$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
I. Подготовка реагентов
- Выбор антител и подготовка
- Определение антител, которые будут использоваться в эксперименте.
- Четыре захвата антител: для конкретного человека TNF-альфа, или моноклональных или поликлональных, все того же вида хозяина.
- Четыре обнаружение антител: для конкретного человека TNF-альфа, либо без изменений, биотинилированного или PE-сопряженными.
- Один подтверждения антител: PE-сопряженными и специфичны для вида-хозяина захвата антител.
- Восстановить все антитела к рекомендованной производителем рабочей концентрации.
- Выберите четыре флакона с низкой концентрацией MagPlex микросфер (шарик) множеств или регионов, например, Luminex часть номеров MC10012-ID, MC10013-ID, MC10014-ID, и MC10015-ID.
- Соединение Антитела к MagPlex микросфер с использованием антител Xmap (ABC) Сцепление комплект
Повторнофер в Руководстве пользователя ABC Kit (Part # 89-00002-00-319) для полной сцепки. (Примечание: Фоточувствительные микросферы должны быть защищены от света, когда это возможно). - Доведите реагенты в комплекте ABC до комнатной температуры и этикетка четыре трубки реакции с борта номера регион выбран для реакции сочетания. Передача содержимого из четырех флаконов MagPlex бисера (1 мл каждая, или 2,5 х 10 6 бусин) в четырех помечены труб реакции.
- Мыть каждый борта наборы дважды в 500 мкл буфера активации, как описано в ABC комплект руководства.
- Активация каждого шарика набор с 480 мкл активация буфера, 10 мкл сульфо-NHS, и 10 мкл реагента EDC, в соответствии с процедурой, описанной в ABC комплект руководство и инкубировать в течение 20 минут. (Примечание:. EDC реагентов должен быть воссоздан в 250 мкл буфера Активация непосредственно перед этим шагом)
- Повторите предыдущий шаг, промыть в настоящее время "активирована" микросфер в общей сложности ЧетEE Times со 500 мкл буфера активации, как описано в руководстве ABC комплект.
- Подготовьте четыре отдельных решений, каждый из которых содержит 7,5 мкг (например, 3 мкг / млн микросфер) захвата антител в активации буфера.
- Добавьте эти четыре решения антител захвата в свои трубы реакции, вихрь каждую пробирку сразу, и инкубировать в течение двух часов на ротатор.
- Повторите предыдущий шаг, промыть в настоящее время "в сочетании" микросфер в общей сложности три раза с 500 мкл промывочного буфера входит в комплект ABC.
- После того, как заключительный этап стирки, добавить 500 мкл промывочного буфера в каждую реакционную трубку для обеспечения конечной концентрации запасов 5000000 антител связью бисером на миллилитр. Vortex и разрушать ультразвуком реакционных труб для разгона микросферы.
Примечание: частично погружаясь закрытом флаконе микросфер в ультразвуковой очиститель наполненный водой DI обеспечивает эффективную обработку ультразвуком для всех промывания. (См. материалы для электронной таблицыquipment детали). - Хранить сочетании бисера при температуре 2-8 ° C в защищенном от света, пока это необходимо.
- Перечень связанной микросфер
- Подсчитайте количество микросфер восстановился после реакции сочетания с помощью счетчика ячейки или hemacytometer. Обратитесь к руководству пользователя считая инструмента для соответствующих инструкций для этого. Восстановление связи реакция, как правило, более 90%.
- Связь подтверждение
- Подтверждение связи реакция была успешной по подготовке теста решения связанных шарика запасов для каждого набора, с конечной концентрации 100 бусин / мкл в буфере для анализа (PBS с 1% BSA). Подготовить разведение фикоэритрин-(PE-) под названием анти-вид антител IgG подтверждение на 4 мкг / мл в буфере для анализа.
- Алиготе 50 мкл каждого теста решение на четыре лунки с круглым дном, 96-луночного планшета, в общей сложности 16 скважин. Затем добавить 50 μЛ буфером на восемь скважин, для измерения фона, и 50 мкл разбавленного антитела подтверждение в восьми оставшихся скважин.
- Смешать реакции осторожно с помощью пипетки вверх и вниз несколько раз с многоканальным пипетки. Закройте планшет и инкубировать 30 минут при комнатной температуре на тарелке шейкер.
