Тест на целостность мембранного уплотнения
Для проверки целостности герметичного чипа верхняя камера заполняется деми-водой с синим красителем, а дно — чистой деми-водой. Щепы оставляют на ночь для оценки возможной утечки синего красителя из верхней камеры вокруг мембраны в нижнюю.
Полностью изготовленные силиконовые чипы, приготовленные нашим методом, могут деформироваться вдоль до 35° без нарушения целостности мембраны, теперь они заключены и связаны с верхней половиной с помощью гибкого раствора PDMS с обеих сторон. Деформация PDMS-чипов — это нормальная часть использования, например, когда половинки или чипсы прилипают к чашке Петри.
Чипы подключались к двунаправленной системе шприцового насоса для проверки их работы при давлении, вызванном потоком. Чипы с мембранами ПЭТ и ПК могут работать без утечки между камерами или разрыва чипов до и включая 30 кПа (максимальное давление, предоставляемое насосами). В предыдущих исследованиях чипы стандартно работают при 150 мкл/ч, что создаёт давление 0,7 Па на камеры каждого устройства8.
Визуализация связывания мембраны
Для визуализации проникновения жидкого раствора PDMS в поры мембраны диаметром 0,4 мкм под микроскопом в результате вакуумной герметизации RT раствор PDMS был окрашён в Nile Red. Nile Red был выбран так как это гидрофобный краситель, который хорошо смешивается с PDMS в жидком виде. Окраска была подготовлена путём тщательного смешивания 1% Nile Red в жидкой PDMS для получения красного цвета под световой микроскопией. Процедура отверждения РТ была повторена, как описано выше. Мембраны с окрашенным раствором встраивались в парафин и разделялись с помощью микротома. Мембранные срезы монтировались на стеклянные стекла и снимались с помощью светового микроскопа (рисунок 4). Для подтверждения необходимости как разбавливать PDMS в раствор с толуолом, так и применять вакуум для проникновения PDMS в поры мембраны, сравнивать мембраны с этими методами и без них можно увидеть на дополнительном рисунке 3.
Тест на жизнеспособность клетки
В предыдущем исследовании была проверена потенциальная химическая токсичность при использовании толуола при изготовлении устройств. Чипы были приготовлены с толуолом и без него в ступе PDMS, эпителиальные клетки аденокарциномы лёгких Calu-3 выращивались до слияния в течение 2 дней и культивировались в чипах в течение 1 дня, как описаноранее, 8. Гибель клеток оценивался с помощью окрашивания в синий цвет трипана, удаления всех клеток из устройства и подсчёта мёртвых клеток (синих) по сравнению с неокрашенными жизнеспособными клетками. Пролиферация оценивалась путём инкубации реагентов в микросреде перед проведением анализа AlamarBlue, считывающего флуоресцентное поглощение через считыватель пластин, что отражает пролиферацию (рисунок 5)8.
Прикрепление базальной мембраны РЭБ
Чтобы показать общую применимость этой процедуры для получения прочного и гибкого связывания с различными мембранами, протокол был повторён с полностью внеклеточной матрицей (ЭКМ) мембраной (рисунок 6). Базальная мембрана, содержащая каркасы ECM, были получены из мочевого пузыря свинины, как описаноранее, 17. Кратко: свиные мочевые пузырьки самок возрастом от 4 до 8 месяцев были получены на местной бойне (Kroon Vlees b.v., Гронинген, Нидерланды) и обработаны в течение 3 часов после сбора. Соединительная ткань и жир были удалены из мочевого пузыря, мочевой пузырь перевернули наизнанку, а эпителиальный слой был тупо вскрыт, при этом ткань в PBS оставалась при комнатной температуре. Каркасы ЭБУ были обезвожены для процедуры креплениямембраны 17. Подготовленные каркасы были разрезаны и связаны с половинами чипа PDMS, как описано в протоколе выше. Была создана новая форма с дополнительными камерами для натяжения мембраны внутри устройства, чтобы показать, что вакуумные силиконовые связи также выдерживают горизонтальное механическое напряжение (Дополнительный файл 2).
Тест на целостность мембраны РЭБ
Тест на целостность мембраны был проведён как выше. Далее стрейч-чип был подключён к шприцовым насосам, которые создавали вакуум в боковых камерах устройства, создавая 1 мм горизонтального растяжения мембраны ECM за ночь (рисунок 7).
Дифференцировка эпителиальных клеток и кокультуры фибробластов в стандартном дыхательных путях на чипе с мембраной ПЭТ
Для подтверждения эффективности предоставленного чипа как дыхательных путей на чипе для клеток ALI, в предыдущемисследовании 8 были выращены клетки аденокарциномы лёгких Calu-3 (ATCC, Манассас, Вирджиния, США) для слияния и воздействия воздуха в устройстве. После 10 дней воздействия апикального воздуха эпителиальные клетки Calu-3 дифференцируются в клетки, производящие слизу, что подтверждается образованием слизи, измеренным окрашиванием Alcian blue (рисунок 8)8.
Для подтверждения нашей процедуры длительного течения без протечек и совместного культивирования можно привести пример из предыдущей публикации; Для полной методологии клеточной культуры см. этустатью 8. Эпителиальные клетки дыхательных путей человека культивировались в апикальной культурной камере чипа при постоянном воздушном потоке в течение 21 дня, при этом первичные фибробласты дыхательных путей культивировались вверх ногами на противоположной стороне мембраны. Короче говоря, первичные эпителиальные клетки дыхательных путей были выделены методом обработки протеазой (0,2 мг/мл при HBSS, 2 часа, 37 °C), соскабливания клеток и криоконсервации клеток, извлечённых из оставшейся трахеобронхиальной ткани у 3 здоровых доноров легких, о которых дополнительной информации не было. Фибробласты дыхательных путей человека (ФП) были выделены аналогичным образом из бронхиальной ткани трансплантированной ткани лёгких при ХОБЛ от одного донора.
На рисунке 9 можно увидеть изображение чипа и того, как вышеупомянутые ячейки проявляются как через камеры, так и вдоль камер устройства.
Культура эпителиальных клеток в совместной культуре с фибробластами на мембране ECM
Каркас, содержащий базальную мембрану, способствует культуре эпителиальных и мезенхимальных клеток. Увековеченные человеческие кератиноциты (HaCaT-клетки) были засеяны с плотностью 60 x 103 клеток/см² на внутренней стороне мембраны, а жизнеспособность составляла 95% после 24 часов по сравнению с 91% в пластиковой колбе для культуры клеток (рисунок 10A). Далее нормальные фибробласты MRC-5 лёгких человека были засеяны плотностью 60 x 103 клетки/см² на стромальную (внешнюю) сторону и выращивались в кокультуре с клетками HaCat в течение 14 дней для оценки долгосрочной жизнеспособности эпителиально-мезенхимальной системы для совместного культивирования на родной мембране ECM (рисунок 10D). Эпителиальные клетки образовывали слияющийся монослой на внутренней стороне мембраны, тогда как фибробласты распределялись менее плотно по внешней поверхности мембраны ECM, но сохранили свою характерную веретенообразную морфологию (рисунок 10C). Видео с 3D-реконструкцией можно посмотреть в дополнительном файле 417.
Текущее исследование представило усовершенствованную процедуру герметизации мембраны, которая обеспечивает прочное соединение PDMS с мембраной, способное противостоять нарушениям, вызванным ручным обращением с чипом, и обеспечивать долгосрочное культурирование под течением при давлении до 0,7 Па. Мы показали, что эти мембраны связаны силиконом, который проник в мембраны культуры через их поры, что способствует формированию ковалентных силановых связей между двумя половинами чипа и вакуумным раствором PDMS. Кроме того, представленная процедура не вызывает цитотоксичности, при правильном нанесении раствора. Кроме того, полученные чипы способствовали долгосрочным эпителиальным моно- и эпителиально-мезенхимным кокультурам. Хотя эта процедура применима только к пористым мембранам, она остаётся малозатратной процедурой для производства надёжных и готовых к культивированию клеток ALI-чипов.

