Оценка активности бактериального шаперона через термическое разворачивание модельного белка

0 просмотров2:38 мин. • November 28th, 2025

Начните с размещения кюветы в флуоресцентном спектрофотометре, оснащённом держателем и мешалкой с контролируемой температурой.

Добавьте предварительно нагретый буфер при умеренно кислом pH и установите температуру держателя для имитации условий напряжения.

В тестовый образец добавьте кислотозащитный шаперон, полученный из E. coli.

В контрольной выборке добавьте равный объём буфера.

Далее введите в оба образца температурно- и кислотно-чувствительный субстратный белок.

Начните мониторинг рассеяния света.

Инкубировать образцы в условиях напряжения, чтобы вызвать разворачивание субстрата.

При умеренно кислом pH шаперон становится активным и стабилизирует неразвернутый белок.

Добавьте сольный раствор, нейтрализующий pH, и продолжайте фиксировать рассеяние света.

В контрольном образце возврат к нейтральному pH приводит к агрегации нераскрытого белка, увеличивая рассеяние света.

В тестовом образце шаперон способствует повторному сгибанию субстрата, что приводит к снижению рассеяния света по сравнению с контролем.

Сравните сигналы рассеяния света, чтобы оценить активность шаперонов.

Поместите кварцевую кювету объёмом один миллилитр в флуоресцентный спектрофотометр, оснащённый держателями и мешалками с контролируемой температурой.

Установить длину волны возбуждения и излучения на 350 нанометров. Добавьте соответствующие объёмы предварительно нагретого буфера D при нужных значениях pH в кювет. Общий объём — 1000 микролитров.

Установите температуру в держателе для кюветы на 43 градуса Цельсия. Добавьте 12,5 микромоляра HdeB в буфер, затем добавите 0,5 микромоляра MDH. Начните мониторинг рассеяния света.

Инкубировать реакцию в течение 360 секунд, чтобы обеспечить достаточное разворачивание MDH. Поднимите pH до семи, добавив объём 0,16–0,34 двух молярных небуферных дикалиев фосфата и продолжайте фиксировать рассеяние света ещё 440 секунд. Проанализируйте данные, как описано в текстовом протоколе.