$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Нейтрализующие антитела, или NAbs, секретируются клетками для защиты их от вторжения вирусов.
Для изучения взаимодействия NAb с вирусами используйте сконструированные вирусоподобные частицы или VLP. Эти наноразмерные структуры содержат сборку вирусных белков без вирусного генетического материала, что делает их незаразными. VLP окружены липидным бислоем, в который встроены антигенные гликопротеины оболочки, которые представляют собой нейтрализующий эпитоп, специализированную область, с которой связываются NAbs.
Добавьте VLP в пробирку, содержащую нейтрализующие антитела, связанные с магнитными шариками, конъюгированными с белками. Инкубируйте под перемешиванием, чтобы бусины не оседали. Во время инкубации эпитопная область VLP распознает комплементарный паратоп на Fab-области NAbs, что приводит к образованию комплексов антиген-антитело. Это, в свою очередь, помогает магнитным шарикам захватывать VLP.
Поместите пробирку в разделительный штатив, оснащенный сильным магнитом. Под действием магнитного поля шарики, комплексированные с VLP, движутся к магниту, не нарушая взаимодействия антиген-антитело. На этом этапе захватываются связанные VLP, в то время как те, у которых отсутствуют специфические антигены, остаются в надосадочной жидкости.
Выбросьте надосадочную жидкость и промойте гранулу с помощью промывочного буфера, чтобы удалить несвязанные VLP. Восстановите комплексы VLP-гранул в буфере для элюирования, что приводит к отделению VLP от гранул и появлению в надосадочной жидкости.
Аспирируйте выделенные антиген-отображающие VLP в свежую пробирку и храните их в холодильнике для дальнейшего анализа.
Начните с ресуспендирования магнитных шариков путем пипетирования вверх и вниз или смешивания на ротаторе со скоростью 50 об/мин в течение не менее 5 минут.
Тем временем приготовьте раствор антитела, содержащий bNAbs. Используйте 10 микрограммов каждого bNAb и 200 микролитров буфера, связывающего антитела и промывающего буфера на каждую реакцию. Для каждой реакции перелейте 50 микролитров раствора магнитных шариков в реакционную пробирку объемом 1,5 миллилитра, затем поместите пробирки на штатив для магнитной сепарации.
Подождите, пока шарики соберутся у стенки трубки, чтобы убедиться, что все шарики собраны, затем удалите надосадочную жидкость. Снимите магнит и подвесьте шарики в 200 микролитрах ранее приготовленного раствора bNAb.
Инкубировать от 30 минут до 3 часов, одновременно перемешивая на ротаторе при 50 об/мин при комнатной температуре. После инкубации поместите реакционные пробирки в штатив для магнитной сепарации, подождите и удалите надосадочную жидкость.
Снимите трубки с магнита и промойте шарики, повторно суспензив в 200 микролитрах буфера, связывающего антитела и промывающего. Повторите промывку со связыванием антител и промывочным буфером, удалив как можно больше промывочного буфера по окончании.
Добавьте образцы в bNAbs, связанные с бусинами. Если добавленный объем образца меньше 1 миллилитра, добавьте PBS, чтобы довести объем образца до 1 миллилитра, затем повторно суспендируйте шарики путем аккуратного пипетирования. Инкубируйте образцы и шарики в течение 2,5 часов на ротаторе при комнатной температуре, следя за тем, чтобы шарики оставались во взвешенном состоянии, а раствор тщательно перемешивался во время инкубации.
Поместите трубки на магнит и удалите надосадочную жидкость. Затем промойте магнитные шарики, суспензив их в 200 микролитрах буфера для стирки. Суспензируйте шарики в 100 миллилитрах промывочного буфера, а суспензию переложите в чистую термостойкую реакционную трубку. Поместите пробирку на магнитную разделительную решетку и полностью удалите надосадочную жидкость.
Чтобы приготовить денатурированные образцы SDS-PAGE, суспензируйте гранулы в буфере Laemmli объемом от 20 до 80 микролитров и инкубируйте при температуре 95 градусов Цельсия в течение 5 минут. Действуйте непосредственно с помощью SDS-PAGE, поместив пробирки на магнитный штатив, чтобы отделить шарики от раствора. В качестве альтернативы храните образцы при температуре -20 градусов Цельсия.