Рисунок 1. Графика производства половины чипа PDMS и подготовки мембран . Для производства PDMS-половины чипа (шаг 1.2) формы для чипов заполняются жидким PDMS с широким сопловым шприцем: 4,4 мл в верхней форме и 2,4 мл в нижней. Половины PDMS отверждают 2 часа при 65 °C, после чего 4 входа в верхней части щепа пробиваются на концах камеры и точках, указанных в форме. Для подготовки мембраны (шаг 1.3) печатный трафарет плотно прижимается к поверхности мембраны. С помощью нового лезвия разрезают трафарет и удаляют мембрану скола из окружающего материала. Мембраны могут быть покрыты для культивирования клеток или использованы непосредственно на втором этапе. Создано в BioRender. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы увидеть увеличенную версию этой фигуры.

Рисунок 2. Процедура связывания мембраны. Раствор PDMS смешивается, как описано выше, непосредственно перед использованием. Раствор капает на четыре угла вокруг камеры и аккуратно распределяется вокруг места связывания мембраны с помощью наклонного конца пипетки. Один конец мембраны кладется на раствор, а затем, выровнявшись с камерой культуры, аккуратно даётся встать на место. Раствор наносится капельно и закрашивается по краям мембраны с большой осторожностью, чтобы силикон не коснулся поверхности мембраны внутри зоны культуры. Мембраны с половиной чипа немедленно помещаются в вакуумную камеру для удаления микропузырьков, обеспечения проникновения силикона в поверхность и поры, а также удаления толуола для минимизации химического воздействия на мембрану. Создано в BioRender. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы увидеть увеличенную версию этой фигуры.

