$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Схематическая иллюстрация стимуляции цитокинов, используемых для поляризации клеток моноцитов к M0 (M2-как клетки), M1 (полностью поляризованные клетки M1) и M2 (полностью поляризованные клетки M2) представлена на рисунке 1A, в то время как репрезентативные изображения M0, M1 и M2 клеточных культур, а также M1 культур в день 0, 3 и 7, показаны на рисунке 1B. Неинфицированные ячейки M0 были использованы для демонстрации основной стратегии гэтинга(рисунок 2A). Первоначально миелоидные клетки (85%) были закрыты в соответствии с их вперед рассеяния (FSC) и бокового рассеяния (SSC) свойства, включая большие клетки с высокой детализацией и за исключением мелких мусора с низким SSC и FSC, которые находятся в левом нижнем углу точка участка. На втором участке дублеты (т.е. клеточные сгустки) были определены как имеющие увеличенную площадь, но аналогичную высоту по сравнению с одиночными ячейками, и были исключены из дальнейшего анализа. Таким образом, только ячейки, пропорциональные между FSC-Area и FSC-Height (одиночные ячейки) были включены внутри наклонных ворот формы. Далее, зомби-УФ жизнеспособности красителя, который пятна цитоплазмических белков внутри мертвых клеток, был использован, чтобы исключить мертвые клетки из последующего анализа. Как и ожидалось, жизнеспособные неинфицированные клетки M0 были отрицательными для выражения Mtb-GFP, визуализированого в fitC-канале.
Далее, мы применили ту же стратегию закрытого для неинфицированных, а также Mtb-инфицированных M1 и M2 макрофагов на 4 часа после заражения(рисунок 2B,C). Две суб популяции были обнаружены в воротах FCS/SSC неинфицированных поляризованных макрофагов М1; одна популяция с меньшим размером (FCS) и более высокой детализацией (SSC) и другая популяция с большим размером и более низкой детализацией(рисунок 2B),в то время как главные ворота неинфицированных клеток M2 казались более однородными(рисунок 2C). Клетки, полученные из M1 и M2, показали вертикальный сдвиг к более высокой детализации и уменьшенный размер клеток при инфекции Mtb, что может отражать повышенную сложность внутри клеток, вызванную поглощением внутриклеточных бактерий Mtb(рисунок 2B,C). Кроме того, пятно жизнеспособности выявило повышенную гибель клеток (17-22%) среди клеток Mtb-инфицированных M1 и M2 в МВД 5, по сравнению с неинфицированными клетками M0 (99%) (Рисунок 2A-C) или неинфицированные ячейки M1 и M2 (данные не показаны). Репрезентативные данные показали, что экспрессия Mtb-GFP (т.е. инфекционная способность Mtb) была значительно выше в M2 (77% GFP-положительных клеток) по сравнению с M1 (19% GFP-положительных клеток) клетки после 4 часов инфекции (Рисунок 2B,C). После 24 часов инфекции, экспрессия Mtb-GFP была 43% и 85% в клетках M1 и M2 соответственно, предполагая, что клетки M1 имели относительно более высокий рост экспрессии GFP от 4-24 часов после инфекции Mtb по сравнению с клетками M2, 126% против 10,4% увеличение GFP-выражения в клетках M1 и M2 от 4-24 часов, соответственно.
Для характеристики эффективности поляризации M1/M2 в неинфицированных моноцитов полученных клеток, точка участки были использованы для выявления M1 клетки, которые были двойной положительный дляCD64и CD86 (CD64иCD86 ) и M2 клетки, которые были двойной положительный для CD163 и CD200R (CD163-CD200R ) ; Рисунок 3A,B). Выбор маркеров M1/M2 был в первую очередь сделан на основе результатовнашей предыдущей работы 25, но и издругих исследований 26,27,28,29. Квадранты для окрашенных клеток, были установлены с использованием соответствующих ворот для необлитающих клеток M1/M2(рисунок 3A). Ни один из этих маркеров не выражается исключительно клетками M1 или M2, но доля положительных клеток, а также интенсивность выражения поверхности различны. Это было особенно очевидно из пятнаM1,где около 95% клеток M1 и 79% клеток M2 были CD64и CD86 , но интенсивность окрашивания была значительно выше в подмножестве M1 (Рисунок 3A). В то время как 27% клеток M1 были положительными для M2-маркера CD200R, только 1% былиположительными для CD163, обеспечивая 0,5% CD163 и CD200R и M1 клетки по сравнению с 63% CD163и CD200R и M2 клеток (рисунок 3A). После 4 часов инфекции Mtb, увеличение частоты CD200Rи клеток наблюдалось в Mtb-GFP-положительных M1 поляризованных клеток (16%), в то время как CD163-выражение было сокращено в клетках M2(рисунок 3B). Тепловая карта демонстрирует высокую интенсивность GFP-выражения в подмножестве CD163иCD200R, а также в подмножестве клеток CD64 и CD86и M2 по сравнению с соответствующими подмножествами ячеек M1 (рисунок 3B). В целом, сдвиг в выражении соответствующих маркеров M1 и M2 также визуализируется в гистограммах на рисунке 3C. Кроме того, бактерии Mtb-GFP также визуализировались в клетках CD64и M1, а в клетках CD163и M2 с помощью конфокарной микроскопии, которая поддерживала повышенное внутриклеточное поглощение и/или рост Mtb внутри M2 по сравнению с клетками M1(рисунок 3D).
