1. Клеточных линий, Vector Строительство и производство лентивирусов
- Человек головы и шеи опухолевых клеток линий (OSC19 или UMSCC1) культивировали в полной средств массовой информации, состоящий из DMEM (Cellgro кошка № 50-003-PB) с добавлением 10% эмбриональной телячьей сыворотки FBS (Hyclone кошка # SH30070.03), 1% пенициллина / стрептомицин (Cellgro кошка № 30-002-CI), и 1% без незаменимых аминокислот (Cellgro кошка № 25-025-ДИ).
- Для передачи LifeAct-mCherry кодирующей последовательности в pLL7.0 лентивирусов вектор, Sbf1 сайта узнавания в родительском mCherry кДНК была изменена путем введения три молчащих мутаций в узнаваемой последовательности использованием сайт-направленного мутагенеза (Stratagene кошка # 200518-5). В результате изменения LifeAct-mCherry последовательности тогда ПЦР усиливается фланговые EcoR1/Sbf1 сайтов и субклонировали pLL7.0 генерировать pLL7.0-LifeAct-mCherry конструкции.
2. pLL7.0-LifeAct-mCherry Вирус производства
- Вирусный производства была проведена в соответствии с лентивирусов Выражение системы руководства (система Bioscience версии 2-051018).
- Упаковочная линия ячейки 293T/17 клетки (АТСС кошка # CRL-11268) вырос на 40% слияния в той же полной среды, используемые для HNSCC линий.
- Клетки трансфицированных pLL7.0-LifeAct-mCherry, psPAX2 и pVSV-G векторов в 3:02:01 соотношение, соответственно использовании CalPhos (Clontech кошка # 631312).
- После 24 часов, первоначальный носитель из трансфекции была заменена свежей информации.
- СМИ тогда собрана и пополняется каждые 12 часов в течение 72 часов и хранили при 4 ° C.
3. Производство головы и шеи линии Ячейка с Стабильный LifeAct-mCherry Выражение
- Собранных средствах массовой информации было выделено на 2000 оборотов в минуту в течение 10 минут при 4 ° C.
- Один мл уточнил средах, содержащих вирус непосредственно добавлены OSC19 или UMSCC1 клетки в течение 12 часов. Затем клетки промывают и еще на один мл вирус был добавлен еще на 12 часа.
- Клетки обрабатывали средах, содержащих 200мг/мл пуромицин в течение двух недель, чтобы выбрать устойчивые колонии.
- Выжившие клоны были показаны визуально для LifeAct-mCherry выражения флуоресцентной микроскопии. Индивидуальные положительные колонии typsinized использованием стерильных 3 мм диски клонирования (Fisher кошка # 0790710A).
- Положительные клетки поддерживается в среде, содержащей 200мг/мл пуромицин пока замороженных обратно или использованы для ортотопической инъекции.
4. Ортотопическая опухолей ксенотрансплантата
- Все животные процедуры были проведены в соответствии с протоколом (09-0821), утвержденных Университета Западной Виргинии уходу и использованию животных комитета.
- LifeAct-mCherry выражения опухолевых клеток трипсином, центрифугировали и 2,5 х 10 4 клеток ресуспендировали в 50 мкл полной информации.
- Опухолевые клетки были загружены в один мл шприц прилагается к 27 ½ иглы.
- Женский athymic Fox1 ню / ню мышей 8-недельного возраста (Харлан лабораторий) анестезировали сочетание 80mg/kg кетамин и 10mg/kg ксилазина. Наркозом мышам поддерживаться между 37-40 ° С на грелку.
- Использование стерильного пинцета, кончик языка мягко схватил и осторожно вытащил из полости рта.
- Клетки вводят внутривенно медленно в одну сторону каждого языка, чтобы создать луковичных массы в центре языка, избегая языковых артерий.
- Мышам вводили йохимбин 2.1mg/kg и вернулся в грелку, где они наблюдали в течение 2-3 часов во время восстановления после анестезии.
- Как только возродилась, мышей помещали в стерильные клетки содержащих трансгенные мягкой диетой тесто (Bioserve кошка # S3472).
- Мыши были взвешены каждые 2-3 дня и контролируется визуально на опухоль начала.
5. Подготовка Мышь языки для экс-естественных изображений
- Мыши укрывательство опухолей в различные моменты времени (обычно 2-4 недели после инъекции) были подвергнуты эвтаназии углерода вдыхания газа.
- Языки были извлечены, промывают 1X PBS и прикреплен к одной стороне обычных кассет ткани вложение парафин (StatLab Cat # H104,), используя нить мононити швейные из местного магазина хобби и размер 8 швейные иглы.
- Как только языки не могли двигаться, вся сборка кассеты был помещен в 30-мм блюдо культуры ткани и погружают в 1X PBS.
- Обработанные языки сразу же были использованы для двухфотонного возбуждения микроскопии.
6. Визуализация опухолей языка с Двухфотонное микроскопии
- Язык Кассеты были погружены в 60 мм блюдо с 1X PBS закреплены в специально созданных держатель на руку выдвижной консоли (палаты Шаттла, Сиския инструменты) расположен под цель прямой микроскоп (Передвижной микроскоп (MOM); Саттер Instruments).
- Воды 40X/0.8NA погружением объектива была помещена непосредственно на или за видимой квантовойили поражений. Языки были обследованы по двухфотонной микроскопии с титан-сапфирового лазера (Мира, Когерентные) интенсивность на 60 мВт и ввода длиной волны 755 нм для оптимизации mCherry сигнала.
