RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
ru_RU
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Lianteng Zhi1, Jingyu Zhao1, David Jaffe1, Yuanxin Chen1, Ninghan Wang1,2, Qi Qin1, Erin L. Seifert3, Chenjian Li4, Hui Zhang1
1Department of Neuroscience,Thomas Jefferson University, 2School of Biomedical Engineering,Drexel University, 3Department of Pathology, MitoCare Center,Thomas Jefferson University, 4School of Life Sciences,Peking University
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Норма потребления кислорода (OCR) является общим показателем митохондриальной функции и может использоваться для изучения различных моделей заболеваний. Мы разработали новый метод с использованием анализатора Seahorse XF для непосредственного измерения OCR в острых полосатых срезах у взрослых мышей, который более физиологически актуален, чем другие методы.
Митохондрии играют важную роль в клеточной продукции АТФ, регуляции активных форм кислорода и контроле концентрации Ca2+ . Митохондриальная дисфункция была вовлечена в патогенез множественных нейродегенеративных заболеваний, включая болезнь Паркинсона (БП), болезнь Хантингтона и болезнь Альцгеймера. Чтобы изучить роль митохондрий в моделях этих заболеваний, мы можем измерить митохондриальное дыхание через скорость потребления кислорода (OCR) в качестве прокси для функции митохондрий. OCR уже был успешно измерен в клеточных культурах, а также в изолированных митохондриях. Однако эти методы менее физиологически значимы, чем измерение OCR в острых срезах мозга. Чтобы преодолеть это ограничение, авторы разработали новый метод с использованием анализатора Seahorse XF для непосредственного измерения OCR в острых полосатых срезах у взрослых мышей. Методика оптимизирована с акцентом на полосатое тело, область мозга, участвующую в БП и болезни Гентингтона. Анализатор выполняет анализ живых клеток с использованием 24-луночной пластины, что позволяет одновременно проводить кинетическое измерение 24 образцов. Метод использует круговые перфорированные куски стриатальных срезов мозга в качестве образцов. Мы демонстрируем эффективность этой методики, выявляя нижний базальный OCR в полосатых срезах мышиной модели БП. Этот метод будет представлять широкий интерес для исследователей, работающих в области БП и болезни Гентингтона.
Митохондриальная дисфункция была вовлечена в несколько неврологических заболеваний, включая болезнь Паркинсона (БП), болезнь Хантингтона и болезнь Альцгеймера 1,2,3. Модели PD, такие как нокаутные мыши PINK1 (KO) и крысы, демонстрируют нарушение митохондриальной функции 4,5,6,7,8,9,10,11. Митохондрии, выделенные из полосатого тела (STR) или всего мозга стареющей мыши PINK1 KO, демонстрируют дефекты в комплексе I 7,10,12,13. Непосредственное измерение скорости потребления кислорода (OCR) является одним из наиболее распространенных методов оценки митохондриальной функции, поскольку OCR связан с продукцией АТФ, основной функцией митохондрий14. Таким образом, измерение OCR в моделях заболеваний или образцах / тканях, полученных от пациента, может помочь исследовать, как митохондриальная дисфункция приводит к заболеванию.
В настоящее время существует несколько способов измерения митохондриального OCR, включая электрод Кларка и другие электроды O2, флуоресцентный краситель O2 и внеклеточный анализатор потока 15,16,17,18,19. В качестве преимущества методы на основе электродов O2 позволяют легко добавлять различные подложки. Однако их недостаточно для одновременного измерения нескольких образцов. По сравнению с традиционными методами на основе электродовO2, внеклеточный анализатор потока, широко используемый инструмент для OCR в клеточных культурах или очищенных митохондриях, предлагает улучшенную пропускную способность 15,18,20. Тем не менее, все эти методы обычно применяются для измерения OCR в изолированных митохондриях или клеточных культурах 6,16,17,19,20,21. Выделение митохондрий вызывает непреднамеренное повреждение, а извлеченные митохондрии или клеточные культуры менее физиологически значимы, чем интактные срезы мозга22. Даже когда микроэлектроды используются в срезах, они менее чувствительны и более сложны в эксплуатации, чем в культивируемых клетках23.
