Настоящее исследование описывает простой способ обнаружения эндогенными уровнями Rab10 фосфорилирования лейцин богатые повторить киназа 2.
Методическая статья
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
| Имя | Компания | Каталожный номер | Комментарии |
|---|---|---|---|
| <сильно>Реагенты | |||
| Дульбекко фосфатно-солевой буферный раствор (DPBS) | домашнего производства | 150 мМ NaCl, 8 мМ Na<суб>2HPO<суб>4-12H<суб>2О, 2,7 мМ KCl, 1,5 мМ KH2PO4 in MilliQ воды и стерилизованный автоклавированием | |
| хлорида натрия | Nacalai Теске | 31320-34 | |
| Натрия динатрия гидрогенфосфат 12-водный | Wako | 196-02835 | |
| Хлорид калия | Wako | 163-03545 | |
| Калия дигидрофосфат | Wako | 169-04245 | |
| 2,5% трипсин (10X) | Sigma-Aldrich | T4549 | Разбавить в 10 раз стерильным DPBS для приготовления рабочего раствора |
| Модифицированная среда от Dulbecco (DMEM) | Wako | 044-29765 | |
| Фетальная бычья сыворотка | BioWest | S1560 | Термоинактивированная при 56 ° C за 30 мин |
| Пенициллин-стрептомицин (100X) | Wako | 168-23191 | |
| HEPES | Wako | 342-01375 | |
| Гидроксид натрия | Wako | 198-13765 | |
| Полиэтиленимин HCl MAX, Linear, Mw 40,000 (PEI MAX 40000) | PolySciences, Inc. | 24765-1 | Стоковый раствор готовили в 20 мМ HEPES-NaOH pH 7,0 при 1 мг/мл и затем доводили pH до 7,0 с помощью NaOH |
| Dimethylsulfoxide | Wako | 045-28335 | |
| Tris | STAR | RSP-THA500G | |
| соляной кислоты | Wako | 080-01066 | |
| полиоксиэтилен(10) октилфенилового эфира | Wako | 160-24751 | в эквиваленте Triton X-100 |
| Этиленгликоль-бис(2-аминоэтиловый эфир)-N,N,N',N'-тетрауксусная кислота (EGTA) | Wako | 346-01312 | |
| Ортванадат натрия(V) | Wako | 198-09752 | |
| Фторид натрия | Kanto Chemical | 37174-20 | |
| &бета;-Глицерофосфорная кислота Динатриевая соль пентагидрат | Nacalai Tesque | 17103-82 | |
| Sodium пирофосфатдекагидрат | Kokusan Chemical 2113899 | ||
| Microcystin-LR | Wako | 136-12241 | |
| Сахароза | Wako | 196-00015 | |
| Полный коктейль ингибиторов протеазы без ЭДТА | Roche | 11873580001 | Растворите одну таблетку в 1 мл воды, которую можно хранить при температуре -20 °°; C в течение месяца. Используйте его в разведении 1:50 для лизиса клеток |
| Pierce Coomassie (Bradford) Набор для анализа белка | Thermo Fisher Scientific | 23200 | |
| Додецилсульфат натрия | Nacalai Tesque | 31607-65 | |
| Глицерин | Wako | 075-00616 | |
| Бромфенол синий | Wako | 021-02911 | |
| β-меркаптоэтанол | Kanto Chemical | 25099-00 | |
| Этанол | Wako | 056-06967 | |
| Метанол | Wako | 136-01837 | |
| Фосфатсвязывающий акриламид | Wako | AAL-107 | P-tag акриламид |
| 40% (w/v) раствор акриламида | Nacalai Tesque | 06119-45 | Акриламид:Bis = 29:1 |
| Тетраметилэтилендиамин (TEMED) | Nacalai Tesque | 33401-72 | |
| Персульфат аммония (APS) | Wako | 016-08021 | 10% (мас./об.) раствор готовили путем растворения порошка персульфата аммония в воде MilliQ |
| 2-пропанол | Wako | 166-04831 | |
| Тетрагидрат хлорида марганца | Sigma-Aldrich | M3634 | |
| Precision Plus Protein Prestained Standard | Bio-Rad | 1610374, 1610373, 1610377 | Маркер молекулярной массы, используемый в протоколе |
| WIDE-VIEW Prestained Protein Size Marker III | Wako | 230-02461 | |
| Glycine | Nacalai Tesque | 17109-64 | |
| Amersham Protran NC 0.45 | GE Healthcare | 10600007 | Нитроцеллюлозная мембрана |
| Durapore Мембранный фильтр | EMD Millipore | GVHP00010 | PVDF мембрана |
| Фильтровальная бумага No1 | Advantec | 00013600 | |
| Ponceau S | Nacalai Tesque | 28322-72 | |
| Уксусная кислота | Wako | 017-00251 | |