- Последовательные образы 1мм лазерного сканирования были собраны на 1 мкм дополнительных глубинах более общую глубину ткани от 15 до 100 мкм (в зависимости от объема опухоли). Изображения были получены с помощью ScanImage, программа с открытым исходным кодом, основанная на платформе MATLAB, который был разработан Карел Свобода лаборатории (Janelia Хутора, HHMI). ScanImage генерирует два-канальный выход растровых шаблонов сканирования для контроля х / у гальванометрические сканирования зеркала, и в то же время захватывает максимум четыре-канальный входной сигнал одновременно от фотоэлектронных умножителей (ФЭУ) с помощью сбора данных платы (PCI-6610S , National Instruments). PMT сигналы усиливаются низким уровнем шума текущей предусилители (SR570, Stanford Research System) перед подачей в NI-DAQ платы для отображения на экране монитора. ScanImage собирает Z-Stack изображения, контролируя Z-оси объектива и собирает покадровой изображений в одно-или цикл режиме. Изображения были сохранены в отдельный файл TIFF с 16-битной глубины.
7. Анализ изображений с использованием программного обеспечения Amira
- Амира визуализации опухоли количественная: В программном обеспечении Aimra, откройте файл TIFF, содержащий набор Z-Stack изображений.
- Выделите имя файла, выбрать и применить Voltex функции для генерации трехмерного рендеринга. Большой первичной опухоли изображения с несколько более мелких, диссоциированных инвазивных группы (ИГ) коллективно вторглись в клетках, как правило, проявляется в изображении (рис. 6А).
- Чтобы выбрать основной массы опухоли, выберите пункт "Open Data", затем "Маркировка", затем "Метка".
- Выбор порога первичной опухоли-выбрать все Z-Stack изображения и прокрутки изображения в плоскости г, чтобы обеспечить включение только основной массы опухоли в трех измерениях. Как правило, это крупнейший размера изображения в поле и часто появляется в качестве сегментированной отображаемого проходится через г-плоскости.
- Используйте волшебную палочку / порог функцию коррекции фоновой флуоресценции и устранения его из образа, не отбрасывая любые опухоли сигнала. Выделите "Внутри файла" ярлык и нажмите на кнопку ⊕. Выберите "Все фрагменты" флажок. Это производит цветной рамкой вокруг thresholded первичной опухоли в области каждый Z-Stack прирост.
- Чтобы выбрать ИГ, выберите "Новый" функцию. Выберите одну IG и убедиться, что он не связан с первичной опухолью, прокрутив г-плоскости.
- Выберите "Все фрагменты" и нажмите на кнопку ⊕. Переименовать файл (например: И. Г. 1)
- Повторите процедуру порога в 7.4 и подсветка шагом в 7.5 для определяться IG. Выберите цвет контура отличается от цвета используются для обозначения основной массы опухоли.
- При необходимости повторите для каждого дополнительного ИГ по всему изображению, сканирование через г-плоскости для обеспечения всех ИГ обозначены. Использование разных цветов для каждой определенной ИГ помогает в будущем идентификации по изображению.
- После первичной опухоли и всех ИГ выбраны, выберите "сегментации" в выпадающем меню, затем выберите "Материал Статистика". Это обеспечивает измерение объема, а также X, Y и X опухоли основные координаты для первичной опухоли для расчета расстояний ИГ из центральной точки опухоли.
- С объемы рассчитывается, определять расстояние для каждого из ИГ центральное ядро первичной опухоли. Выберите "сегментация", затем "Материал Статистика". Этот шаг вычисляет все измерения в пикселях. Преобразование пикселей мкм на основе калибровки объектива микроскопа и любое дополнительное увеличение увеличение (то есть, функции масштабирования). Для микроскопа и параметры, используемые в этих экспериментах, 40X целью было использовать без зума, давая калибровки 1 пиксель = 0,298 мкм. Импорт данных в таблицы Excel, которая дает параметры первичной опухоли в трех измерениях (X1, Y1, Z1) и для каждого IG (например: X2, Y2, Z2 в первый IG).
- Вторглись расстояние в микронах для каждого ИГ от центра первичной опухоли рассчитывается по формуле √ ((X2-X1) 2 + (Y2-Y1) 2 + (Z2-Z1) 2).
- Инвазивных опухолей индекс (T I) рассчитывается по формуле Т И Н Т = х V Т х D T, где N T = Общее число ИГ по образу и подобию, V T = общий объем всех ИГ, D T = общее расстояние, пройденное всех инвазивных групп из центра первичной опухоли.
8. Трехмерная визуализация с Nikon NIS-Elements программное обеспечение
- Трехмерная визуализация с большей топографические подробности могут быть получены за счет импорта оригинальных 16-разрядных монохромных файлов TIFF всего изображения опухоли в Nikon NIS-Elements программное обеспечениепакет (Nikon, Мелвилл, штат Нью-Йорк). Выберите "Файл", затем "НД", затем "Создать ND файла из файла Sequence". Выберите TIFF Z-серии изображений стека и указать соответствующий размер шага.
- Калибровка ND документ в плоскости ху. Укажите размер одного пикселя использованием ручной калибровки.
- Выберите "Объем View". Используйте "HQ", чтобы вычислить дополнительные ломтики в г-плоскости для более высокого качества. В "Параметры 3D Renderer", используйте "Advanced Renderer" с качеством "сверхвысокого Детали" и "полное разрешение". Выберите "Альфа-смешение", чтобы подчеркнуть опухоли поверхностей.
- Оптимизация трехмерного изображения для презентации. Увеличить на опухоль и связанные с ИГ и обрезать по мере необходимости. Поворот изображения в плоскостях хуг и корректировать ТМП.
- Захват изображений для презентации. Выберите "Правка-Создать представление Snapshot (8 бит RGB)". Назовите и сохраните файл соответственно.
9. Представитель Результаты