- Поместите пластину на магнитный сепаратор пластину в течение 1-2 минут, чтобы сделать бусы из раствора. Затем удалите жидкость насильственно обращения пластины, а на сепаратор, на отходы сосуд.
- Промыть каждую лунку в два раза путем добавления 100 мкл буфером и удаления надосадочной от пластины таким же образом с помощью магнитного сепаратора пластины.
- Ресуспендируют бусины в 100 мкл буфером, осторожно пипеткой вверх и вниз в пять раз с многоканальной пипетки.
- Анализ на приборе Luminex XMap, таких как инструмента MAGPIX. Интенсивность флуоресцентного сигнала этой реакции directlу пропорционально количеству белка на поверхности гранул, обеспечивающих оперативную оценку относительного количества белка связаны с бисером.
- Связь Биотин в Немодифицированные антитела для обнаружения
- При использовании немодифицированных антител обнаружения, biotinylate этих антител с Thermo Fisher EZ-Link сульфо-NHS-LC-биотин реагентов (№ ПИ-21335) и процедуру, описанную в листке-вкладыше. После биотинилированный, обнаружение антител в дальнейшем могут быть помечены стрептавидин фикоэритрин (SA-PE) в анализе (шаг III.6.), Так что они могут быть обнаружены с помощью анализатора Xmap.
II. Анализ установки
- Подготовить исходную смесь всех четырех наборов шарика, добавляя 10 мкл каждого до 0,96 мл ФСБ с 1% BSA (буфером. См. материалы таблицы) для определения наиболее эффективных с Xmap анализа.
- Подготовка решений обнаружение антител к разбавленнойuting каждый 1 мкг / мл в буфере для анализа.
- Подготовка R & D Systems TNF-α белка стандарт в 2000 пг / мл в буфере для анализа.
- Развести стрептавидином rPhycoerythrin (SA-PE) (при условии, @ 1 мг / мл) до 8 мкг / мл в буфере для анализа.
III. Скрининг антител
- Добавить 50 мкл антител связью микросфер смеси каждого из 16 скважин Costar круглым дном 96-луночный планшет для скрининге.
- Добавить 50 мкл буфером на 8 из 16 скважин, для измерения фона.
- Добавить 50 мкл R & D Systems TNF-α стандарт (@ 2000 пг / мл) в другие 8 скважин, для измерения реакции.
- Выдержите в течение одного часа при комнатной температуре, в защищенном от света, при встряхивании на шейкере анализа пластины.
- Добавить по 50 мкл каждого из четырех антител обнаружения четырех скважин (два справочных и два ответа) и инкубировать 30 минут при комнатной температуре, в защищенном от света, при встряхивании на анализ пластины шакег.
- Добавить 50 мкл SA-PE реагента в каждую лунку и инкубировать 15 минут при комнатной температуре в защищенном от света месте, при встряхивании на шейкере анализа пластины.
- Поместите пластину на магнитный сепаратор пластину в течение одной минуты, а затем удалить жидкость насильственно обращения пластины.
- Добавить 100 мкл аналитического буфера для каждого из 16 скважин, поместите пластину на магнитный сепаратор пластину в течение одной минуты, а затем удалить жидкость насильственно обращения пластины, а на сепараторе.
- Добавить 100 мкл буфером для каждого из 16 скважин и читать пластины с инструментом Luminex MAGPIX, ссылаясь на инструкции по эксплуатации для нормальной работы.
- Выберите антител пара, которая отвечает желаемого сигнала.
IV. Анализ функциональных Xmap
- После выбора лучшего захвата антител, развести 100 мкл, что антитела, связанной акции шарик (от шага IB8) до 10 мл с буфером.
- Добавить 50 мклразбавленных бисером до 78 скважин из двух Costar круглым дном 96-луночный. (78 скважин х 2 = 156 пластин скважин) Каждая пластинка будет использоваться для оценки деятельности различных антител.
- Подготовка 12-точка стандартной кривой, начиная с 8000 пг / мл и заканчивая на 4 пг / мл, с R & D Systems TNF-α стандарта. Добавить шесть 50 мкл повторов каждого разведения каждой из пластин, плюс шесть скважин с 50 мкл буфером каждый, в качестве фона, в общей сложности 78 скважин / пластины.
