Привет-C: метод изучения трехмерной архитектуры геномов.

416.2K просмотров

Цитируется: 517

22:27 мин.

6 мая 2010 г.

10.3791/1869-v

6 мая 2010 г.

416.2K просмотров

Nynke L. van Berkum^*¹ , Erez Lieberman-Aiden^*²^,³^,⁴^,⁵ , Louise Williams^*² , Maxim Imakaev⁶ , Andreas Gnirke² , Leonid A. Mirny³^,⁶ , Job Dekker¹ , Eric S. Lander²^,⁷^,⁸

¹Program in Gene Function and Expression, Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology, University of Massachusetts Medical School, ²Broad Institute of Harvard and Massachusetts Institute of Technology, ³Division of Health Sciences and Technology, Massachusetts Institute of Technology, ⁴Program for Evolutionary Dynamics, Department of Organismic and Evolutionary Biology, Department of Mathematics, Harvard University , ⁵Department of Applied Mathematics, Harvard University , ⁶Department of Physics, Massachusetts Institute of Technology, ⁷Department of Systems Biology, Harvard Medical School, ⁸Department of Biology, Massachusetts Institute of Technology

^* These authors contributed equally

Привет-C метод позволяет непредвзято, генома идентификации хроматина взаимодействия (1). Привет-C пар перевязки близости и массивно параллельной последовательности. Полученные данные могут быть использованы для изучения геномной архитектуры в различных масштабах: первые результаты определены такие функции, как хромосомы территорий, разделение открытых и закрытых хроматина, а также структуры хроматина в масштабах megabase.