1. Микродиссекция улитки
- Подготовьте диссекционный микроскоп в вытяжном шкафу, протерев поверхности 70% этанолом и подготовив блоки льда.
- В стерильных условиях подготовьте 10–15 чашек Петри диаметром 35 мм и наполовину заполните их (~2 мл) стерильным сбалансированным солевым раствором Хэнкса с кальцием (HBSS).
- В стерильных условиях подготовьте две чашки Петри диаметром 35 мм и наполовину заполните их (~2 мл) стерильным 1x фосфатно-солевым буфером (PBS).
- Стерилизуйте микропинцеты в конической пробирке Falcon объемом 50 мл с 70% этанолом.
- В помещении, отдельном от стерильного шкафа, с помощью ирисных ножниц проведите декапитацию 12–15 постнатальных (P) мышей-репортеров Axin2LacZ/+ в возрасте 0–3 дней и поместите головы в чашку Петри диаметром 60 мм на блок льда.
- С помощью пинцета Dumont №5 и ирисных ножниц вырежьте нижнюю челюсть и язык, а также сделайте разрез основания черепа на уровне неба.
- Удалите кожу над сводом черепа и пересеките основание черепа, введя ножницы от нижней части большого затылочного отверстия до середины неба.
- Сделайте еще один разрез ирисными ножницами от края среза неба к верхней части свода черепа с обеих сторон, стараясь не повредить слуховую капсулу.
- Завершите изоляцию височной кости, сделав два разреза под углом 45 градусов от верхней части большого затылочного отверстия до коронарного среза на твердом небе.
- Поместите изолированные височные кости в чашки Петри диаметром 35 мм с HBSS на блок льда.
- Соберите височные кости примерно от 12–15 забитых животных, всего 24–30 височных костей.
- Перенесите чашку Петри с изолированными височными костями в предварительно подготовленный стерильный диссекционный шкаф (1.1).
- Перенесите по четыре височные кости в каждую заранее подготовленную чашку Петри диаметром 35 мм с HBSS (1.2) и поместите на блок льда.
- Начните микродиссекцию, используя два пинцета №55, чтобы осторожно удалить кору, ствол мозга и мозжечок в височной кости над слуховой капсулой.
- Не удаляя саму слуховую капсулу, постепенно скалывайте части улиточной капсулы, начиная от места входа вестибулокохлеарного нерва в слуховую капсулу.
- После обнажения основания улитки осторожно извлеките улитку и окружающие ткани. Удалите остатки спирального ганглия и сосудистой полоски, начиная с основания.
- Перенесите улитку в чашку Петри диаметром 35 мм с PBS на блок льда.
- Для обеспечения оптимальной жизнеспособности тканей общее время диссекции должно составлять менее 60 мин.
- Повторите вышеописанные шаги для 3–5 мышей дикого типа (WT) P0–P3 в качестве контроля для мышей Axin2-LacZ.
2. Диссоциация клеток (модифицированный вариант ранее описанных методов)2,10
- Поместите 50 μl стерильный PBS в центре лунки 6-луночного некатированного культурального планшета.
- Перенесите до 20 Axin2LacZ/+ улитками в каждую 50 μl капля ФСБ. Новая 50 μl одной капли PBS должно быть достаточно более чем для 20 улиток.
- Предварительно нагреть 50 μl аликвоты 0,125% раствора трипсина примерно на 2 минуты в 37°C водяная баня
- Добавить 50 μl предварительно нагретого 0,125% трипсина к PBS, содержащему улитки.
- Поместите планшет на 6 лунок в 37°C в течение 8 мин, стараясь не встряхивать планшет.
- Для прекращения трипсинизации добавьте 50 μl ингибитора трипсина сои в каждую 100 μl капля
- Добавьте дополнительный 50 μl полной среды (FM) (IGF-1, EGF, bFGF, HS, ампициллин в DMEM/F12)2
- Используя 300 μl тупоконечный наконечник для дозатора P200 Pipetteman, установленного на значение 125 μlаккуратно тритурируйте клетки 80 раз, стараясь не создавать пузырьков.
- После тритурации каждой капли добавьте дополнительный 200 μl FM в каждую лунку.
- Пропустите клетки через 40 μm синий фильтр для клеток Falcon в новую лунку.
- Перенесите клетки в стандартные пробирки Falcon для FACS (приблизительно 300 μl остается после растирания и фильтрации).
- Распределите клетки из улиток дикого типа по трем пробиркам, разбавляя их 100 μl с 300 μl FM в каждой пробирке. Одна пробирка будет использоваться в качестве холостого контроля, другая будет окрашена пропидиййодидом (PI, 1 μg/ml) только (на данном этапе не добавлять), в то время как последний образец будет окрашен 3-карбоксиумбеллиферил-β-D-галактопиранозидом (CUG, см. 2.15) для определения фоновой флуоресценции.
- Поместите 400 μl диссоциированных клеток из улиток Axin2-LacZ в каждой пробирке FACS. В качестве контроля только с CUG разведите 10 μl клеток в 390 μl FM (см. пробирку F в шаге 2.15). Доведите объем содержимого всех остальных пробирок до 400 μl.