| Tween-20 | Sigma-Aldrich | P1379 | полиоксиэтиленорбитан монолаурат |
| этилендиаминтетрауксусная кислота (ЭДТА) | Wako | 345-01865 | |
| Сухое обезжиренное молоко | Difco Laboratories | 232100 | |
| Immunostar | Wako | 291-55203 | ECL раствор (нормальная чувствительность) |
| Immunostar LD Wako | 290-69904 | ECL раствор (высокая чувствительность) | |
| CBB раствор для окрашивания домашний | 1 | г CBB R-250, 50% (v/v) метанол, 10% (v/v) уксусная кислота в 1 л воды MilliQ | |
| CBB R-250 | Wako | 031-17922 | |
| CBB для задержания раствор | домашнего приготовления | 12% (v/v) метанола, 7% (v/v) уксусной кислоты в 1 л MilliQ вода | |
| Название | Company | >Каталожный номер | Комментарии |
| Антитела | |||
| anti-HA антитела | Sigma-Aldrich | 11583816001 | Используется при 0,2 μ г/мл для иммуноблоттинга. |
| anti-Rab10 anti-Rab10 | Cell Signaling Technology | #8127 | Используется в 1:1000 для иммуноблоттинга. Специфичность подтверждена CRISPR KO в Ito et al., Biochem J, 2016. |
| анти-pSer935 антитело | Abcam | ab133450 | Используется в 1 μ г/мл для иммуноблоттинга. |
| антитело против LRRK2 | Abcam | ab133518 | Используется в 1 μ г/мл для иммуноблоттинга. |
| анти-&альфа;-тубулиновое антитело | Sigma-Aldrich | T9026 | Используется при 1 μ г/мл для иммуноблоттинга. |
| антитело против GAPDH | Santa-Cruz | sc-32233 | Используется при 0,02 мкм; г/мл для иммуноблоттинга. |
| Пероксидаза AffiniPure Sheep Anti-Mouse IgG (H+L) | Jackson ImmunoResearch | 515-035-003 | используется в дозе 0,16 мкм; г/мл для иммуноблоттинга. |
| Пероксидаза AffiniPure Goat Anti-rabbit IgG (H+L) | Jackson ImmunoResearch | 111-035-003 | Используется в дозе 0,16 μ г/мл для иммуноблоттинга. |
| Name< | strong>Company | Каталожный номер | Комментарии |
| InhibitorsGSK2578215A | |||
| MedChem Express | HY-13237 | Стоковый раствор готовили в ДМСО при 10 мМ и хранили при -80 °°; C | |
| MLi-2 | Предоставлено доктором Дарио Алесси (Университет Данди) | Исходный раствор был приготовлен в ДМСО при 10 мМ и хранился при -80 °°; C | |
| Name | Company | Номер в каталоге< | strong>Comments |
| Plasmids | |||
| Rab10/pcDNA5 FRT TO HA | Предоставлено доктором Дарио Алесси (Университет Данди) | Эта плазмида экспрессирует аминотерминальную мечку ГА человека Rab10. | |
| LRRK2 WT/p3xFLAG-CMV-10 | Предоставлено доктором Такеши Ивацубо (Токийский университет) | Ито и др., Биохимия, 46: 1380– 1388 (2007). Эта плазмида экспрессирует амино-концевую метку 3xFLAG-меченного дикого типа человека LRRK2. | |
| LRRK2 K1906M/p3xFLAG-CMV-10 | предоставлено доктором Такеши Ивацубо (Токийский университет) | Ито и др., Биохимия, 46: 1380– 1388 (2007). Эта плазмида экспрессирует амино-концевой K1906M-меченный K1906M киназный неактивный мутант человеческого LRRK2. | |
| LRRK2 N1437H/p3xFLAG-CMV-10 | Этот документ. Эта плазмида экспрессирует амино-концевой 3xFLAG-меченный N1437H FPD мутант человеческого LRRK2. | ||
| LRRK2 R1441C/p3xFLAG-CMV-10 | Предоставлено доктором Такеши Ивацубо (Токийский университет) | Kamikawaji et al., Биохимия, 48: 10963– 10975 (2013). Эта плазмида экспрессирует амино-концевой 3xFLAG-меченный R1441C FPD мутант человеческого LRRK2. | |
| LRRK2 R1441G/p3xFLAG-CMV-10 | предоставлено доктором Такеши Ивацубо (Токийский университет) | Kamikawaji et al., Биохимия, 48: 10963– 10975 (2013). Эта плазмида экспрессирует амино-концевой 3xFLAG-меченный мутант R1441G FPD человека LRRK2. | |