Рисунок 3. Примеры размещения мембран.(A) Успешное размещение мембраны, отверждение на RT. (B) Связывание мембраны затвердело в печи (65 °C вместо RT), мембрана раздулась в камеру из-за сжатия силикона после нагрева. (C) Комплектные чипы с правильным размещением мембран ПЭТ и ПК. (D) Неправильное расположение мембран приведёт к изменению объёма каждой стороны чипа с её движением, что приводит к переменному потоку и созданию напряжения как для ячеек внутри чипа, так и на насосы, прикреплённые к микросхеме. Создано в BioRender. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы увидеть увеличенную версию этой фигуры.

Рисунок 4. Световые микроскопические изображения разрезанных и установленных мембран ПЭТ и ПК. Показано проникновение силикона в поры мембран в результате нашей процедуры вакуумного RT-отверждения. (A) Изображения той же мембраны без PDMS, видны прозрачные поры, а также чистая поверхность на поляризованном изображении. (B) Раствор PDMS был окрашён Nile Red, а силикон в мадженте успешно проник в поры и тонко покрыл поверхность вакуумом. Выделено белыми/пурпурными формами. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы увидеть увеличенную версию этой фигуры.

Рисунок 5. Жизнеспособность клеток в чиповых устройствах не изменялась при наличии или без толуола в растворе PDMS . Клетки Calu-3 были засеяны по 6,5 × 104 клеток на чип и, достигнув слияния, инкубировались в течение ночи, после чего на супернатанте проводился анализ AlamarBlue и TrypanBlue на клетках. Различия между группами (n=4), подготовленные с толуолом и без него, были проверены с помощью теста Стьюдента без пары, p > 0,05 = ns (не значимо)8. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы увидеть увеличенную версию этой фигуры.

Рисунок 6. Чипы базальных мембран. (A) Целостность мембраны была нарушена, так как раствор PDMS/толуола не был достаточно быстро удалён; Это повредило матричные белки и нарушило герметизацию чипов. (B) Герметизация мембран и сколов удалась, но мембрана запечатана в рыхлом состоянии. (C) Успешное герметизация мембраны и сколов — чип работает для обеспечения потока и растяжения. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы увидеть увеличенную версию этой фигуры.

Рисунок 7. Два изображения чипа ECM под растяжением. (A) Откол в состоянии покоя. (B) Скол менее 1,2 мм горизонтального растяжения. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы увидеть увеличенную версию этой фигуры.

Рисунок 8. Alcian Blue (ядра в мадженте, слизистая в синем) окрашивание эпителиальных клеток Calu-3 в лёгких человека, выращенных в чипах после воздействия воздуха в устройстве. Клетки Calu-3 выращивались до слияния и культивировались в течение 10 дней при непрерывном расходе 150 мкл/ч в базальном компартменте и с апикальной стороной средней или воздушной экспозиции. Поток осуществлялся с помощью перистальтического насоса внутри инкубатора при 37 °C и 5%CO2. В конце культивирования мембраны удалялись и окрашивались. Поперечный вид окрашивания Alcian Blue клеток Calu-3, выращиваемых в течение 10 дней под водой (A) и воздушным (B)8. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы увидеть увеличенную версию этой фигуры.

Рисунок 9. Визуализация первичных эпителиальных клеток и фибробластов человека в расширенной кокультуре внутри устройства. Фибробласты дыхательных путей были засеяны в устройство и оставляли прикрепиться на ночь, после чего устройство инвертировали и засевали эпителиальные клетки на другой стороне мембраны. Клетки выращивались до слияния, подвергались воздействию воздуха и культивировали в течение 21 дня при непрерывном расходе 150 мкл/ч, создаваемом перистальтическим насосом в инкубаторе при температуре 37 °C и 5%CO2. Мембраны удалялись после культуры, фиксировали, встраивались и крепили на стекли перед окрашиванием. Эпителиальные клетки были окрашены на Mucin 5AC (MUC5AC)18, компонент слизи, и белок forkhead box J1 (FOXJ1)19, транскрипционный фактор, участвующий в передаче сигналов для образования реснички. Фибробласты были окрашены агглютинином зародыша пшеницы (WGA) для визуализации клеточных фосфолипидных бислоев. Клетки инкубировали с 5 мкг/мл в HBSS в течение 15 минут и трижды промывались с помощью PBS перед визуализацией. Все ядра клеток визуализировались с помощью DAPI. (A) Обзор поперечного сечения: создаётся на основе Z-стековой проекции изображений (B) и (C). (B) Эпителиальная окраска MUC5AC/FOXJ1/DAPI на мембране чипа. (C) Полная внешняя структура слоя фибробластов в базальнойкамере 8. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы увидеть увеличенную версию этой фигуры.