- Инкубируйте клетки в 37°C в увлажненном инкубаторе в течение 10 мин.
- Приготовьте раствор CUG:
- Подготовьте 200 μl CUG для каждой пробирки FACS, требующей окрашивания.
- Разведите CUG в FM в соотношении 1:50 в темном вытяжном шкафу при минимальном воздействии света.
- Предварительно прогрейте разведенный CUG при 37°C в течение 3–5 минут.
- Затем добавьте 200 μl разбавленного CUG в каждую соответствующую пробирку для FACS. В пробирки, для которых не предусмотрено добавление CUG, добавьте только FM (см. раздел 2.15).
- На данном этапе должно быть пять групп пробирок со следующим содержимым (на этом шаге PI не добавлять):
- Дикий тип — без CUG или PI (для компенсации см. шаги 3.5–6)
- Дикий тип — только с PI (для компенсации)
- Дикий тип — с CUG и PI (в качестве контроля по сравнению с клетками Axin2-LacZ)
- Axin2-LacZ — только с CUG (для компенсации)
- Axin2-LacZ — с CUG и PI (для фактической сортировки клеток)
- Axin2-LacZ — с CUG и PI (для анализа событий)
- Защитите все пробирки от света и инкубируйте их в 37°C в увлажненный инкубатор на 25 минут.
- Приготовьте свежий раствор HEPES с добавлением сыворотки бычьей крови (FBS) для остановки реакции после инкубации:
- Разбавить 400 μl свежеразмороженного FBS в 10 мл стерильного 10 мМ HEPES (в PBS) в пробирке Falcon объемом 15 мл.
- Держите пробирку на льду до завершения этапа 2.16.
- Добавьте по 1,8 мл ледяного раствора HEPES в каждую пробирку для FACS в стерильном боксе при выключенном свете, чтобы минимизировать воздействие света.
- Центрифугируйте клетки при 1200 об/мин в течение 5 минут.
- Удалите супернатант и повторно суспендируйте клетки в 300 μl ФМ, объедините все аликвоты для образца к сортировке (Axin2-LacZ, окрашенные CUG и PI).
- Добавьте PI в каждую пробирку до достижения конечной концентрации 1 μg/ml.
- Поместите клетки на лед и защитите от света.
3. Проточная цитометрия
- Мы используем систему BD Aria II, оснащенную лазерами с длиной волны 488 нм, 633 нм и 407 нм. Детекция CUG проводилась с использованием фиолетового лазера (407 нм), а PI — синего лазера (488 нм) в Центре совместного использования FACS при Стэнфордском университете.
- Требуется квалифицированный оператор проточного цитометра. Переходите к следующему этапу после прогрева лазеров, калибровки детекторов цитометра согласно инструкциям производителя и настройки оптимальных параметров сортировки. По нашему опыту, использование сопла 100 μm оптимизирует жизнеспособность клеток для последующих экспериментов.
- Использовались следующие параметры: порог (threshold) — 5 000 событий, скорость потока — менее 3 000 событий/с, прямое светорассеяние (FSC) при 125 В и боковое светорассеяние (SSC) при 250 В; канал PE-Cy5 использовался для PI, а Cascade Blue — для CUG.
- Промойте камеру цитометра 70% этанолом и PBS по два раза в указанном порядке.
- Начните анализ с неокрашенных клеток дикого типа (пробирка A в шаге 2.15). Соберите 1 000 событий для определения распределения клеток на графике FSC против SSC. Если рассеяние неудовлетворительное, отрегулируйте параметры FSC и SSC.
- Выполните компенсацию, используя неокрашенные клетки WT (пробирка A), окрашенные PI клетки WT (пробирка B) и окрашенные CUG клетки Axin2-LacZ (пробирка D). Компенсация позволит более точно дифференцировать сигналы на разных длинах волн лазера.
- Начните анализ с окрашенных PI и CUG клеток дикого типа (пробирка C) и установите параметры гейтирования для:
- исключения детрита на основе графика FSC против SSC;
- исключения дуплетов и агрегатов с помощью графика FSC-height против FSC-area;
- исключения мертвых клеток на основе графика FSC-area против PE-Cy5-area;
- построения графика FSC-area против Cascade Blue-area с произвольным расположением гейта.
- Затем проанализируйте 10 000 событий из пробирки с образцом для сортировки, содержащей окрашенные PI и CUG клетки Axin2-LacZ (пробирка F).
- Все гейты, установленные для клеток дикого типа, должны быть применены и здесь.
- Используя графики для клеток дикого типа, создайте гейт для клеток с высоким уровнем Cascade Blue (Cascade Blue-high), составляющий менее 1% от общего числа событий.
- Этот же гейт Cascade Blue-high теперь охватывает примерно 15-20% клеток в образце Axin2-LacZ, что характеризует их как Axin2-high клетки.
- Используя график анализа клеток Axin2-LacZ, создайте гейт для 15-20% клеток с наименьшей флуоресценцией, в дальнейшем именуемых Axin2-low клетками.