| LRRK2 R1441H/p3xFLAG-CMV-10 | предоставлено доктором Такеши Ивацубо (Токийский университет) | Kamikawaji et al., Биохимия, 48: 10963– 10975 (2013). Эта плазмида экспрессирует амино-концевой 3xFLAG-меченный мутант R1441H FPD человека LRRK2. | |
| LRRK2 R1441S/p3xFLAG-CMV-10 | Этот документ. Эта плазмида экспрессирует амино-концевой 3xFLAG-меченный R1441S FPD мутант человеческого LRRK2. | ||
| LRRK2 Y1699C/p3xFLAG-CMV-10 | Предоставлено доктором Такеши Ивацубо (Токийский университет) | Kamikawaji et al., Биохимия, 48: 10963– 10975 (2013). Эта плазмида экспрессирует амино-концевой меченный 3xFLAG мутант Y1699C FPD человека LRRK2. | |
| LRRK2 G2019S/p3xFLAG-CMV-10 | Предоставлено доктором Такеши Ивацубо (Токийский университет) | Kamikawaji et al., Биохимия, 48: 10963– 10975 (2013). Эта плазмида экспрессирует амино-концевой 3xFLAG-меченный G2019S FPD мутант человеческого LRRK2. | |
| LRRK2 I2020T/p3xFLAG-CMV-10 | предоставлено доктором Такеши Ивацубо (Токийский университет) | Kamikawaji et al., Биохимия, 48: 10963– 10975 (2013). Эта плазмида экспрессирует амино-концевой 3xFLAG-меченный I2020T FPD мутант человеческого LRRK2. | |
| Name< | strong>Company | Номер в каталоге | Комментарии |
| Equipments | |||
| CO2 инкубатор | Thermo Fisher Scientific | Forma Series II 3110 | |
| Drummond | Pipet-Aid PA-400 | ||
| Микропипетка P10 Микропипетка | 00-NPX2-10 | 0.5– 10 μ L | |
| Микропипетка P200 | Ничирио | 00-NPX2-200 | 20– 200 μ L |
| Микропипетка P1000 | Ничирио | 00-NPX2-1000 | 100– 1000 μ L |
| Наконечники для микропипетки P10 | STAR | RST-481LCRST | Стерильные |
| наконечники для микропипетки P200 | FUKAEKASEI | 1201-705YS | Стерильные |
| наконечники для микропипетки P1000 | STAR | RST-4810BRST | Стерильные |
| 5 мл диспорсибельная пипетка | Greiner | 606180 | Стерильные |
| 10 мл диспорсибельная пипетка | Greiner | 607180 | Стерильная |
| 25 мл диспорируемая пипетка | Falcon | 357535 | Стерильный |
| гематоцитометр | Солнцесвинцовое стекло | A126 | Улучшенный микроскоп Neubeuer |
| Olympus | CKX53 | ||
| 10 см посуда | Falcon | 353003 Для | культуры тканей |
| 6-луночные планшеты | AGC Techno Glass | 3810-006 | Для культуры тканей |
| Вихревой смеситель | Scientific Industries | Vortex-Genie 2 | |
| Скребки | Sumitomo Bakelite | MS-93100 | |
| 1,5 мл Тубы | STAR | RSV-MTT1,5 | |
| 15 мл Тубы | AGC Techno Glass | 2323-015 | |
| 50 мл Тубы | AGC Techno Glass | 2343-050 | |
| Центрифуги | TOMY | MX-307 | |
| 96-луночные планшеты | Greiner | 655061 | не для тканевых культур |
| Планшет для чтения | молекулярных приборов | SpectraMax M2e | |
| SDS– PAGE баки | Nihon Eido | NA-1010 | |
| Передаточные баки | Nihon Eido | NA-1510B | |
| Гелевые пластины (с насечкой) | Nihon Eido | NA-1000-1 | |
| Гелевые пластины (гладкие) | Nihon Eido | NA-1000-2 | |
| Силиконовые прокладки | Nihon Eido | NA-1000-16 | |
| 17-луночные гребни | Nihon Eido | Custom made | |
| Связующие зажимы | Nihon Eido | NA-1000-15 | |
| 5 мл шприц | Terumo | SS-05SZ | |
| 21G | Terumo | NN-2138R | |
| Power Station 1000 VC | ATTO | AE-8450 | Блок питания для SDS– СТРАНИЦА и трансфер |
| Большие весовые лодки | Ina Optika | AS-DL | |
| Пластиковые контейнеры | КАК ОДИН | ПС КЕЙС No4 | 10 х 80 х 50 мм |
| Качалка | Шейкер Titech | NR-10 | |
| Пеностирольный ящик | общий | Внутренние размеры должны вместить один передаточный бак (200 х 250 х 250 мм). | |
| ImageQuant LAS-4000 | GE Healthcare | Имидж-сканер, оснащенный охлаждаемой ПЗС-камерой для обнаружения ECL |
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Запросить разрешение на повторное использование текста или иллюстраций этой статьи JoVE
Запросить разрешение