- Инкубируйте пластины в течение одного часа при комнатной температуре, в защищенном от света, при встряхивании на шейкере анализа пластины.
- Добавить 50 мкл первого антител ко всем 78 скважин первой пластинки. Повторите эти действия для второго антител на второй пластине.
- Инкубируйте пластины в течение 30 минут при комнатной температуре, в защищенном от света при встряхивании на шейкере анализа пластины.
- Добавить 50 мкл SA-PE реагента во все лунки каждой пластины.
- Высиживатьдвумя пластинами в течение 15 минут при комнатной температуре, в защищенном от света при встряхивании на шейкере анализа пластины.
- Установите плиты на магнитные сепараторы пластин в течение одной минуты, а затем удалить жидкость насильственно обращения пластины, а на сепараторе.
- Добавить 100 мкл буфером для каждого из 78 скважин на пластинах; поместить пластины на магнитных сепараторах пластину в течение одной минуты, а затем удалить жидкость насильственно обращения пластины.
- Добавить 100 мкл буфером для каждого из 78 скважин на пластинках и анализа на приборе MAGPIX, обращаясь к руководству пользователя для нормальной работы.
В. ИФА
- Следуя инструкциям в комплекте с R & D Systems человека TNF-α/TNFSF1A DuoSet ИФА (R & D Part # DY210), измерить отклик порожденных стандарту, предусмотренному в R & D комплект. Повторите тест ИФА еще три раза, подставляя R & D Systems захвата и обнаружения муравейibodies с антителами других производителей. Для простоты пары антител поставщика (например, Millipore захват антитела антител Millipore, Abcam захват антитела антител Abcam и т.д.).
- Оценка каждой паре отдельно, как того требует формат ИФА, с каждой из трех TNF-α стандартам белка.
VI. Представитель Результаты
Этот протокол демонстрирует типичную ИФА может быть преобразован в платформе Xmap при использовании мультиплексирования возможности технологии быстро оптимизировать анализа. ИФА используется в этом примере был прав некроза опухоли фактор альфа (TNF-α) DuoSet ИФА с R & D Systems (R & D Part # DY210).
В дополнение к антител пара представлена в комплекте, три другие пары антител из различных источников (см. материалы таблицу) оценивались одновременно, используя Xmap платформы. ФоУра антитела были обозначены как захват антител и были связаны с MagPlex Низкая концентрация микросфер. Остальные четыре антитела были обозначены как обнаружение антител, три из которых были приобретены как биотин связью и четвертый биотинилированный, как описано в протоколе.
Антитела для этого исследования были выбраны в зависимости от наличия и продавца. Однако в практических условиях, антитела должны быть выбраны на основе предпочтений отдельных пользователей и прошлый опыт исполнения с антителом. Несмотря на то, что этот эксперимент не проверить пригодность антител, антител против захвата обнаружение антител, этот протокол может быть легко модифицирован для этой цели.
Luminex Xmap анализы были проведены в мультиплексе для оценки всех четырех антител захвата в виде смеси, объединяя четыре комплекта TNF-α антител связанной MagPlex микросферы. Захват антител были оценены с каждой из четырехбиотинилированного антитела выявление индивидуально, таким образом, чтобы взаимодействие одного обнаружение антител с каждой из четырех антител захвата могут быть определены одновременно. Четыре таких анализов, выполняемых параллельно, определяется взаимодействием всех четырех антител обнаружения со всеми четырьмя антител захвата. На рисунке 1 показаны сравнительные данные из этих скрининга.
Результаты показали, что антитела пары из R & D Systems DuoSet показала лучшие результаты с результатом реагирования на 6183 Медиана интенсивности флуоресценции (MFI) единиц. Было также отмечено, что обнаружение антител от Millipore (86% от R & D ответ пару антитела) и Abcam (67%), при условии разумного ответа в тесте Xmap в сочетании с R & D антител захвата системы. Захват антитела Abcam, Millipore и Novus производится менее желательно ответ в тесте Xmap.
