Индукция литической репликации профага для транскриптомного анализа

0 просмотров • 2:52 мин. • September 30th, 2026

Начните с бактериальной культуры, содержащей интегрированный геном профага, который подавляется белком-репрессором фага, что поддерживает состояние покоя в лизогенной фазе.

Добавьте индуктор и инкубируйте при перемешивании для запуска клеточного стресса.

Клеточный стресс индуцирует автокаталитический расщепление белка-репрессора, что позволяет профагу перейти от лизогении к литическому циклу репликации.

ДНК профага вырезается из бактериального генома и последовательно транскрибирует ранние регуляторные гены, гены репликации ДНК среднего этапа, а также поздние структурные гены и гены лизиса.

Перенесите культуру в большой объем среды, чтобы разбавить индуктор, и инкубируйте для восстановления клеток.

Через определенные интервалы времени добавляйте стоп-раствор для прекращения транскрипции и сохранения профиля РНК в бактериальных клетках.

Центрифугируйте культуру и удалите супернатант. Ресуспендируйте клетки, перенесите суспензию в маленькую пробирку и центрифугируйте.

Удалите супернатант и быстро заморозьте осадок для сохранения целостности РНК.

Наконец, добавьте реагент для экстракции РНК и гомогенизируйте смесь для разрушения клеток. Образец готов к выделению РНК и последующему транскрипто

Просмотрите полный транскрипт и получите доступ к тысячам научных видео

Войти

Больше видео

Индукция профага