Для решения этих задач мы разработали метод с использованием анализатора внеклеточного потока XF24, который позволяет анализировать множественные метаболические параметры острых полосатых срезов мозга мышей24. Этот метод обеспечивает непрерывную прямую количественную оценку митохондриального дыхания через OCR. Короче говоря, небольшие участки стриатальных срезов мозга помещаются в лунки островковой пластинки, а анализатор использует биосенсоры на основе кислорода и протонов на основе флуоресценций для измерения скорости OCR и внеклеточного подкисления соответственно 17,21,25.
Одной из уникальных особенностей анализатора являются четыре нагнетательные скважины, которые позволяют непрерывно измерять OCR при последовательной закачке до четырех соединений или реагентов; это позволяет измерять несколько параметров клеточного дыхания, таких как базальный митохондриальный OCR, ATP-связанный OCR и максимальный митохондриальный OCR. Соединения, введенные в ходе измерений по протоколу, показанному здесь, представляли собой рабочие концентрации пирувата 10 мМ в первой скважине раствора (порт А), 20 мкМ олигомицина во второй скважине раствора (порт В), 10 мкМ карбонилцианида 4-(трифторметокси) фенилгидразона (FCCP) в третьей скважине (порт С) и 20 мкМ антимицина А в четвертой скважине (порт D), на основе Фрида и др.25. Следует отметить, что эти концентрации были рабочими концентрациями, и исходные растворы 10x, 11x, 12x и 13x вводились в порты раствора A-D соответственно. Цель использования каждого решения заключалась в следующем: 1) Пируват был необходим, поскольку без него добавление FCCP имело бы сниженную реакцию OCR, вызванную ограничением доступных субстратов; 2) Олигомицин ингибирует АТФ-синтазу и позволяет измерять АТФ-связанное дыхание; 3) FCCP отделяет окисление от фосфорилирования и позволяет измерять максимальную митохондриальную емкость; 4) Антимицин А ингибирует комплекс III в цепи переноса электронов и, следовательно, позволяет измерять OCR, не связанный с митохондриями.
Концентрацию используемого олигомицина определяли исходя из следующих причин: 1) Рекомендуемая доза олигомицина для большинства типов клеток (изолированных митохондрий или клеточных культур) составляет 1,5 мкМ. По опыту, обычно для экспериментов с срезом используется доза диссоциированных клеток 3х-10х, так как может быть градиент, а проникновение раствора в срезы требует времени. Поэтому концентрация должна быть в диапазоне от 5 мкМ до 25 мкМ. 2) Концентрация 20 мкМ была выбрана на основе Fried et al.25. Более высокие концентрации не были опробованы из-за неспецифической токсичности олигомицина. 3) В отчете Underwood et al.26 авторы провели эксперимент по титрованию олигомицина и обнаружили, что дозы в 6,25, 12,5, 25 и 50 мкг / мл приводили к аналогичному ингибированию. Более высокая концентрация олигомицина (50 мкг/мл) не ингибировала больше, но имела большую дисперсию. 4) По нашим наблюдениям, определяющим фактором, по-видимому, является проникающая способность олигомицина. Олигомицину трудно проникнуть в ткани, и именно поэтому требуется не менее 7 - 8 циклов, чтобы достичь плато, максимального ответа. До тех пор, пока он достигает плато, торможение считается максимальным.
