$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
1. Микродиссекция улитки
- Подготовьте микроскоп для препарирования под колпаком, протерев поверхности 70% этанолом и выложив ледяные блоки.
- Приготовьте 10-15 чашек Петри 35 мм в стерильных условиях и заполните наполовину (~2 мл) стерильным раствором сбалансированной соли Хэнка с кальцием (HBSS).
- Приготовьте две чашки Петри диаметром 35 мм в стерильных условиях и заполните наполовину (~2 мл) стерильным 1x фосфатным буферным раствором (PBS).
- Стерилизовать микрощипцы в конической трубке Falcon объемом 50 мл с содержанием этанола 70%.
- В отдельной комнате от стерильного капюшона с помощью ножниц радужной оболочки глаза обезглавьте 12-15 постнатальных (P) 0-3-дневных мышей-репортеров Axin2LacZ/+ и поместите головы на 60-миллиметровую чашку Петри на ледяной глыбе.
- С помощью щипцов Дюмона #5 и ножниц для радужной оболочки глаза иссеките нижнюю челюсть и язык и разрежьте основание черепа на уровне нёба.
- Удалите вышележащую кожу кальварии и пересеките основание черепа, вставив ножницы в нижнюю часть большого затылочного отверстия до середины нёба.
- Сделайте еще один надрез ножницами для радужной оболочки от среза неба до верхней части черепной кости с обеих сторон, стараясь не повредить глазную капсулу.
- Полная изоляция височной кости путем выполнения двух разрезов под углом 45 градусов, начиная с верхней части большого затылочного отверстия и заканчивая корональным разрезом на твердом небе.
- Поместите изолированные височные кости в 35-миллиметровые чашки Петри, содержащие HBSS, на ледяную глыбу.
- Соберите височные кости примерно 12-15 животных, которые были принесены в жертву, всего 24-30 височных костей.
- Переложите чашку Петри с изолированными височными костями в заранее подготовленный стерильный капюшон для вскрытия (1.1).
- Переложите по четыре височные кости в каждую заранее подготовленную 35-миллиметровую чашку Петри, содержащую HBSS (1.2) и положите на ледяную глыбу.
- Начните микродиссекцию с помощью двух щипцов #55, чтобы аккуратно удалить кору, ствол мозга и мозжечок в височной кости, расположенной над глазной капсулой.
- Не удаляя глазную капсулу, откалывайте части кохлеарной капсулы, начиная от входа вестибулокоохлеарного нерва в глазную капсулу.
- После обнажения основания улитки аккуратно вытяните улитку и окружающие ткани. Удалите оставшийся спиральный ганглий и сосудистую полоску, начинающуюся у основания.
- Перенесите улитку в 35 мм чашку Петри, содержащую PBS, на ледяную глыбу.
- Для оптимальной жизнеспособности тканей общее время диссекции должно составлять менее 60 минут.
- Повторите описанные выше шаги для 3-5 мышей дикого типа (WT) P0-P3 в качестве контрольной группы для мышей Axin2-LacZ.
2. Диссоциация клеток (модифицированная из ранее описанных методов)2,10
- Поместите 50 мкл стерильного PBS в центр лунки в 6-луночную чашку для культивирования, не покрытую покрытием.
- Перенесите до 20 улиток Axin2LacZ/+ в каждую каплю PBS объемом 50 мкл. Новая капля PBS объемом 50 мкл должна быть использована для более чем 20 улиток.
- Предварительно подогрейте 50 мкл аликвот 0,125% трипсина в течение ~2 минут на водяной бане при температуре 37°C.
- Добавьте 50 мкл предварительно подогретого 0,125% трипсина в PBS, содержащую улитки.
- Поставьте 6-луночную тарелку при температуре 37°C на 8 минут, стараясь не трясти блюдо.
- Чтобы прекратить трипсинизацию, добавьте 50 мкл ингибитора трипсина сои в каждую каплю объемом 100 мкл.
- Добавьте еще 50 мкл полной среды (FM) (IGF-1, EGF, bFGF, HS, ампициллин в DMEM/F12)2
- Используя тупой наконечник для дозатора объемом 300 μл с пипеточным аппаратом p200, установленным на 125 μл, осторожно растирайте клетки 80 раз, стараясь не создавать пузырьков.
- После растирания каждой капли добавьте еще 200 мкл FM в каждую лунку.
- Пропустите ячейки через синий сетчатый фильтр Falcon размером 40 мкм в новую лунку.
- Переложите ячейки в стандартные пробирки Falcon FACS (после растирания и фильтрации остается около 300 μл).
- Разделите клетки улиток дикого типа на три пробирки, разбавив 100 мкл с 300 мкл FM в каждой пробирке. Одна пробирка будет использована в качестве пустого контроля, другая будет окрашена только йодидом пропидия (PI, 1 мкг/мл) (не добавляется на этом этапе), а последняя будет окрашена 3-карбоксиумбеллиферилом β-D-галактопиранозидом (CUG, см. 2.15) для обнаружения фоновой флуоресценции.
