CCF4-AM/β-lactamase подход является надежным и чувствительным методом для отслеживания вакуолярных разрыва внутриклеточных патогенов, таких как шигеллы Флекснера (рис. 1). Shigella штаммы, используемые в этом исследовании, называют M90T AfaI и BS176 AfaI. M90T AfaI является штаммом шигеллы Флекснера, которая выражает адгезином AFAE, который способен эффективно связывать CD55 на поверхности эпителиальных клеток 15. Поэтому AFAE выражения штаммов отображать намного выше способности вторжение по сравнению с диким типом M90T деформации в эпителиальных клетках. BS176 AfaI является AFAE выражения мутантного штамма Shigella Флекснера лишенные вирулентности Shigella плазмиды. Этот штамм не может вторгнуться в клетки HeLa. Тем не менее этот штамм способен войти клетки ТНР-1, так как поглощение в этой клеточной линии полагаться только на классические фагоцитоза и не требуют функционального типа-3 секреции системы. Оба штамма выразить β-лактамазИ отображение β-лактамазу активность на их поверхности из-за наличия AFAE плазмиды, кодирующей. По клетки HeLa инфекции с неинвазивным BS176 AfaI штамм в течение 1 часа, CCF4 FRET зонд остается неизменным, как показано на рисунке 2а зеленого сигнала (535 нм). Напротив, инфекция с вирулентным штаммом M90T AfaI в течение 1 ч приводит к переключателю сигнала к синим (450 нм), выделяя расщеплением зонда в цитозоле. Для количественной оценки этого, мы разработали сценарий для Metamorph и Acapella программное обеспечение, которое позволяет автоматическое обнаружение клеток и измерение интенсивностей в 535 и 450 нм каналах для определения логометрических сигнала. Как показано на рисунке 2B, ядра и цитозоле клетки сегментируются использованием Draq5 канала. Затем алгоритм способен обнаруживать 450 нм и 535 нм положительных клеточных популяций для вычисления соотношения между интенсивностями для каждой отдельной ячейки, котораяпредставить в виде гистограммы на фиг.2С. Низкие коэффициенты, полученные для мутантного штамма по сравнению с высокими коэффициентами для вирулентных штамма. Хотя это репрезентативного эксперимента инфекция была приобретена с помощью конфокальной микроскопии эпифлуоресцентной микроскопии также подходит для выполнения этой задачи рисунках 3 и 4 показаны примеры с использованием 2 различных типов клеток человека:. Эпителиальных клеток HeLa и ТНР-1 макрофаг-подобные клетки. После инфицирования вирулентными M90T AfaI Shigella деформации в течение 1 ч и 90 мин для HeLa и клетки ТНР-1, переключатель сигнала с зеленым (535 нм), синий (450 нм) наблюдается по сравнению с BS176 AfaI инфицированные клетки (Фиг.3А и 4А). Сценарий был разработан на MetaMorph обеспечение обнаруживает непосредственно CCF4 положительный популяции клеток и расчета отношения интенсивностей в 450 и 535 нм каналах для каждой отдельной клетки. Затем клетки классифицируют в зависимости от их соотношение с использованием макросов развитпед в Excel, получая таким образом гистограммы, показывающие распределения клеток. Как это было в случае с другими сценарий разработан для Acapella, BS176 AfaI инфицированные клетки характеризуются низкими коэффициентами, в то время M90T AfaI инфицированные клетки проявляют высокую отношений с использованием алгоритма MetaMorph на клетках HeLa и ТНР-1 макрофагами (рис. 3В и 4В) . Наконец, адаптации этого метода к изучению микобактерий показано на рисунке 5. Mycobacterium Bovis БЦЖ находится в фагосомы в течение всего хода эксперимента, о чем свидетельствуют сильные 535 нм сигнал, обнаруженный на протяжении всего времени хода эксперимента. В противоположность этому, микобактерии туберкулеза вызывает phagosomal разрыве мембраны в ТНР-1 макрофагами после более чем 3 дней после заражения, были отмечены на 450 нм сигнал на 7 дней после заражения (рис. 5А и 5В). Используя тот же алгоритм для изучения вакуолярных разрыва шигеллами , мы обнаружили, что микобактерии туберкулеза инфицированные клетки демонстрируют более 450/535 нм соотношениях, чем Mycobacterium Bovis БЦЖ через 7 дней после заражения (рис. 5C и 5D).

Рисунок 1. Схема, представляющая принцип CCF4-AM/β-lactamase анализа для отслеживания шигелл Флекснера разрыв вакуоли. CCF4-AM свободно диффундирует через плазматическую мембрану в цитоплазму, где сложноэфирные остатки являются отщепляют цитозольных эстераз производства CCF4 анионов. Эта реакция CCF4 предотвращает попадание любого встроенного мембранного отсека. На этом этапе CCF4 вызывает FRET при 535 нм при возбуждении при 405 нм. Зонд не остается нетронутым до β-лактамаз бактерий выразив РуптуРE эндоцитотический вакуоли. На этом этапе FRET сигнал теряется из-за CCF4 расщепляется β-лактамазы срабатывание переключателя излучение от 535 нм до 450 нм при возбуждении при 405 нм.

