Для просмотра этого контента требуется подписка на JoVE. Войдите или начните свой бесплатный пробный период.

Методическая статья

Характеризуя Состав молекулярных моторов на перемещение аксонов Грузы Использование "Грузовой Mapping" Анализ

9.3K просмотров

DOI:

10.3791/52029

30 октября 2014 г.

* These authors contributed equally

В этой статье

Краткое содержание

Внутриклеточный транспорт грузов, таких как везикулы или органеллы, осуществляется молекулярными моторными белками, которые отслеживаются по поляризованным микротрубочкам. Этот протокол описывает корреляцию направленности транспорта отдельных частиц груза, движущихся внутри нейронов, с относительным количеством и типом ассоциированных моторных белков.

Аннотация

Понимание механизмов, с помощью которых молекулярные моторы координации их деятельности для транспортировки везикулярные грузов в нейронах требуется количественный анализ двигатель / грузовых ассоциаций на одном уровне пузырьков. Цель этого протокола заключается в использовании количественных флуоресцентной микроскопии соотнести ("карта") позицию и направленность движения живого груза к составу и относительных количеств двигателей, связанных с тем же грузом. "Отображение Cargo" состоит из живых изображений флуоресцентно меченных грузов, движущихся в аксонов культивируемых на микрофлюидных устройств с последующей химической фиксации во время записи живого движения, и последующее иммунофлюоресценции (ИФ) окрашивания тех же аксонов регионах с антителами против двигателей. Колокализации между грузов и связанных с ними двигателей оценивается путем присвоения позиции субпиксельную координаты моторных и грузовых каналов, по монтажу функций Гаусса к дифракционной-лираничена функции рассеяния точки, представляющие отдельные люминесцентные точечные источники. Фиксированные грузовые и моторные образы впоследствии накладывается на участках движения грузового, чтобы "карта" их на гусеничных траекторий. Сила этого протокола является сочетание живой и IF данные для записи как транспорт везикулярного грузов в живых клетках и определять двигатели, связанные с этими же самыми пузырьков. Эта методика позволяет преодолеть прежние проблемы, которые используют биохимические методы для определения средней состав двигателя очищенных гетерогенных популяций массовых пузырьков, как эти методы не выявляют композиции на отдельных движущихся грузов. Кроме того, этот протокол может быть адаптирован для анализа других транспортных и / или оборот путей в других типах клеток коррелирует движение отдельных внутриклеточных структур с их белкового состава. Ограничения этого протокола являются относительно низкая производительность за счет низкой эффективности трансфекции культивируемыхпервичные нейроны и ограниченное поле зрения, доступного для изображений с высоким разрешением. Будущие приложения могут включать в себя методы, чтобы увеличить количество нейронов, экспрессирующих флуоресцентно меченных грузов.

Введение

Внутриклеточный транспорт имеет решающее значение во всех типах клеток для доставки белков, мембран, органелл и сигнальных молекул в различных сотовых областях 1. Нейроны являются узкоспециализированными клетки с длинными, поляризованных проекций, что критически зависят от внутриклеточного транспорта эфирных грузов для их дальней доставки различных аксонов микродоменов. Этот транспорт опосредуется кинезинов и динеинами - два больших семейств белков молекулярных двигателей - которые связываются с грузами и отслеживать вдоль поляризованных микротрубочек в антероградная и ретроградных направлений, соответственно. В то время как ретроградная движение в основно....

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Протокол

Все эксперименты проводились следующие утвержденные протоколы и в соответствии с ведомственным руководящим принципам для гуманной помощи исследовательских животных. Новорожденных мышей умерщвляли путем обезглавливания.

1. Подготовка микрожидкостных устройств для сотовых культуры

  1. Подготовка полидиметилсилоксан (PDMS) микрофлюидных устройств для роста нейронов гиппокампа, как описано Харрисом и его коллегами 17-19. Ниже приведены некоторые модификации, которые были адаптированы к протоколу отображения грузов.
    Примечание: микрожидкостных устройства также являются коммерчески доступными (Список материалов), таким ....

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Результаты

На рисунке 1 показан обзор микрожидкостных устройств используется расти гиппокампа нейронов (1А, Б). Нейроны высевают в резервуаре 1. Размер микроканалов препятствует диффузии клеточных тел (сомы) в аксонов отделении в то время как длина каналов предотвращает дендритные прогнозы от пересечения весь путь к аксонов отсеке. После ~ 2-3 дней в культуре, нейроны начинают расширяя свои аксоны через микроканалы в аксонов отсека (рис 1B, C). Трансфицированные аксоны, экспрессир.......

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Обсуждение

Протокол, представленные здесь дает соотношение направленности движения отдельных флуоресцентных микротрубочек на основе перемещения грузов частиц с относительной типа и количества связанных моторных белков в живых нейронов. Ранее общая моторная состав аксонов везикулярного грузов анализировали на гетерогенных популяций биохимически очищенных везикул и органелл 9,15. Тем не менее, характеризующие двигатель композиция для одного типа груза внутри клеток было достаточно сложной задаче.......