- Основываясь на вышеописанной стратегии гейтирования, отсортируйте клетки в пробирки FACS, содержащие 500 μl FM: одну пробирку для Axin2-high и другую для Axin2-low клеток. Убедитесь, что пробирки для сбора находятся в камере, охлажденной до 4°C, во время сортировки.
- Зафиксируйте количество клеток каждой популяции, подсчитанное проточным цитометром.
4. Репрезентативные результаты (см. рисунок 2):
При использовании вышеописанного протокола мы обычно выделяем 40-45% клеток без клеточного детрита из улиток как дикого типа, так и Axin2LacZ/+ (рисунки 2A и B), при этом около 70% из них не содержат дублетов (см. рисунки 2A' и B'). Большинство отсортированных клеток жизнеспособны и не поглотили PI (~95%) (рисунки 2A'' и B''). В среднем верхние ~20% CUG-положительных клеток считаются Axin2-LacZ-положительными клетками (рисунок 2B''') и соответствуют примерно 15 000 клеток с высоким уровнем экспрессии Axin2-LacZ на 10-12 животных.
Повторный анализ методом проточной цитометрии клеток с высоким уровнем экспрессии Axin2 показал чистоту более 93% в канале Cascade Blue. Для дальнейшего подтверждения идентичности этих клеток мы провели иммуноокрашивание клеток с высоким и низким уровнем экспрессии Axin2 после сортировки с использованием антител к β-галактозидазе. Было установлено, что клетки с высоким уровнем экспрессии Axin2 содержали ~93,4% β-галактозидаза-положительных клеток (проанализировано более 1 500 клеток), а клетки с низким уровнем экспрессии Axin2 содержали ~4,8% β-галактозидаза-положительных клеток.
Рисунки и таблицы:

Рисунок 1.Экспериментальная парадигма. На рисунке выше представлена общая стратегия и методы эксперимента, описанные в разделе протокола. Улитки дикого типа и Axin2LacZ/+ Мышей забивают, ткани гомогенизируют до получения суспензии одиночных клеток, которые затем обрабатывают CUG — флуоресцентным субстратом β-галактозидазы. Затем с помощью проточной цитометрии выделяют клетки с высоким и низким уровнем экспрессии Axin2-LacZ. Нажмите здесь, чтобы просмотреть изображение в полном размере.

Рисунок 2. Стратегии гейтирования. На этом рисунке представлены использованные стратегии гейтирования при проточной цитометрии. А) Здесь проанализированы диссоциированные клетки дикого типа, подвергшиеся той же обработке, что и клетки Axin2-LacZ; всего проанализировано 10 000 событий. На первой панели показана площадь бокового рассеяния (SSC-A) в зависимости от площади прямого рассеяния (FSC-A). Здесь видна отдельная группа событий, размер которых значительно больше, чем у событий, расположенных ближе к оси y. Эти события обозначены как «Debris Negative» (без детрита). Следующий гейт, A', анализирует клетки «Debris Negative» из панели A, которые составляют 43,8% от общего числа событий (см. таблицу ниже). На этой панели для исключения дуплетов используется высота прямого рассеяния (FSC-H) в зависимости от FSC-A. События, отклоняющиеся от ожидаемого линейного характера графика, исключаются. Такая подготовка обычно дает ~70% событий внутри назначенного гейта, остальные клетки исключаются. На панели A'' пропидий иодид (PI), детектируемый в канале PE-Cy5, используется для маркировки мертвых клеток (5,3%). На следующей панели (A''') канал Cascade blue используется для детектирования флуоресцентного субстрата CUG. Здесь гейты LacZ-high включают менее 1% от общего числа событий. B) Здесь проанализированы диссоциированные клетки мышей Axin2-LacZ, обработанные CUG и PI; всего проанализировано 10 000 событий. Здесь применяются те же гейты, что и на панели A. На B' показано, что 29,5% клеток исключены как дуплеты, а на B'' видно, что 5,4% нежизнеспособны. Начальные гейты для клеток LacZ-high и LacZ-low определяются с помощью панели B''', при этом LacZ-high изначально установлен на уровне 19,7%, а LacZ-low — на 20,4%. Нажмите здесь, чтобы просмотреть изображение в полном размере.
| | | Номер события | Процентное содержание |
| A | Анализ дикого типа | 10,000 | |
| А' | Без обломков (Debris Negative) | 4,381 | 43.80% |
| А'' | Двойной негатив | 3,116 | 71.10% |
| А''' | Отрицательный по PI | 2,951 | 94.70% |
| | высокая экспрессия LacZ | 16 | 0.54% |
| | LacZ-низкий | 2,790 | 94.50% |
| B | Анализ Axin2-LacZ | 10,000 | |
| B' | Без посторонних частиц | 4,218 | 42.2% |
| B'' | Двойные отрицательные | 2,973 | 70.50% |
| B''' | Отрицательный по PI | 2,813 | 94.6% |
| | LacZ-высокая экспрессия | 553 | 19.70% |
| | LacZ-low | 573 | 20.40% |
Таблица 1. Количественный анализ стратегий гейтирования на Рисунке 2.