность П. И. окрашивание ядер в зависимости от степени сходства ряда хорошо известных ядерных пятна (BrdU, 7-AAD и DAPI), чтобы DRAQ5. BrdU представляет собой синтетический нуклеозид, которая включена в ДНК пролиферирующих клеток, и как таковая будет только пятно в ядерном отсеке. 7-AAD имеет высокое сродство к ДНК и, как и ИП, не может пересечь нетронутыми плазматической мембране. DAPI также имеет сильное сродство к ДНК и является наиболее часто используемых ядерных пятном в люминесцентной микроскопии. Степень сходства было> 99% в период с BrdU, 7-AAD, DAPI и DRAQ5, выделяя их способность точно пятно клеточного ядра в RAW 264,7 макрофагов. В отличие от цитоплазматического окрашивания П. И. на основе традиционных протоколов приводит к заметному снижению процента сходство окраски по отношению к DRAQ5. (Б) Подобные результаты наблюдаются в двух первичных элементов протестированы: мышиных макрофагов костного мозга (БММ) и золотая рыбка первичной макрофагов почек (ПКМ). Включение 50 мкг / мл РНКазы на определенном этапе в течение окрашивания процедура удаляет неядерных П. И. окрашивания и значительно увеличивает степень сходства по отношению к DRAQ5 окрашивания. (C) представитель образы первичных макрофагов почек показать степень сходства для клеток с и без лечения РНКазы. Для облегчения визуального определения различия между процедурами, DRAQ5 был дан зеленый. Желтый областях изображают колокализации между BrdU и DRAQ5, П. И. и DRAQ5.

Рисунок 3. Измененный Аннексин V / PI значительно снижает ложные апоптоз / некротические события. Первичная золотая рыбка почек макрофагов (ПКМ) были окрашены обычной и модифицированной Аннексин V / PI протоколов. Диаграммы рассеяния изобразить Аннексин V / PI пятна в золотой рыбки ПКМ. Рассеяния слева показывает обычные Аннексин V / PI окрашивания (без РНКазы) из ПКМ клеток. Рассеяния справа показывает ПКМ клеток, окрашенных изменение Аннексин V / PI протокол (с РНКазы). Помимо результатов РНКазы в выраженное снижение PI окрашивания из-за удаления ложных положительных пятен. ПКМ клетки были затем проанализированы на основе различных групп населения в рамках культур-предшественников ранней (EP), моноцитов (моно) и зрелых макрофагов (Мат Mac). Сокращение числа позитивных событий П.И., из-за удаления ложных положительных событий является более выраженным в крупных зрелых клеток макрофагов, чем в небольших ранних клеток-предшественников. Выводы, основанные на традиционных протоколов бы ошибочно предложил положительную корреляцию в клеточной смерти для более зрелых подмножества макрофагов.
Точным методом оценки гибели клеток описывается. Протокол улучшает обычных Аннексин В / пропидий йодида (PI) протоколов, которые отображают до 40% ложно-положительных событий в клеточных линий и первичных клеток от широкого круга животных моделях.
Это исследование было поддержано естественных наук и инженерного совета Канады (NSERC) исследовательский грант и Альберта сельского хозяйства Финансирование консорциума предоставлять DRB. AMR поддерживается посредством NSERC Ванье канадской высшей стипендии Университета Альберты ассистентом преподавания и королева Елизавета II выпускников стипендии.
| 1 x PBS-/- | |||
| 1 x Аннексин V Связывающий буфер | BD Biosciences | 556454 | |
| Аннексин V-Alexa Fluor 488 | Молекулярные зонды, Life Technologies | A13201 | |
| Пропидия йодид (PI) | Sigma-Aldrich | P4864 | 1 мг/мл в H2O |
| 2% формальдегид | Sigma-Aldrich | F1268 | |
| РНКаза А из поджелудочной железы крупного рогатого скота | Sigma-Aldrich | R4642 | |
| DRAQ5 | Biostatus | DR50050 | Разбавить 1:60 в 1 x PBS-/- |