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Раскрытие информации

Авторам нечего раскрывать.

Благодарности

Мы благодарим Ге Янга, Гауденца Данусера, Хулуда Джакамана и Дэниела Вислера за помощь в адаптации и разработке программного обеспечения для количественного картирования грузов, а также Эмили Нидерст за помощь в создании микрофлюидных устройств. Эта работа была частично поддержана грантом NIH-NIA AG032180 L.S.B.G. и Медицинским институтом Говарда Хьюза. L.S. была частично поддержана грантом NIH Bioinformatics Training Grant T32 GM008806, S.E.E. была поддержана стипендией Фонда исследования рака Деймона Раньона, грантом NIH по обучению нейропластичности AG000216, а также грантом от Медицинского фонда Эллисона New Scholar in Aging Award, G.E.C была поддержана премией NI....

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Материалы

Список материалов, использованных в этой статье
ИмяКомпанияКаталожный номерКомментарии
поли-L-лизинSigmaP5899-20 мг
D-MEM (Dulbecco' s Модифицированная Eagle Medium) с высоким содержанием глюкозы, с L-глутамином, без пирувата натрия (1x)Life Technologies11965092
FBS (фетальная бычья сыворотка)Life Technologies10082147
Нейробазал-А Medium (1x)Life Technologies10888022
B-27 Сывороточная добавкаLife Technologies10888022
Добавка GlutaMAX I (100x)Life Технологии35050061
HBSS (1x) (Хэнк LifeTechnologies24020117
DPBS (Dulbecco' s Фосфатно-солевой буфер, без магния, без кальция (1x)Life Technologies14190250
пенициллин/стрептомицин (100x)Life Technologies15140122
Corning cellgro Water for Cell Culture Fisher ScientificMT46000CM
PapainUSB Corporation19925
DL-цистеин HClSigma-AldrichC9768
BSA (бычий сывороточный альбумин)Sigma-AldrichA7906
D-глюкозаSigma-AldrichG6152
DNAse I grade IIRoche Applied Sciences10104159001
Липофектамин 2000Технологии Жизни 
Раствор формальдегида 16% ЭМ классаFisher Scientific50980487Внимание: Вреден при вдыхании, контакте с кожей и при проглатывании. Раздражает глаза, дыхательную систему и кожу. Утилизируйте в соответствии с официальными правилами.
СахарозаFisherScientific S5-500
HEPESSigmaH-3375
Нормальная сыворотка ослаJackson Immuno Research017-000-0121
BSA жирные кислоты и IgG без жирных кислот и IgGJackson Immuno Research001-000-162
АцетонFisher ScientificBP2403-4
ЭтанолFisher ScientificBP2818-100
ProLong Gold антифлюидный реагентLife TechnologiesP36934
Покровное стекло 1 1/2. 24 x 40 ммCorning2980-244
Axis микрофлюидное устройство, 450 &; mMilliporeAX450
Adobe PhotoshopAdobe
Nikon Eclipse TE2000-U Фотоаппарат Nikon
Coolsnap HQ Roper Scientific
60 ммFisher Scientific12-565-95
Чашка для клеточной культуры 150 мм FisherScientific12-565-100
Используемые антитела:
Легкая цепь анти-кинезин, V-17Santa Cruz sc-13362проверена с использованием нейронов KLC1-/- (ссылка 16), рекомендуемое разведение 1:100.
Тяжелая цепь Anti Dynein 1, R-325Санта-Круз sc-9115проверена с использованием shRNA против DYN1HC1 (Ref. 16), рекомендуемое разведение 1:100
Alexa Fluor 568 Donkey Anti-Rabbit IgG АнтителаLife TechnologiesA10042  Рекомендуемое разведение 1:200.
Alexa Fluor 647 Donkey Anti-Rabbit IgG (H+L) АнтителаLife TechnologiesA31573  Рекомендуемое разведение 1:200.
Alexa Fluor 568 Donkey Anti-Goat IgG (H+L) Антитела IgG АнтителаLife TechnologiesA11057  Рекомендуемое разведение 1:200.
Alexa Fluor 647 Donkey Anti-Goat IgG (H+L) АнтителаLife TechnologiesA21447  Рекомендуемое разведение 1:200.
Плагины и макросы
ImageJ  http://imagej.nih.gov/ij/index.html. 
ImageJ Плагинhttp://www.embl.de/eamnet/html/body_kymograph.html.
11668027Чашка для клеточной культуры Специфичность Специфичность для кимографа

Ссылки

  1. Goldstein, A. Y. N., Wang, X., Schwarz, T. L. Axonal transport and the delivery of pre-synaptic components. Curr. Opin. Neurobiol. 18, 495-503 (2008).
  2. Hirokawa, N. Kinesin and dynein superfamily proteins and the mechanism of organelle transport. Science.

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Перепечатки и разрешения

Теги