Рисунок 1. В целом схема иллюстрирующие основные этапы производства ортотопической опухоли языка и на месте два изображения фотона.

Рисунок 2. Инъекция LifeAct-mCherry выражения OSC19 клеток в мышь язык.

Рисунок 3 резекции опухоли содержащих мыши язык подготовлен в течение двух фотонов изображений.

Рисунок 4. Ориентация опухоли содержащих язык в положении на два фотона микроскопии готовы для работы с изображениями.

Рисунок 5. Представителю скриншот из ScanImage демонстрируя сырые сбора данных начального двухфотонного изображения.

Рисунок 6. Анализ изображений и количественной оценки опухолевой инвазии в ортотопической опухоли OSC19. Представитель снимок экрана изображения Амира Voltex рендеринга () и одного thresholded Z-секции (В) с основной первичной опухоли, изложенные в фиолетовый, инвазивные 1-й группы (ИГ-1), изложенные в синий, ИГ-2, изложенных в красный и И. Г. -3, изложенные в зеленый в качестве примера процедуру идентификации. Стрелки обозначают ИГ в (А) и (Б). С. Земельные объема от расстояния вторглись на восемь отдельных ИГ используется для расчета индекса опухоли вторжения (Ti).

Рисунок 7. Представителю изображения опухоли и опухоли вторглись групп из этого протокола по сравнению с изображениями из традиционного подхода IHC. Парафин А. раздел весь язык мыши укрывательство UMSCC1 ортотопической опухоли. Иммуногистохимическое окрашивание был проведен с использованием обычных процедур с первичными антителами против HNSCC конкретной ячейки маркера emmprin (Zymed; кошка # 34-5600) в разведении 1:1000 и визуализируется с помощью OmniMap DAB анти-Rb обнаружения комплект (Вентана кошка # 760 -149) с последующим окрашиванием железным гематоксилином. Изображения охватывающий общую площадь языку были собраны индивидуально 4X увеличение на Олимп ZX70 Провис микроскоп с камерой Optronics MicroFire CCD и реконструировано с использованием пакета StereoINvestigator томография (ФМС Bioscience). Опухоль очевидна на кончик языка. Увеличены региона показывает инвазивных передней и отдельные группы клеток опухоли (наконечники стрел) показана на (В). С. Nikon NIS-Elements оказание представитель опухоли OSC19. Расширенные подробно контура и ясно визуализации ИГ (наконечники стрел) очевидна. Бары в все изображения = 100 мкм.