$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Белковый олигомер представляет собой комплекс из нескольких белковых субъединиц, которые связаны друг с другом, образуя более крупную функциональную единицу.
Для определения молекулярной массы белковых мономеров и их олигомеров в растворе с помощью SEC-MALS, комбинации эксклюзионной хроматографии и многоуглового рассеяния света, начинают с колонки эксклюзионной хроматографии (SEC).
Колонка содержит пористые сферические гелевые шарики, похожие на сито, которые захватывают в себе молекулы меньшего размера. Уравновесьте колонку буфером, совместимым с нативным состоянием белка.
Загрузите образец, содержащий белковые мономеры и олигомеры, в верхнюю часть колонки.
Во время потока олигомеры проходят через межчастичное пространство колонны, в то время как мономеры попадают в поры гранул. Это приводит к тому, что белковые олигомеры большего размера перемещаются быстрее, чем мономера меньшего размера.
Направьте быстро элюирующие олигомеры, а затем медленно элюирующие мономеры к детектору MALS.
Когда они проходят через детектор, их освещает лазерный свет, который рассеивается под разными углами. Многосубъединичные олигомеры рассеивают больше света, чем мономер.
Интенсивность рассеянного света под разными углами прямо пропорциональна молекулярной массе белкового олигомера и мономера.
Начните эту процедуру с подготовки системы SEC-MALS, как описано в текстовом протоколе. Используя реагенты класса ВЭЖХ, приготовьте один литр фосфатно-солевого буфера с 50-100 миллилитрами хлорида натрия. Отфильтруйте буфер до 0,1 микрона с помощью полиэфирсульфонового фильтра на крышке бутылки или аналогичного.
Отфильтруйте первые 50-100 миллилитров буфера в бутылку для отходов, чтобы удалить частицы из сухих фильтров. Затем отфильтруйте оставшуюся часть в чистую стерильную бутылку, которая была предварительно вымыта фильтрованной деионизированной водой и сохранена для предотвращения попадания пыли.
Промойте колонку на ночь со скоростью потока 0,5 миллилитров в минуту, чтобы уравновесить колонку в буфере и удалить твердые частицы. Используйте режим "Непрерывный поток" FPLC и убедитесь, что поток не останавливается до тех пор, пока не будут завершены все прогоны SEC-MALS. Поместите проточную ячейку dRI в режим продувки во время ночной промывки.
Начиная промывку, постепенно увеличивайте расход, чтобы предотвратить эффект «осыпания колонны», вызванный резким изменением давления в колонне. Выключите продувку перед началом прогонов проб.
Проверьте чистоту системы, слегка постучав по трубке ниже по потоку колонны, чтобы выпустить скопившиеся частицы. Наблюдайте за сигналом в детекторе с углом обзора 90 градусов на дисплее прибора MALS на передней панели. Убедитесь, что размах шума составляет не более 50–100 микровольт. Кроме того, убедитесь, что показатель преломления или сигнал RI стабилен и составляет менее 1 x 10-7 единиц показателя преломления.
Выполните «холостой» впрыск, чтобы убедиться, что инжектор чист от частиц. «Заготовка» — это просто рабочий буфер, приготовленный в свежем стерильном флаконе. Если пик частиц составляет не более 1 миллилитра по объему, и не более чем на 5 милливольт выше базового уровня, то система готова к отбору проб. В противном случае выполните дополнительные холостые впрыски до очистки или выполните техническое обслуживание для очистки инжектора.
Теперь приготовьте не менее 200 микролитров BSA в соотношении от 1 до 2 миллиграммов на миллилитр в буфере SEC. Отфильтруйте белок до 0,025 мкм с помощью фильтра с наконечником шприца. Выбросьте первые несколько капель фильтрата, чтобы удалить частицы из сухих фильтров. В качестве альтернативы центрифугируйте образец при 10 000 мгновений g в течение 15 минут, чтобы обеспечить осаждение нерастворимых агрегатов и других крупных частиц. Затем введите в петлю 100 микролитров раствора БСА.