Чтобы проверить результаты ручного gating, мы применили уменьшение размерности с помощью равномерного многообразного приближения и проекции (UMAP). Анализ UMAP показал, что инфекции Mtb в течение 4 часов было недостаточно, чтобы повлиять на поляризацию макрофагов, в отличие от 24 часов инфекции, что привело к четко разделенных кластеров M1 и M2 неинфицированных и инфицированных клеток(рисунок 4A). Неинфицированные макрофаги M1 отображали более высокую экспрессию макрофагов CD64, CD86, TLR2, HLA-DR и CCR7 по сравнению с макрофагами M2, в то время как неинфицированные клетки M2 продемонстрировали сильную регулировку фенотипных маркеров M2 CD163, CD200R, CD206 и CD80 (Рисунок 4B,C). В согласии с ручным gating, Mtb инфекции после 24 часов вызвало четкое downregulation CD163, CD200R и CD206 на M2 клеток и upregulation CD86 и HLA-DR на M1 клеток (Рисунок 4B,C), что свидетельствует о том, что Mtb может модулировать макрофаг поляризации. Последующий фенографический анализ (Рисунок 4D-F) определил 24 различных кластеров различных размеров, которые были однозначно распределены между M1 и M2 неинфицированных и Mtb-инфицированных клеток, как показано на графиках UMAP (Рисунок 4D), пирог диаграммы (Рисунок 4E) и тепловые карты (Рисунок 4F). В целом, эти результаты показывают многообещающую эффективность этого протокола для генерации фенотипически и функционально разнообразны M1 и M2 поляризованных клеток in vitro, которые дополнительно модулируются инфекцией Mtb.

Рисунок 1: Схематическая иллюстрация дифференциации in vitro и поляризации клеток, полученных из миелоидов человека. (A) M0 (M2-как), M1 (классически активированный) и M2 (альтернативно активированные) клетки изображены. Моноциты, полученные от здоровых доноров крови, были поляризованы с различными цитокинами, как описано в протоколе, и инфицированы штаммом Mtb с маркировкой GFP, H37Rv, в течение 4 часов до анализа с цитометрией 10-цветного потока. М1-поляризованные клетки обычно содержат меньше бактерий по сравнению с M2-поляризованными клетками. (B)Микроскопические изображения полностью поляризованных, неинфицированных клеток M0, M1 и M2 в 6-хорошо пластин на 7-й день, и репрезентативные изображения дифференциации клеток M1 от моноцитов в день 0, 3 и 7. Увеличение в 20 раз (верхняя панель) и 10x (нижняя панель). Обратите внимание, что клетки M1 более вытянуты и растянуты по сравнению с более округлыми ячейками M0 и M2 (верхняя панель). Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой цифры.

Рисунок 2: Gating стратегии дифференциально поляризованных миелоидных производных клеток. Представитель точка участков,показывающих ( )Вперед рассеяния (FSC) и бокового рассеяния (SSC) свойства неинфицированных M0 макрофагов. В сюжете FSC-A/FSC-H показана ручная заготовки одиночных ячеек, пропорциональных площади и высоте. Ворота живых клеток исключали клетки, которые были положительными для зомби-УФ (краситель жизнеспособности). Внутриклеточный Mtb был обнаружен GFP-выражением в живых клетках, наблюдаемых в канале FITC. (B) Gating M1 и ( C )M2макрофаги, показывающие FCS / SSC точка участков как в неинфицированных клеток и Mtb-инфицированных клеток 4 ч и 24 ч после заражения. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой цифры.