Ключевой технической проблемой адаптации внеклеточного анализатора флюса для измерения OCR в стриатальных срезах является предотвращение гипоксии тканей. Поскольку буфер не насыщался кислородом в течение всей продолжительности измерений (около 4 ч), гипоксия была центральной проблемой. Это особенно верно для более толстых образцов тканей, где кислород не может диффундировать по всем образцам. Чтобы преодолеть эту проблему, срезы были разделены на толщину 150 мкм, чтобы окружающий кислород мог проникать в середину срезов мозга. Кроме того, 4 мг/мл бычьего сывороточного альбумина (BSA) добавляли в буфер предварительно оксигенированной искусственной спинномозговой жидкости (ACSF), что облегчало определение максимального OCR, как предлагалось ранее23. Мы исследовали, живы ли клетки. Во-первых, Hoechst 33258 (10 мкМ) и йодид пропидия (10 мкМ) были использованы для изучения того, являются ли клетки здоровыми в этих условиях. Затем мы изучили, являются ли средние колючие нейроны функционально здоровыми, используя запись зажимов. Мы также оценили, были ли терминалы дофамина (DA) в стриатальных срезах функционально здоровыми, измеряя высвобождение DA с помощью вольтамметрии быстрого сканирования. Результаты показали, что стриатальные срезы, которые не были насыщены кислородом (группа ACSF / BSA), были такими же здоровыми, как и контрольная группа24 с кислородом.
Затем мы протестировали различные комбинации толщины среза и размера перфоратора, чтобы определить оптимальные условия стриатального среза для анализа дыхания флюсом. Для анализа OCR с использованием анализатора использовались дорсальные стриатальные срезы различной толщины (150 мкм и 200 мкм) и размеров перфоратора (1,0 мм, 1,5 мм и 2,0 мм в диаметре). Стриатальные срезы толщиной 150 мкм с диаметром перфоратора 1,5 мм имели наивысшую эффективность соединения и OCR в оптимальном для анализатора24 диапазоне.
Все процедуры, включая работу с животными, проводились в соответствии с национальными и международными руководящими принципами и были одобрены Комитетом по уходу за животными и их использованию Университета Томаса Джефферсона. Использовались самцы мышей FVB/NTac в возрасте от 3 до 14 месяцев. Следующие шаги были выполнены в нестерильных условиях, но следует соблюдать осторожность, чтобы все было как можно более чистым.
ПРИМЕЧАНИЕ: Метод, представленный здесь, был установлен и использован в исследовании, о котором сообщили Zhi et al.24. В экспериментах, описанных здесь, использовался внеклеточный анализатор потока Seahorse XF24 (см. Таблицу материалов). Эти методы могут быть адаптированы для анализатора XFe24, и некоторые результаты были подтверждены с помощью этого анализатора.
1. Датчики гидрата картриджа (за 1 день до анализа)
2. Подготовьте тканевую пластинку (в день анализа)
3. Приготовление острых стриатальных ломтиков и размещение иссеченных ломтиков
4. Загрузка патронов нужными составами
5. Калибровка и выполнение анализа
Первым шагом этого исследования была оптимизация толщины среза и размера перфоратора, используемого для вырезания участка полосатого тела из среза (рисунок 3A). Срез толщиной 150 мкм и размером перфоратора 1,5 мм давал наилучшие результаты, определяемые эффективностью соединения (рисунок 3B-C). Как показано на рисунке 3B, OCR относительно стабилен в течение 5 ч при снижении менее 10%. Кроме того, использовались функциональные измерения, а также запись корковых нейронов и средних колючих нейронов в полосатом теле и измерение высвобождения DA с быстрым сканированием циклической вольтамметрии (FSCV), чтобы продемонстрировать, что нейроны и терминали были полностью функциональны в этом препарате, как показано в Zhi et al.24. В комплекте с этим мы затем протестировали различные концентрации FCCP, чтобы обнаружить, какой из них даст лучший ответ; 10 мкМ FCCP дали наилучшее считывание (рисунок 3D1,D2), определяемое запасной дыхательной способностью:
Запасная дыхательная способность = максимальное дыхание - базальное дыхание
Эти условия среза использовались для измерения различий в OCR полосатых срезов у мышей PINK1 KO и однопометников дикого типа (WT). Для результатов мышей PINK1 KO и WT использовали 3-4 мыши и использовали 4-6 реплик на мышь и усредняли для получения одной точки данных. Поскольку PINK1 является ключевым регулятором митохондриальной функции, ожидалось, что митохондриальная дисфункция будет обнаружена у мышей KO, измеренная снижением митохондриальной OCR. Действительно, возрастное снижение OCR было очевидно у мышей KO по сравнению с их контрольной группой WT (рисунок 4A, D). Базальный OCR был аналогичен как в группах KO, так и WT для молодых мышей (3-4 месяца); однако базальный OCR снизился у мышей KO в старой группе (10-14 месяцев; Рисунок 4B,E). Эффективность соединения, определяемая следующим образом,
Эффективность соединения = [скорость производства АТФ] / [базальная частота дыхания] × 100
однако уменьшился у мышей KO как для молодой, так и для старой групп (рисунок 4C,F). Эти данные демонстрируют, что участки стриатальной ткани у мышей PINK1 KO имели митохондриальную дисфункцию. Эта дисфункция у мышей KO также началась с раннего возраста, о чем свидетельствует снижение эффективности связи, хотя базальный OCR был снижен только в старой группе. Это возрастное снижение, вероятно, было результатом накопления митохондриальных дефектов, вызванных нокаутом PINK1.