Рисунок 10. Жизнеспособность клеток и кокультура на каркасе базальной мембраны. (a) жизнеспособность HaCaT-клеток, засеянных на эпителиальной стороне, были протестированы 3 независимых образца, из каждого образца взяты 3 случайных поля (n = 3). Был проведён обычный односторонний тест ANOVA с коррекцией Тьюки. График показывает среднее значение со стандартным отклонением. Кокультура (B) HaCaT-клеток на эпителиальной стороне и (C) лёгких фибробластов MRC-5 на стромальной стороне каркасов с базальной мембраной, окружённой коллагеновыми волокнами; полосы масштаба имеют размер 50 мкм. (D) 3D-вид кокультуры с изометрических сверху и снизу, масштабные полосы 100 мкм, анимированная визуализация показана на дополнительном рисунке 4. (E) Толщина каркасов базальной мембраны до и после децеллюляризации измерялись 14 слизистых, из которых 6 (представленных треугольниками) были взяты для децеллюляризации. В каждой из выборок было отсканировано три случайных поля, и не менее 10 точек на поле былиизмерены 17. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы увидеть увеличенную версию этой фигуры.
Дополнительный рисунок 1. Дизайны форм для верхней и нижней половин стандартного чипа PET/PC. (A) Изображение нижней формы чипа, которую можно получить из . STL в дополнительном файле 1. (B) Изображение верхней формы чипа, которую можно получить из . STL в дополнительном файле 2. (C) Изображение трафарета мембраны для резки мембран для чипа, который можно получить из . STL в дополнительном файле 3. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы скачать этот файл.
Дополнительный рисунок 2. Дизайны форм для форм для верхней и нижней половин мембранного чипа с растяжённой ECM. (A) Изображение нижней формы чипа, которую можно получить из . STL в дополнительном файле 4. (B) Изображение верхней формы чипа, которую можно получить из . STL в дополнительном файле 5. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы скачать этот файл.
Дополнительный рисунок 3. Валидация процедуры герметизации: сравнение проникновения PDMS в поры без толуола для снижения вязкости раствора и затвердевших при RT без вакуума. Все состояния связаны с ПЭТ-мембранами (поры 0,4 мкм), после обработки ПДМС (Nile Red 1%) мембраны встраивались в парафин перед установкой и световой микроскопической визуализацией. (A) Неразбавленный PDMS, пропылесосённый на ПЭТ-мембрану. На поверхности мембраны можно заметить толстый слой PDMS, при этом PDMS не проникли в поры (выделено белыми рамками). (B) Разбавленный раствор PDMS, пропылесосённый на ПЭТ-мембрану. На поверхности мембраны можно увидеть слой PDMS, при этом PDMS не наблюдается как проник в поры (выделено белыми рамками). (C) Разбавленный раствор PDMS, пропылесосённый на ПЭТ-мембрану. Тонкий слой PDMS можно увидеть на поверхности мембраны, а также проникание в поры вдоль мембраны (выделено белыми рамками). Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы скачать этот файл.
Дополнительный рисунок 4. 3D визуализацию ко-культивируемых клеток HaCat (эпителиальных) и MRC-5 (стром) на каркасе свиньей ECM. Анимированный 3D-вид кокультуры с изометрических сверху и снизу, изображения которого видны на рисунке 10D, масштабные полосы имеют размер 100 мкм. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы скачать этот файл.
Дополнительный файл 1. 3D. STL-файл нижней формы. Форма может использоваться для производства нижней части стандартного чипа с помощью 3D-печати или аналогичного метода изготовления. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы скачать этот файл.
Дополнительный файл 2. 3D. STL-файл верхней формы. Форма может использоваться для производства верхней половины стандартного чипа с помощью 3D-печати или аналогичного метода изготовления. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы скачать этот файл.
Дополнительный файл 3. 3D. STL-файл трафарета мембраны. Трафарет может использоваться для создания мембран нужного размера для предоставленного чипа и может быть изготовлен методом 3D-печати или аналогичным методом изготовления. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы скачать этот файл.
Дополнительный файл 4. 3D. STL-файл нижней формы стрейч-чипа. Форма может использоваться для создания нижней половины стрейч-чипа с помощью 3D-печати или аналогичного метода изготовления. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы скачать этот файл.
Дополнительный файл 5. 3D. STL-файл верхней формы стрейч-чипа. Форма может использоваться для получения верхней половины стрейч-чипа с помощью 3D-печати или аналогичного метода изготовления. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы скачать этот файл.