Рисунок 2. Отслеживание шигеллы Флекснера вакуолярных разрыва с помощью конфокальной микроскопии. (А) Через 2 ч 30 мин CCF4-AM погрузки, клетки HeLa, инфицированных β-лактамазы выразив шигеллы Флекснера BS176 AfaI мутантный штамм или M90T AfaI вирулентным штаммом в течение 1 часа и фиксированной с использованием 4% параформальдегида в течение 10 мин. Затем ядра окрашиваются Draq5 и клетки визуализируют с помощью конфокальной микроскопии с 10x цели. Представитель фотографии были выбраны со следующими объединенной каналами: неповрежденную CCF4 зонда появляется при 535 нм (степеньN), расщепленный CCF4 зонда появляется при 450 нм (синий). (B) Примеры фотографий подчеркнув система обнаружения наших автоматизированных алгоритмов на программное обеспечение Acapella. Сегментация клеток (ядра + цитозоль) получают с использованием Draq5 канала. CCF4 позитивные клетки, полученные с использованием 450 и 535 нм каналы объединяются. (C) гистограмму, показывающую результат нашего автоматизированного анализа на Acapella использованием шигеллы Флекснера BS176 AfaI мутантный штамм или M90T AfaI вирулентным штаммом. Среднее отношение представляет собой соотношение между интенсивностью в 450 и 535 нм каналах. Нажмите здесь, чтобы увеличить рисунок .

Рисунок 3. Отслеживание Shigella ФЛЭxneri вакуолярных разрыва в клетках HeLa эпифлуоресцентной использованием микроскопа. (А) Через 2 ч 30 мин CCF4-AM погрузки, HeLa клетки инфицируют β-лактамазы выразив шигеллы Флекснера BS176 AfaI мутантный штамм или M90T AfaI вирулентным штаммом течение 1 ч и фиксируется с использованием 4% параформальдегида в течение 10 мин. Затем клетки отображаемого использованием эпифлуоресцентной микроскоп с 20-кратным цели. Представитель фотографии были выбраны со следующими каналами:. CCF4 нетронутыми зонда 535 нм (зеленый) и расщепленные CCF4 зонда 450 нм (синий) (B) Гистограмма являющийся итогом нашего автоматизированного анализа на программное обеспечение MetaMorph. Отдельные клетки распределены в зависимости от их соотношения интенсивностей в 450 и 535 нм каналах.

> Рисунок 4. Отслеживание шигеллы Флекснера вакуолярных разрыва в ТНР-1 клеток с использованием эпифлуоресцентной микроскопии. (А) Через 2 ч 30 мин CCF4-AM погрузки, клетки ТНР-1 инфицированных β-лактамазы выразив шигеллы Флекснера BS176 AfaI мутантный штамм или M90T AfaI вирулентным штаммом в течение 1 ч 30 мин и фиксированной использованием 4% параформальдегида в течение 10 мин. Затем клетки отображаемого использованием эпифлуоресцентной микроскоп с 20-кратным цели. Представитель фотографии были выбраны со следующими каналами:. CCF4 нетронутыми зонда 535 нм (зеленый) и расщепленные CCF4 зонда 450 нм (синий) (B) Гистограмма являющийся итогом нашего автоматизированного анализа с помощью программного обеспечения MetaMorph. Отдельные клетки распределены в зависимости от их соотношения интенсивностей в 450 и 535 нм каналах.
ghres.jpg "SRC =" / files/ftp_upload/50116/50116fig5.jpg "/>
Рисунок 5. Отслеживание Mycobacterium Bovis БЦЖ и микобактерий туберкулеза phagosomal разрыва в ТНР-1 макрофагами использованием эпифлуоресцентной микроскопии. (A, B) клеток ТНР-1 инфицированных β-лактамазы выразив Mycobacterium Bovis БЦЖ или микобактериями туберкулеза в течение 2 часов и культивировали в течение 3 до 7 дней . После промывки клетки загружают CCF-4-AM течение 2 ч и фиксированный с использованием 4% параформальдегида в течение 30 минут перед визуализации с использованием эпифлуоресцентной микроскопа с 40x цели. Представитель фотографии были выбраны со следующими каналами: целая CCF4 зонд, 535 нм (зеленый); расщепленной CCF4, зонд 450 нм (синий) (C, D) гистограмм представляя результаты нашего анализа с использованием автоматизированной MetaMorph программного обеспечения.. Отдельные клетки распределены зависимости от соотношения между интенсивностью в 450 и 535 нм каналах.