Микротрубочки (МТ) представляют собой удлиненные трубчатые структуры, состоящие из протофиламентов, состоящих из α/β-тубулиновых гетеродимерных субъединиц. Они играют важную роль в различных клеточных процессах, таких как деление клеток, подвижность, поддержание формы и внутриклеточный транспорт, что делает их неотъемлемыми компонентами эукариотического цитоскелета. Минус-конец МТ, где экспонируется субъединица α-тубулина, относительно стабилен, тогда как плюс-конец, где экспонируется субъединица β-тубулина, подвергается динамической деполимеризации и полимеризации2. Этот непрерывный цикл присоединения и диссоциации димера тубулина на плюс-конце, называемый динамической нестабильностью, приводит к повторяющемуся процессу спасения икатастрофы. МТ демонстрируют фокальные домены с локализованными вариациями динамической неустойчивости, включая стабильные и лабильные домены4.
Точный контроль динамической нестабильности МТ имеет решающее значение для многих клеточных функций, особенно в нейронах, характеризующихся сложной морфологией. Адаптивность и долговечность МТ играют жизненно важную роль в развитии и правильном функционировании нервных клеток 5,6,7. Было обнаружено, что динамическая нестабильность МТ связана с различными посттрансляционными модификациями (ПТМ) тубулина, такими как ацетилирование, фосфорилирование, пальмитоилирование, детирозинирование, дельта2, окисление полиглутамина и полиглицилирование. Кроме того, связывание белков, ассоциированных с микротрубочками (MAP), служит регуляторным механизмом8. ПТМ, исключая ацетилирование, преимущественно встречаются в карбоксиконцевой области тубулина, расположенной на наружной поверхности МТ. Эти модификации создают разнообразные поверхностные условия на МТ, влияя на их взаимодействие с MAP и, в конечном счете, определяя устойчивость МТ9. Наличие карбокси-концевого остатка тирозина в α-тубулине свидетельствует о динамических МТ, которые быстро замещаются пулом свободного тубулина. И наоборот, детирозинация карбокси-конца и ацетилирование Lys40 означают стабильные МТ с пониженной динамической нестабильностью 9,10.
ПТМ тубулина широко использовались в экспериментах по оценке динамики и стабильности МТ 5,7,11,12,13,14,15. Например, в исследованиях клеточных культур тубулины могут быть разделены на два пула: пул свободного тубулина и пул МТ. Это достигается высвобождением свободного тубулина через пермеабилизацию клеток перед фиксацией оставшихся МТ 15,16,17,18,19. Биохимические методы включают использование химических стабилизаторов МТ, которые защищают МТ от катастрофы, позволяя отделять МТ и свободный тубулин путем центрифугирования20,21,22. Тем не менее, эти процедуры не различают стабильные и менее стабильные (лабильные) МТ, что делает невозможным количественное определение МТ или растворимого тубулина в тканях, таких как головной мозг. Следовательно, оценка стабильности МТ у организмов в физиологических и патологических условиях оказалась сложной задачей. Чтобы устранить это экспериментальное ограничение, мы разработали новый метод точного разделения МТ и свободного тубулина в тканях мыши23.
Этот уникальный метод фракционирования МТ включает в себя гомогенизацию тканей в условиях, поддерживающих статус тубулина в тканях, и двухступенчатое центрифугирование для разделения стабильных МТ, лабильных МТ и свободного тубулина. Эта простая процедура может быть применена к широким исследованиям, включая фундаментальные исследования МТ и МАП у живых организмов, физиологический и патологический анализ здоровья и заболеваний, связанных со стабильностью МТ, а также разработку лекарств и других терапевтических средств, нацеленных на МТ.