Основные этапы способа, которые описаны для получения одноклеточной суспензии лейкоцитов матки, обобщены на рисунке 3. На рисунке 2B показана базовая стратегия гатинга FACS, используемая для идентификации трех подмножеств G1 ILC у мышей B6: клеток uILC1 (CD49a + Eomes-), trNK (CD49a + Eomes +) и cNK (CD49a-Eomes +). Дальнейший анализ этих популяций может быть выполнен для изучения различных поверхностных и внутриклеточных маркеров g1 ILC. Например, коэкспрессия рецепторов IFN-ɣ и self-MHC может быть оценена в клетках uILC1, trNK и cNK после стимуляции антителом против NK1.1 (рисунок 7).
В зависимости от вопроса исследования могут быть адаптированы как протокол (рисунок 3), так и панель антител. Важно отметить, что рекомендуется использовать как анти-NK1.1, так и анти-NKp46 антитела в одной панели FACS для g1 ILC g1 (рисунок 2B и таблица 1). Следует отметить, что G1 ILC, полученные из крови, селезенки или печени, имеют более высокую экспрессию NKp46 на своей поверхности, чем маточный аналог (рисунок 8). Окрашивание поверхности для NK1.1 обеспечивает лучшее разделение и позволяет легко закрывать ILC g1 матки (рисунок 8). В то время как NKp46 экспрессируется всеми штаммами мышей, антиген NKR-P1C, распознаваемый антителом PK136 против NK1.1, экспрессируется только некоторыми штаммами мышей, включая C57BL/6 (т.е. B6), FVB/N и NZB, но не в AKR, BALB/c, CBA/J, C3H, DBA/1, DBA/2, NOD, SJL или 129. Кроме того, если исследователь намерен изучить важнейшие рецепторы NK-клеток, такие как рецепторы MHC Ly49, важно знать об аллельных вариациях в лабораторных штаммах мышей, которые повторяют высокую вариабельность иммуноглобулиноподобных рецепторов-киллеров человека (KIR). Более того, если клетки должны стимулироваться NK1.1 для функционального анализа, как описано в Kim, S. et al.20, может быть желательно окрашивать клетки анти-NKp46, а не анти-NK1.1, так как антиген NKR-P1C может быть занят сшивающим анти-NK1.1 или рецептор может следовать за стимуляцией. Либо поглощенность рецепторов, либо пониженная регуляция могут препятствовать окрашиванию тем же антителом, которое используется для стимуляции.
Распространенной проблемой диссоциации ферментативной ткани является изменение поверхностных эпитопов на клетках ферментами, используемыми для среды пищеварения. Например, окрашивание для рецептора MHC CD94:NKG2A является плохим, если используется Liberase TM. Однако пищеварение с Liberase DH сохраняет распознавание NKG2A клоном антитела 16A11 (рисунок 9). Рекомендуется проверить влияние ферментов на все эпитопы в своей панели FACS. Для этого используют суспензию мышиных спленоцитов, полученную путем механической диссоциации (пропускания всей селезенки через 70 мкм ситечко). Затем образец разделяют на две или более частей с последующей инкубацией со средой с ферментом (ферментами) или без него.
Как упоминалось ранее, клетки, полученные из крови, присутствуют в тканевых диссоциированных образцах. При необходимости загрязняющие вещества крови могут быть исключены с помощью метода внутрисосудистого окрашивания, разработанного в лаборатории Масопуста21. Рисунок 10 показывает, что около 6,5% G1 ILC, присутствующих в образцах тканей матки на 8,5-й день беременности, получены из крови. Анти-CD45 антитела, используемые для внутрисосудистого окрашивания, могут быть конъюгированы с фторхромом, используемым для дампа-канала; это исключит загрязнители крови без использования дополнительного флуоресцентного канала. Наиболее распространенные проблемы и их решения представлены в таблице 2.