Рисунок 1: Изображения, показывающие внеклеточный анализатор потока гидратных картриджных датчиков и пластины. (A) Картридж датчика, расположенный поверх калибровочной пластины (вспомогательной пластины). (B) Вид сбоку на пластину утилиты и пластину картриджа датчика. Треугольная выемка картриджной пластины утилиты и датчика должна быть правильно выровнена. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 2: Прикрепление и размещение перфорированного среза. (A) Перфорированный срез прикрепляется к сетчатой вставке экрана захвата, а затем (B) помещается в один из колодцев инкубационной островковой пластины осторожно, чтобы срез не отсоединялся и не двигался во время измерения. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 3: Оптимальное состояние стриатального среза для анализа флюсового дыхания. (A) Диаграмма размеров тканевого перфоратора (1,0 мм, 1,5 мм и 2,0 мм в диаметре) для полосатого тела (STR) с красными кругами, представляющими области, которые были получены для анализа. (В1) O2 Нормы расхода (OCR) для различных толщин и размеров перфораторов срезов в контрольной группе показали стабильное базальное дыхание в течение всего измерения (4 ч), а OCR был пропорционален объему среза. OCR измеряли в срезах толщиной 150 мкм и 200 мкм, пробитых перфорацией 1,0 мм, 1,5 мм и 2,0 мм. Используемые комбинации упоминаются в легендах как толщина * размер перфоратора (например, 150 мкм * 1 мм). (В2) Усредненные OCR, измеренные в срезах толщиной 150 мкм, пробитых перфорацией 1,5 мм; n = 7. (С1) Репрезентативные ответы OCR срезов различной толщины и диаметра с пируватом 10 мМ (P), 20 мкМ олигомицина (O), 10 мкМ FCCP (F) и 20 мкМ антимицина A (A), вводимого последовательно. Стрелки указывают временную точку инъекции этих соединений. (С2) Эффективность митохондриальной связи сравнивалась между различными группами. Срезы размером 150 мкм* 1,5 мм имели высокую эффективность соединения, но наименьшую дисперсию; n = 4. (Д1) Был проведен эксперимент по титрованию для FCCP, и 10 мкМ FCCP дали наибольшую резервную мощность; n = 4 для каждой группы. (Д2) Эксперименты по титрованию для FCCP проводились с помощью анализатора, и 10 мкМ FCCP давали наибольшую резервную мощность; n = 4 для каждой группы. Значения, приведенные на рисунках, являются средними ± стандартной погрешности среднего значения (SEM). Этот рисунок был изменен по сравнению с Zhi et al.24. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 4: Срезы PINK1 KO из старой группы, показывающие значительно более низкий OCR. OCR острых срезов STR (150 мкм * 1,5 мм) у мышей в молодой (A, B и C) и старой группах (D, E и F), подвергшихся последовательному добавлению респираторных модуляторов (показано с помощью стрелок). OCR молодой группы существенно не отличался между различными генотипами (B), в то время как эффективность связи (определяемая как процентное значение с использованием формулы, упомянутой выше%) была снижена в срезах PINK1 KO (C). В старой группе PINK1 KOslices показали значительное снижение уровня базального дыхания (E) и эффективности связи (F). Следующий раствор, пируват 10 мМ (P), 20 мкМ олигомицина (O), 10 мкМ FCCP (F) и 20 мкМ антимицина A (A), вводили последовательно. n = 4 для каждого генотипа и возраста. Значения, приведенные на рисунках, являются средними ± SEM. Разница считалась существенной, когда p < 0,05 (*). Эта цифра была изменена с Zhi et al.24. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Авторам нечего раскрывать.