Важно отметить, что PURПоза это исследование не обязательно подчеркнуть различия между отдельными антител или поставщиков, а просто чтобы показать, что есть наблюдаемая различия в их производительности при работе в аналогичных условиях, и что платформа Xmap может предложить эффективный способ оценки этих различий.
R & D Systems DuoSet протокол используется для сравнения четыре пары антител в ИФА. R & D Systems протокол был использован со всеми парами антитело, потому что это отражает типичные протоколы ИФА широко используется сегодня, и это аналогично используются протоколы технологии Xmap. ИФА тесты показали, что антитела пары из R & D Systems снова дала лучшие результаты (рис. 2). Антитела пара из Abcam не дали ответа и антител пар из Millipore и Novus производится скромный ответ.
Для того чтобы оценить любые изменения реактивности антител со стандартными, все четыре антителу пары были протестированы с тремя различными рекомбинантный ФНО-α стандартам белка, из трех разных производителей (см. материалы таблицу). Данные на рисунке 2 показано, что рекомбинантный ФНО-α белка стандартам от трех поставщиков дало такие же результаты.
ФНО-α белка из R & D Systems была использована для стандартных кривых с ИФА (табл. 1) и Xmap анализов (табл. 2 и 3). В то время как анализ ИФА было сделано с R & D пары антител Systems, Xmap анализов использовали R & D Systems антител захвата и либо обнаружение антител от R & D Systems или Millipore. ФНО-α белка из R & D Systems разводили для получения диапазоне концентраций от 8000 до 4 пг / мл. Только антитела пары из R & D Systems дали ожидаемых результатов в тесте Xmap с ответом> 20000 МФО, как показано в Таблице 2 иРисунок 3. При обнаружении антител от Millipore были использованы с Xmap Анализ на месте R & D антител системы (табл. 3), ответ (6000 МФО) составляла около 30% ответов, полученных с обнаружения антител от R & D Systems, как показано на Рисунок 3.
Данные в таблице 1 представлена стандартная кривая ИФА, который был рекомендован TNF-α ряд производителей от 16 до 1000 пг / мл. Этот диапазон был весьма ограничен, так как диаметр 1000 пг / мл была немного больше 2 единиц ОП и спектрофотометр не в состоянии измерить выше 3 ОД. Из-за предела спектрофотометр, не было возможности увеличить диапазон анализа ELISA дальше. Кроме того, данные в таблице 1, показывают, что R & D Systems DuoSet ИФА не способны обнаруживать TNF-α в концентрациях, значительно меньше, чем 16 пг / мл. С другой стороны, анализ Xmap способна измеренииING TNF-α в концентрации менее 7,8 пг / мл с захватом антитела из R & D Systems в сочетании с обнаружением антител либо R & D Systems или Millipore.
Динамический диапазон и чувствительность обоих методов лучше проиллюстрировать, когда построены в логарифмическом масштабе (рис. 4). Четкое различие между наклоном ответы ИФА и ответы от Xmap анализов видно, что также указывает более жесткие ограничения способности к обнаружению TNF-α с ИФА, как на высших и низших концентрациях.
Пределы обнаружения (LOD) для двух функциональных TNF-α анализов Xmap аппроксимировались выявления низкого TNF-α с концентрацией наблюдается реакция уровне (МФО) больше, чем фон, а также в три раза стандартное отклонение (SD). Для достижения статистической значимости, шесть репликации были использованы для определения SD для Xmap и ИФА. Фесэлектронная оценки детализации с оптимизмом и предназначен для обеспечения "лучшем случае" сценарий, при том понимании, что в нормальных условиях эксплуатации только два или три повторяет будет использоваться. В таблице 2, можно заметить, что при использовании R & D Systems пара, самая низкая TNF-α концентрации в 3,91 пг / мл производства ответ 66 МФО, что больше, чем ответов фона + 3SD, отвечающих этим критериям . Когда Millipore антител были использованы с R & D Systems Захват антител (табл. 3), предел обнаружения составляет менее 7,81 пг / мл. В этом случае, 2-й низкой TNF-α концентрации производства приемлемый ответ от 17 МФО, больше, чем ответов из самых низких TNF-α концентрация плюс три раза больше стандартного отклонения. (10 МФО + 3 (2,4) = 16,29 МФО) Аналогичным образом, предел обнаружения для R & D Systems DuoSet ИФА, по оценкам, от 63 пг / мл и 31 пг / мл (табл. 1).