Рисунок 1: Поперечное сечение матки мыши. (A) Поперечное сечение матки мыши (небеременное), указывающее на разнообразие материнских лейкоцитов, которые населяют матку. (B) Поперечное сечение матки мыши (день беременности 8,5). (C) Поперечное сечение матки мыши (день беременности 13,5). (D) Сравнение образования плаценты мыши и человека от стадии бластоцисты и далее. Изображения, созданные с помощью BioRender.com. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 2: Субпопуляции матки g1 ILC1. (A) Процентное содержание маточного cNK, ILC1 и trNK у мышей в раннем возрасте и во время беременности. W - недели, gd - день беременности. Модифицированный график от Filipovic, I. et al.4. (B) Стратегия гатинга для анализа подмножеств ILC группы матки 1 с помощью проточной цитометрии. Лимфоциты выделяли из тканей матки на 10,5 день беременности. Переваривание тканей проводили с использованием среды для пищеварения, содержащей Liberase TM. Клетки были закрыты на основе их способности рассеивать свет. Дублеты были исключены с использованием графика FSC-A против FSC-H, и только CD45 + CD3-CD19- жизнеспособные клетки были проанализированы дополнительно. В CD45+CD3-CD19-жизнеспособных клетках ILC группы 1 был идентифицирован как клетки NK1.1+ NKp46+. В группе 1 ILC могут быть идентифицированы три подмножества: CD49a-Eomes+ обычные NK-клетки (cNK), CD49a + Eomes + тканевые резидентные NK-клетки (trNK) и CD49a + Eomes-uILC1. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 3: Визуальное руководство по основным шагам протокола. (1) Рассечение матки беременной без мезотриального жира. (2) Удалить плоды; вернуть матку в пробирку объемом 5 мл и измельчить ткань. Приступайте к этапу переваривания ферментов: добавьте 3 мл теплой ферментативной смеси для пищеварения в каждый образец. Инкубировать пробирки по 5 мл в течение 30 мин при 37 °C с перемешиванием. (3) (i) После пищеварения смойте все из 5 мл пробирок в пробирки по 15 мл, используя 10 мл ледяного 5 мМ раствора EDTA PBS. ii) Центрифуги 15 мл пробирки, содержащие переваренные ткани в течение 10 мин при 400 х г. iii) выбросить супернатант; Осторожно смахните гранулу и повторно суспендируйте ее в 10 мл теплого (37 °C) 5 мМ раствора EDTA PBS. iv) Инкубировать образцы в пробирках объемом 15 мл при 37°С с перемешиванием в течение 15 мин. (4) Используя поршень стерильного шприца объемом 1 мл, форсируйте переваренную ткань через ситечко 70 мкм на правильно маркированную и стерильную трубку объемом 50 мл и вращайте в течение 10 минут при 400 х г. (5) После отжима перейдите к варианту A (представленному здесь на диаграммах) или B. Вариант A: выбросьте супернатант из трубки объемом 50 мл и, используя пипетку, повторно суспендируйте каждую гранулу в 8 мл 40% (v/v) изотонического Percoll в PBS. (6) i) Вариант А продолжение: Используя пипетку на медленной скорости, осторожно накладывайте гранулу, повторно суспендированную в 40% растворе Перколла, на 5 мл 80% раствора Перколла. Пипетка медленно и непрерывно; удерживать трубку объемом 15 мл под углом 45°. ii) Не нарушая накладки, центрифугировать трубки объемом 15 мл при температуре 850 х g в течение 20 мин при комнатной температуре со средним ускорением и медленным разрывом. (7) После отжима, пытаясь высосать минимальное количество раствора Перколла (всего до 4-5 мл), тщательно соберите кольцо лейкоцитов. (8) Выполните этапы лизиса эритроцитов. (9) Подсчитайте ячейку, используя трипан синий и камеру Нойбауэра. (10) Перенесите 1-2 миллиона клеток на скважину в круглодонную 96-луночную пластину. (11) Приступайте к окрашиванию красителем жизнеспособности и антителами. (12) Наконец, перенесите образцы в маркированные пробирки FACS. Храните трубки на льду или в холодильнике до обработки анализом FACS в течение 24 ч. Изображения, созданные с помощью BioRender.com. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 4: Вагинальная пробка (A) и ее отсутствие (B) у самок C57BL/6 через 0,5 дня после спаривания. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 5: Рассечение для извлечения матки у беременной мыши. (А) Плотина зажимается иглами на мягкой доске, чтобы протереть тело 70% этанолом. Сделаны два вертикальных разреза, на что указывают синие пунктирные линии. (B) Кожа подтягивается для обнажения внутренних органов. Кишечные петли осторожно перемещаются вверх, чтобы визуализировать матку. (C) Матка отбирается путем разрезания в трех точках: рядом с яичниками и на шейке матки, о чем свидетельствуют две синие пунктирные линии и синяя стрелка, соответственно. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 6: Приготовление одноклеточной суспензии. (А) Механическое удаление эмбрионов из места их имплантации. B) наложение градиента Перколла; верхний слой содержит одноэлементную суспензию в 40% Перколла, а нижний слой в 80% Перколла. (C) Образование кольца лимфоцитов после центрифугирования градиента перколла. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 7: Репрезентативный анализ FACS функционального анализа с ILC группы 1. Внутриклеточное обнаружение IFN-ɣ и поверхностного CD107a в ILC группы 1, экспрессирующих NK-рецепторы для само-MHC (Ly49C, Ly49I и NKG2A) по сравнению с теми, которые этого не делают, после сшивания NK1.1 с пластинчатыми антителами. Клетки были выделены из тканей матки на 9,5 день беременности. Тканевое переваривание проводили с использованием среды пищеварения, содержащей Liberase DH. Показаны исходные значения всех четырех квадрантов (углов), а также относительный процент респондентов среди клеток, экспрессирующих рецепторы для себя и респондентов, которые не имеют саморецепторов (жирные числа). Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 8: Окрашивание селезеночных и маточных лимфоцитов антителами анти-NKp46 и анти-NK1.1. (A) Клеточные суспензии, полученные из мышиной селезенки и (В) матки на 10,5-й день беременности, были разделены на две части; одна деталь была окрашена NKp46-APC (красный), а другая - NK1.1-APC (синий). Обратите внимание, что окрашивание NKp46 лимфоцитов матки не разделяет NKp46+ и NKp46-клетки так же аккуратно, как селезеноциты. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 9: Снижение NKG2A MFI (клон антитела: 16A11) путем инкубации со средой пищеварения. Клеточная суспензия мышиных спленоцитов C56BL/6 была разделена на три части. Одну часть инкубировали в среде пищеварения Liberase DH (HBSS, содержащей 0,13 WU/mL Liberase DH и 30 мкг/мл DNAse), а другую часть инкубировали со средой пищеварения Liberase TM (HBSS, содержащей 0,52 WU/mL Liberase TM и 30 мкг/мл DNAse). Третью часть обрабатывали аккуратным HBSS в течение 30 мин при 37 °C. Экспрессию маркера NKG2A на ILC g1 оценивали с помощью проточной цитометрии. График взят из Шрива Н. Роль ингибирования NK-клеток матки при беременности (тезисы); Руководитель: Колуччи Ф, 2020. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 10: Прижизненное окрашивание антителами против CD45 для исключения G1 ILC, полученных из крови. Мышь C57BL/6 dam на 8,5-й день беременности отбраковывали через 3 мин после внутривенной инъекции с 3 мкг CD45-AF647. Матка, цельная кровь и тимус были собраны и обработаны для анализа FACS. Ось X показывает сигнал от внутривенного окрашивания CD45-AF647, а ось Y демонстрирует сигнал от окрашенного in vitro CD45-BUV395. Проценты субпопуляций показаны в квадрантах. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
| Антитела / Краситель | Клон | Фторхром | Лазер |
| 1 (канал дампа) | Зомби Фиолетовый Поправимый Краситель жизнеспособности | | | Фиолетовый |
| СД19 | 1Д3 | БВ421 |
| СД3 | 145-2С11 | БВ421 |
| 2 | СД45 | 30-Ф11 | ФИТК | Синий |
| 3 | НК1.1 | ПК136 | БВ605 | Фиолетовый |
| 4 | НКП46 | 29А1,4 | БТР | Красный |
| 5 | СД49а | Ха31/8 | БУВ395 | Ультрафиолетовый |
| 6 | ЭОМЕС | Дан11маг | ЧП | Зеленый |
Таблица 1: Пример панели FACS для обычного 5-лазерного цитометра.
| Проблема | Возможная причина | Предложение |
| Кольцо ячейки не видно на границе раздела двух растворов Перколла | Плохое наслоение перколл-раствора или смешивание двух слоев во время обработки образца | Будьте особенно осторожны, чтобы не сломать 80% подушку во время наложения. Обратите внимание во время обработки образцов: не нарушайте интерфейс percoll |
| Низкое количество лейкоцитов (например, при использовании небеременной матки) | Интерфейс можно увидеть даже тогда, когда номер ячейки на интерфейсе очень низкий. Даже если кольцо не видно, соберите жидкость с содержанием от 40% до 80% растворов, так как все еще может быть достаточно ячеек для дальнейшей обработки. |
| Неполный лизис РБК | Клетки не были повторно суспендированы должным образом в буфере лизирования | Пипетки вверх и вниз, чтобы сломать сгустки и полностью повторно суспендировать клетки в буфере лизирования |
| Раствор лизирования холодный | Уравновешивайте раствор лизирования до комнатной температуры перед использованием |
| Увеличение времени инкубации раствором лизирования до 15мин |
| Стадия лизиса RBC может быть повторена |
| Низкий выход ячеек | Плохое ферментативное пищеварение | Проверьте, не устарели ли ферменты и не хранились ли они в соответствии с их руководствами |
| Потеря клеток во время этапов промывки | Осматривайте ячейку гранулы после каждого этапа промывки: непрозрачные гранулы на дне скважины после отжима. Использование V-образного дна вместо U-образных пластин, центрифуги с поворотным ротором, более длительного времени центрифугирования может снизить потери клеток |
| Образец ткани содержит низкое количество лимфоцитов (например, при использовании небеременной матки) | Объедините несколько маток, чтобы получить достаточно событий для анализа. Рассмотрите возможность использования варианта B протокола для изоляции ячеек |
| Высокая вариабельность абсолютных чисел лейкоцитов, полученных у мышей той же группы | Непоследовательный сбор ячеек на границе раздела 40% и 80% растворов перколла | Убедитесь, что вы собрали целую фракцию ячейки на интерфейсе percoll. Рассмотрите возможность использования варианта B протокола для изоляции ячеек |
| Неспособность обнаружить ожидаемые субпопуляции /маркеры лимфоцитов или необычно низкий MFI для некоторых маркеров клеточной поверхности | Ферментативное пищеварение влияет на поверхностную экспрессию некоторых эпитопов или их деградацию | Оптимизация ферментативного пищеварения путем изменения: фермента (например, на другой тип либеразы или коллагеназы) и/или продолжительности инкубации и/или концентрации фермента |
| Высокий фоновый шум в проточном цитометре | Высокая доля клеточного мусора или загрязнения эритроцитами | Настройте пороговый параметр FSC. Рассмотрите возможность использования варианта A протокола для изоляции ячеек |
Таблица 2: Руководство по устранению неполадок.