Клетки и ткани в организме подвергаются воздействию условий окружающей среды, которые влияют на их архитектуру, межклеточные взаимодействия и общие функции. Чтобы модели клеточных культур in vitro точно имитировали исследуемую ткань, критически важным аспектом является среда выращивания культуры. В обычно используемых традиционных системах культивирования эпителиальные клетки размножаются на плоских двухмерных (2-D) непроницаемых поверхностях. Несмотря на то что традиционные системы культивирования позволили узнать многое, многие результаты не воспроизводятся в клинических исследованиях на людях или в эксплантатах тканей, что может быть следствием отсутствия физиологически релевантного микроокружения.
В данной работе мы описываем систему культивирования, которая позволяет преодолеть многие ограничения условий культивирования 2-D клеточных культур благодаря использованию инновационной технологии биореактора с вращающимся стенками сосудом (RWV). Мы и другие авторы продемонстрировали, что органотипические модели, полученные с помощью RWV, могут воспроизводить структуру, функцию и аутентичные реакции человека на внешние стимулы аналогично эксплантам тканей человека 1-6. Биореактор RWV представляет собой систему суспензионного культивирования, которая обеспечивает рост эпителиальных клеток в условиях низкого физиологического сдвига жидкости. Биореакторы бывают двух форматов: вращающийся сосуд с высоким аспектом (HARV) или медленно вращающийся боковой сосуд (STLV), которые различаются источником аэрации. Эпителиальные клетки добавляют в выбранный биореактор вместе с пористыми микроносителями, покрытыми коллагеном (Рисунок 1A). Клетки используют микроносители в качестве каркаса для роста во время постоянного свободного падения в биореакторе (Рисунок 1B). Микросреда, создаваемая биореактором, позволяет клеткам формировать трехмерные (3-D) агрегаты, обладающие характеристиками, подобными in vivo, которые часто не наблюдаются в стандартных условиях 2-D культивирования (Рисунок 1D). Эти характеристики включают плотные контакты, выработку слизи, апикально-базальную ориентацию, локализацию белков, характерную для in vivo, и дополнительные специфические свойства эпителиальных клеток.
Процесс перехода от монослоя эпителиальных клеток к полностью дифференцированному 3-D агрегату варьируется в зависимости от типа клеток1, 7-13. Периодический отбор проб из биореактора позволяет контролировать формирование эпителиальных агрегатов, маркеры клеточной дифференцировки и жизнеспособность (Рисунок 1D). После того как клеточная дифференцировка и формирование агрегатов завершены, клетки собирают из биореактора; при этом анализы, проводимые на 2-D клетках, могут быть применены и к 3-D агрегатам с учетом некоторых особенностей (Рисунок 1E-G). В данной работе мы подробно описываем этапы культивирования 3-D агрегатов эпителиальных клеток в системе биореактора RWV, а также предлагаем ряд возможных методов анализа, которые можно проводить с 3-D агрегатами. Эти анализы включают, помимо прочего, структурный/морфологический анализ (конфокальная, сканирующая и трансмиссионная электронная микроскопия), секрецию цитокинов/хемокинов и клеточную сигнализацию (цитометрический массив бусин и вестерн-блоттинг), анализ экспрессии генов (ПЦР в реальном времени), токсикологический анализ/анализ действия лекарственных средств и изучение взаимодействий между хозяином и патогеном. Использование этих методов анализа закладывает основу для более глубоких и обширных исследований, таких как метаболомика, транскриптомика, протеомика и другие приложения на основе микромассивов. Наша цель — представить нетрадиционный способ культивирования эпителиальных клеток человека для создания органотипических 3-D моделей, воспроизводящих ткани человека in vivo , в рамках простой и надежной системы, которая может быть использована исследователями с самыми разными научными интересами.