Рисунок 1. Средняя интенсивность флуоресценции (МФО) в R & D Systems стандарта (@ 2000 пг / мл) для всех возможных комбинаций из четырех антител захвата (в сочетании с четырьмя различными регионами микросфер) и четырех антител обнаружения.
Нажмите здесь, чтобы увеличить понять .

Рисунок 2. Оптической плотности (ОП) из трех различных рекомбинантных стандартов (@ 1000 пг / мл) в течение четырех захвата и обнаружения антител комбинаций пар. Захват и обнаружение антител произвольно парных продавцом, для простоты. Нажмите здесь, чтобы увеличить рисунок .
| R & D Systems DuoSet |
| пг / мл | OD | Std Dev | +3 SD |
| 1000 | 2,084 | 0,035 | 2,187 |
| 500 | 1,328 | 0,038 | 1,441 |
| 250 | 0,787 | 0,025 | 0,863 |
| 125 | 0,476 | 0,026 | 0,554 |
| 63 | 0,304 | 0,023 | 0,374 |
| 31,3 | 0,212 | 0,025 | 0,287 |
| 15,6 | 0,167 | | 0,244 |
| 0 | 0,118 | 0,021 | 0,182 |
Таблица 1 оптической плотности (ОП) в 2-кратном разведении ряд указанных в R & D Systems DuoSet листок-вкладыш, для использования в качестве стандартной кривой. Включая стандартное отклонение (SD) и оценивается предел обнаружения (LOD), между 31,3 пг / мл и 63 пг / мл.
| R & D Systems Capture и обнаружение антител |
| пг / мл | МФО | Std Dev | +3 SD |
| 8000 | 20320 | 463 21707 |
| 4000 | 15594 | 223 | 16263 |
| 2000 | 11098 | 79 | 11336 |
| 1000 | 6985 | 160 | 7465 |
| 500 | 4149 | 80 | 4390 |
| 250 | 2233 | 30,0 | 2323 |
| 125 | 1199 | 43,8 | 1330 |
| 63 | 636 | 14,0 | 678 |
| 31,3 | 340 | 12,9 | 379 |
| 183 | 5,9 | 201 |
| 7,8 | 103 | 2,2 | 109 |
| 3,9 | 66 | 2,4 | 73 |
| 0 | 11 | 0,8 | 13,8 |
Таблица 2 Средняя интенсивность флуоресценции (MFI) из стандартной серии разведения измеряется технологии Xmap с использованием антител пара входит в R & D Systems DuoSet,. Включая стандартное отклонение (SD) и расчетный предел обнаружения (LOD), менее 3,91 пг / мл.
| R & D Systems Захват Ab с Millipore обнаружения Ab |
| пг / мл | МФО | | +3 SD |
| 8000 | 5800 | 143 | 6229 |
| 4000 | 3881 | 120 | 4242 |
| 2000 | 2176 | 73 | 2396 |
| 1000 | 1138 | 32,1 | 1234 |
| 500 | 578 | 31,3 | 671 |
| 250 | 289 | 6,2 | 307 |
| 125 | 142 | 3,1 | 151 |
| 63 | 75 | 5,3 | 91 |
| 31,3 | 44 | 3,3 | 54 |
| 15,6 | 28 | 2,6 | 35,5 |
| 7,8 | 17 | 1,5 | 21,2 |
| 3,9 | 10 | 2,0 | 16,3 |
| 0 | 7 | 1,4 | 11,4 |
Таблица 3 средней интенсивности флуоресценции (MFI) из стандартной серии разведения измеряется технологии Xmap с помощью R & D Systems антител захвата и обнаружения EMD Millipore антител,. Включая стандартное отклонение (SD) и расчетный предел обнаружения (LOD), менее чем 7,81 пг / мл.
Рисунок 3. Стандартных кривых двух Xmap анализов и R & D Systems DuoSet ELISA. Нажмите здесь, чтобы увеличить рисунок .

Рисунок 4. Сравнение Xmap стандартных кривых и кривой ИФА стандарт в логарифмической шкале. Нажмите здесь, чтобы увеличить рисунок .