Норма потребления кислорода (OCR) является общим показателем митохондриальной функции и может использоваться для изучения различных моделей заболеваний. Мы разработали новый метод с использованием анализатора Seahorse XF для непосредственного измерения OCR в острых полосатых срезах у взрослых мышей, который более физиологически актуален, чем другие методы.
Мы благодарим Вангчена Церинга и Памелу Уолтер за их критическое прочтение и редактирование этой рукописи. Эта работа была поддержана Национальным институтом неврологических расстройств и инсульта (NINDS) (NS054773 для C.J. L. и NS098393 для H.Z.) и кафедрой неврологии в Университете Томаса Джефферсона (Startup Funds to H.Z.).
| Настольный измеритель pH Accumet AB150 | Thermo Fisher Scientific | 13-636-AB150 | Для измерения pH |
| Antimycin A из streptomyces sp. | SIGMA | A8674 | Для ингибирования комплекса III митохондриального |
| сывороточного альбумина крупного рогатого скота (BSA) | SIGMA | A6003 | Для получения модифицированной искусственной спинномозговой жидкости (BSA-ACSF) |
| Карбонилцианид 4-(трифторметокси) фенилгидразон (FCCP) | SIGMA | C2920 | Для разъединения митохондриального дыхания |
| D-глюкоза | SIGMA | G8270 | Для создания искусственной спинномозговой жидкости (ACSF) |
| DMSO | SIGMA | D8418 | Для удаления соединений |
| HEPES | SIGMA | H3375 | Для изготовления искусственной спинномозговой жидкости (ACSF) |
| Инкубатор с увлажненной жидкостью без CO2 | Fisher Scientific | 11-683-230D | Для гидратации планшетов при температуре 37 градусов; |
| C Олигомицин из Streptomyces diastatochromogenes | SIGMA | O4876 | Для ингибирования митохондриальной АТФ-синтазы |
| Парапленка | SIGMA-ALDRICH | герметизирующая пленка | |
| Rotenone | Tocris | 3616 | Для ингибирования комплекса I митохондрий |
| Морской конек XF Calibrant Раствор 500 мл Морской | конек Bioscience | 103681-100 | Раствор для калибровки морского конька |
| Анализатор внеклеточного потока Seahorse XF | Бионаучное | оборудование Seahorse | для анализа потребления кислорода, старое поколение |
| Анализатор внеклеточного потока Seahorse XFe24 | Бионаучное | оборудование Seahorse | для анализа потребления кислорода, новое поколение |
| Seahorse XF24 FluxPaks | Seahorse | Bioscience 101174-100 | Упаковка картриджей для датчиков анализатора потока, планшетов для культивирования тканей, экранов захвата, калибровочные растворы и калибровочные планшеты; Набор для анализов. |
| Пируват натрия | SIGMA | P2256 | Для предотвращения любых ограничений подачи субстрата, ограничивающих субстрат |
| Пробойники для биопсии из нержавеющей стали | Miltex | Устройство, используемое для пробивания срезов | |
| Стерильная чашка для клеточных культур, 35 x 10 мм | Eppendrof | 0030700102 | Используется для пробивки срезов |
| Vibratome | Leica VT1200 | Для среза тканей мозга | |
| Водяная баня | Thermo Scientific Precision | 282-115 | К тепловому буферу и растворам |