- Поместите 400 мкл диссоциированных клеток из улиток Axin2-LacZ в каждую пробирку FACS. В качестве контрольной группы разбавьте 10 мкл клеток в 390 мкл FM (см. пробирку F в шаге 2.15). Доведите объем оставшихся пробирок до 400 мкл.
- Инкубируйте клетки в инкубаторе с влажной температурой 37°C в течение 10 минут.
- Приготовьте раствор КУГ:
- Приготовьте 200 мкл CUG для каждой пробирки FACS, требующей окрашивания.
- Разводить CUG в FM 1:50 в темной бленде с минимальной световой экспозицией.
- Предварительно разогрейте разведенный CUG при 37°C в течение 3-5 минут.
- Затем добавьте 200 мкл разбавленного CUG в каждую подходящую пробирку FACS. Для ламп, не предназначенных для CUG, добавьте только FM (см. 2.15).
- На этом этапе должно быть пять категорий пробирок со следующим содержимым (не добавляйте PI на этом этапе):
- Wildtype - без CUG или PI (компенсацию см. на шаге 3.5-6)
- Wildtype - только с PI (за компенсацию)
- Wildtype - с CUG и PI (для контроля против клеток Axin2-LacZ)
- Axin2-LacZ - только с CUG (для компенсации)
- Axin2-LacZ - с CUG и PI (для фактической сортировки клеток)
- Axin2-LacZ - с CUG и PI (для анализа событий)
- Защитите все пробирки от света и инкубируйте их в инкубаторе с влажной температурой 37°C в течение 25 минут.
- Приготовьте свежий раствор HEPES + Фетальная сыворотка крупного рогатого скота (FBS) для остановки реакции после инкубации:
- Разведите 400 мкл свежеразмороженного FBS в 10 мл стерильного 10 мМ HEPES (in PBS) в пробирке Falcon объемом 15 мл.
- Поместите трубку на лед до конца 2.16.
- Добавьте 1,8 мл ледяного раствора HEPES в каждую пробирку FACS под стерильным колпаком с выключенным светом, чтобы свести к минимуму воздействие света.
- Центрифугируйте ячейки при 1200 об/мин в течение 5 минут.
- Удалите надосадочную жидкость и повторно суспендируйте клетки в 300 мкл FM, объедините все аликвоты для сортировки образца (Axin2-LacZ, окрашенный CUG и PI).
- Добавьте PI в каждую пробирку для достижения конечной концентрации 1 мкг/мл.
- Поместите клетки на лед и защищайте от света.
3. Проточная цитометрия
- Мы используем BD Aria II, оснащенный лазерами с длиной волны 488, 633 нм и 407 нм. Обнаружение CUG проводилось с помощью фиолетового лазера с длиной волны 407 нм, а PI — с помощью синего лазера с длиной волны 488 нм в Стэнфордском центре FACS.
- Требуется обученный оператор проточного цитометра. Переходите к следующему этапу после прогрева лазеров, калибровки детекторов цитометра в соответствии с инструкциями производителя и установки оптимальных параметров сортировки. По нашему опыту, мы обнаружили, что использование сопла 100 мкм оптимизирует жизнеспособность клеток для последующих экспериментов.
- Использовались следующие параметры: пороговое значение при 5 000 событий, расход менее 3 000 событий в секунду, прямое рассеяние (FSC) при напряжении 125 вольт и боковое рассеяние (SSC) при напряжении 250 вольт, для PI использовался канал PE-Cy5, а для CUG — Cascade Blue.
- Промойте цитометрическую камеру 70% этанолом и PBS дважды в указанном порядке.
- Начните анализ с неокрашенных клеток дикого типа (пробирка А в шаге 2.15). Соберите 1 000 событий для определения распределения ячеек на графике FSC и SSC. Если разброс не желателен, то отрегулируйте параметры FSC и SSC.
- Выполните компенсацию с использованием неокрашенных элементов WT (трубка A), окрашенных PI WT (трубка B) и окрашенных CUG элементов Axin2-LacZ (трубка D). Компенсация позволит более точно различать сигнал между различными длинами волн лазера.
- Начните анализ с PI- и CUG-окрашенных клеток дикого типа (трубка C) и установите параметры стробирования для:
- Исключение мусора на основе графика FSC и SSC.
- Исключение дублетов и комков с помощью графика FSC-высоты в сравнении с FSC-площадью.
- Исключение мертвых клеток на основе графика FSC-области в сравнении с PE-Cy5-областью.
- Задайте график между FSC-зоной и Cascade Blue-зоной при любом размещении ворот.
- Затем проанализируйте 10 000 событий из пробирки с образцом сортировки, содержащей окрашенные клетки Axin2-LacZ PI и CUG (пробирка F).
- Здесь должны быть применены все вентили, установленные с использованием ячеек wildtype.
- Используя графики для ячеек wildtype, создайте вентили для ячеек Cascade Blue-high, которые составляют менее 1% от общего числа событий.
- Эти же затворы Cascade Blue-high теперь охватывают примерно 15-20% клеток в образце Axin2-LacZ, что делает эти клетки Axin2-high.