Рисунок 3: Эффективность протокола поляризации in vitro M1/M2. Представитель точка участков и квадрант gating показаны подмножества частот M1- и M2-поляризованных клеток с использованием CD64 и CD86 (M1) или CD163 и CD200R (M2) в ()необитых и окрашенных неинфицированных клеток и (B) Mtb-инфицированных окрашенных клеток 4 ч пост-инфекции. Точечные участки в (B) иллюстрирует интенсивность флуоресценции GFP-выражения (тепловая карта) в M1- и M2-поляризованных макрофагов, полученных из различных суб-ворот. (C)Геометрическое среднее интенсивности флуоресценции (МФО) показано в гистограммах от одного представителя донора после 4 ч инфекции Mtb. Значения МФО в неинфицированных клетках M1 (светло-голубой) и M2 (светло-фиолетовый) представлены в верхней панели, а Mtb-инфицированные M1 (глубоко-синие) и M2 клетки (глубокий фиолетовый) представлены в нижней панели. (D)Показаны конфокальные изображения неинфицированных и инфицированных МТБ М1- и М2-поляризованных клеток. Клетки M1 и M2 были окрашены для выражения CD64 и CD163, соответственно, с использованием иммунофлуоресценции. Положительное окрашивание поверхности показано красным цветом, а внутриклеточные бактерии, выражаюющие GFP, показаны зеленым цветом. Ядра, окрашенные в DAPI, показаны в синем цвете. Шкала - 10 мкм. Увеличение изображения справа составляет 350x. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой фигуры.

Рисунок 4: Уменьшение размерности с помощью единообразного многообразного приближения и проекции (UMAP) и фенографического анализа неинфицированных и зараженных M1 и M2 клеток M1 и M2. (A) UMAP, созданный путем контатенатации 11000 живых клеток из неинфицированных и Mtb-инфицированных M1 и M2 клеточных культур от двух репрезентативных доноров крови, 4 ч (левые графики) или 24 ч (правые графики) после инфекции. Тепловая карта для GFP-выражения (нижняя панель) указывает на неинфицированные и инфицированные Mtb клетки. (B-C) МФО маркеров, выраженных в неинфицированных и Mtb-инфицированных M1 и M2 клеток 24 ч после инфекции, показано, как (B) тепловой карты или (C) бар участков. (D-F) Фенографический анализ выявил 24 кластера, которые дифференцированно распределены между неинфицированными и инфицированными M1 и M2 культурами M1 и M2. Кластеры 8-13 уникальны в неинфицированных клетках M1, кластеры 1-7 уникальны в Mtb-инфицированных клетках M1, кластеры 20-24 уникальны в неинфицированных клетках M2 и кластеры 14-19 уникальны в Mtb-инфицированных клетках M2. МФО каждого маркера в каждом фенографическом кластере отображается в (F). Данные представлены как неинфицированные M1 (светло-голубые) и M2 клетки (светло-фиолетовый) и Mtb-инфицированных M1 (глубоко синий) и M2 клеток (глубокий фиолетовый). Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой цифры.
Таблица 1: Список антител, используемых для цитометрии потока.
| лазер | фильтр | Фторхром | фенотип | функция | клон | Каталог No. | компания |
| 639 | 670/30 | AF647 | TLR2 | Рецептор распознавания патогенов | TL2.1 | 309714 | БиоЛегенд |
| 639 | 780/60 | БТР-Си7 | CD206 | Рецептор маннозы | 15-2 | 321120 | БиоЛегенд |
| 405 | 610/20 | BV605 | CD163 | Рецептор мусорщика | GHI/61 | 333616 | БиоЛегенд |
| 405 | 670/30 | BV650 | CD80 | Молекула состимулятора | 2D10 | 305227 | БиоЛегенд |
| 405 | 710/50 | BV711 | CCR7 | Рецептор химоккина | G043H7 | 353228 | БиоЛегенд |
| 405 | 780/60 | BV785 | CD86 | Молекула состимулятора | IT2.2 | 305442 | БиоЛегенд |
| 488 | 530/30 | GFP | Мтб | Внутриклеточные бактерии | | | |
| 561 | 586/15 | PE | CD200R | Ингибиторный рецептор | OX-108 | 329306 | БиоЛегенд |
| 561 | 620/14 | PE/DAZZLE 594 | CD64 | Fc гамма-рецептор-I IgG | 10.1 | 305032 | БиоЛегенд |
| 561 | 661/20 | PE-Cy5 (PC5) | HLA-DR | Молекула класса II MHC | L243 | 307608 | БиоЛегенд |
| 355 | 450/50 | BUV395 | Жизнеспособность красителя | Маркер живых/мертвых клеток | Зомби УФ | 423108 | Инвитрог |