- Используя график анализа клеток Axin2-LacZ, создайте ворота для наименее флюорогенных 15-20% клеток, в дальнейшем с низким содержанием клеток Axin2.
- Основываясь на вышеупомянутой стратегии стробирования, отсортируйте ячейки в пробирки FACS, содержащие 500 мкл FM, одну пробирку для элементов Axin2-high, а другую для элементов Axin2-low. Во время сортировки убедитесь, что пробирки для сбора находятся в камере, охлажденной до 4°C.
- Рекордное количество клеток подсчитывается проточным цитометром для каждой популяции.
4. Репрезентативные результаты (см. Рисунок 2):
С помощью приведенного выше протокола мы обычно восстанавливаем 40-45% свободных от мусора клеток как у дикого типа, так и у улиток Axin2LacZ/+ (рисунки 2A и B), причем около 70% из них свободны от дублетов (см. рисунки 2A' и B'). Большинство отсортированных клеток жизнеспособны и не поглощают PI (~95%) (рисунки 2A'' и B''). В среднем, верхние ~20% CUG-положительных клеток считаются Axin2-LacZ-положительными клетками (Рисунок 2B''') и коррелируют примерно с 15 000 клеток с высоким содержанием Axin2-LacZ на 10-12 животных.
Анализ повторной сортировки клеток с высоким содержанием Axin2 с помощью проточной цитометрии показал чистоту более 93% в канале Cascade Blue. Для дальнейшего подтверждения идентичности этих клеток мы провели постсортное иммуноокрашивание клеток Axin2-high и Axin2-low с использованием антител против β-галактозидазы и обнаружили, что клетки Axin2-high содержат ~93,4% β-галактозидазоположительных клеток (более 1500 проанализированных клеток), а клетки Axin2-low содержат ~4,8% β-галактозидазоположительных клеток.
Рисунки и таблицы:

Рисунок 1.Экспериментальная парадигма. На приведенном выше рисунке показана общая стратегия и методы эксперимента, описанные в разделе протокола. Улитки от мышей дикого типа и Axin2LacZ/+ собирают и диссоциируют на отдельные клетки, которые затем обрабатывают CUG, флуоресцентным субстратом для β-галактозидазы. Затем с помощью проточной цитометрии были выделены клетки Axin2-LacZ-high и -low. Нажмите здесь, чтобы просмотреть полноразмерную версию этого изображения.

Рисунок 2.Стратегии стробирования. На этом рисунке показаны используемые стратегии стробирования проточной цитометрии. А) Диссоциированные клетки дикого типа, подвергшиеся той же обработке, что и клетки Axin2-LacZ, анализируются здесь с использованием в общей сложности 10 000 событий. На первой панели показана область бокового рассеяния (SSC-A) в сравнении с областью прямого рассеяния (FSC-A). Здесь определенная группа событий имеет гораздо больший размер, чем события, расположенные ближе к оси y. Эти события обозначаются как «Негатив обломков». Следующий вентиль, A', анализирует ячейки "Debris Negative" с панели A, что составляет 43,8% от общего числа событий (см. таблицу ниже). На этой панели высота прямого рассеяния (FSC-H) по отношению к FSC-A используется для исключения дублетов. Исключаются события, отклоняющиеся от ожидаемого линейного характера сюжета. Этот препарат обычно дает ~70% событий в пределах назначенного вентиля, а остальные ячейки исключаются. На панели A'', йодид пропидия (PI), обнаруживаемый каналом PE-Cy5, используется для маркировки мертвых клеток (5,3%). На следующей панели (A''') синий канал Cascade используется для обнаружения флуоресцентной подложки CUG. Здесь на ворота LacZ-high приходится менее 1% от общего числа событий. Б) Диссоциированные клетки мышей Axin2-LacZ, получавших CUG и PI, анализируются здесь с использованием в общей сложности 10 000 событий. Здесь применены идентичные ворота из панели А. B' показывает, что 29,5% клеток исключены как дублеты, в то время как B'' демонстрирует, что 5,4% нежизнеспособны. Начальные вентили для ячеек LacZ-high и -low рисуются с помощью панели B'''', при этом LacZ-high изначально установлен на уровне 19,7%, а LacZ-low — на уровне 20,4%. Нажмите здесь, чтобы просмотреть полноразмерную версию этого изображения.
| | | Номер мероприятия | процент |
| a | Анализ вайлдтипов | 10 000 | |
| А' | Мусор Негатив | 4 381 | 43.80% |
| А'' | Дуплет Негатив | 3 116 | 71,10% |
| А''' | PI Отрицательный | 2 951 | 94.70% |
| | LacZ-высокий | 16 | 0,54% |
| | LacZ-низкий | 2 790 | 94.50% |
| В | Анализ Axin2-LacZ | 10 000 | |
| В' | Мусор Негатив | 4 218 | 42,2% |
| В'' | Дуплет Негатив | 2 973 | 70.50% |
| В''' | PI Отрицательный | 2 813 | 94,6% |
| | LacZ-высокий | 553 | 19,70% |
| | LacZ-низкий | 573 | 20.40% |
Таблица 1. Количественный анализ стратегий стробирования на рисунке 2.